164 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfri_1960 on replicon NC_008345
Organism: Shewanella frigidimarina NCIMB 400



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008345  Sfri_1960  hypothetical protein  100 
 
 		 327 aa  644    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0139154  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0668  hypothetical protein  66.77 
 
 		 330 aa  432  1e-120  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1983  hypothetical protein  29.61 
 
 		 343 aa  141  1.9999999999999998e-32  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.042136  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2635  hypothetical protein  29.57 
 
 		 328 aa  139  4.999999999999999e-32  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2416  hypothetical protein  27.92 
 
 		 359 aa  129  5.0000000000000004e-29  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.186903  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3499  hypothetical protein  29.38 
 
 		 324 aa  125  7e-28  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2447  hypothetical protein  27.69 
 
 		 323 aa  120  1.9999999999999998e-26  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.106785  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0040  paraquat-inducible protein  29.61 
 
 		 569 aa  120  3e-26  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  decreased coverage  0.00684202  normal  0.214843 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1713  hypothetical protein  26.89 
 
 		 356 aa  120  3.9999999999999996e-26  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00000000187754 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0040  Mammalian cell entry related domain protein  28.57 
 
 		 327 aa  119  7e-26  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4623  hypothetical protein  26.33 
 
 		 334 aa  119  9e-26  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1056  Mammalian cell entry related domain protein  26.69 
 
 		 322 aa  117  1.9999999999999998e-25  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2114  Mammalian cell entry related domain protein  31.36 
 
 		 539 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2893  Mammalian cell entry related domain protein  29.97 
 
 		 548 aa  117  3e-25  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.3428  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3382  paraquat-inducible protein  30.95 
 
 		 551 aa  116  6e-25  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3340  paraquat-inducible protein B  30.95 
 
 		 551 aa  116  6e-25  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.440052  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3374  mce family protein  30.95 
 
 		 551 aa  116  6e-25  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0292  paraquat-inducible protein B  30.95 
 
 		 551 aa  116  6.9999999999999995e-25  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1154  paraquat-inducible protein B  30.95 
 
 		 551 aa  116  6.9999999999999995e-25  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2561  mce family protein  30.95 
 
 		 551 aa  116  6.9999999999999995e-25  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2378  paraquat-inducible protein B  30.95 
 
 		 553 aa  115  7.999999999999999e-25  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.154964  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1268  paraquat-inducible protein B  30.61 
 
 		 551 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2674  hypothetical protein  32.18 
 
 		 539 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.531712  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0678  hypothetical protein  31.96 
 
 		 539 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0419217  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0227  hypothetical protein  31.96 
 
 		 539 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0711  hypothetical protein  31.96 
 
 		 539 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0626  hypothetical protein  30.93 
 
 		 539 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.735429  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0709  Mammalian cell entry related domain protein  30.93 
 
 		 552 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.381837  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4000  putative paraquat-inducible protein  30.45 
 
 		 552 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.113556  normal  0.829107 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0602  hypothetical protein  30.93 
 
 		 539 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.483664  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3799  hypothetical protein  32.18 
 
 		 539 aa  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.660029  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2127  putative paraquat-inducible transmembrane protein, PqiB  29.66 
 
 		 539 aa  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.460028  normal  0.102127 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2000  Mammalian cell entry related domain protein  30.45 
 
 		 558 aa  110  2.0000000000000002e-23  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.939676  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0579  hypothetical protein  29.97 
 
 		 546 aa  109  6e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.30623  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2535  hypothetical protein  30.34 
 
 		 544 aa  108  2e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2221  Mammalian cell entry related domain protein  30.1 
 
 		 556 aa  105  1e-21  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000538523 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2679  hypothetical protein  30.14 
 
 		 546 aa  104  2e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.331347  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1230  Mammalian cell entry related domain protein  26.89 
 
 		 322 aa  103  4e-21  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.16167  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3535  hypothetical protein  28.77 
 
 		 531 aa  103  5e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.128458  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5802  hypothetical protein  30.48 
 
 		 531 aa  102  9e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.00328946  hitchhiker  0.0014272 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0403  hypothetical protein  27.78 
 
 		 545 aa  102  1e-20  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3242  Mammalian cell entry related domain protein  27.24 
 
 		 555 aa  101  2e-20  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1445  Mammalian cell entry related domain protein  27.7 
 
 		 547 aa  100  5e-20  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.578149  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5278  hypothetical protein  29.39 
 
 		 531 aa  100  5e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0363  paraquat-inducible protein B  28.05 
 
 		 572 aa  97.4  3e-19  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.364646  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0530  Mammalian cell entry related domain protein  29.97 
 
 		 547 aa  97.4  3e-19  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0517  Mammalian cell entry related domain protein  29.97 
 
 		 547 aa  96.7  4e-19  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3376  hypothetical protein  24.4 
 
 		 559 aa  96.7  5e-19  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.166606  normal  0.0325483 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0601  hypothetical protein  29.9 
 
 		 547 aa  96.3  6e-19  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.184325  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5506  hypothetical protein  31.06 
 
 		 533 aa  95.5  1e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.286213  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2580  hypothetical protein  28.72 
 
 		 551 aa  94.7  2e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.732971 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3138  hypothetical protein  26.91 
 
 		 322 aa  94  3e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.448864  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2831  hypothetical protein  27.33 
 
