204 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acry_3015 on replicon NC_009484
Organism: Acidiphilium cryptum JF-5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009484  Acry_3015  hypothetical protein  100 
 
 		 329 aa  668    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.231252  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1320  Mammalian cell entry related domain protein  32.63 
 
 		 337 aa  171  2e-41  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2751  paraquat-inducible ABC-type transporter, periplasmic component  32.95 
 
 		 326 aa  135  9e-31  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1496  Mammalian cell entry related domain protein  31.75 
 
 		 335 aa  131  2.0000000000000002e-29  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.024979  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1072  hypothetical protein  25.93 
 
 		 309 aa  125  9e-28  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4623  hypothetical protein  26.25 
 
 		 334 aa  102  1e-20  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2635  hypothetical protein  29.29 
 
 		 328 aa  100  4e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2416  hypothetical protein  25.85 
 
 		 359 aa  90.1  5e-17  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.186903  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0522  Mammalian cell entry related domain protein  26.15 
 
 		 308 aa  88.2  2e-16  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.629914  normal  0.424693 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0626  ABC transporter permease  23.21 
 
 		 308 aa  83.6  0.000000000000004  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.112844  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0577  hypothetical protein  23.21 
 
 		 308 aa  82.4  0.00000000000001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.749568  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0363  paraquat-inducible protein B  24.75 
 
 		 572 aa  80.5  0.00000000000004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.364646  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0668  hypothetical protein  26.79 
 
 		 330 aa  80.5  0.00000000000004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1960  hypothetical protein  24.33 
 
 		 327 aa  80.1  0.00000000000004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0139154  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0466  Mammalian cell entry related domain protein  25.9 
 
 		 337 aa  79  0.0000000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1015  hypothetical protein  31.55 
 
 		 321 aa  77.4  0.0000000000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_22660  hypothetical protein  26.82 
 
 		 312 aa  76.6  0.0000000000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00283529 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2028  hypothetical protein  25.3 
 
 		 307 aa  76.6  0.0000000000006  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2023  hypothetical protein  24.92 
 
 		 307 aa  75.1  0.000000000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1913  hypothetical protein  26.61 
 
 		 312 aa  73.6  0.000000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3499  hypothetical protein  28.36 
 
 		 324 aa  70.9  0.00000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2447  hypothetical protein  28.05 
 
 		 323 aa  70.9  0.00000000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.106785  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1610  hypothetical protein  24.86 
 
 		 313 aa  68.9  0.0000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1105  paraquat-inducible protein B  24.4 
 
 		 546 aa  68.2  0.0000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.486337  normal  0.0294366 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00955  paraquat-inducible protein B  24.4 
 
 		 546 aa  67.8  0.0000000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.00000262354  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2692  Mammalian cell entry related domain protein  24.4 
 
 		 546 aa  67.8  0.0000000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000610454  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00962  hypothetical protein  24.4 
 
 		 546 aa  67.8  0.0000000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.00000379419  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1139  paraquat-inducible protein B  24.4 
 
 		 546 aa  67.4  0.0000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0102675  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03181  ABC transporter substrate-binding protein  24.83 
 
 		 308 aa  67.4  0.0000000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.721062  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1115  paraquat-inducible protein B  24.4 
 
 		 546 aa  67.4  0.0000000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000291875  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2645  paraquat-inducible protein B  24.4 
 
 		 546 aa  67.8  0.0000000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000298494  hitchhiker  0.00000476211 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1060  paraquat-inducible protein B  24.4 
 
 		 546 aa  67.8  0.0000000003  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000012177  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2368  hypothetical protein  25.93 
 
 		 316 aa  67.4  0.0000000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.709282  normal  0.77833 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1022  paraquat-inducible protein B  24.4 
 
 		 546 aa  67.4  0.0000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00119913  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1173  paraquat-inducible protein B  24.4 
 
 		 546 aa  67.4  0.0000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.371767  normal  0.608659 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1066  paraquat-inducible protein B  24.4 
 
 		 546 aa  67.8  0.0000000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.00000000000823988  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2168  paraquat-inducible protein B  24.4 
 
 		 546 aa  67.8  0.0000000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000764872  normal  0.254429 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1222  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  25.31 
 
 		 308 aa  67.4  0.0000000004  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0743  hypothetical protein  25.31 
 
 		 308 aa  67.4  0.0000000004  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1127  paraquat-inducible protein B  24.4 
 
 		 546 aa  67  0.0000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0201216  normal  0.953621 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1713  hypothetical protein  26.85 
 
 		 356 aa  67  0.0000000005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00000000187754 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0178  Mammalian cell entry related domain protein  24.73 
 
 		 305 aa  67  0.0000000005  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1360  Mammalian cell entry related domain protein  26.01 
 
 		 334 aa  66.6  0.0000000005  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1679  hypothetical protein  28.19 
 
 		 298 aa  66.2  0.0000000008  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2366  paraquat-inducible protein B  24 
 
 		 546 aa  65.9  0.0000000008  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.547013  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1983  hypothetical protein  28.53 
 
 		 343 aa  64.7  0.000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.042136  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1203  hypothetical protein  26.96 
 
 		 310 aa  65.1  0.000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.511791  normal  0.098201 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2674  hypothetical protein  31.52 
 
