130 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tgr7_1496 on replicon NC_011901
Organism: Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011901  Tgr7_1496  Mammalian cell entry related domain protein  100 
 
 		 335 aa  672    Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.024979  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1320  Mammalian cell entry related domain protein  38.67 
 
 		 337 aa  239  5e-62  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2751  paraquat-inducible ABC-type transporter, periplasmic component  32.74 
 
 		 326 aa  171  1e-41  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1072  hypothetical protein  33.13 
 
 		 309 aa  166  5e-40  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3015  hypothetical protein  29.26 
 
 		 329 aa  125  1e-27  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.231252  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2635  hypothetical protein  27.07 
 
 		 328 aa  92  1e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1015  hypothetical protein  24.44 
 
 		 321 aa  90.5  3e-17  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4623  hypothetical protein  27.18 
 
 		 334 aa  89.4  9e-17  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0466  Mammalian cell entry related domain protein  25.21 
 
 		 337 aa  86.3  7e-16  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0668  hypothetical protein  28.13 
 
 		 330 aa  85.1  0.000000000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1960  hypothetical protein  25.66 
 
 		 327 aa  79.7  0.00000000000006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0139154  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3242  Mammalian cell entry related domain protein  26.17 
 
 		 555 aa  75.1  0.000000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2416  hypothetical protein  23.97 
 
 		 359 aa  73.2  0.000000000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.186903  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1323  Mammalian cell entry related domain protein  25.23 
 
 		 561 aa  71.6  0.00000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.404082  normal  0.550075 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2893  Mammalian cell entry related domain protein  27.4 
 
 		 548 aa  70.9  0.00000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.3428  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2127  putative paraquat-inducible transmembrane protein, PqiB  29.77 
 
 		 539 aa  70.5  0.00000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.460028  normal  0.102127 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5506  hypothetical protein  29.13 
 
 		 533 aa  70.1  0.00000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.286213  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3288  hypothetical protein  25.17 
 
 		 546 aa  68.9  0.0000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2577  hypothetical protein  24.83 
 
 		 546 aa  68.2  0.0000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0122207  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2000  Mammalian cell entry related domain protein  30.68 
 
 		 558 aa  68.6  0.0000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.939676  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2674  hypothetical protein  26.72 
 
 		 539 aa  68.2  0.0000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.531712  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0651  hypothetical protein  28.03 
 
 		 534 aa  68.2  0.0000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.1317  normal  0.879007 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2114  Mammalian cell entry related domain protein  27.48 
 
 		 539 aa  68.2  0.0000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3139  hypothetical protein  25.17 
 
 		 546 aa  67.4  0.0000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.667877  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0517  Mammalian cell entry related domain protein  28.46 
 
 		 547 aa  67  0.0000000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1056  Mammalian cell entry related domain protein  24.53 
 
 		 322 aa  67.4  0.0000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0602  hypothetical protein  27.46 
 
 		 539 aa  66.6  0.0000000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.483664  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0626  hypothetical protein  27.46 
 
 		 539 aa  66.6  0.0000000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.735429  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0709  Mammalian cell entry related domain protein  25.77 
 
 		 552 aa  66.6  0.0000000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.381837  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0363  paraquat-inducible protein B  26 
 
 		 572 aa  66.2  0.0000000007  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.364646  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2378  paraquat-inducible protein B  29.31 
 
 		 553 aa  66.2  0.0000000007  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.154964  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3382  paraquat-inducible protein  29.31 
 
 		 551 aa  66.2  0.0000000007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0292  paraquat-inducible protein B  29.31 
 
 		 551 aa  66.2  0.0000000007  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1154  paraquat-inducible protein B  29.31 
 
 		 551 aa  66.2  0.0000000007  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3340  paraquat-inducible protein B  29.31 
 
 		 551 aa  66.2  0.0000000007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.440052  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3374  mce family protein  29.31 
 
 		 551 aa  66.2  0.0000000007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2561  mce family protein  29.31 
 
 		 551 aa  66.2  0.0000000007  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4000  putative paraquat-inducible protein  25.77 
 
 		 552 aa  65.1  0.000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.113556  normal  0.829107 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0579  hypothetical protein  29.61 
 
 		 546 aa  64.7  0.000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.30623  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3799  hypothetical protein  29.31 
 
 		 539 aa  64.3  0.000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.660029  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1268  paraquat-inducible protein B  29.31 
 
 		 551 aa  63.9  0.000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0227  hypothetical protein  29.31 
 
 		 539 aa  64.3  0.000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0711  hypothetical protein  29.31 
 
 		 539 aa  64.3  0.000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0678  hypothetical protein  29.31 
 
 		 539 aa  64.3  0.000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0419217  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0530  Mammalian cell entry related domain protein  28.06 
 
 		 547 aa  63.9  0.000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1445  Mammalian cell entry related domain protein  24.73 
 
 		 547 aa  62.4  0.00000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.578149  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2221  Mammalian cell entry related domain protein  27.56 
 
 		 556 aa  62.4  0.00000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000538523 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3535  hypothetical protein  31.84 
 
 		 531 aa  62  0.00000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.128458  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0601  hypothetical protein  26.75 
 
 		 547 aa  61.2  0.00000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.184325  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0257  hypothetical protein  30.99 
 
 		 543 aa  61.6  0.00000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2535  hypothetical protein  27.2 
 
 		 544 aa  61.2  0.00000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1983  hypothetical protein  25 
 
