76 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PMN2A_1655 on replicon NC_007335
Organism: Prochlorococcus marinus str. NATL2A



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007335  PMN2A_1655  putative ABC transporter  100 
 
 		 281 aa  560  1.0000000000000001e-159  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_03691  putative ABC transporter  96.8 
 
 		 281 aa  543  1e-153  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_03221  putative ABC transporter  49.47 
 
 		 281 aa  288  9e-77  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.0751946  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_03151  putative ABC transporter  48.4 
 
 		 281 aa  281  6.000000000000001e-75  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_03131  putative ABC transporter  48.04 
 
 		 281 aa  281  9e-75  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0291  putative ABC transporter  47.33 
 
 		 281 aa  278  6e-74  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.324707  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_03121  putative ABC transporter  47.33 
 
 		 281 aa  276  2e-73  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.776003  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_25211  putative ABC transporter  45.91 
 
 		 291 aa  274  1.0000000000000001e-72  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0235  ABC transporter  42.7 
 
 		 286 aa  253  2.0000000000000002e-66  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0208  ABC transporter  39.15 
 
 		 286 aa  242  5e-63  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.751363 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3809  Mammalian cell entry related domain protein  26.07 
 
 		 404 aa  98.2  1e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.622643  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0351  putative ABC transport system substrate-binding protein  29.28 
 
 		 377 aa  85.9  7e-16  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0530  Mammalian cell entry related domain protein  25.08 
 
 		 465 aa  78.6  0.0000000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0794795  hitchhiker  0.00420823 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3037  Mammalian cell entry related domain protein  31.29 
 
 		 479 aa  78.6  0.0000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.622361 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0513  Mammalian cell entry related domain protein  25.08 
 
 		 465 aa  78.6  0.0000000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0998  mammalian cell entry related domain-containing protein  43.18 
 
 		 470 aa  67  0.0000000004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0397137  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2165  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  32.69 
 
 		 476 aa  66.2  0.0000000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2674  hypothetical protein  28.66 
 
 		 470 aa  63.9  0.000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2960  signal peptide protein  33.93 
 
 		 173 aa  54.3  0.000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.432073  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11078  hypothetical protein  25 
 
 		 316 aa  53.1  0.000005  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0239  hypothetical protein  28.97 
 
 		 164 aa  52.8  0.000006  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.852395 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2747  hypothetical protein  29.46 
 
 		 161 aa  51.2  0.00002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0329  hypothetical protein  21.56 
 
 		 430 aa  51.2  0.00002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.967579  normal  0.70235 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13528  MCE-family protein mce4F  35.37 
 
 		 564 aa  50.8  0.00003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000487906 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0097  Mammalian cell entry related domain protein  38.03 
 
 		 160 aa  50.4  0.00003  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  decreased coverage  0.0000148019  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1898  putative ABC transporter substrate-binding protein  29.29 
 
 		 155 aa  50.1  0.00004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5281  Mammalian cell entry related domain protein  22.61 
 
 		 340 aa  49.7  0.00005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.192594 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3702  hypothetical protein  31.78 
 
 		 149 aa  49.7  0.00005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2399  hypothetical protein  33.64 
 
 		 156 aa  49.7  0.00005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0098  hypothetical protein  36.62 
 
 		 160 aa  48.9  0.00009  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.334829  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1156  Mammalian cell entry related domain protein  33.64 
 
 		 163 aa  48.9  0.00009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.482142  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3238  Mammalian cell entry related domain protein  31.25 
 
 		 175 aa  48.9  0.0001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.303674  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3120  hypothetical protein  31.25 
 
 		 173 aa  48.5  0.0001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.771354  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4571  Mammalian cell entry related domain protein  23.77 
 
 		 468 aa  48.5  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2937  hypothetical protein  30.84 
 
 		 162 aa  48.5  0.0001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.887715  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2891  Mammalian cell entry related domain protein  30.36 
 
 		 175 aa  47.8  0.0002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.27124 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0707  Mammalian cell entry related domain protein  22.63 
 
 		 362 aa  47.8  0.0002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.886561  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0395  hypothetical protein  30.36 
 
