94 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Synpcc7942_0351 on replicon NC_007604
Organism: Synechococcus elongatus PCC 7942



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007604  Synpcc7942_0351  putative ABC transport system substrate-binding protein  100 
 
 
377 aa  736    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3809  Mammalian cell entry related domain protein  37.17 
 
 
404 aa  243  3.9999999999999997e-63  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.622643  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0530  Mammalian cell entry related domain protein  35.79 
 
 
465 aa  214  1.9999999999999998e-54  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0794795  hitchhiker  0.00420823 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0513  Mammalian cell entry related domain protein  35.79 
 
 
465 aa  214  1.9999999999999998e-54  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3037  Mammalian cell entry related domain protein  33.91 
 
 
479 aa  204  2e-51  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.622361 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2674  hypothetical protein  34.46 
 
 
470 aa  179  7e-44  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0998  mammalian cell entry related domain-containing protein  33.51 
 
 
470 aa  177  2e-43  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0397137  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4571  Mammalian cell entry related domain protein  31.22 
 
 
468 aa  172  6.999999999999999e-42  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2165  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  35.98 
 
 
476 aa  127  3e-28  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_41114  predicted protein  27.25 
 
 
306 aa  112  9e-24  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.830125  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_25211  putative ABC transporter  25.81 
 
 
291 aa  112  1.0000000000000001e-23  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_03221  putative ABC transporter  27.13 
 
 
281 aa  101  3e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.0751946  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_03121  putative ABC transporter  26.74 
 
 
281 aa  100  5e-20  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.776003  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_03131  putative ABC transporter  27.63 
 
 
281 aa  99.8  7e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0291  putative ABC transporter  24.7 
 
 
281 aa  99.4  9e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.324707  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0235  ABC transporter  24.63 
 
 
286 aa  97.4  3e-19  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0208  ABC transporter  23.05 
 
 
286 aa  96.3  8e-19  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.751363 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_03691  putative ABC transporter  30.56 
 
 
281 aa  91.3  3e-17  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_03151  putative ABC transporter  20.97 
 
 
281 aa  89.4  1e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1655  putative ABC transporter  29.28 
 
 
281 aa  85.9  0.000000000000001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0393  Mammalian cell entry related domain protein  21.68 
 
 
515 aa  66.2  0.0000000009  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0926  mce-related protein  28.1 
 
 
360 aa  63.2  0.000000007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0329  hypothetical protein  29.27 
 
 
430 aa  59.3  0.0000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.967579  normal  0.70235 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0178  Mammalian cell entry related domain protein  26.05 
 
 
305 aa  54.7  0.000002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1230  Mammalian cell entry related domain protein  26.98 
 
 
322 aa  54.7  0.000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.16167  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2784  ABC-type transport system involved in resistance to organic solvents periplasmic component  34.19 
 
 
155 aa  53.9  0.000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.162084  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0021  ABC-type transport system involved in resistance to organic solvents periplasmic component-like  23.88 
 
 
313 aa  53.1  0.000008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.577639  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0171  hypothetical protein  37.35 
 
 
166 aa  52.8  0.00001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1015  hypothetical protein  23.63 
 
 
321 aa  52.8  0.00001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0751  ABC transporter permease  24 
 
 
308 aa  51.6  0.00002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0221313  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1861  hypothetical protein  24.29 
 
 
567 aa  50.8  0.00003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1360  Mammalian cell entry related domain protein  26.95 
 
 
334 aa  51.2  0.00003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4394  virulence factor Mce family protein  24.51 
 
 
483 aa  51.2  0.00003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2221  hypothetical protein  33.33 
 
 
153 aa  50.8  0.00004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.693824  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0161  Mammalian cell entry related domain protein  22.34 
 
 
334 aa  50.4  0.00005  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.458265 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0172  Mce family protein  27.46 
 
 
304 aa  50.1  0.00006  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0838  virulence factor Mce family protein  22.6 
 
 
523 aa  49.7  0.00009  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1867  Mammalian cell entry related domain protein  22.48 
 
 
316 aa  49.7  0.00009  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.449047  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3636  Mammalian cell entry related domain protein  21.35 
 
 
321 aa  48.9  0.0001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.676726 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2811  ABC transporter periplasmic substrate-binding protein  32.26 
 
 
321 aa  48.5  0.0002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.218461  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1487  hypothetical protein  32.26 
 
 
321 aa  48.5  0.0002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.30011 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2193  Mammalian cell entry related domain protein  21.13 
 
 
456 aa  48.9  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.141725  normal  0.182946 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4715  Mammalian cell entry related domain protein  27.73 
 
 
398 aa  48.1  0.0002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.324726  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2066  Mammalian cell entry related domain protein  26.29 
 
 
388 aa  47.8  0.0003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4998  virulence factor Mce family protein  21.85 
 
 
352 aa  47.8  0.0003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.408593 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2448  hypothetical protein  21.91 
 
 
333 aa  48.1  0.0003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2635  hypothetical protein  23.77 
 
