155 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene HS_1068 on replicon NC_008309
Organism: Haemophilus somnus 129PT



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011353  ECH74115_2567  mce-related protein  40.48 
 
 		 879 aa  744    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.160689  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01805  hypothetical protein  40.48 
 
 		 877 aa  745    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.877807  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1808  Mammalian cell entry related domain protein  40.48 
 
 		 877 aa  746    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0324574  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1988  mce-related protein  40.8 
 
 		 879 aa  729    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00626047 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2050  mce-related protein  40.71 
 
 		 877 aa  729    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.103459  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2078  Mammalian cell entry related domain protein  40.55 
 
 		 876 aa  736    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.858989  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1068  hypothetical protein  100 
 
 		 881 aa  1789    Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.439473  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01793  hypothetical protein  40.48 
 
 		 877 aa  745    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1841  Mammalian cell entry related domain protein  40.6 
 
 		 876 aa  730    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1849  Mammalian cell entry related domain protein  40.67 
 
 		 880 aa  738    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.608446  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1282  mce-related protein  40.71 
 
 		 877 aa  731    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000164876  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2404  hypothetical protein  39.72 
 
 		 877 aa  724    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2137  Mammalian cell entry related domain protein  40.32 
 
 		 880 aa  730    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.726628  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1668  mce family protein  41.49 
 
 		 883 aa  754    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00393452  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1925  mce-related protein  40.48 
 
 		 879 aa  745    Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00368027  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2102  mce-related protein  40.25 
 
 		 879 aa  739    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000578956  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2063  mce-related protein  40.37 
 
 		 879 aa  743    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0411122  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1992  mce-related protein  40.71 
 
 		 879 aa  729    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2667  hypothetical protein  41.37 
 
 		 883 aa  751    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.209056  normal  0.0159074 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1779  hypothetical protein  41.49 
 
 		 876 aa  752    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.284568  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1798  hypothetical protein  40.48 
 
 		 877 aa  745    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.604041  normal  0.0674591 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1466  mce-related protein  40.6 
 
 		 877 aa  729    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.62714  normal  0.15186 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1353  mce-related protein  40.6 
 
 		 879 aa  744    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0226456  normal  0.0741452 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02351  hypothetical protein  34.66 
 
 		 884 aa  562  1.0000000000000001e-159  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1539  hypothetical protein  33.64 
 
 		 880 aa  557  1e-157  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.123668  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1109  hypothetical protein  33.14 
 
 		 879 aa  530  1e-149  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.281833  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003426  paraquat-inducible protein B  34.17 
 
 		 833 aa  523  1e-147  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.55092  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2566  hypothetical protein  30.34 
 
 		 879 aa  416  9.999999999999999e-116  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.830034  normal  0.124645 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2446  hypothetical protein  30.34 
 
 		 879 aa  416  1e-114  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.000190027  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1898  Mammalian cell entry related domain protein  30.01 
 
 		 879 aa  414  1e-114  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0890151  normal  0.35094 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2489  virulence factor MCE-like protein  30.24 
 
 		 874 aa  413  1e-114  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.336956  normal  0.349105 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2453  hypothetical protein  30.11 
 
 		 879 aa  411  1e-113  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.552902  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2127  hypothetical protein  30.24 
 
 		 874 aa  407  1.0000000000000001e-112  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.182748  normal  0.142819 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2223  hypothetical protein  29 
 
 		 890 aa  407  1.0000000000000001e-112  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.280111  normal  0.190601 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1796  hypothetical protein  29.24 
 
 		 874 aa  409  1.0000000000000001e-112  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.738799  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1667  hypothetical protein  30 
 
 		 878 aa  398  1e-109  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.479229  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2208  hypothetical protein  30.11 
 
 		 881 aa  397  1e-109  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2606  PqiB family protein  29.11 
 
 		 869 aa  393  1e-108  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1742  hypothetical protein  29.85 
 
 		 878 aa  395  1e-108  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.893513  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2234  hypothetical protein  29.17 
 
 		 881 aa  383  1e-105  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.788365  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1772  hypothetical protein  29.61 
 
 		 878 aa  386  1e-105  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.91737  normal  0.173538 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1929  hypothetical protein  29.23 
 
 		 876 aa  367  1e-100  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.379281  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1579  virulence factor MCE-like protein related  28.88 
 
 		 871 aa  357  3.9999999999999996e-97  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0624926  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1716  hypothetical protein  27.9 
 
 		 883 aa  357  5.999999999999999e-97  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.122105  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0281  PqiB family protein  27.06 
 
 		 1035 aa  292  2e-77  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42450  hypothetical protein  26.76 
 
 		 771 aa  267  5.999999999999999e-70  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4780  hypothetical protein  27.8 
 
 		 767 aa  266  1e-69  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0797853 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0640  hypothetical protein  30.52 
 
 		 769 aa  266  1e-69  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.591879  normal  0.219756 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4563  hypothetical protein  31.39 
 
 		 766 aa  265  3e-69  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.816323  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0599  hypothetical protein  30.47 
 
 		 766 aa  264  6e-69  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.649359  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1015  hypothetical protein  27.5 
 
 		 767 aa  264  6.999999999999999e-69  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.428496  normal  0.236638 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0645  hypothetical protein  30.52 
 
