173 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPS_3077 on replicon NC_003910
Organism: Colwellia psychrerythraea 34H



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003910  CPS_3077  putative paraquat-inducible protein B  100 
 
 		 580 aa  1186    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.198785  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2074  hypothetical protein  57.55 
 
 		 550 aa  666    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0955309  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1704  hypothetical protein  46.3 
 
 		 554 aa  554  1e-156  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02656  putative paraquat-inducible protein B  42.15 
 
 		 555 aa  466  9.999999999999999e-131  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.40052  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1173  paraquat-inducible protein B  35.37 
 
 		 546 aa  383  1e-105  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.371767  normal  0.608659 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1022  paraquat-inducible protein B  35.37 
 
 		 546 aa  383  1e-105  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00119913  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1105  paraquat-inducible protein B  35.55 
 
 		 546 aa  384  1e-105  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.486337  normal  0.0294366 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1127  paraquat-inducible protein B  35.14 
 
 		 546 aa  383  1e-105  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0201216  normal  0.953621 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1139  paraquat-inducible protein B  35.37 
 
 		 546 aa  383  1e-105  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0102675  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1683  paraquat-inducible protein B  36.11 
 
 		 548 aa  381  1e-104  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00955  paraquat-inducible protein B  35.18 
 
 		 546 aa  376  1e-103  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.00000262354  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2692  Mammalian cell entry related domain protein  35.18 
 
 		 546 aa  376  1e-103  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000610454  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00962  hypothetical protein  35.18 
 
 		 546 aa  376  1e-103  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.00000379419  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1115  paraquat-inducible protein B  35.18 
 
 		 546 aa  377  1e-103  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000291875  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2366  paraquat-inducible protein B  35.18 
 
 		 546 aa  376  1e-103  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.547013  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2645  paraquat-inducible protein B  35.18 
 
 		 546 aa  376  1e-103  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000298494  hitchhiker  0.00000476211 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1060  paraquat-inducible protein B  35.18 
 
 		 546 aa  376  1e-103  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000012177  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1066  paraquat-inducible protein B  35.18 
 
 		 546 aa  376  1e-103  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.00000000000823988  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2168  paraquat-inducible protein B  35.18 
 
 		 546 aa  377  1e-103  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000764872  normal  0.254429 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1746  paraquat-inducible protein B  34.93 
 
 		 548 aa  375  1e-102  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0445264  decreased coverage  0.000000731619 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2638  paraquat-inducible protein B  34.95 
 
 		 550 aa  367  1e-100  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2549  paraquat-inducible protein B  34.95 
 
 		 550 aa  367  1e-100  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0824615  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0366  paraquat-inducible protein B  34.89 
 
 		 547 aa  368  1e-100  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.838729  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4853  paraquat-inducible protein B  34.71 
 
 		 547 aa  365  1e-100  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00098113 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1990  paraquat-inducible protein B  34.95 
 
 		 550 aa  367  1e-100  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1652  paraquat-inducible protein B  36.2 
 
 		 548 aa  365  1e-99  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1463  paraquat-inducible protein B  34.59 
 
 		 545 aa  363  7.0000000000000005e-99  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0560595  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02851  hypothetical protein  35.18 
 
 		 548 aa  362  1e-98  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003028  paraquat-inducible protein B  35.73 
 
 		 548 aa  361  2e-98  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2008  hypothetical protein  35.54 
 
 		 547 aa  356  7.999999999999999e-97  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2113  hypothetical protein  36.6 
 
 		 554 aa  356  7.999999999999999e-97  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.696493  normal  0.025726 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1865  hypothetical protein  36.19 
 
 		 554 aa  355  2e-96  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0867784 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1794  paraquat-inducible protein B  34.77 
 
 		 555 aa  349  9e-95  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1920  hypothetical protein  35.75 
 
 		 554 aa  348  1e-94  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.976156  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2067  paraquat-inducible protein B  34.59 
 
 		 546 aa  346  6e-94  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.883854  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2722  paraquat-inducible protein B  32.15 
 
 		 550 aa  327  4.0000000000000003e-88  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1352  paraquat-inducible protein B  32.97 
 
 		 547 aa  327  4.0000000000000003e-88  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000273869  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0257  hypothetical protein  32.52 
 
 		 543 aa  316  7e-85  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2932  hypothetical protein  31.71 
 
 		 548 aa  305  2.0000000000000002e-81  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0328  Mammalian cell entry related domain protein  31.58 
 
 		 552 aa  304  3.0000000000000004e-81  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0363  paraquat-inducible protein B  30.37 
 
 		 572 aa  285  2.0000000000000002e-75  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.364646  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3509  fibronectin, type III  29.84 
 
 		 537 aa  266  5.999999999999999e-70  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.736082  normal  0.990532 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2679  hypothetical protein  29.1 
 
 		 546 aa  263  8e-69  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.331347  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2000  Mammalian cell entry related domain protein  29.39 
 
 		 558 aa  257  4e-67  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.939676  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2221  Mammalian cell entry related domain protein  29.89 
 
 		 556 aa  256  7e-67  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000538523 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2893  Mammalian cell entry related domain protein  28.97 
 
 		 548 aa  254  4.0000000000000004e-66  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.3428  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0579  hypothetical protein  28.84 
 
 		 546 aa  253  1e-65  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.30623  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44090  PqiB family protein  28.65 
 
 		 537 aa  252  1e-65  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.760607  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3535  hypothetical protein  28.28 
 
