177 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_3636 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013037  Dfer_3636  Mammalian cell entry related domain protein  100 
 
 		 321 aa  640    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.676726 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4901  Mammalian cell entry related domain protein  52.34 
 
 		 328 aa  338  7e-92  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.374077  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0751  ABC transporter permease  38.26 
 
 		 308 aa  194  2e-48  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0221313  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4584  hypothetical protein  32.42 
 
 		 321 aa  166  2.9999999999999998e-40  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6192  Mammalian cell entry related domain protein  31.82 
 
 		 332 aa  162  6e-39  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.387563 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0638  hypothetical protein  28.38 
 
 		 306 aa  160  2e-38  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.498696 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1867  Mammalian cell entry related domain protein  31.27 
 
 		 316 aa  158  1e-37  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.449047  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11078  hypothetical protein  29.28 
 
 		 316 aa  150  3e-35  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2113  Mammalian cell entry related domain protein  32.09 
 
 		 316 aa  122  7e-27  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.202192  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1049  hypothetical protein  27.71 
 
 		 292 aa  116  3.9999999999999997e-25  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00460957 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2344  Mammalian cell entry related domain protein  26.67 
 
 		 314 aa  108  2e-22  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1508  Mammalian cell entry related domain protein  27.84 
 
 		 356 aa  92.8  6e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.577537 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1739  Mammalian cell entry related domain protein  25.86 
 
 		 292 aa  90.1  5e-17  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0678  Mammalian cell entry related domain protein  25.5 
 
 		 529 aa  89  1e-16  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.828772 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1873  Mammalian cell entry related domain protein  25.73 
 
 		 293 aa  86.7  6e-16  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.010294 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0440  VpsC protein  25.85 
 
 		 292 aa  86.3  7e-16  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0661  hypothetical protein  27.12 
 
 		 292 aa  84.7  0.000000000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0478  VpsC protein  27.15 
 
 		 292 aa  83.2  0.000000000000005  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.238955  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2254  Mammalian cell entry related domain protein  26.13 
 
 		 292 aa  83.2  0.000000000000005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.371924  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1696  Mammalian cell entry related domain protein  25.89 
 
 		 293 aa  82.8  0.000000000000007  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3705  hypothetical protein  25.85 
 
 		 349 aa  82  0.00000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0838  virulence factor Mce family protein  24.48 
 
 		 523 aa  81.3  0.00000000000002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0188  Mammalian cell entry related domain protein  27.69 
 
 		 337 aa  81.6  0.00000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.107684  normal  0.968767 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2733  Mammalian cell entry related domain protein  27.89 
 
 		 356 aa  79  0.0000000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.978964  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4517  hypothetical protein  26.07 
 
 		 359 aa  78.2  0.0000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0329  hypothetical protein  25 
 
 		 430 aa  73.9  0.000000000003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.967579  normal  0.70235 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2541  virulence factor MCE-like protein-related protein  24.58 
 
 		 360 aa  71.2  0.00000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.143277  hitchhiker  0.00000000000784881 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1899  virulence factor Mce family protein  25.99 
 
 		 349 aa  70.1  0.00000000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1272  virulence factor MCE-like protein-related protein  23.84 
 
 		 347 aa  69.7  0.00000000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.821992  hitchhiker  0.0000000117847 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0495  Mammalian cell entry related domain protein  24.15 
 
 		 360 aa  69.3  0.00000000008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3019  ABC-type transport system involved in resistance to organic solvents periplasmic component-like protein  30.8 
 
 		 339 aa  68.2  0.0000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0707  Mammalian cell entry related domain protein  22.79 
 
 		 362 aa  65.5  0.000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.886561  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0161  Mammalian cell entry related domain protein  23.46 
 
 		 334 aa  65.1  0.000000002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.458265 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0393  Mammalian cell entry related domain protein  24.46 
 
 		 515 aa  64.3  0.000000003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1243  hypothetical protein  22.41 
 
 		 360 aa  64.3  0.000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1894  hypothetical protein  23.64 
 
 		 324 aa  64.3  0.000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000276188  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2448  hypothetical protein  24.76 
 
 		 333 aa  63.2  0.000000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2514  hypothetical protein  21.86 
 
 		 302 aa  63.2  0.000000006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0373094  hitchhiker  0.00640469 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1487  hypothetical protein  26.79 
 
 		 321 aa  60.8  0.00000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.30011 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0926  mce-related protein  23.36 
 
 		 360 aa  60.5  0.00000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0021  ABC-type transport system involved in resistance to organic solvents periplasmic component-like  24.15 
 
 		 313 aa  60.1  0.00000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.577639  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2811  ABC transporter periplasmic substrate-binding protein  26.48 
 
 		 321 aa  59.7  0.00000006  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.218461  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3569  Mammalian cell entry related domain protein  37.7 
 
 		 186 aa  59.3  0.00000009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0424468  hitchhiker  0.0000173433 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0389  putative signal peptide protein, toluene tolerance Ttg2C-like  36.43 
 
 		 181 aa  58.9  0.0000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2028  hypothetical protein  25.83 
 
 		 307 aa  58.5  0.0000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2023  hypothetical protein  26.61 
 
 		 307 aa  57.8  0.0000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1506  virulence factor Mce family protein  26.07 
 
 		 339 aa  58.2  0.0000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3823  virulence factor Mce family protein  22.86 
 