 
328 aa  47.4  0.0004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1243  hypothetical protein  31.53 
 
 
360 aa  47.8  0.0004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0878  hypothetical protein  35.65 
 
 
156 aa  47.4  0.0004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.600632  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2541  virulence factor MCE-like protein-related protein  23.72 
 
 
360 aa  47.4  0.0004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.143277  hitchhiker  0.00000000000784881 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0708  virulence factor Mce family protein  31.25 
 
 
424 aa  47.8  0.0004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0372566  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2744  hypothetical protein  26.22 
 
 
315 aa  47.4  0.0005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0811657 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1899  virulence factor Mce family protein  24.13 
 
 
349 aa  47  0.0005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1171  hypothetical protein  29.58 
 
 
168 aa  47.4  0.0005  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1718  hypothetical protein  32.26 
 
 
321 aa  47.4  0.0005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.130812  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4533  virulence factor Mce family protein  22.7 
 
 
504 aa  47  0.0005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0456406  normal  0.287629 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09320  virulence factor Mce family protein  24.51 
 
 
359 aa  47  0.0006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.906316 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2084  Mammalian cell entry related domain protein  24.1 
 
 
564 aa  46.6  0.0007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1552  hypothetical protein  22.61 
 
 
458 aa  46.6  0.0007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.394461  normal  0.189115 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2411  hypothetical protein  37.39 
 
 
154 aa  46.6  0.0007  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.108225  normal  0.153742 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1888  Mammalian cell entry related domain protein  19.77 
 
 
529 aa  46.6  0.0007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1999  Mammalian cell entry related domain protein  24.1 
 
 
567 aa  46.6  0.0007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2747  hypothetical protein  36.63 
 
 
161 aa  46.2  0.001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2113  Mammalian cell entry related domain protein  24.89 
 
 
316 aa  45.8  0.001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.202192  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3509  fibronectin, type III  36.84 
 
 
537 aa  45.8  0.001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.736082  normal  0.990532 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4901  Mammalian cell entry related domain protein  21.75 
 
 
328 aa  46.2  0.001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.374077  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4397  virulence factor Mce family protein  28.3 
 
 
430 aa  45.8  0.001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2566  hypothetical protein  36.54 
 
 
879 aa  45.8  0.001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.830034  normal  0.124645 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2453  hypothetical protein  36.54 
 
 
879 aa  45.8  0.001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.552902  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2885  hypothetical protein  28.79 
 
 
160 aa  45.1  0.002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.827962  normal  0.785076 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3214  hypothetical protein  24.19 
 
 
360 aa  45.4  0.002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2733  Mammalian cell entry related domain protein  21.83 
 
 
356 aa  45.1  0.002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.978964  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2707  hypothetical protein  34.29 
 
 
149 aa  45.4  0.002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1272  virulence factor MCE-like protein-related protein  22.49 
 
 
347 aa  45.1  0.002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.821992  hitchhiker  0.0000000117847 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2514  hypothetical protein  21.49 
 
 
302 aa  45.4  0.002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0373094  hitchhiker  0.00640469 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2446  hypothetical protein  36.54 
 
 
879 aa  45.4  0.002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.000190027  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1375  hypothetical protein  24.8 
 
 
390 aa  44.7  0.003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4177  Mammalian cell entry related domain protein  22.14 
 
 
356 aa  43.9  0.004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1923  hypothetical protein  21.61 
 
 
369 aa  43.9  0.005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.743497  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1542  hypothetical protein  22.46 
 
 
458 aa  43.9  0.005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.133417  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0371  hypothetical protein  25 
 
 
305 aa  43.9  0.005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1667  hypothetical protein  34.62 
 
 
878 aa  43.5  0.006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.479229  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1742  hypothetical protein  34.62 
 
 
878 aa  43.5  0.006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.893513  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1772  hypothetical protein  34.62 
 
 
878 aa  43.5  0.006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.91737  normal  0.173538 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1355  hypothetical protein  26.23 
 
 
390 aa  43.1  0.007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0761  Mammalian cell entry related domain protein  30.56 
 
 
145 aa  43.5  0.007  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4145  virulence factor Mce family protein  23.73 
 
 
561 aa  43.1  0.007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.903302  normal  0.559384 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4584  hypothetical protein  21.35 
 
 
321 aa  43.5  0.007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0403  hypothetical protein  31.15 
 
 
146 aa  43.1  0.008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.304841  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2606  PqiB family protein  34.62 
 
 
869 aa  42.7  0.009  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1982  Mammalian cell entry related domain protein  22.43 
 
 
456 aa  42.7  0.009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0362661  normal  0.670067 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2315  hypothetical protein  22.09 
 
 
433 aa  42.7  0.009  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.629666  normal  0.23577 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4148  virulence factor Mce family protein  24.3 
 
 
367 aa  43.1  0.009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09340  virulence factor Mce family protein  24.05 
 
 
329 aa  42.7  0.01  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.677284 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>