 		 187 aa  47.4  0.0002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.147868  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0708  virulence factor Mce family protein  23.31 
 
 		 424 aa  47.8  0.0002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0372566  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0687  hypothetical protein  32.71 
 
 		 169 aa  47.8  0.0002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2784  ABC-type transport system involved in resistance to organic solvents periplasmic component  33.33 
 
 		 155 aa  47  0.0003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.162084  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2691  hypothetical protein  30.36 
 
 		 189 aa  47.4  0.0003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0995365  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0416  hypothetical protein  30.36 
 
 		 189 aa  47.4  0.0003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.249405  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0795  hypothetical protein  30.84 
 
 		 168 aa  47  0.0004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0952502  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0449  ABC-type transport system protein  32.08 
 
 		 148 aa  46.6  0.0004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  2.58514e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0761  Mammalian cell entry related domain protein  32.56 
 
 		 145 aa  46.6  0.0005  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1888  Mammalian cell entry related domain protein  20.28 
 
 		 529 aa  46.2  0.0006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0319  hypothetical protein  34.78 
 
 		 187 aa  46.2  0.0006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0287402  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0905  hypothetical protein  31.65 
 
 		 158 aa  45.8  0.0009  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0874  hypothetical protein  31.65 
 
 		 158 aa  45.8  0.0009  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1561  virulence factor Mce family protein  24.87 
 
 		 565 aa  45.1  0.001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0522  Mammalian cell entry related domain protein  32 
 
 		 308 aa  45.1  0.001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.629914  normal  0.424693 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1750  hypothetical protein  32.89 
 
 		 178 aa  45.4  0.001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.892099  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2243  virulence factor Mce family protein  28.16 
 
 		 420 aa  44.3  0.002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0389  putative signal peptide protein, toluene tolerance Ttg2C-like  30.36 
 
 		 181 aa  44.3  0.002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0981  hypothetical protein  33.64 
 
 		 158 aa  44.7  0.002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0890  Mammalian cell entry related domain protein  31.94 
 
 		 156 aa  44.3  0.002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.114761  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3400  hypothetical protein  33.8 
 
 		 156 aa  44.7  0.002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0739  Mammalian cell entry related domain protein  31.96 
 
 		 152 aa  44.7  0.002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.942465  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1330  hypothetical protein  31.71 
 
 		 168 aa  44.7  0.002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.519307  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1818  toluene tolerance protein  31.58 
 
 		 178 aa  43.9  0.003  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3514  ABC transporter, inner membrane subunit  29.46 
 
 		 184 aa  43.9  0.003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.531635  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0297  Mammalian cell entry related domain protein  26.88 
 
 		 323 aa  43.9  0.003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.525082  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4599  virulence factor Mce family protein  24.7 
 
 		 499 aa  43.5  0.004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.376755  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1230  Mammalian cell entry related domain protein  35.94 
 
 		 322 aa  43.5  0.004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.16167  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0343  hypothetical protein  29.46 
 
 		 187 aa  43.1  0.005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.908048  normal  0.599528 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5534  hypothetical protein  31.53 
 
 		 161 aa  43.1  0.005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.264569  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0334  hypothetical protein  29.46 
 
 		 187 aa  43.1  0.005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3569  Mammalian cell entry related domain protein  34.78 
 
 		 186 aa  43.1  0.006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0424468  hitchhiker  0.0000173433 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0172  Mce family protein  26.77 
 
 		 304 aa  42.7  0.006  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1222  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  27.27 
 
 		 308 aa  42.7  0.007  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0743  hypothetical protein  27.27 
 
 		 308 aa  42.7  0.007  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0626  ABC transporter permease  29.13 
 
 		 308 aa  42.4  0.008  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.112844  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0577  hypothetical protein  29.13 
 
 		 308 aa  42.4  0.008  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.749568  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3002  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  34.78 
 
 		 176 aa  42.4  0.009  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.784047  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2102  virulence factor Mce family protein  31 
 
 		 343 aa  42.4  0.009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0525635  normal  0.778813 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>