186 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gura_2635 on replicon NC_009483
Organism: Geobacter uraniireducens Rf4



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009483  Gura_2635  hypothetical protein  100 
 
 		 328 aa  656    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2416  hypothetical protein  37.85 
 
 		 359 aa  237  2e-61  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.186903  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0040  Mammalian cell entry related domain protein  38.07 
 
 		 327 aa  193  3e-48  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1983  hypothetical protein  34.66 
 
 		 343 aa  189  5e-47  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.042136  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1056  Mammalian cell entry related domain protein  32.93 
 
 		 322 aa  164  2.0000000000000002e-39  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3499  hypothetical protein  33.13 
 
 		 324 aa  157  2e-37  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0668  hypothetical protein  32.33 
 
 		 330 aa  150  2e-35  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0363  paraquat-inducible protein B  29.13 
 
 		 572 aa  142  7e-33  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.364646  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2447  hypothetical protein  29.13 
 
 		 323 aa  140  3.9999999999999997e-32  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.106785  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1960  hypothetical protein  29.57 
 
 		 327 aa  139  4.999999999999999e-32  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0139154  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5506  hypothetical protein  33 
 
 		 533 aa  139  7e-32  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.286213  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1230  Mammalian cell entry related domain protein  29.97 
 
 		 322 aa  138  1e-31  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.16167  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0328  Mammalian cell entry related domain protein  27.45 
 
 		 552 aa  130  4.0000000000000003e-29  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3382  paraquat-inducible protein  31.33 
 
 		 551 aa  129  5.0000000000000004e-29  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3374  mce family protein  31.33 
 
 		 551 aa  129  5.0000000000000004e-29  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2378  paraquat-inducible protein B  31.33 
 
 		 553 aa  129  6e-29  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.154964  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0292  paraquat-inducible protein B  31.33 
 
 		 551 aa  129  7.000000000000001e-29  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1154  paraquat-inducible protein B  31.33 
 
 		 551 aa  129  7.000000000000001e-29  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3340  paraquat-inducible protein B  31.33 
 
 		 551 aa  129  7.000000000000001e-29  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.440052  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2561  mce family protein  31.33 
 
 		 551 aa  129  7.000000000000001e-29  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3376  hypothetical protein  29.51 
 
 		 559 aa  128  1.0000000000000001e-28  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.166606  normal  0.0325483 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0626  hypothetical protein  31.89 
 
 		 539 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.735429  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0602  hypothetical protein  31.89 
 
 		 539 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.483664  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0403  hypothetical protein  31.67 
 
 		 545 aa  127  3e-28  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4623  hypothetical protein  27.19 
 
 		 334 aa  127  4.0000000000000003e-28  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2674  hypothetical protein  31.67 
 
 		 539 aa  126  5e-28  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.531712  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1268  paraquat-inducible protein B  31.35 
 
 		 551 aa  125  7e-28  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3799  hypothetical protein  31.56 
 
 		 539 aa  125  1e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.660029  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2535  hypothetical protein  29.57 
 
 		 544 aa  124  2e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0651  hypothetical protein  29.93 
 
 		 534 aa  124  3e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.1317  normal  0.879007 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2114  Mammalian cell entry related domain protein  29.9 
 
 		 539 aa  124  3e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0678  hypothetical protein  31.56 
 
 		 539 aa  123  4e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0419217  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0227  hypothetical protein  31.56 
 
 		 539 aa  123  4e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0711  hypothetical protein  31.56 
 
 		 539 aa  123  4e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2127  putative paraquat-inducible transmembrane protein, PqiB  29.57 
 
 		 539 aa  121  9.999999999999999e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.460028  normal  0.102127 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2221  Mammalian cell entry related domain protein  29.74 
 
 		 556 aa  121  9.999999999999999e-27  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000538523 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3242  Mammalian cell entry related domain protein  31.13 
 
 		 555 aa  122  9.999999999999999e-27  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4088  paraquat-inducible protein B  30.17 
 
 		 508 aa  121  1.9999999999999998e-26  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.141129  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2000  Mammalian cell entry related domain protein  30.07 
 
 		 558 aa  120  3e-26  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.939676  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0709  Mammalian cell entry related domain protein  28.38 
 
 		 552 aa  120  3e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.381837  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2893  Mammalian cell entry related domain protein  29.33 
 
 		 548 aa  120  3.9999999999999996e-26  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.3428  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4000  putative paraquat-inducible protein  28.38 
 
 		 552 aa  119  4.9999999999999996e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.113556  normal  0.829107 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0257  hypothetical protein  29.19 
 
 		 543 aa  117  3e-25  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44090  PqiB family protein  29.04 
 
 		 537 aa  115  1.0000000000000001e-24  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.760607  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2679  hypothetical protein  31.29 
 
 		 546 aa  114  3e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.331347  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2831  hypothetical protein  29.32 
 
 		 551 aa  109  6e-23  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3535  hypothetical protein  28.57 
 
 		 531 aa  108  1e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.128458  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0579  hypothetical protein  30.51 
 
 		 546 aa  107  2e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.30623  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0040  paraquat-inducible protein  29.08 
 
 		 569 aa  108  2e-22  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  decreased coverage  0.00684202  normal  0.214843 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3138  hypothetical protein  28.03 
 
 		 322 aa  107  3e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.448864  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2577  hypothetical protein  27.81 
 
