55 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PMT9312_0291 on replicon NC_007577
Organism: Prochlorococcus marinus str. MIT 9312



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007577  PMT9312_0291  putative ABC transporter  100 
 
 
281 aa  560  1e-158  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.324707  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_03131  putative ABC transporter  87.9 
 
 
281 aa  504  9.999999999999999e-143  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_03121  putative ABC transporter  88.61 
 
 
281 aa  506  9.999999999999999e-143  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.776003  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_03221  putative ABC transporter  85.05 
 
 
281 aa  491  9.999999999999999e-139  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.0751946  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1655  putative ABC transporter  47.33 
 
 
281 aa  278  6e-74  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_03691  putative ABC transporter  47.33 
 
 
281 aa  277  1e-73  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_03151  putative ABC transporter  42.91 
 
 
281 aa  250  2e-65  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_25211  putative ABC transporter  40.21 
 
 
291 aa  244  9.999999999999999e-64  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0235  ABC transporter  38.08 
 
 
286 aa  239  4e-62  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0208  ABC transporter  37.72 
 
 
286 aa  234  9e-61  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.751363 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3809  Mammalian cell entry related domain protein  27.63 
 
 
404 aa  102  6e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.622643  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0351  putative ABC transport system substrate-binding protein  24.7 
 
 
377 aa  99.4  6e-20  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0530  Mammalian cell entry related domain protein  28.33 
 
 
465 aa  87.4  2e-16  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0794795  hitchhiker  0.00420823 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0513  Mammalian cell entry related domain protein  28.33 
 
 
465 aa  87.4  2e-16  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3037  Mammalian cell entry related domain protein  26.88 
 
 
479 aa  79.3  0.00000000000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.622361 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0998  mammalian cell entry related domain-containing protein  31.85 
 
 
470 aa  73.2  0.000000000004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0397137  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2960  signal peptide protein  35.04 
 
 
173 aa  62.4  0.000000009  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.432073  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3238  Mammalian cell entry related domain protein  36.7 
 
 
175 aa  60.5  0.00000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.303674  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2891  Mammalian cell entry related domain protein  35.78 
 
 
175 aa  59.3  0.00000006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.27124 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2674  hypothetical protein  25 
 
 
470 aa  58.2  0.0000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2399  hypothetical protein  33.03 
 
 
156 aa  58.5  0.0000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1898  putative ABC transporter substrate-binding protein  28.97 
 
 
155 aa  57  0.0000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2165  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  29.27 
 
 
476 aa  56.6  0.0000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2747  hypothetical protein  28.04 
 
 
161 aa  54.7  0.000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2937  hypothetical protein  28.57 
 
 
162 aa  52.4  0.000008  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.887715  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3120  hypothetical protein  28.69 
 
 
173 aa  51.6  0.00001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.771354  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2707  hypothetical protein  26 
 
 
149 aa  50.4  0.00003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0687  hypothetical protein  30.28 
 
 
169 aa  50.1  0.00004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1195  hypothetical protein  24.82 
 
 
312 aa  49.3  0.00007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1330  hypothetical protein  26.42 
 
 
168 aa  48.9  0.0001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.519307  normal 
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_41114  predicted protein  18.21 
 
 
306 aa  47.4  0.0002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.830125  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12002  MCE-family protein mce3F  25 
 
 
437 aa  47.4  0.0002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000281764  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0393  Mammalian cell entry related domain protein  25.33 
 
 
515 aa  46.2  0.0005  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3702  hypothetical protein  31.78 
 
 
149 aa  46.2  0.0005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4584  hypothetical protein  22.83 
 
 
321 aa  46.2  0.0006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2411  hypothetical protein  24.07 
 
 
154 aa  45.8  0.0007  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.108225  normal  0.153742 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0098  hypothetical protein  30.99 
 
 
160 aa  45.8  0.0009  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.334829  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0795  hypothetical protein  29.36 
 
 
168 aa  45.4  0.001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0952502  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1015  hypothetical protein  30.43 
 
 
163 aa  45.1  0.002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0097  Mammalian cell entry related domain protein  30.99 
 
 
160 aa  44.7  0.002  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  decreased coverage  0.0000148019  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1156  Mammalian cell entry related domain protein  30.28 
 
 
163 aa  44.3  0.002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.482142  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0718  Mammalian cell entry related domain protein  26.4 
 
 
161 aa  44.3  0.002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2118  hypothetical protein  32.53 
 
 
151 aa  44.7  0.002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3400  hypothetical protein  33.02 
 
 
156 aa  44.7  0.002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0389  putative signal peptide protein, toluene tolerance Ttg2C-like  26.23 
 
 
181 aa  43.9  0.003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0761  Mammalian cell entry related domain protein  29.29 
 
 
145 aa  43.9  0.003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2885  hypothetical protein  24.24 
 
 
160 aa  43.9  0.003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.827962  normal  0.785076 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2635  hypothetical protein  20 
 
 
328 aa  43.9  0.003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5534  hypothetical protein  28.57 
 
 
161 aa  43.9  0.003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.264569  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3296  hypothetical protein  26.42 
 
 
164 aa  43.9  0.003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.091613  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2768  hypothetical protein  28.44 
 
 
184 aa  43.5  0.004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.422541  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0815  mce-related protein  28.3 
 
 
149 aa  42.7  0.006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0750  hypothetical protein  26.4 
 
 
161 aa  42.7  0.007  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0239  hypothetical protein  28.44 
 
 
164 aa  42.4  0.009  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.852395 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09310  virulence factor Mce family protein  24.76 
 
 
394 aa  42.4  0.01  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.91288 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>