 		 343 aa  60.8  0.00000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.042136  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2831  hypothetical protein  24.75 
 
 		 551 aa  60.1  0.00000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44090  PqiB family protein  29.24 
 
 		 537 aa  60.1  0.00000006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.760607  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5802  hypothetical protein  30.29 
 
 		 531 aa  59.7  0.00000007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.00328946  hitchhiker  0.0014272 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0040  paraquat-inducible protein  25.2 
 
 		 569 aa  59.3  0.00000008  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  decreased coverage  0.00684202  normal  0.214843 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1203  hypothetical protein  28.12 
 
 		 310 aa  59.3  0.00000009  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.511791  normal  0.098201 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2391  hypothetical protein  28.09 
 
 		 545 aa  58.5  0.0000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.931506  normal  0.945303 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2562  hypothetical protein  27.37 
 
 		 558 aa  58.2  0.0000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0758211  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2679  hypothetical protein  28.65 
 
 		 546 aa  58.2  0.0000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.331347  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3138  hypothetical protein  25.07 
 
 		 322 aa  57.8  0.0000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.448864  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0403  hypothetical protein  25.95 
 
 		 545 aa  58.2  0.0000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6816  paraquat-inducible protein B'  23.9 
 
 		 556 aa  57  0.0000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.237593  normal  0.938789 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5278  hypothetical protein  28.57 
 
 		 531 aa  57  0.0000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0040  Mammalian cell entry related domain protein  24.93 
 
 		 327 aa  56.6  0.0000005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2692  hypothetical protein  30.99 
 
 		 688 aa  56.2  0.0000007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1652  paraquat-inducible protein B  26.74 
 
 		 548 aa  56.2  0.0000007  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2580  hypothetical protein  24.47 
 
 		 551 aa  55.5  0.000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.732971 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0853  Mammalian cell entry related domain protein  25 
 
 		 360 aa  55.1  0.000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.547444  normal  0.0740756 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1230  Mammalian cell entry related domain protein  32.14 
 
 		 322 aa  55.1  0.000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.16167  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0819  Mammalian cell entry related domain protein  26.35 
 
 		 360 aa  54.7  0.000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.940856  normal  0.371377 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3509  fibronectin, type III  24.64 
 
 		 537 aa  54.3  0.000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.736082  normal  0.990532 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1954  hypothetical protein  28.4 
 
 		 360 aa  54.3  0.000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.104433  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1570  hypothetical protein  27.72 
 
 		 538 aa  53.5  0.000004  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3376  hypothetical protein  22.22 
 
 		 559 aa  53.5  0.000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.166606  normal  0.0325483 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1115  paraquat-inducible protein B  27.41 
 
 		 546 aa  53.5  0.000005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000291875  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00955  paraquat-inducible protein B  27.41 
 
 		 546 aa  53.1  0.000006  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.00000262354  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2692  Mammalian cell entry related domain protein  27.41 
 
 		 546 aa  53.1  0.000006  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000610454  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1683  paraquat-inducible protein B  25.3 
 
 		 548 aa  53.1  0.000006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1060  paraquat-inducible protein B  27.41 
 
 		 546 aa  53.1  0.000006  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000012177  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1066  paraquat-inducible protein B  27.41 
 
 		 546 aa  53.1  0.000006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.00000000000823988  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2645  paraquat-inducible protein B  27.41 
 
 		 546 aa  53.1  0.000006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000298494  hitchhiker  0.00000476211 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2168  paraquat-inducible protein B  27.41 
 
 		 546 aa  53.5  0.000006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000764872  normal  0.254429 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2366  paraquat-inducible protein B  27.02 
 
 		 546 aa  53.1  0.000006  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.547013  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00962  hypothetical protein  27.41 
 
 		 546 aa  53.1  0.000006  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.00000379419  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4088  paraquat-inducible protein B  26.5 
 
 		 508 aa  52.8  0.000009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.141129  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1022  paraquat-inducible protein B  26.72 
 
 		 546 aa  52  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00119913  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1139  paraquat-inducible protein B  26.72 
 
 		 546 aa  52  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0102675  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0893  hypothetical protein  24.7 
 
 		 360 aa  52.4  0.00001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.932259  normal  0.840241 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1173  paraquat-inducible protein B  26.72 
 
 		 546 aa  52  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.371767  normal  0.608659 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1127  paraquat-inducible protein B  26.72 
 
 		 546 aa  52.4  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0201216  normal  0.953621 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1794  paraquat-inducible protein B  25.84 
 
 		 555 aa  51.2  0.00002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0371  hypothetical protein  24.89 
 
 		 305 aa  51.2  0.00003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2549  paraquat-inducible protein B  25.4 
 
 		 550 aa  50.8  0.00003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0824615  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1746  paraquat-inducible protein B  25.1 
 
 		 548 aa  50.8  0.00003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0445264  decreased coverage  0.000000731619 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2067  paraquat-inducible protein B  25.91 
 
 		 546 aa  50.8  0.00003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.883854  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1990  paraquat-inducible protein B  25.4 
 
 		 550 aa  50.8  0.00003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2638  paraquat-inducible protein B  25.4 
 
 		 550 aa  50.8  0.00003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3328  hypothetical protein  24.32 
 
 		 694 aa  50.4  0.00004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.901171  normal  0.708038 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1105  paraquat-inducible protein B  26.72 
 
 		 546 aa  50.8  0.00004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.486337  normal  0.0294366 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>