 		 769 aa  261  4e-68  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0122805 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62020  paraquat-inducible protein B-like protein  26.03 
 
 		 768 aa  259  1e-67  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0157201 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5396  hypothetical protein  25.74 
 
 		 768 aa  256  2.0000000000000002e-66  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_36020  paraquat-inducible protein B  25.6 
 
 		 767 aa  251  5e-65  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000370976 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3509  fibronectin, type III  33.21 
 
 		 537 aa  187  6e-46  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.736082  normal  0.990532 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3288  hypothetical protein  36.23 
 
 		 546 aa  187  6e-46  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2577  hypothetical protein  36.6 
 
 		 546 aa  187  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0122207  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3139  hypothetical protein  36.23 
 
 		 546 aa  186  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.667877  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0363  paraquat-inducible protein B  30.99 
 
 		 572 aa  185  4.0000000000000006e-45  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.364646  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2831  hypothetical protein  34.94 
 
 		 551 aa  177  8e-43  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44090  PqiB family protein  33.33 
 
 		 537 aa  175  3.9999999999999995e-42  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.760607  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5506  hypothetical protein  36.43 
 
 		 533 aa  175  3.9999999999999995e-42  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.286213  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0601  hypothetical protein  33.33 
 
 		 547 aa  173  1e-41  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.184325  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0403  hypothetical protein  32.18 
 
 		 545 aa  173  1e-41  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2580  hypothetical protein  35.07 
 
 		 551 aa  172  4e-41  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.732971 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0530  Mammalian cell entry related domain protein  33.97 
 
 		 547 aa  169  2e-40  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2893  Mammalian cell entry related domain protein  35.02 
 
 		 548 aa  169  2e-40  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.3428  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1445  Mammalian cell entry related domain protein  32.24 
 
 		 547 aa  169  2e-40  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.578149  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0651  hypothetical protein  33.66 
 
 		 534 aa  168  4e-40  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.1317  normal  0.879007 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0517  Mammalian cell entry related domain protein  33.33 
 
 		 547 aa  168  4e-40  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2113  hypothetical protein  28.87 
 
 		 554 aa  167  5.9999999999999996e-40  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.696493  normal  0.025726 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0257  hypothetical protein  32.28 
 
 		 543 aa  167  8e-40  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3179  PqiB family protein  33.21 
 
 		 559 aa  167  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.360667  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3045  PqiB family protein  32.73 
 
 		 559 aa  166  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.114944  normal  0.0226159 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1865  hypothetical protein  29.17 
 
 		 554 aa  165  3e-39  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0867784 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0131  hypothetical protein  32.53 
 
 		 306 aa  165  4.0000000000000004e-39  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.822942  normal  0.934019 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6816  paraquat-inducible protein B'  33.96 
 
 		 556 aa  164  5.0000000000000005e-39  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.237593  normal  0.938789 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1704  hypothetical protein  30.74 
 
 		 554 aa  164  5.0000000000000005e-39  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1920  hypothetical protein  29.24 
 
 		 554 aa  162  2e-38  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.976156  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2000  Mammalian cell entry related domain protein  30.82 
 
 		 558 aa  162  3e-38  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.939676  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2074  hypothetical protein  30.22 
 
 		 550 aa  161  5e-38  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0955309  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0579  hypothetical protein  31.58 
 
 		 546 aa  160  1e-37  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.30623  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0602  hypothetical protein  32.31 
 
 		 539 aa  158  3e-37  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.483664  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0626  hypothetical protein  32.31 
 
 		 539 aa  158  3e-37  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.735429  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2127  putative paraquat-inducible transmembrane protein, PqiB  34.89 
 
 		 539 aa  157  7e-37  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.460028  normal  0.102127 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4088  paraquat-inducible protein B  33.59 
 
 		 508 aa  157  8e-37  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.141129  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0678  hypothetical protein  31.92 
 
 		 539 aa  156  1e-36  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0419217  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0227  hypothetical protein  31.92 
 
 		 539 aa  156  1e-36  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0711  hypothetical protein  31.92 
 
 		 539 aa  156  1e-36  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2679  hypothetical protein  32.54 
 
 		 546 aa  156  2e-36  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.331347  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2221  Mammalian cell entry related domain protein  29.18 
 
 		 556 aa  156  2e-36  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000538523 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3242  Mammalian cell entry related domain protein  32.18 
 
 		 555 aa  156  2e-36  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1323  Mammalian cell entry related domain protein  29.26 
 
 		 561 aa  155  2.9999999999999998e-36  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.404082  normal  0.550075 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3328  hypothetical protein  30.91 
 
 		 694 aa  155  2.9999999999999998e-36  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.901171  normal  0.708038 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1683  paraquat-inducible protein B  29.71 
 
 		 548 aa  155  2.9999999999999998e-36  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2674  hypothetical protein  31.92 
 
 		 539 aa  155  2.9999999999999998e-36  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.531712  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3799  hypothetical protein  31.23 
 
 		 539 aa  154  7e-36  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.660029  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5802  hypothetical protein  29.72 
 
 		 531 aa  154  7e-36  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.00328946  hitchhiker  0.0014272 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1990  paraquat-inducible protein B  31.46 
 
 		 550 aa  154  7e-36  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>