133 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lferr_1794 on replicon NC_011206
Organism: Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011206  Lferr_1794  Mammalian cell entry related domain protein  100 
 
 		 312 aa  628  1e-179  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2135  mce-related protein  100 
 
 		 312 aa  628  1e-179  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6241  ABC transporter, periplasmic ligand binding protein  33.22 
 
 		 309 aa  171  2e-41  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2908  hypothetical protein  32.58 
 
 		 309 aa  167  2e-40  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2948  hypothetical protein  32.8 
 
 		 310 aa  166  4e-40  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2284  hypothetical protein  32.26 
 
 		 309 aa  166  5e-40  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2899  hypothetical protein  32.26 
 
 		 309 aa  166  5e-40  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.236087  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2810  hypothetical protein  32.8 
 
 		 311 aa  166  5e-40  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.177575 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0297  Mammalian cell entry related domain protein  34.78 
 
 		 323 aa  166  5.9999999999999996e-40  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.525082  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0064  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  31.92 
 
 		 309 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.702785  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0614  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  31.92 
 
 		 309 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.399104  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0230  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  31.92 
 
 		 309 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1363  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  31.92 
 
 		 309 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.498606  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0433  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  31.92 
 
 		 309 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.233147  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0452  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  31.92 
 
 		 309 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3199  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  31.92 
 
 		 309 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1983  hypothetical protein  35.18 
 
 		 301 aa  160  2e-38  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0099  hypothetical protein  32.17 
 
 		 313 aa  160  3e-38  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.447004  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0375  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  30.84 
 
 		 309 aa  157  2e-37  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.747955  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0405  hypothetical protein  33.33 
 
 		 309 aa  156  5.0000000000000005e-37  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0144565 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2368  hypothetical protein  32.93 
 
 		 316 aa  152  1e-35  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.709282  normal  0.77833 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0207  hypothetical protein  29.9 
 
 		 320 aa  151  2e-35  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0170  Mammalian cell entry related domain protein  29.97 
 
 		 322 aa  150  3e-35  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0315  signal peptide protein  30.91 
 
 		 330 aa  149  6e-35  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0493  Mammalian cell entry related domain protein  29.29 
 
 		 320 aa  146  5e-34  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.254167  normal  0.0924288 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0246  Mammalian cell entry related domain protein  31.1 
 
 		 325 aa  141  9.999999999999999e-33  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0172  Mce family protein  30.2 
 
 		 304 aa  140  3e-32  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0177  Mammalian cell entry related domain protein  30.6 
 
 		 322 aa  139  4.999999999999999e-32  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3915  hypothetical protein  33.94 
 
 		 321 aa  139  4.999999999999999e-32  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4223  ABC transporter, periplasmic ligand binding protein  29.29 
 
 		 320 aa  139  6e-32  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.381021 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0252  hypothetical protein  30.79 
 
 		 325 aa  139  7e-32  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0686058 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0367  hypothetical protein  29.07 
 
 		 320 aa  135  7.000000000000001e-31  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0232  hypothetical protein  31.41 
 
 		 310 aa  135  9e-31  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0070  hypothetical protein  29.8 
 
 		 313 aa  133  3.9999999999999996e-30  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0184  hypothetical protein  29.9 
 
 		 310 aa  132  5e-30  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.683235  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1360  Mammalian cell entry related domain protein  29.6 
 
 		 334 aa  129  5.0000000000000004e-29  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2028  hypothetical protein  25 
 
 		 307 aa  128  1.0000000000000001e-28  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2023  hypothetical protein  24.68 
 
 		 307 aa  126  4.0000000000000003e-28  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0308  hypothetical protein  33.03 
 
 		 326 aa  124  3e-27  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1203  hypothetical protein  32.05 
 
 		 310 aa  122  9e-27  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.511791  normal  0.098201 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1208  hypothetical protein  29.5 
 
 		 308 aa  117  1.9999999999999998e-25  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1913  hypothetical protein  28.89 
 
 		 312 aa  109  7.000000000000001e-23  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_22660  hypothetical protein  36.13 
 
 		 312 aa  108  9.000000000000001e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00283529 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0922  hypothetical protein  29.01 
 
 		 321 aa  108  1e-22  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0371  hypothetical protein  30.39 
 
 		 305 aa  108  1e-22  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5087  hypothetical protein  28.71 
 
 		 312 aa  105  7e-22  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0684473 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1820  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein, putative  26.5 
 
 		 296 aa  105  8e-22  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_2008  ABC transporter periplasmic substrate-binding protein  26.5 
 
 		 296 aa  105  8e-22  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1639  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein, putative  26.18 
 
 		 296 aa  103  6e-21  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0178  Mammalian cell entry related domain protein  24.75 
 
 		 305 aa  100  2e-20  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2275  Mammalian cell entry related domain protein  35.62 
 
 		 305 aa  98.2  1e-19  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0743  hypothetical protein  26.05 
 
 		 308 aa  98.6  1e-19  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1222  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  26.05 
 
