162 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmul_A1983 on replicon NC_007614
Organism: Nitrosospira multiformis ATCC 25196



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007614  Nmul_A1983  hypothetical protein  100 
 
 
301 aa  608  1e-173  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0064  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  37.38 
 
 
309 aa  203  2e-51  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.702785  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0614  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  37.38 
 
 
309 aa  203  2e-51  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.399104  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0230  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  37.38 
 
 
309 aa  203  2e-51  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1363  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  37.38 
 
 
309 aa  203  2e-51  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.498606  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0433  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  37.38 
 
 
309 aa  203  2e-51  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.233147  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0452  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  37.38 
 
 
309 aa  203  2e-51  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3199  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  37.38 
 
 
309 aa  203  2e-51  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0297  Mammalian cell entry related domain protein  36.71 
 
 
323 aa  202  4e-51  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.525082  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0375  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  36.39 
 
 
309 aa  197  1.0000000000000001e-49  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.747955  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2948  hypothetical protein  36.39 
 
 
310 aa  193  2e-48  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2810  hypothetical protein  36.18 
 
 
311 aa  192  8e-48  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.177575 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0099  hypothetical protein  33.97 
 
 
313 aa  191  9e-48  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.447004  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0232  hypothetical protein  36.77 
 
 
310 aa  190  2.9999999999999997e-47  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2284  hypothetical protein  35.74 
 
 
309 aa  188  8e-47  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2899  hypothetical protein  35.74 
 
 
309 aa  188  8e-47  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.236087  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2908  hypothetical protein  35.74 
 
 
309 aa  188  9e-47  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6241  ABC transporter, periplasmic ligand binding protein  35.74 
 
 
309 aa  188  1e-46  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0315  signal peptide protein  33.33 
 
 
330 aa  180  2e-44  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0367  hypothetical protein  34.49 
 
 
320 aa  179  4.999999999999999e-44  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0207  hypothetical protein  33.02 
 
 
320 aa  177  2e-43  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3915  hypothetical protein  37.14 
 
 
321 aa  176  5e-43  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0170  Mammalian cell entry related domain protein  32.49 
 
 
322 aa  176  5e-43  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0246  Mammalian cell entry related domain protein  33.33 
 
 
325 aa  174  9.999999999999999e-43  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0252  hypothetical protein  33.33 
 
 
325 aa  174  1.9999999999999998e-42  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.0686058 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0405  hypothetical protein  36.07 
 
 
309 aa  170  2e-41  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0144565 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2368  hypothetical protein  35 
 
 
316 aa  167  1e-40  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.709282  normal  0.77833 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1208  hypothetical protein  38.02 
 
 
308 aa  167  2e-40  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0184  hypothetical protein  33.66 
 
 
310 aa  167  2.9999999999999998e-40  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.683235  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0172  Mce family protein  41.05 
 
 
304 aa  165  9e-40  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0070  hypothetical protein  31.42 
 
 
313 aa  162  5.0000000000000005e-39  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0177  Mammalian cell entry related domain protein  32.81 
 
 
322 aa  162  5.0000000000000005e-39  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1794  Mammalian cell entry related domain protein  33.45 
 
 
312 aa  156  4e-37  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2135  mce-related protein  33.45 
 
 
312 aa  156  4e-37  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0493  Mammalian cell entry related domain protein  30.98 
 
 
320 aa  154  2.9999999999999998e-36  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.254167  normal  0.0924288 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0308  hypothetical protein  36.14 
 
 
326 aa  152  5e-36  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0922  hypothetical protein  35.67 
 
 
321 aa  152  5.9999999999999996e-36  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4223  ABC transporter, periplasmic ligand binding protein  30.64 
 
 
320 aa  143  4e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.381021 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2275  Mammalian cell entry related domain protein  32.8 
 
 
305 aa  131  2.0000000000000002e-29  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1203  hypothetical protein  30.48 
 
 
310 aa  125  9e-28  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.511791  normal  0.098201 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1913  hypothetical protein  31.11 
 
 
312 aa  123  4e-27  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_22660  hypothetical protein  30.7 
 
 
312 aa  119  3.9999999999999996e-26  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00283529 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1360  Mammalian cell entry related domain protein  26.14 
 
 
334 aa  117  1.9999999999999998e-25  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1679  hypothetical protein  30.72 
 
 
298 aa  113  3e-24  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0100  Mammalian cell entry related domain protein  25.94 
 
 
316 aa  109  4.0000000000000004e-23  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1820  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein, putative  26.09 
 
 
296 aa  108  1e-22  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2028  hypothetical protein  26.13 
 
 
307 aa  108  1e-22  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2023  hypothetical protein  25.81 
 
 
307 aa  107  3e-22  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_2008  ABC transporter periplasmic substrate-binding protein  26.4 
 
 
296 aa  106  4e-22  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0119  putative ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  26.78 
 
 
275 aa  106  6e-22  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0371  hypothetical protein  32.13 
 
