155 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ping_2223 on replicon NC_008709
Organism: Psychromonas ingrahamii 37



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008709  Ping_2223  hypothetical protein  100 
 
 		 890 aa  1797    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.280111  normal  0.190601 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1539  hypothetical protein  33.63 
 
 		 880 aa  524  1e-147  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.123668  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1109  hypothetical protein  31.82 
 
 		 879 aa  513  1e-144  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.281833  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02351  hypothetical protein  31.98 
 
 		 884 aa  510  1e-143  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003426  paraquat-inducible protein B  31.04 
 
 		 833 aa  480  1e-134  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.55092  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2489  virulence factor MCE-like protein  32.85 
 
 		 874 aa  448  1.0000000000000001e-124  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.336956  normal  0.349105 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1849  Mammalian cell entry related domain protein  30.25 
 
 		 880 aa  443  1e-123  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.608446  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2137  Mammalian cell entry related domain protein  31.22 
 
 		 880 aa  446  1e-123  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.726628  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2127  hypothetical protein  32.5 
 
 		 874 aa  440  9.999999999999999e-123  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.182748  normal  0.142819 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1841  Mammalian cell entry related domain protein  31.1 
 
 		 876 aa  439  1e-121  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1796  hypothetical protein  31.45 
 
 		 874 aa  436  1e-120  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.738799  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2078  Mammalian cell entry related domain protein  30.25 
 
 		 876 aa  431  1e-119  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.858989  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1929  hypothetical protein  31.9 
 
 		 876 aa  432  1e-119  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.379281  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2234  hypothetical protein  31.99 
 
 		 881 aa  429  1e-118  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.788365  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1898  Mammalian cell entry related domain protein  30.93 
 
 		 879 aa  426  1e-118  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0890151  normal  0.35094 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2453  hypothetical protein  30.81 
 
 		 879 aa  426  1e-117  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.552902  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2446  hypothetical protein  30.81 
 
 		 879 aa  423  1e-117  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.000190027  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2566  hypothetical protein  30.93 
 
 		 879 aa  425  1e-117  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.830034  normal  0.124645 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1716  hypothetical protein  31.69 
 
 		 883 aa  419  1e-116  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.122105  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1668  mce family protein  30.11 
 
 		 883 aa  422  1e-116  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00393452  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2667  hypothetical protein  30.11 
 
 		 883 aa  422  1e-116  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.209056  normal  0.0159074 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2606  PqiB family protein  30.58 
 
 		 869 aa  417  9.999999999999999e-116  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1667  hypothetical protein  30.66 
 
 		 878 aa  419  9.999999999999999e-116  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.479229  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1772  hypothetical protein  30.58 
 
 		 878 aa  419  9.999999999999999e-116  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.91737  normal  0.173538 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2208  hypothetical protein  31.5 
 
 		 881 aa  419  9.999999999999999e-116  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1779  hypothetical protein  29.95 
 
 		 876 aa  419  9.999999999999999e-116  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.284568  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01805  hypothetical protein  29.98 
 
 		 877 aa  414  1e-114  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.877807  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1808  Mammalian cell entry related domain protein  29.98 
 
 		 877 aa  415  1e-114  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0324574  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01793  hypothetical protein  29.98 
 
 		 877 aa  414  1e-114  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2102  mce-related protein  29.98 
 
 		 879 aa  414  1e-114  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000578956  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1925  mce-related protein  29.98 
 
 		 879 aa  414  1e-114  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00368027  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2063  mce-related protein  29.98 
 
 		 879 aa  414  1e-114  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0411122  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1798  hypothetical protein  29.98 
 
 		 877 aa  414  1e-114  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.604041  normal  0.0674591 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1742  hypothetical protein  30.06 
 
 		 878 aa  412  1e-113  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.893513  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2567  mce-related protein  29.87 
 
 		 879 aa  412  1e-113  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.160689  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1353  mce-related protein  30.09 
 
 		 879 aa  412  1e-113  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0226456  normal  0.0741452 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1068  hypothetical protein  29 
 
 		 881 aa  407  1.0000000000000001e-112  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.439473  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1579  virulence factor MCE-like protein related  31.8 
 
 		 871 aa  408  1.0000000000000001e-112  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0624926  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1992  mce-related protein  29.22 
 
 		 879 aa  404  1e-111  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2404  hypothetical protein  29.53 
 
 		 877 aa  404  1e-111  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2050  mce-related protein  29.11 
 
 		 877 aa  401  9.999999999999999e-111  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.103459  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1466  mce-related protein  29 
 
 		 877 aa  401  9.999999999999999e-111  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.62714  normal  0.15186 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1282  mce-related protein  29.11 
 
 		 877 aa  402  9.999999999999999e-111  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000164876  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1988  mce-related protein  29.11 
 
 		 879 aa  402  9.999999999999999e-111  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00626047 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0599  hypothetical protein  28.29 
 
 		 766 aa  315  2.9999999999999996e-84  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.649359  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0640  hypothetical protein  27.86 
 
 		 769 aa  315  2.9999999999999996e-84  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.591879  normal  0.219756 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0645  hypothetical protein  27.86 
 
 		 769 aa  314  3.9999999999999997e-84  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0122805 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4563  hypothetical protein  27.68 
 
 		 766 aa  307  5.0000000000000004e-82  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.816323  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42450  hypothetical protein  28.31 
 
 		 771 aa  304  5.000000000000001e-81  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4780  hypothetical protein  27.51 
 
 		 767 aa  291  3e-77  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0797853 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62020  paraquat-inducible protein B-like protein  27.41 
 