 		 308 aa  98.6  1e-19  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0156  hypothetical protein  27.04 
 
 		 312 aa  98.2  1e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.997452 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1156  Mammalian cell entry related domain protein  28.85 
 
 		 313 aa  98.2  2e-19  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2744  hypothetical protein  29.21 
 
 		 315 aa  96.7  5e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0811657 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1679  hypothetical protein  26.58 
 
 		 298 aa  95.1  1e-18  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_04760  MCE domain protein  26.47 
 
 		 312 aa  94.4  2e-18  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.321932  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2344  hypothetical protein  29.35 
 
 		 306 aa  94.4  2e-18  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0043368 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0039  hypothetical protein  26.54 
 
 		 312 aa  93.6  4e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.292682  normal  0.178021 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0100  Mammalian cell entry related domain protein  24.84 
 
 		 316 aa  93.2  5e-18  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0158  hypothetical protein  26.06 
 
 		 312 aa  93.2  5e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0479  hypothetical protein  27.56 
 
 		 313 aa  92  1e-17  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0772873  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0140  hypothetical protein  26.21 
 
 		 312 aa  91.3  2e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.682464 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1841  hypothetical protein  29.05 
 
 		 313 aa  90.1  4e-17  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2315  hypothetical protein  29.64 
 
 		 433 aa  89  9e-17  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.629666  normal  0.23577 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2811  ABC transporter periplasmic substrate-binding protein  29.55 
 
 		 321 aa  89  1e-16  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.218461  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1526  hypothetical protein  23.89 
 
 		 300 aa  88.6  1e-16  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0265226  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1487  hypothetical protein  29.35 
 
 		 321 aa  88.2  2e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.30011 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2109  hypothetical protein  25.53 
 
 		 331 aa  86.7  5e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0522  Mammalian cell entry related domain protein  27.22 
 
 		 308 aa  85.5  0.000000000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.629914  normal  0.424693 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2002  hypothetical protein  33.64 
 
 		 316 aa  83.2  0.000000000000005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3566  hypothetical protein  28.1 
 
 		 312 aa  83.2  0.000000000000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.46814  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1021  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein, putative  25.9 
 
 		 331 aa  81.3  0.00000000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3670  hypothetical protein  26.05 
 
 		 353 aa  81.3  0.00000000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.0456409 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1718  hypothetical protein  28.24 
 
 		 321 aa  80.5  0.00000000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.130812  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1610  hypothetical protein  29.32 
 
 		 313 aa  78.6  0.0000000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0376  Mammalian cell entry related domain protein  40.15 
 
 		 295 aa  77.8  0.0000000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.202968  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2048  hypothetical protein  27.51 
 
 		 579 aa  75.9  0.0000000000008  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.715666 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0626  ABC transporter permease  24.04 
 
 		 308 aa  75.5  0.000000000001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.112844  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0577  hypothetical protein  24.04 
 
 		 308 aa  75.5  0.000000000001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.749568  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1503  Mammalian cell entry related domain protein  25.74 
 
 		 307 aa  75.5  0.000000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0988  putative ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  25.3 
 
 		 331 aa  74.7  0.000000000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0119  putative ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  25.26 
 
 		 275 aa  73.9  0.000000000003  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2514  hypothetical protein  26.64 
 
 		 302 aa  73.9  0.000000000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0373094  hitchhiker  0.00640469 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4041  hypothetical protein  40.32 
 
 		 367 aa  72.8  0.000000000007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.474065  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1954  hypothetical protein  29.61 
 
 		 360 aa  69.3  0.00000000008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.104433  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2843  hypothetical protein  24.42 
 
 		 319 aa  68.2  0.0000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1195  hypothetical protein  26.6 
 
 		 312 aa  67.8  0.0000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03181  ABC transporter substrate-binding protein  30.13 
 
 		 308 aa  67  0.0000000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.721062  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4483  Mammalian cell entry related domain protein  25.67 
 
 		 297 aa  65.1  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1982  Mammalian cell entry related domain protein  24.73 
 
 		 456 aa  63.5  0.000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0362661  normal  0.670067 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1638  hypothetical protein  26.42 
 
 		 317 aa  63.5  0.000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1552  hypothetical protein  25.62 
 
 		 458 aa  63.2  0.000000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.394461  normal  0.189115 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4715  Mammalian cell entry related domain protein  36.52 
 
 		 398 aa  61.2  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.324726  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2193  Mammalian cell entry related domain protein  23.64 
 
 		 456 aa  61.2  0.00000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.141725  normal  0.182946 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0575  putative ABC transport system periplasmic substrate-binding protein  19.54 
 
 		 288 aa  61.6  0.00000002  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4935  hypothetical protein  27.62 
 
 		 359 aa  60.8  0.00000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.704687  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1072  hypothetical protein  24.21 
 
 		 309 aa  60.8  0.00000003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4115  hypothetical protein  24.46 
 
 		 307 aa  60.8  0.00000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0544388  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>