182 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PC1_1794 on replicon NC_012917
Organism: Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001509  ECD_00955  paraquat-inducible protein B  67.28 
 
 		 546 aa  781    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.00000262354  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2692  Mammalian cell entry related domain protein  67.28 
 
 		 546 aa  781    Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000610454  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1794  paraquat-inducible protein B  100 
 
 		 555 aa  1134    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2638  paraquat-inducible protein B  73.11 
 
 		 550 aa  827    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1173  paraquat-inducible protein B  69.33 
 
 		 546 aa  791    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.371767  normal  0.608659 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1139  paraquat-inducible protein B  69.33 
 
 		 546 aa  791    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0102675  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1652  paraquat-inducible protein B  73.13 
 
 		 548 aa  862    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1990  paraquat-inducible protein B  73.11 
 
 		 550 aa  827    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2366  paraquat-inducible protein B  67.28 
 
 		 546 aa  780    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.547013  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1022  paraquat-inducible protein B  69.33 
 
 		 546 aa  791    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00119913  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1105  paraquat-inducible protein B  69.52 
 
 		 546 aa  793    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.486337  normal  0.0294366 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2645  paraquat-inducible protein B  67.28 
 
 		 546 aa  781    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000298494  hitchhiker  0.00000476211 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1463  paraquat-inducible protein B  69.14 
 
 		 545 aa  790    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0560595  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2067  paraquat-inducible protein B  96.7 
 
 		 546 aa  1064    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.883854  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1115  paraquat-inducible protein B  67.28 
 
 		 546 aa  782    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000291875  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2168  paraquat-inducible protein B  67.46 
 
 		 546 aa  782    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000764872  normal  0.254429 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1683  paraquat-inducible protein B  74.77 
 
 		 548 aa  868    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1127  paraquat-inducible protein B  69.33 
 
 		 546 aa  792    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0201216  normal  0.953621 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2549  paraquat-inducible protein B  73.11 
 
 		 550 aa  827    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0824615  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1060  paraquat-inducible protein B  67.28 
 
 		 546 aa  781    Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000012177  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1066  paraquat-inducible protein B  67.28 
 
 		 546 aa  781    Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.00000000000823988  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00962  hypothetical protein  67.28 
 
 		 546 aa  781    Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.00000379419  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0366  paraquat-inducible protein B  73.08 
 
 		 547 aa  827    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.838729  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1746  paraquat-inducible protein B  77.11 
 
 		 548 aa  877    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0445264  decreased coverage  0.000000731619 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4853  paraquat-inducible protein B  73.63 
 
 		 547 aa  830    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00098113 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2008  hypothetical protein  44.07 
 
 		 547 aa  480  1e-134  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003028  paraquat-inducible protein B  41.34 
 
 		 548 aa  472  1e-132  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02851  hypothetical protein  41.98 
 
 		 548 aa  471  1.0000000000000001e-131  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1352  paraquat-inducible protein B  40.25 
 
 		 547 aa  467  9.999999999999999e-131  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000273869  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1920  hypothetical protein  43.73 
 
 		 554 aa  453  1.0000000000000001e-126  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.976156  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1865  hypothetical protein  42.99 
 
 		 554 aa  449  1e-125  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0867784 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2722  paraquat-inducible protein B  40.64 
 
 		 550 aa  447  1.0000000000000001e-124  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2113  hypothetical protein  43.09 
 
 		 554 aa  448  1.0000000000000001e-124  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.696493  normal  0.025726 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2074  hypothetical protein  38.57 
 
 		 550 aa  409  1e-113  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0955309  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2932  hypothetical protein  39.13 
 
 		 548 aa  408  1.0000000000000001e-112  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1704  hypothetical protein  35.16 
 
 		 554 aa  364  2e-99  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3077  putative paraquat-inducible protein B  34.77 
 
 		 580 aa  364  3e-99  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.198785  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02656  putative paraquat-inducible protein B  34.64 
 
 		 555 aa  337  1.9999999999999998e-91  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.40052  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0257  hypothetical protein  35.15 
 
 		 543 aa  318  2e-85  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0363  paraquat-inducible protein B  33.69 
 
 		 572 aa  305  1.0000000000000001e-81  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.364646  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0328  Mammalian cell entry related domain protein  33.84 
 
 		 552 aa  301  2e-80  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3376  hypothetical protein  32.07 
 
 		 559 aa  295  1e-78  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.166606  normal  0.0325483 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2893  Mammalian cell entry related domain protein  34.19 
 
 		 548 aa  291  2e-77  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.3428  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2679  hypothetical protein  32.29 
 
 		 546 aa  285  1.0000000000000001e-75  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.331347  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0651  hypothetical protein  34.52 
 
 		 534 aa  276  6e-73  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.1317  normal  0.879007 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0579  hypothetical protein  31.3 
 
 		 546 aa  275  2.0000000000000002e-72  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.30623  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44090  PqiB family protein  34.24 
 
 		 537 aa  274  3e-72  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.760607  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1445  Mammalian cell entry related domain protein  31.38 
 
 		 547 aa  271  2e-71  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.578149  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3535  hypothetical protein  31.72 
 
 		 531 aa  271  2e-71  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.128458  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2221  Mammalian cell entry related domain protein  30.7 
 
 		 556 aa  271  2e-71  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000538523 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0530  Mammalian cell entry related domain protein  32.92 
 