 		 531 aa  251  2e-65  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.128458  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0530  Mammalian cell entry related domain protein  28.24 
 
 		 547 aa  247  4.9999999999999997e-64  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2831  hypothetical protein  30 
 
 		 551 aa  244  3e-63  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0517  Mammalian cell entry related domain protein  28.06 
 
 		 547 aa  244  3e-63  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2535  hypothetical protein  28.86 
 
 		 544 aa  243  6e-63  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2580  hypothetical protein  29.46 
 
 		 551 aa  243  9e-63  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.732971 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2114  Mammalian cell entry related domain protein  27.93 
 
 		 539 aa  242  1e-62  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3242  Mammalian cell entry related domain protein  28.7 
 
 		 555 aa  242  1e-62  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5802  hypothetical protein  27.89 
 
 		 531 aa  240  5e-62  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.00328946  hitchhiker  0.0014272 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2674  hypothetical protein  26.87 
 
 		 539 aa  240  6.999999999999999e-62  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.531712  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5278  hypothetical protein  28.04 
 
 		 531 aa  239  1e-61  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3382  paraquat-inducible protein  28.01 
 
 		 551 aa  238  2e-61  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3340  paraquat-inducible protein B  28.01 
 
 		 551 aa  238  2e-61  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.440052  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3374  mce family protein  28.01 
 
 		 551 aa  238  2e-61  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0626  hypothetical protein  27.09 
 
 		 539 aa  237  4e-61  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.735429  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6816  paraquat-inducible protein B'  28.8 
 
 		 556 aa  237  4e-61  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.237593  normal  0.938789 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3799  hypothetical protein  27.09 
 
 		 539 aa  237  4e-61  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.660029  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0227  hypothetical protein  27.27 
 
 		 539 aa  237  4e-61  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0602  hypothetical protein  27.09 
 
 		 539 aa  237  4e-61  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.483664  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0711  hypothetical protein  27.27 
 
 		 539 aa  237  4e-61  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3376  hypothetical protein  27.08 
 
 		 559 aa  237  4e-61  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.166606  normal  0.0325483 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0678  hypothetical protein  27.27 
 
 		 539 aa  237  4e-61  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0419217  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0292  paraquat-inducible protein B  28.01 
 
 		 551 aa  237  5.0000000000000005e-61  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1154  paraquat-inducible protein B  28.01 
 
 		 551 aa  237  5.0000000000000005e-61  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2561  mce family protein  28.01 
 
 		 551 aa  237  5.0000000000000005e-61  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2378  paraquat-inducible protein B  28.01 
 
 		 553 aa  237  6e-61  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.154964  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1268  paraquat-inducible protein B  27.64 
 
 		 551 aa  236  6e-61  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0403  hypothetical protein  29.43 
 
 		 545 aa  236  7e-61  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0040  paraquat-inducible protein  27.96 
 
 		 569 aa  236  9e-61  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  decreased coverage  0.00684202  normal  0.214843 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1445  Mammalian cell entry related domain protein  27.79 
 
 		 547 aa  236  1.0000000000000001e-60  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.578149  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5506  hypothetical protein  28.21 
 
 		 533 aa  236  1.0000000000000001e-60  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.286213  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0601  hypothetical protein  27.07 
 
 		 547 aa  235  2.0000000000000002e-60  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.184325  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4000  putative paraquat-inducible protein  27.16 
 
 		 552 aa  235  2.0000000000000002e-60  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.113556  normal  0.829107 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4088  paraquat-inducible protein B  28.7 
 
 		 508 aa  234  3e-60  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.141129  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0709  Mammalian cell entry related domain protein  26.97 
 
 		 552 aa  234  4.0000000000000004e-60  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.381837  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2127  putative paraquat-inducible transmembrane protein, PqiB  27.46 
 
 		 539 aa  233  5e-60  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.460028  normal  0.102127 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0651  hypothetical protein  26.57 
 
 		 534 aa  232  1e-59  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.1317  normal  0.879007 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3288  hypothetical protein  28.65 
 
 		 546 aa  229  8e-59  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3139  hypothetical protein  28.19 
 
 		 546 aa  227  5.0000000000000005e-58  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.667877  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3179  PqiB family protein  29.03 
 
 		 559 aa  227  6e-58  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.360667  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2577  hypothetical protein  28.28 
 
 		 546 aa  226  9e-58  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0122207  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3045  PqiB family protein  28.9 
 
 		 559 aa  220  3.9999999999999997e-56  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.114944  normal  0.0226159 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1571  virulence factor MCE-like protein-related protein  26.33 
 
 		 808 aa  219  7.999999999999999e-56  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.645853  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3328  hypothetical protein  27.89 
 
 		 694 aa  213  9e-54  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.901171  normal  0.708038 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1323  Mammalian cell entry related domain protein  26.39 
 
 		 561 aa  211  3e-53  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.404082  normal  0.550075 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2692  hypothetical protein  26.39 
 
 		 688 aa  204  3e-51  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2562  hypothetical protein  27.17 
 
 		 558 aa  200  6e-50  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0758211  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1570  hypothetical protein  26.04 
 
 		 538 aa  196  1e-48  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5396  hypothetical protein  30.56 
 
 		 768 aa  186  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62020  paraquat-inducible protein B-like protein  31.29 
 
 		 768 aa  185  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0157201 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1539  hypothetical protein  31.8 
 
 		 880 aa  182  2e-44  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.123668  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0645  hypothetical protein  31.29 
 
 		 769 aa  181  4e-44  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0122805 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>