155 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputGB1_0645 on replicon NC_010322
Organism: Pseudomonas putida GB-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002947  PP_0599  hypothetical protein  97.39 
 
 		 766 aa  1511    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.649359  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4780  hypothetical protein  77.05 
 
 		 767 aa  1238    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0797853 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4563  hypothetical protein  95.56 
 
 		 766 aa  1483    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.816323  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_36020  paraquat-inducible protein B  64.02 
 
 		 767 aa  1003    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000370976 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62020  paraquat-inducible protein B-like protein  64.31 
 
 		 768 aa  1006    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0157201 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42450  hypothetical protein  72.01 
 
 		 771 aa  1136    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1015  hypothetical protein  70.53 
 
 		 767 aa  1115    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.428496  normal  0.236638 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0640  hypothetical protein  97.66 
 
 		 769 aa  1521    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.591879  normal  0.219756 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5396  hypothetical protein  64.31 
 
 		 768 aa  1006    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0645  hypothetical protein  100 
 
 		 769 aa  1552    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0122805 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0281  PqiB family protein  34.77 
 
 		 1035 aa  455  1.0000000000000001e-126  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1109  hypothetical protein  31.19 
 
 		 879 aa  331  3e-89  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.281833  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1539  hypothetical protein  30.35 
 
 		 880 aa  328  2.0000000000000001e-88  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.123668  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1779  hypothetical protein  30.76 
 
 		 876 aa  323  8e-87  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.284568  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2127  hypothetical protein  30.7 
 
 		 874 aa  319  1e-85  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.182748  normal  0.142819 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1668  mce family protein  30.59 
 
 		 883 aa  317  4e-85  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00393452  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2667  hypothetical protein  30.59 
 
 		 883 aa  317  5e-85  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.209056  normal  0.0159074 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2137  Mammalian cell entry related domain protein  31.7 
 
 		 880 aa  317  6e-85  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.726628  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2453  hypothetical protein  33.5 
 
 		 879 aa  317  7e-85  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.552902  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2566  hypothetical protein  33.33 
 
 		 879 aa  315  1.9999999999999998e-84  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.830034  normal  0.124645 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1898  Mammalian cell entry related domain protein  33.33 
 
 		 879 aa  315  2.9999999999999996e-84  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0890151  normal  0.35094 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2223  hypothetical protein  27.86 
 
 		 890 aa  314  2.9999999999999996e-84  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.280111  normal  0.190601 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2446  hypothetical protein  33.33 
 
 		 879 aa  314  3.9999999999999997e-84  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.000190027  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1849  Mammalian cell entry related domain protein  31.22 
 
 		 880 aa  313  6.999999999999999e-84  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.608446  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2404  hypothetical protein  31.45 
 
 		 877 aa  311  2e-83  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1742  hypothetical protein  33.05 
 
 		 878 aa  311  2.9999999999999997e-83  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.893513  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1667  hypothetical protein  33.05 
 
 		 878 aa  311  4e-83  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.479229  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2234  hypothetical protein  32.08 
 
 		 881 aa  310  5.9999999999999995e-83  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.788365  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1772  hypothetical protein  32.6 
 
 		 878 aa  310  6.999999999999999e-83  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.91737  normal  0.173538 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2606  PqiB family protein  33.39 
 
 		 869 aa  309  1.0000000000000001e-82  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1716  hypothetical protein  30.93 
 
 		 883 aa  308  2.0000000000000002e-82  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.122105  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2208  hypothetical protein  32.37 
 
 		 881 aa  305  2.0000000000000002e-81  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02351  hypothetical protein  29.03 
 
 		 884 aa  305  3.0000000000000004e-81  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1929  hypothetical protein  30.58 
 
 		 876 aa  303  7.000000000000001e-81  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.379281  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2078  Mammalian cell entry related domain protein  31.11 
 
 		 876 aa  302  2e-80  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.858989  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2489  virulence factor MCE-like protein  32.25 
 
 		 874 aa  300  5e-80  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.336956  normal  0.349105 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1796  hypothetical protein  32.19 
 
 		 874 aa  298  2e-79  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.738799  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2063  mce-related protein  30.16 
 
 		 879 aa  292  2e-77  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0411122  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01805  hypothetical protein  30.16 
 
 		 877 aa  291  3e-77  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.877807  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01793  hypothetical protein  30.16 
 
 		 877 aa  291  3e-77  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1925  mce-related protein  30.16 
 
 		 879 aa  291  3e-77  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00368027  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1798  hypothetical protein  30.16 
 
 		 877 aa  291  3e-77  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.604041  normal  0.0674591 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2567  mce-related protein  29.79 
 
 		 879 aa  291  5.0000000000000004e-77  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.160689  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1841  Mammalian cell entry related domain protein  30.41 
 
 		 876 aa  290  7e-77  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1808  Mammalian cell entry related domain protein  30.01 
 
 		 877 aa  289  1e-76  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0324574  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2102  mce-related protein  30.01 
 
 		 879 aa  288  2e-76  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000578956  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1282  mce-related protein  30.21 
 
 		 877 aa  288  2e-76  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000164876  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1992  mce-related protein  30.08 
 
 		 879 aa  288  2e-76  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1466  mce-related protein  30.07 
 
 		 877 aa  288  2.9999999999999996e-76  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.62714  normal  0.15186 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1988  mce-related protein  30.08 
 
