151 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rru_A2447 on replicon NC_007643
Organism: Rhodospirillum rubrum ATCC 11170



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007643  Rru_A2447  hypothetical protein  100 
 
 		 323 aa  634    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.106785  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3499  hypothetical protein  53.09 
 
 		 324 aa  319  3.9999999999999996e-86  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1230  Mammalian cell entry related domain protein  37.62 
 
 		 322 aa  201  1.9999999999999998e-50  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.16167  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2416  hypothetical protein  32.67 
 
 		 359 aa  185  9e-46  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.186903  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1983  hypothetical protein  33.94 
 
 		 343 aa  155  7e-37  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.042136  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2635  hypothetical protein  29.13 
 
 		 328 aa  140  3.9999999999999997e-32  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1056  Mammalian cell entry related domain protein  31.69 
 
 		 322 aa  129  9.000000000000001e-29  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0040  Mammalian cell entry related domain protein  31.63 
 
 		 327 aa  123  3e-27  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0668  hypothetical protein  29.97 
 
 		 330 aa  123  5e-27  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1960  hypothetical protein  27.69 
 
 		 327 aa  120  1.9999999999999998e-26  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0139154  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3376  hypothetical protein  28.57 
 
 		 559 aa  116  3.9999999999999997e-25  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.166606  normal  0.0325483 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0363  paraquat-inducible protein B  32.04 
 
 		 572 aa  107  4e-22  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.364646  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1794  paraquat-inducible protein B  33.07 
 
 		 555 aa  103  4e-21  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3138  hypothetical protein  32.73 
 
 		 322 aa  102  7e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.448864  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2067  paraquat-inducible protein B  33.07 
 
 		 546 aa  102  7e-21  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.883854  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4623  hypothetical protein  26.17 
 
 		 334 aa  102  9e-21  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1683  paraquat-inducible protein B  31.11 
 
 		 548 aa  100  2e-20  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2000  Mammalian cell entry related domain protein  31.25 
 
 		 558 aa  100  3e-20  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.939676  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2072  Mammalian cell entry related domain protein  29.56 
 
 		 341 aa  100  4e-20  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.435744 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2893  Mammalian cell entry related domain protein  30.1 
 
 		 548 aa  99  1e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.3428  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1652  paraquat-inducible protein B  29.51 
 
 		 548 aa  97.4  3e-19  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1713  hypothetical protein  35.61 
 
 		 356 aa  97.1  4e-19  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00000000187754 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2221  Mammalian cell entry related domain protein  29.24 
 
 		 556 aa  95.1  2e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000538523 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00955  paraquat-inducible protein B  30.65 
 
 		 546 aa  94  3e-18  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.00000262354  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2692  Mammalian cell entry related domain protein  30.65 
 
 		 546 aa  94  3e-18  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000610454  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00962  hypothetical protein  30.65 
 
 		 546 aa  94  3e-18  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.00000379419  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1115  paraquat-inducible protein B  30.65 
 
 		 546 aa  94.4  3e-18  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000291875  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1060  paraquat-inducible protein B  30.65 
 
 		 546 aa  94  3e-18  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000012177  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1066  paraquat-inducible protein B  30.65 
 
 		 546 aa  94  3e-18  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.00000000000823988  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2645  paraquat-inducible protein B  30.65 
 
 		 546 aa  94  3e-18  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000298494  hitchhiker  0.00000476211 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2168  paraquat-inducible protein B  30.65 
 
 		 546 aa  94  3e-18  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000764872  normal  0.254429 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3382  paraquat-inducible protein  30.43 
 
 		 551 aa  94  4e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3374  mce family protein  30.43 
 
 		 551 aa  94  4e-18  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1268  paraquat-inducible protein B  30.43 
 
 		 551 aa  93.6  5e-18  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2366  paraquat-inducible protein B  29.39 
 
 		 546 aa  93.2  5e-18  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.547013  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2378  paraquat-inducible protein B  30.43 
 
 		 553 aa  92.8  7e-18  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.154964  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1105  paraquat-inducible protein B  31.36 
 
 		 546 aa  92.8  7e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.486337  normal  0.0294366 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0292  paraquat-inducible protein B  30.43 
 
 		 551 aa  92.8  7e-18  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1154  paraquat-inducible protein B  30.43 
 
 		 551 aa  92.8  7e-18  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3340  paraquat-inducible protein B  30.43 
 
 		 551 aa  92.8  7e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.440052  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2561  mce family protein  30.43 
 
 		 551 aa  92.8  7e-18  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1139  paraquat-inducible protein B  30.22 
 
 		 546 aa  92.4  9e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0102675  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1173  paraquat-inducible protein B  30.22 
 
 		 546 aa  92.4  9e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.371767  normal  0.608659 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1022  paraquat-inducible protein B  30.22 
 