 
305 aa  104  2e-21  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1639  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein, putative  25.47 
 
 
296 aa  103  3e-21  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1610  hypothetical protein  25.49 
 
 
313 aa  102  6e-21  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1156  Mammalian cell entry related domain protein  28.25 
 
 
313 aa  100  4e-20  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0178  Mammalian cell entry related domain protein  25.43 
 
 
305 aa  99.8  5e-20  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_04760  MCE domain protein  28.85 
 
 
312 aa  97.1  3e-19  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.321932  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0039  hypothetical protein  26.1 
 
 
312 aa  95.5  1e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.292682  normal  0.178021 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1195  hypothetical protein  27.36 
 
 
312 aa  94.7  1e-18  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0140  hypothetical protein  24.76 
 
 
312 aa  94.4  2e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.682464 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0158  hypothetical protein  24.76 
 
 
312 aa  93.2  5e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5087  hypothetical protein  24.44 
 
 
312 aa  92.8  6e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0684473 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2514  hypothetical protein  24.58 
 
 
302 aa  92.4  9e-18  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0373094  hitchhiker  0.00640469 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1317  hypothetical protein  26.1 
 
 
293 aa  91.7  1e-17  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0479  hypothetical protein  31.03 
 
 
313 aa  90.9  2e-17  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0772873  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2344  hypothetical protein  26.07 
 
 
306 aa  90.1  4e-17  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0043368 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0626  ABC transporter permease  25.53 
 
 
308 aa  89.7  5e-17  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.112844  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0743  hypothetical protein  23.84 
 
 
308 aa  88.6  1e-16  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2843  hypothetical protein  28.75 
 
 
319 aa  88.6  1e-16  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2002  hypothetical protein  31.75 
 
 
316 aa  88.6  1e-16  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1222  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  23.84 
 
 
308 aa  88.6  1e-16  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2811  ABC transporter periplasmic substrate-binding protein  26.84 
 
 
321 aa  87.8  2e-16  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.218461  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4483  Mammalian cell entry related domain protein  26.1 
 
 
297 aa  87.8  2e-16  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0522  Mammalian cell entry related domain protein  27.22 
 
 
308 aa  87.8  2e-16  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.629914  normal  0.424693 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0156  hypothetical protein  23.79 
 
 
312 aa  88.2  2e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.997452 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0577  hypothetical protein  27.39 
 
 
308 aa  88.2  2e-16  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.749568  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1487  hypothetical protein  26.84 
 
 
321 aa  86.7  4e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.30011 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1435  hypothetical protein  25.71 
 
 
313 aa  87  4e-16  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0152442  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2805  Mammalian cell entry related domain protein  29.73 
 
 
357 aa  85.9  8e-16  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5555  ABC transporter periplasmic-binding protein  25.91 
 
 
292 aa  85.9  8e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.99193  normal  0.689785 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2109  hypothetical protein  23.58 
 
 
331 aa  85.9  8e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0575  putative ABC transport system periplasmic substrate-binding protein  22.6 
 
 
288 aa  85.1  0.000000000000001  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1503  Mammalian cell entry related domain protein  25.08 
 
 
307 aa  84.7  0.000000000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1454  hypothetical protein  25.42 
 
 
289 aa  83.6  0.000000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0474733  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1638  hypothetical protein  25.76 
 
 
317 aa  83.6  0.000000000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2048  hypothetical protein  25.42 
 
 
579 aa  82.4  0.000000000000009  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.715666 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2315  hypothetical protein  24.59 
 
 
433 aa  82  0.00000000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.629666  normal  0.23577 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1718  hypothetical protein  25.91 
 
 
321 aa  81.3  0.00000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.130812  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1629  hypothetical protein  24.75 
 
 
291 aa  80.9  0.00000000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.232196 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1841  hypothetical protein  26.06 
 
 
313 aa  80.5  0.00000000000003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3566  hypothetical protein  24.2 
 
 
312 aa  80.1  0.00000000000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.46814  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2744  hypothetical protein  29.88 
 
 
315 aa  80.5  0.00000000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0811657 
 
 
-
 
NC_004310  BR1021  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein, putative  23.15 
 
 
331 aa  79  0.0000000000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0376  Mammalian cell entry related domain protein  35.42 
 
 
295 aa  78.6  0.0000000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.202968  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0988  putative ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  23.15 
 
 
331 aa  78.2  0.0000000000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03181  ABC transporter substrate-binding protein  26.73 
 
 
308 aa  76.6  0.0000000000005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.721062  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3670  hypothetical protein  21.26 
 
 
353 aa  74.3  0.000000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.0456409 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4115  hypothetical protein  23.26 
 
 
307 aa  74.7  0.000000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0544388  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1015  hypothetical protein  27.38 
 
 
321 aa  72  0.00000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0090  mce related protein  22.76 
 
 
313 aa  71.6  0.00000000001  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0699486  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1552  hypothetical protein  25.86 
 
 
458 aa  70.9  0.00000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.394461  normal  0.189115 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>