 		 539 aa  63.9  0.000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.531712  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1156  Mammalian cell entry related domain protein  26.09 
 
 		 313 aa  64.3  0.000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0297  Mammalian cell entry related domain protein  25.51 
 
 		 323 aa  63.2  0.000000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.525082  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3242  Mammalian cell entry related domain protein  24.84 
 
 		 555 aa  63.2  0.000000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2810  hypothetical protein  26.12 
 
 		 311 aa  62.8  0.000000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.177575 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0626  hypothetical protein  29 
 
 		 539 aa  62.8  0.000000008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.735429  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0177  Mammalian cell entry related domain protein  29.58 
 
 		 322 aa  62.8  0.000000008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0602  hypothetical protein  29 
 
 		 539 aa  62.8  0.000000008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.483664  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2948  hypothetical protein  26.12 
 
 		 310 aa  62.8  0.000000008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1056  Mammalian cell entry related domain protein  24.16 
 
 		 322 aa  62  0.00000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0579  hypothetical protein  25.5 
 
 		 546 aa  62  0.00000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.30623  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1683  paraquat-inducible protein B  26.85 
 
 		 548 aa  62.4  0.00000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0170  Mammalian cell entry related domain protein  25.07 
 
 		 322 aa  62.4  0.00000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2744  hypothetical protein  26 
 
 		 315 aa  61.6  0.00000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0811657 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0040  Mammalian cell entry related domain protein  26.85 
 
 		 327 aa  61.6  0.00000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5506  hypothetical protein  25.25 
 
 		 533 aa  61.2  0.00000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.286213  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0371  hypothetical protein  24.85 
 
 		 305 aa  61.6  0.00000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0039  hypothetical protein  23.56 
 
 		 312 aa  60.8  0.00000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.292682  normal  0.178021 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0366  paraquat-inducible protein B  26.43 
 
 		 547 aa  60.8  0.00000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.838729  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2692  hypothetical protein  23.31 
 
 		 688 aa  60.8  0.00000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0140  hypothetical protein  26.57 
 
 		 312 aa  60.5  0.00000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.682464 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4853  paraquat-inducible protein B  25.99 
 
 		 547 aa  60.1  0.00000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00098113 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3509  fibronectin, type III  20.93 
 
 		 537 aa  60.1  0.00000005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.736082  normal  0.990532 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2067  paraquat-inducible protein B  24.2 
 
 		 546 aa  60.1  0.00000005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.883854  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0158  hypothetical protein  26.57 
 
 		 312 aa  59.7  0.00000007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0709  Mammalian cell entry related domain protein  24.75 
 
 		 552 aa  59.3  0.00000009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.381837  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3179  PqiB family protein  25.08 
 
 		 559 aa  58.9  0.0000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.360667  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0651  hypothetical protein  24.35 
 
 		 534 aa  58.5  0.0000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.1317  normal  0.879007 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0315  signal peptide protein  33.33 
 
 		 330 aa  58.2  0.0000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3045  PqiB family protein  24.41 
 
 		 559 aa  58.2  0.0000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.114944  normal  0.0226159 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1652  paraquat-inducible protein B  25.58 
 
 		 548 aa  58.2  0.0000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3139  hypothetical protein  25.17 
 
 		 546 aa  57.8  0.0000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.667877  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4000  putative paraquat-inducible protein  24.75 
 
 		 552 aa  58.5  0.0000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.113556  normal  0.829107 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0156  hypothetical protein  23.94 
 
 		 312 aa  58.2  0.0000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.997452 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2378  paraquat-inducible protein B  28.8 
 
 		 553 aa  57.4  0.0000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.154964  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2135  mce-related protein  33.09 
 
 		 312 aa  57.4  0.0000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1794  paraquat-inducible protein B  23.74 
 
 		 555 aa  57.4  0.0000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2284  hypothetical protein  25.43 
 
 		 309 aa  57.4  0.0000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2899  hypothetical protein  25.43 
 
 		 309 aa  57.4  0.0000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.236087  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1794  Mammalian cell entry related domain protein  33.09 
 
 		 312 aa  57.4  0.0000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0405  hypothetical protein  28.13 
 
 		 309 aa  57.4  0.0000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0144565 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3382  paraquat-inducible protein  28.8 
 
 		 551 aa  57  0.0000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3799  hypothetical protein  29.89 
 
 		 539 aa  57.4  0.0000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.660029  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0292  paraquat-inducible protein B  28.8 
 
 		 551 aa  57  0.0000004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1154  paraquat-inducible protein B  28.8 
 
 		 551 aa  57  0.0000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3340  paraquat-inducible protein B  28.8 
 
 		 551 aa  57  0.0000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.440052  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3374  mce family protein  28.8 
 
 		 551 aa  57  0.0000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2561  mce family protein  28.8 
 
 		 551 aa  57  0.0000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2577  hypothetical protein  25.17 
 
 		 546 aa  57  0.0000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0122207  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0227  hypothetical protein  25.76 
 
 		 539 aa  56.6  0.0000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0711  hypothetical protein  25.76 
 
 		 539 aa  56.6  0.0000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1445  Mammalian cell entry related domain protein  26.21 
 
 		 547 aa  56.6  0.0000006  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.578149  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0678  hypothetical protein  25.76 
 
 		 539 aa  56.6  0.0000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0419217  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>