 		 879 aa  288  2.9999999999999996e-76  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00626047 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2050  mce-related protein  30.21 
 
 		 877 aa  288  2.9999999999999996e-76  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.103459  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1353  mce-related protein  30.01 
 
 		 879 aa  286  8e-76  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0226456  normal  0.0741452 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1579  virulence factor MCE-like protein related  30.97 
 
 		 871 aa  284  4.0000000000000003e-75  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0624926  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003426  paraquat-inducible protein B  28.53 
 
 		 833 aa  265  2e-69  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.55092  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1068  hypothetical protein  30.52 
 
 		 881 aa  261  3e-68  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.439473  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44090  PqiB family protein  38.27 
 
 		 537 aa  217  7e-55  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.760607  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3179  PqiB family protein  37.8 
 
 		 559 aa  215  2.9999999999999995e-54  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.360667  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3045  PqiB family protein  37.2 
 
 		 559 aa  213  1e-53  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.114944  normal  0.0226159 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0403  hypothetical protein  37.01 
 
 		 545 aa  212  2e-53  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3288  hypothetical protein  35 
 
 		 546 aa  212  2e-53  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2577  hypothetical protein  34.38 
 
 		 546 aa  211  4e-53  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0122207  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0257  hypothetical protein  37.22 
 
 		 543 aa  211  6e-53  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0363  paraquat-inducible protein B  36.56 
 
 		 572 aa  208  2e-52  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.364646  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0328  Mammalian cell entry related domain protein  38.17 
 
 		 552 aa  209  2e-52  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3139  hypothetical protein  34.38 
 
 		 546 aa  209  2e-52  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.667877  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1323  Mammalian cell entry related domain protein  33.42 
 
 		 561 aa  208  4e-52  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.404082  normal  0.550075 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3509  fibronectin, type III  36.81 
 
 		 537 aa  207  5e-52  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.736082  normal  0.990532 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1445  Mammalian cell entry related domain protein  36.36 
 
 		 547 aa  207  5e-52  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.578149  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2580  hypothetical protein  34.63 
 
 		 551 aa  207  8e-52  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.732971 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2831  hypothetical protein  36.51 
 
 		 551 aa  203  9.999999999999999e-51  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2221  Mammalian cell entry related domain protein  36.22 
 
 		 556 aa  202  1.9999999999999998e-50  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000538523 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2000  Mammalian cell entry related domain protein  36.42 
 
 		 558 aa  202  1.9999999999999998e-50  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.939676  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5506  hypothetical protein  34.88 
 
 		 533 aa  199  2.0000000000000003e-49  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.286213  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0579  hypothetical protein  35.62 
 
 		 546 aa  197  8.000000000000001e-49  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.30623  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6816  paraquat-inducible protein B'  35.76 
 
 		 556 aa  196  2e-48  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.237593  normal  0.938789 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2074  hypothetical protein  32.28 
 
 		 550 aa  194  6e-48  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0955309  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5802  hypothetical protein  34.77 
 
 		 531 aa  193  8e-48  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.00328946  hitchhiker  0.0014272 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4000  putative paraquat-inducible protein  31.49 
 
 		 552 aa  192  2e-47  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.113556  normal  0.829107 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3340  paraquat-inducible protein B  34.64 
 
 		 551 aa  192  2e-47  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.440052  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0709  Mammalian cell entry related domain protein  33.42 
 
 		 552 aa  192  2e-47  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.381837  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2114  Mammalian cell entry related domain protein  36.19 
 
 		 539 aa  191  4e-47  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3382  paraquat-inducible protein  34.34 
 
 		 551 aa  191  5e-47  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3374  mce family protein  34.34 
 
 		 551 aa  191  5e-47  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2378  paraquat-inducible protein B  34.34 
 
 		 553 aa  190  7e-47  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.154964  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0292  paraquat-inducible protein B  34.34 
 
 		 551 aa  190  7e-47  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1154  paraquat-inducible protein B  34.34 
 
 		 551 aa  190  7e-47  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2561  mce family protein  34.34 
 
 		 551 aa  190  7e-47  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1268  paraquat-inducible protein B  34.34 
 
 		 551 aa  190  8e-47  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3535  hypothetical protein  35.06 
 
 		 531 aa  188  3e-46  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.128458  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0227  hypothetical protein  34.43 
 
 		 539 aa  187  4e-46  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0711  hypothetical protein  34.43 
 
 		 539 aa  187  4e-46  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0678  hypothetical protein  34.43 
 
 		 539 aa  187  4e-46  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0419217  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3242  Mammalian cell entry related domain protein  36.11 
 
 		 555 aa  187  9e-46  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0530  Mammalian cell entry related domain protein  35 
 
 		 547 aa  186  1.0000000000000001e-45  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0626  hypothetical protein  34.21 
 
 		 539 aa  186  1.0000000000000001e-45  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.735429  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003028  paraquat-inducible protein B  36.17 
 
 		 548 aa  186  1.0000000000000001e-45  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0602  hypothetical protein  34.21 
 
 		 539 aa  186  1.0000000000000001e-45  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.483664  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0517  Mammalian cell entry related domain protein  35 
 
 		 547 aa  186  1.0000000000000001e-45  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1704  hypothetical protein  34.65 
 
 		 554 aa  186  2.0000000000000003e-45  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0040  paraquat-inducible protein  36.36 
 
 		 569 aa  186  2.0000000000000003e-45  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  decreased coverage  0.00684202  normal  0.214843 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>