 		 547 aa  270  5e-71  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3509  fibronectin, type III  30.7 
 
 		 537 aa  270  5.9999999999999995e-71  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.736082  normal  0.990532 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2127  putative paraquat-inducible transmembrane protein, PqiB  31.82 
 
 		 539 aa  270  5.9999999999999995e-71  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.460028  normal  0.102127 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5506  hypothetical protein  32.94 
 
 		 533 aa  269  8e-71  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.286213  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3242  Mammalian cell entry related domain protein  31.43 
 
 		 555 aa  269  8.999999999999999e-71  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4000  putative paraquat-inducible protein  32.81 
 
 		 552 aa  268  2e-70  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.113556  normal  0.829107 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0517  Mammalian cell entry related domain protein  32.72 
 
 		 547 aa  268  2e-70  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0678  hypothetical protein  30.97 
 
 		 539 aa  266  5.999999999999999e-70  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0419217  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0227  hypothetical protein  30.97 
 
 		 539 aa  266  5.999999999999999e-70  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0711  hypothetical protein  30.97 
 
 		 539 aa  266  5.999999999999999e-70  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2000  Mammalian cell entry related domain protein  31.02 
 
 		 558 aa  266  7e-70  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.939676  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2674  hypothetical protein  31.59 
 
 		 539 aa  266  8.999999999999999e-70  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.531712  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2378  paraquat-inducible protein B  32.07 
 
 		 553 aa  266  1e-69  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.154964  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3045  PqiB family protein  32.29 
 
 		 559 aa  265  1e-69  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.114944  normal  0.0226159 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1268  paraquat-inducible protein B  31.67 
 
 		 551 aa  266  1e-69  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0709  Mammalian cell entry related domain protein  32.42 
 
 		 552 aa  265  1e-69  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.381837  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0292  paraquat-inducible protein B  32.07 
 
 		 551 aa  265  2e-69  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1154  paraquat-inducible protein B  32.07 
 
 		 551 aa  265  2e-69  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2561  mce family protein  32.07 
 
 		 551 aa  265  2e-69  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3382  paraquat-inducible protein  32.07 
 
 		 551 aa  264  3e-69  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3374  mce family protein  32.07 
 
 		 551 aa  264  3e-69  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0040  paraquat-inducible protein  31.74 
 
 		 569 aa  264  4e-69  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  decreased coverage  0.00684202  normal  0.214843 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3340  paraquat-inducible protein B  31.87 
 
 		 551 aa  263  8e-69  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.440052  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0602  hypothetical protein  30.18 
 
 		 539 aa  261  2e-68  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.483664  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0626  hypothetical protein  30.18 
 
 		 539 aa  261  2e-68  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.735429  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2535  hypothetical protein  31.37 
 
 		 544 aa  259  1e-67  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2114  Mammalian cell entry related domain protein  31.87 
 
 		 539 aa  258  2e-67  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3799  hypothetical protein  30.54 
 
 		 539 aa  258  3e-67  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.660029  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2831  hypothetical protein  34.72 
 
 		 551 aa  257  4e-67  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3179  PqiB family protein  32.88 
 
 		 559 aa  257  5e-67  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.360667  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0601  hypothetical protein  32.52 
 
 		 547 aa  256  7e-67  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.184325  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6816  paraquat-inducible protein B'  31.79 
 
 		 556 aa  256  8e-67  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.237593  normal  0.938789 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3139  hypothetical protein  34.19 
 
 		 546 aa  255  2.0000000000000002e-66  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.667877  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2577  hypothetical protein  32.07 
 
 		 546 aa  254  4.0000000000000004e-66  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0122207  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5802  hypothetical protein  30.56 
 
 		 531 aa  254  4.0000000000000004e-66  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.00328946  hitchhiker  0.0014272 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2580  hypothetical protein  32.23 
 
 		 551 aa  254  4.0000000000000004e-66  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.732971 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3288  hypothetical protein  33.59 
 
 		 546 aa  252  1e-65  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4088  paraquat-inducible protein B  32.86 
 
 		 508 aa  252  2e-65  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.141129  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0403  hypothetical protein  32.35 
 
 		 545 aa  251  2e-65  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5278  hypothetical protein  30.35 
 
 		 531 aa  251  2e-65  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1570  hypothetical protein  30.78 
 
 		 538 aa  226  1e-57  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1323  Mammalian cell entry related domain protein  30.39 
 
 		 561 aa  223  6e-57  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.404082  normal  0.550075 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2562  hypothetical protein  31.06 
 
 		 558 aa  218  2.9999999999999998e-55  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0758211  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2692  hypothetical protein  29.71 
 
 		 688 aa  205  1e-51  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3328  hypothetical protein  27.84 
 
 		 694 aa  205  2e-51  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.901171  normal  0.708038 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2391  hypothetical protein  28.51 
 
 		 545 aa  199  1.0000000000000001e-49  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.931506  normal  0.945303 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1571  virulence factor MCE-like protein-related protein  29.86 
 
 		 808 aa  199  1.0000000000000001e-49  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.645853  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1539  hypothetical protein  30.6 
 
 		 880 aa  168  2e-40  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.123668  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62020  paraquat-inducible protein B-like protein  30.9 
 
 		 768 aa  169  2e-40  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0157201 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5396  hypothetical protein  30.9 
 
 		 768 aa  168  2e-40  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>