 		 551 aa  92.8  6e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6816  paraquat-inducible protein B'  29.79 
 
 		 556 aa  90.9  2e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.237593  normal  0.938789 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44090  PqiB family protein  27.59 
 
 		 537 aa  90.9  2e-17  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.760607  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4088  paraquat-inducible protein B  28.82 
 
 		 508 aa  91.7  2e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.141129  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0651  hypothetical protein  27.59 
 
 		 534 aa  91.3  2e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.1317  normal  0.879007 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3179  PqiB family protein  27.4 
 
 		 559 aa  90.9  3e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.360667  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3045  PqiB family protein  27.05 
 
 		 559 aa  90.5  3e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.114944  normal  0.0226159 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2577  hypothetical protein  24.91 
 
 		 546 aa  87.8  2e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0122207  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3139  hypothetical protein  24.48 
 
 		 546 aa  86.3  7e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.667877  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3288  hypothetical protein  24.91 
 
 		 546 aa  85.1  0.000000000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1320  Mammalian cell entry related domain protein  25.29 
 
 		 337 aa  83.6  0.000000000000005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5822  hypothetical protein  23.18 
 
 		 431 aa  82  0.00000000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.324893  normal  0.303543 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1496  Mammalian cell entry related domain protein  25.66 
 
 		 335 aa  79.7  0.00000000000006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.024979  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1072  hypothetical protein  24.16 
 
 		 309 aa  75.9  0.0000000000009  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2562  hypothetical protein  27.67 
 
 		 558 aa  74.7  0.000000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0758211  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2391  hypothetical protein  24.32 
 
 		 545 aa  75.1  0.000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.931506  normal  0.945303 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1683  paraquat-inducible protein B  35.71 
 
 		 548 aa  74.3  0.000000000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2751  paraquat-inducible ABC-type transporter, periplasmic component  26.54 
 
 		 326 aa  73.6  0.000000000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2366  paraquat-inducible protein B  25.95 
 
 		 546 aa  73.6  0.000000000005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.547013  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1570  hypothetical protein  24.75 
 
 		 538 aa  72.8  0.000000000007  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1704  hypothetical protein  28.02 
 
 		 554 aa  72  0.00000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0257  hypothetical protein  24.49 
 
 		 543 aa  71.2  0.00000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00955  paraquat-inducible protein B  25.57 
 
 		 546 aa  70.9  0.00000000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.00000262354  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2692  Mammalian cell entry related domain protein  25.57 
 
 		 546 aa  70.9  0.00000000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000610454  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1115  paraquat-inducible protein B  25.57 
 
 		 546 aa  70.9  0.00000000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000291875  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00962  hypothetical protein  25.57 
 
 		 546 aa  70.9  0.00000000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.00000379419  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0328  Mammalian cell entry related domain protein  21.33 
 
 		 552 aa  70.9  0.00000000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1652  paraquat-inducible protein B  25.51 
 
 		 548 aa  70.9  0.00000000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1060  paraquat-inducible protein B  25.57 
 
 		 546 aa  70.9  0.00000000003  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000012177  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1066  paraquat-inducible protein B  25.57 
 
 		 546 aa  70.9  0.00000000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.00000000000823988  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2645  paraquat-inducible protein B  25.57 
 
 		 546 aa  70.9  0.00000000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000298494  hitchhiker  0.00000476211 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2168  paraquat-inducible protein B  25.57 
 
 		 546 aa  70.9  0.00000000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000764872  normal  0.254429 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1105  paraquat-inducible protein B  24.14 
 
 		 546 aa  68.9  0.0000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.486337  normal  0.0294366 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3015  hypothetical protein  24.32 
 
 		 329 aa  68.9  0.0000000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.231252  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1022  paraquat-inducible protein B  24.14 
 
 		 546 aa  68.6  0.0000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00119913  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1139  paraquat-inducible protein B  24.14 
 
 		 546 aa  68.6  0.0000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0102675  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1173  paraquat-inducible protein B  24.14 
 
 		 546 aa  68.6  0.0000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.371767  normal  0.608659 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1127  paraquat-inducible protein B  24.14 
 
 		 546 aa  68.2  0.0000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0201216  normal  0.953621 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003028  paraquat-inducible protein B  22.46 
 
 		 548 aa  67.8  0.0000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2549  paraquat-inducible protein B  25.67 
 
 		 550 aa  67  0.0000000004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0824615  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1990  paraquat-inducible protein B  25.67 
 
 		 550 aa  67  0.0000000004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2638  paraquat-inducible protein B  25.67 
 
 		 550 aa  67  0.0000000004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3509  fibronectin, type III  27.05 
 
 		 537 aa  66.6  0.0000000005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.736082  normal  0.990532 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2067  paraquat-inducible protein B  24.91 
 
 		 546 aa  65.9  0.000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.883854  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1746  paraquat-inducible protein B  24.71 
 
 		 548 aa  63.9  0.000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0445264  decreased coverage  0.000000731619 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02851  hypothetical protein  21.84 
 
 		 548 aa  63.5  0.000000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_22660  hypothetical protein  24.01 
 
 		 312 aa  63.2  0.000000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00283529 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1794  paraquat-inducible protein B  30.36 
 
 		 555 aa  63.2  0.000000007  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>