 		 546 aa  107  4e-22  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0122207  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3139  hypothetical protein  27.81 
 
 		 546 aa  106  5e-22  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.667877  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3045  PqiB family protein  27.91 
 
 		 559 aa  105  1e-21  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.114944  normal  0.0226159 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3288  hypothetical protein  28.48 
 
 		 546 aa  105  1e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5802  hypothetical protein  26.64 
 
 		 531 aa  103  3e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.00328946  hitchhiker  0.0014272 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0530  Mammalian cell entry related domain protein  27.74 
 
 		 547 aa  104  3e-21  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0517  Mammalian cell entry related domain protein  27.74 
 
 		 547 aa  103  3e-21  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1320  Mammalian cell entry related domain protein  27.14 
 
 		 337 aa  102  7e-21  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3179  PqiB family protein  27.91 
 
 		 559 aa  102  1e-20  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.360667  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1713  hypothetical protein  25.96 
 
 		 356 aa  102  1e-20  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00000000187754 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5278  hypothetical protein  26.97 
 
 		 531 aa  100  3e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2638  paraquat-inducible protein B  30.35 
 
 		 550 aa  100  3e-20  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1990  paraquat-inducible protein B  30.35 
 
 		 550 aa  100  3e-20  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2549  paraquat-inducible protein B  30.35 
 
 		 550 aa  100  3e-20  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0824615  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5822  hypothetical protein  25.33 
 
 		 431 aa  99.4  8e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.324893  normal  0.303543 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2562  hypothetical protein  33.15 
 
 		 558 aa  98.6  1e-19  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0758211  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2067  paraquat-inducible protein B  27.88 
 
 		 546 aa  93.6  5e-18  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.883854  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1496  Mammalian cell entry related domain protein  27.07 
 
 		 335 aa  92  1e-17  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.024979  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00955  paraquat-inducible protein B  29.52 
 
 		 546 aa  90.1  4e-17  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.00000262354  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2692  Mammalian cell entry related domain protein  29.52 
 
 		 546 aa  90.1  4e-17  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000610454  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1794  paraquat-inducible protein B  26.92 
 
 		 555 aa  90.1  4e-17  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00962  hypothetical protein  29.52 
 
 		 546 aa  90.1  4e-17  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.00000379419  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2645  paraquat-inducible protein B  29.52 
 
 		 546 aa  90.1  4e-17  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000298494  hitchhiker  0.00000476211 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2168  paraquat-inducible protein B  29.52 
 
 		 546 aa  90.1  4e-17  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000764872  normal  0.254429 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1115  paraquat-inducible protein B  29.52 
 
 		 546 aa  90.5  4e-17  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000291875  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1060  paraquat-inducible protein B  29.52 
 
 		 546 aa  90.1  4e-17  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000012177  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1066  paraquat-inducible protein B  29.52 
 
 		 546 aa  90.1  4e-17  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.00000000000823988  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0601  hypothetical protein  26.45 
 
 		 547 aa  90.1  5e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.184325  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1127  paraquat-inducible protein B  28.23 
 
 		 546 aa  89.4  8e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0201216  normal  0.953621 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2366  paraquat-inducible protein B  29.05 
 
 		 546 aa  88.6  1e-16  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.547013  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3015  hypothetical protein  27.81 
 
 		 329 aa  88.6  1e-16  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.231252  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1173  paraquat-inducible protein B  28.23 
 
 		 546 aa  88.2  2e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.371767  normal  0.608659 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1105  paraquat-inducible protein B  28.23 
 
 		 546 aa  88.2  2e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.486337  normal  0.0294366 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1139  paraquat-inducible protein B  28.23 
 
 		 546 aa  88.2  2e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0102675  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1570  hypothetical protein  27.59 
 
 		 538 aa  88.2  2e-16  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1022  paraquat-inducible protein B  28.23 
 
 		 546 aa  88.2  2e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00119913  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2580  hypothetical protein  26.49 
 
 		 551 aa  87.4  3e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.732971 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1072  hypothetical protein  27.17 
 
 		 309 aa  87  4e-16  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1463  paraquat-inducible protein B  26.7 
 
 		 545 aa  86.7  6e-16  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0560595  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0366  paraquat-inducible protein B  32.98 
 
 		 547 aa  85.9  8e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.838729  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4853  paraquat-inducible protein B  31.77 
 
 		 547 aa  85.1  0.000000000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00098113 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3509  fibronectin, type III  24.03 
 
 		 537 aa  85.5  0.000000000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.736082  normal  0.990532 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1323  Mammalian cell entry related domain protein  24.41 
 
 		 561 aa  85.1  0.000000000000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.404082  normal  0.550075 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1683  paraquat-inducible protein B  27.14 
 
 		 548 aa  84.7  0.000000000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1015  hypothetical protein  30.88 
 
 		 321 aa  84  0.000000000000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2072  Mammalian cell entry related domain protein  28.36 
 
 		 341 aa  82.4  0.00000000000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.435744 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1445  Mammalian cell entry related domain protein  24.15 
 
 		 547 aa  82  0.00000000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.578149  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2751  paraquat-inducible ABC-type transporter, periplasmic component  35.78 
 
 		 326 aa  81.6  0.00000000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2074  hypothetical protein  28.5 
 
 		 550 aa  80.9  0.00000000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0955309  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1652  paraquat-inducible protein B  27.14 
 
 		 548 aa  79.7  0.00000000000006  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>