 		 432 aa  58.2  0.0000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1718  hypothetical protein  24.46 
 
 		 321 aa  57  0.0000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.130812  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1203  hypothetical protein  23.17 
 
 		 310 aa  56.6  0.0000005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.511791  normal  0.098201 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2768  hypothetical protein  34.88 
 
 		 184 aa  55.1  0.000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.422541  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4169  virulence factor Mce family protein  23.17 
 
 		 342 aa  55.5  0.000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.757225  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1552  hypothetical protein  22.58 
 
 		 458 aa  55.1  0.000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.394461  normal  0.189115 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1810  Mammalian cell entry related domain protein  25.53 
 
 		 341 aa  54.3  0.000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.550546 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2960  signal peptide protein  30.69 
 
 		 173 aa  52.8  0.000009  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.432073  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1360  Mammalian cell entry related domain protein  23.32 
 
 		 334 aa  51.2  0.00002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4398  virulence factor Mce family protein  21.67 
 
 		 342 aa  51.2  0.00002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2891  Mammalian cell entry related domain protein  30.43 
 
 		 175 aa  51.2  0.00002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.27124 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0450  mce family protein  32.12 
 
 		 185 aa  51.2  0.00002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.132036  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1144  hypothetical protein  32.12 
 
 		 185 aa  51.2  0.00002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0514  hypothetical protein  32.12 
 
 		 185 aa  51.2  0.00002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.449918  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1898  putative ABC transporter substrate-binding protein  35 
 
 		 155 aa  50.8  0.00003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4187  virulence factor Mce family protein  25 
 
 		 342 aa  50.4  0.00004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.39714  normal  0.700299 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0099  hypothetical protein  22.46 
 
 		 313 aa  50.1  0.00005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.447004  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0119  putative ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  26.07 
 
 		 275 aa  50.1  0.00005  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3238  Mammalian cell entry related domain protein  30.43 
 
 		 175 aa  50.1  0.00005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.303674  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4603  virulence factor Mce family protein  26.58 
 
 		 346 aa  50.1  0.00005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1655  virulence factor MCE-like protein  20.92 
 
 		 342 aa  49.7  0.00006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1679  virulence factor Mce family protein  20.92 
 
 		 342 aa  49.7  0.00006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.859349  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1628  virulence factor Mce family protein  20.92 
 
 		 342 aa  49.7  0.00006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0651  virulence factor Mce family protein  20.92 
 
 		 342 aa  49.7  0.00006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.228257  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0710  virulence factor Mce family protein  23.13 
 
 		 343 aa  49.7  0.00006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.476442  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10171  MCE-family protein mce1B  23.24 
 
 		 346 aa  50.1  0.00006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0795  Mammalian cell entry related domain protein  19.8 
 
 		 328 aa  49.3  0.00009  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1208  hypothetical protein  25.16 
 
 		 308 aa  48.5  0.0001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0351  putative ABC transport system substrate-binding protein  21.35 
 
 		 377 aa  48.9  0.0001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3002  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  38.3 
 
 		 176 aa  48.5  0.0001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.784047  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1841  hypothetical protein  22.27 
 
 		 313 aa  48.9  0.0001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03058  predicted ABC-type organic solvent transporter  33.61 
 
 		 183 aa  48.5  0.0002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0328967  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0514  Mammalian cell entry related domain protein  33.61 
 
 		 183 aa  48.5  0.0002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0145877  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0687  hypothetical protein  21.74 
 
 		 332 aa  48.1  0.0002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4515  Mce family protein  33.61 
 
 		 183 aa  48.5  0.0002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0766033  normal  0.489861 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2910  hypothetical protein  24.68 
 
 		 317 aa  47.8  0.0002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0334  hypothetical protein  37.23 
 
 		 187 aa  48.1  0.0002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0890  Mammalian cell entry related domain protein  33.08 
 
 		 156 aa  48.1  0.0002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.114761  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3489  Mce family protein  33.61 
 
 		 183 aa  48.5  0.0002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0522  Mammalian cell entry related domain protein  23.95 
 
 		 308 aa  48.1  0.0002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.629914  normal  0.424693 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0100  Mammalian cell entry related domain protein  26.52 
 
 		 316 aa  48.5  0.0002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03009  hypothetical protein  33.61 
 
 		 183 aa  48.5  0.0002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0277207  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3577  Mce family protein  33.61 
 
 		 183 aa  48.5  0.0002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.45422  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5087  hypothetical protein  23.81 
 
 		 312 aa  48.1  0.0002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0684473 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0743  hypothetical protein  26.32 
 
 		 308 aa  48.1  0.0002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3386  Mce family protein  33.61 
 
 		 183 aa  48.5  0.0002  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000578801  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3681  Mce family protein  33.61 
 
 		 183 aa  48.5  0.0002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0116721  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0319  hypothetical protein  37.25 
 
 		 187 aa  48.5  0.0002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0287402  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1222  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  26.32 
 
 		 308 aa  48.1  0.0002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3566  hypothetical protein  25 
 
 		 312 aa  48.5  0.0002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.46814  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0507  hypothetical protein  33.61 
 
 		 183 aa  48.5  0.0002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.945849  normal  0.16691 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3608  Mce family protein  32.48 
 
 		 183 aa  47.4  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.345737 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1895  ABC transporter substrate binding protein  23.38 
 
 		 455 aa  47.4  0.0003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>