50 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene P9301_03131 on replicon NC_009091
Organism: Prochlorococcus marinus str. MIT 9301



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009091  P9301_03131  putative ABC transporter  100 
 
 
281 aa  560  1.0000000000000001e-159  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_03121  putative ABC transporter  93.95 
 
 
281 aa  532  1e-150  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.776003  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0291  putative ABC transporter  87.9 
 
 
281 aa  504  9.999999999999999e-143  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.324707  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_03221  putative ABC transporter  86.12 
 
 
281 aa  495  1e-139  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.0751946  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_03691  putative ABC transporter  48.75 
 
 
281 aa  282  5.000000000000001e-75  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1655  putative ABC transporter  48.04 
 
 
281 aa  281  9e-75  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_25211  putative ABC transporter  40.57 
 
 
291 aa  246  2e-64  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_03151  putative ABC transporter  41.49 
 
 
281 aa  239  4e-62  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0235  ABC transporter  38.79 
 
 
286 aa  238  5.999999999999999e-62  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0208  ABC transporter  38.79 
 
 
286 aa  237  2e-61  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.751363 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0351  putative ABC transport system substrate-binding protein  27.63 
 
 
377 aa  99.8  4e-20  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3809  Mammalian cell entry related domain protein  26.38 
 
 
404 aa  96.7  4e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.622643  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3037  Mammalian cell entry related domain protein  29.38 
 
 
479 aa  87.8  2e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.622361 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0530  Mammalian cell entry related domain protein  26.53 
 
 
465 aa  85.9  7e-16  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0794795  hitchhiker  0.00420823 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0513  Mammalian cell entry related domain protein  26.53 
 
 
465 aa  85.9  7e-16  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0998  mammalian cell entry related domain-containing protein  31.11 
 
 
470 aa  73.6  0.000000000004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0397137  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2674  hypothetical protein  26.39 
 
 
470 aa  58.5  0.0000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2960  signal peptide protein  30.77 
 
 
173 aa  57  0.0000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.432073  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1898  putative ABC transporter substrate-binding protein  28.8 
 
 
155 aa  55.1  0.000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2891  Mammalian cell entry related domain protein  33.94 
 
 
175 aa  55.5  0.000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.27124 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2399  hypothetical protein  31.19 
 
 
156 aa  55.1  0.000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2165  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  26.45 
 
 
476 aa  55.1  0.000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3238  Mammalian cell entry related domain protein  33.03 
 
 
175 aa  53.9  0.000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.303674  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2747  hypothetical protein  26.03 
 
 
161 aa  52.8  0.000006  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_41114  predicted protein  20.86 
 
 
306 aa  51.6  0.00001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.830125  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2937  hypothetical protein  28.44 
 
 
162 aa  50.4  0.00003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.887715  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0393  Mammalian cell entry related domain protein  24.62 
 
 
515 aa  49.7  0.00005  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2707  hypothetical protein  26 
 
 
149 aa  49.3  0.00007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3120  hypothetical protein  26.61 
 
 
173 aa  49.3  0.00007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.771354  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1330  hypothetical protein  27.59 
 
 
168 aa  48.9  0.0001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.519307  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2635  hypothetical protein  21.37 
 
 
328 aa  47.8  0.0002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0687  hypothetical protein  29.36 
 
 
169 aa  47.4  0.0003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1195  hypothetical protein  23.55 
 
 
312 aa  47  0.0004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2411  hypothetical protein  24.8 
 
 
154 aa  45.8  0.0009  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.108225  normal  0.153742 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3702  hypothetical protein  31.78 
 
 
149 aa  45.1  0.001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2744  hypothetical protein  24.47 
 
 
315 aa  45.1  0.001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0811657 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4584  hypothetical protein  22.1 
 
 
321 aa  45.1  0.001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5534  hypothetical protein  27.15 
 
 
161 aa  44.3  0.002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.264569  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0761  Mammalian cell entry related domain protein  28.45 
 
 
145 aa  44.7  0.002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0638  hypothetical protein  24.77 
 
 
306 aa  44.3  0.002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.498696 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2118  hypothetical protein  33.73 
 
 
151 aa  44.7  0.002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0098  hypothetical protein  28.4 
 
 
160 aa  43.5  0.004  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.334829  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2106  virulence factor Mce family protein  28.45 
 
 
486 aa  43.1  0.005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.583314  normal  0.616965 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0795  hypothetical protein  29.63 
 
 
168 aa  43.1  0.005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0952502  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0097  Mammalian cell entry related domain protein  28.4 
 
 
160 aa  42.7  0.006  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  decreased coverage  0.0000148019  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0718  Mammalian cell entry related domain protein  25.7 
 
 
161 aa  42.4  0.008  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1156  Mammalian cell entry related domain protein  30.58 
 
 
163 aa  42.4  0.008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.482142  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1222  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  26.83 
 
 
308 aa  42.4  0.009  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0743  hypothetical protein  26.83 
 
 
308 aa  42.4  0.009  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3400  hypothetical protein  33.02 
 
 
156 aa  42.4  0.009  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>