 		 768 aa  282  2e-74  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0157201 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5396  hypothetical protein  27.41 
 
 		 768 aa  281  5e-74  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1015  hypothetical protein  26.24 
 
 		 767 aa  278  3e-73  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.428496  normal  0.236638 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_36020  paraquat-inducible protein B  27.92 
 
 		 767 aa  275  4.0000000000000004e-72  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000370976 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0281  PqiB family protein  26.58 
 
 		 1035 aa  251  5e-65  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3509  fibronectin, type III  33.43 
 
 		 537 aa  186  1.0000000000000001e-45  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.736082  normal  0.990532 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0363  paraquat-inducible protein B  29.72 
 
 		 572 aa  184  7e-45  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.364646  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3077  putative paraquat-inducible protein B  32.72 
 
 		 580 aa  179  2e-43  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.198785  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2577  hypothetical protein  31.6 
 
 		 546 aa  176  9.999999999999999e-43  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0122207  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44090  PqiB family protein  31.01 
 
 		 537 aa  175  2.9999999999999996e-42  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.760607  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3139  hypothetical protein  31.5 
 
 		 546 aa  175  2.9999999999999996e-42  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.667877  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3288  hypothetical protein  31.6 
 
 		 546 aa  175  3.9999999999999995e-42  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2113  hypothetical protein  29.84 
 
 		 554 aa  174  5e-42  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.696493  normal  0.025726 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1865  hypothetical protein  29.84 
 
 		 554 aa  172  2e-41  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0867784 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1704  hypothetical protein  32.52 
 
 		 554 aa  171  6e-41  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6816  paraquat-inducible protein B'  29.41 
 
 		 556 aa  171  8e-41  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.237593  normal  0.938789 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2074  hypothetical protein  29.19 
 
 		 550 aa  170  1e-40  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0955309  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1920  hypothetical protein  29.51 
 
 		 554 aa  169  2e-40  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.976156  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3179  PqiB family protein  30 
 
 		 559 aa  169  2.9999999999999998e-40  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.360667  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2127  putative paraquat-inducible transmembrane protein, PqiB  29.87 
 
 		 539 aa  168  4e-40  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.460028  normal  0.102127 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2549  paraquat-inducible protein B  30.86 
 
 		 550 aa  167  5.9999999999999996e-40  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0824615  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1990  paraquat-inducible protein B  30.86 
 
 		 550 aa  167  5.9999999999999996e-40  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2638  paraquat-inducible protein B  30.86 
 
 		 550 aa  167  5.9999999999999996e-40  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2831  hypothetical protein  30.06 
 
 		 551 aa  167  8e-40  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2114  Mammalian cell entry related domain protein  29.25 
 
 		 539 aa  167  8e-40  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0517  Mammalian cell entry related domain protein  31.72 
 
 		 547 aa  167  9e-40  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2008  hypothetical protein  29.29 
 
 		 547 aa  166  1.0000000000000001e-39  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0366  paraquat-inducible protein B  30.56 
 
 		 547 aa  166  1.0000000000000001e-39  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.838729  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0530  Mammalian cell entry related domain protein  31.68 
 
 		 547 aa  166  2.0000000000000002e-39  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1445  Mammalian cell entry related domain protein  30.33 
 
 		 547 aa  166  2.0000000000000002e-39  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.578149  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0709  Mammalian cell entry related domain protein  29.87 
 
 		 552 aa  165  3e-39  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.381837  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0626  hypothetical protein  29.25 
 
 		 539 aa  164  5.0000000000000005e-39  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.735429  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0602  hypothetical protein  29.25 
 
 		 539 aa  164  5.0000000000000005e-39  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.483664  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4000  putative paraquat-inducible protein  29.87 
 
 		 552 aa  164  8.000000000000001e-39  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.113556  normal  0.829107 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0678  hypothetical protein  28.93 
 
 		 539 aa  164  9e-39  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0419217  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3045  PqiB family protein  29.48 
 
 		 559 aa  164  9e-39  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.114944  normal  0.0226159 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0227  hypothetical protein  28.93 
 
 		 539 aa  164  9e-39  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0711  hypothetical protein  28.93 
 
 		 539 aa  164  9e-39  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2000  Mammalian cell entry related domain protein  30.21 
 
 		 558 aa  163  1e-38  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.939676  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00955  paraquat-inducible protein B  30.57 
 
 		 546 aa  163  2e-38  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.00000262354  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2692  Mammalian cell entry related domain protein  30.57 
 
 		 546 aa  163  2e-38  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000610454  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00962  hypothetical protein  30.57 
 
 		 546 aa  163  2e-38  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.00000379419  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4088  paraquat-inducible protein B  31.43 
 
 		 508 aa  162  2e-38  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.141129  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0040  paraquat-inducible protein  31.51 
 
 		 569 aa  162  2e-38  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  decreased coverage  0.00684202  normal  0.214843 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1060  paraquat-inducible protein B  30.57 
 
 		 546 aa  163  2e-38  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000012177  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1066  paraquat-inducible protein B  30.57 
 
 		 546 aa  163  2e-38  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.00000000000823988  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4853  paraquat-inducible protein B  30.12 
 
 		 547 aa  163  2e-38  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00098113 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2645  paraquat-inducible protein B  30.57 
 
 		 546 aa  163  2e-38  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000298494  hitchhiker  0.00000476211 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0601  hypothetical protein  30.31 
 
 		 547 aa  162  3e-38  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.184325  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5506  hypothetical protein  31.17 
 
 		 533 aa  162  3e-38  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.286213  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>