 		 546 aa  92.4  9e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00119913  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1127  paraquat-inducible protein B  31.36 
 
 		 546 aa  92  1e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0201216  normal  0.953621 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1746  paraquat-inducible protein B  27.53 
 
 		 548 aa  91.7  2e-17  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0445264  decreased coverage  0.000000731619 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1463  paraquat-inducible protein B  31.7 
 
 		 545 aa  90.1  4e-17  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0560595  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0651  hypothetical protein  31.65 
 
 		 534 aa  89.4  8e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.1317  normal  0.879007 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2679  hypothetical protein  29.55 
 
 		 546 aa  88.6  1e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.331347  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0602  hypothetical protein  30 
 
 		 539 aa  89  1e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.483664  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0626  hypothetical protein  30 
 
 		 539 aa  89  1e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.735429  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2674  hypothetical protein  29.74 
 
 		 539 aa  87.8  2e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.531712  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5506  hypothetical protein  33.48 
 
 		 533 aa  87.4  3e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.286213  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4853  paraquat-inducible protein B  28.28 
 
 		 547 aa  86.3  6e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00098113 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0227  hypothetical protein  29.39 
 
 		 539 aa  85.9  8e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0711  hypothetical protein  29.39 
 
 		 539 aa  85.9  8e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0678  hypothetical protein  29.39 
 
 		 539 aa  85.9  8e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0419217  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3535  hypothetical protein  28.26 
 
 		 531 aa  85.9  9e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.128458  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0366  paraquat-inducible protein B  27.99 
 
 		 547 aa  85.5  0.000000000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.838729  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0579  hypothetical protein  29.59 
 
 		 546 aa  84.3  0.000000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.30623  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1323  Mammalian cell entry related domain protein  28.97 
 
 		 561 aa  84.3  0.000000000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.404082  normal  0.550075 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2535  hypothetical protein  30.09 
 
 		 544 aa  84  0.000000000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2549  paraquat-inducible protein B  27.48 
 
 		 550 aa  84.3  0.000000000000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0824615  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1990  paraquat-inducible protein B  27.48 
 
 		 550 aa  84.3  0.000000000000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2638  paraquat-inducible protein B  27.48 
 
 		 550 aa  84.3  0.000000000000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0328  Mammalian cell entry related domain protein  29.01 
 
 		 552 aa  84  0.000000000000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3799  hypothetical protein  28.19 
 
 		 539 aa  81.3  0.00000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.660029  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0709  Mammalian cell entry related domain protein  27.63 
 
 		 552 aa  81.6  0.00000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.381837  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2114  Mammalian cell entry related domain protein  28.32 
 
 		 539 aa  81.3  0.00000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2127  putative paraquat-inducible transmembrane protein, PqiB  27.88 
 
 		 539 aa  80.5  0.00000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.460028  normal  0.102127 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4000  putative paraquat-inducible protein  27.63 
 
 		 552 aa  80.5  0.00000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.113556  normal  0.829107 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3509  fibronectin, type III  25.25 
 
 		 537 aa  79.7  0.00000000000005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.736082  normal  0.990532 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44090  PqiB family protein  30.17 
 
 		 537 aa  79.7  0.00000000000006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.760607  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0403  hypothetical protein  28 
 
 		 545 aa  78.2  0.0000000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2074  hypothetical protein  26.36 
 
 		 550 aa  77  0.0000000000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0955309  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5802  hypothetical protein  27.07 
 
 		 531 aa  75.1  0.000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.00328946  hitchhiker  0.0014272 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1320  Mammalian cell entry related domain protein  24.78 
 
 		 337 aa  73.6  0.000000000004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5278  hypothetical protein  27.09 
 
 		 531 aa  73.6  0.000000000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0530  Mammalian cell entry related domain protein  27.27 
 
 		 547 aa  72.4  0.000000000009  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0517  Mammalian cell entry related domain protein  27.03 
 
 		 547 aa  72.4  0.00000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3242  Mammalian cell entry related domain protein  27.65 
 
 		 555 aa  71.6  0.00000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1352  paraquat-inducible protein B  24.67 
 
 		 547 aa  72.4  0.00000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000273869  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4088  paraquat-inducible protein B  27.71 
 
 		 508 aa  71.6  0.00000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.141129  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003028  paraquat-inducible protein B  26.36 
 
 		 548 aa  70.9  0.00000000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0601  hypothetical protein  26.58 
 
 		 547 aa  70.5  0.00000000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.184325  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02851  hypothetical protein  24.42 
 
 		 548 aa  70.5  0.00000000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0466  Mammalian cell entry related domain protein  23.14 
 
 		 337 aa  69.7  0.00000000006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2722  paraquat-inducible protein B  26.5 
 
 		 550 aa  68.6  0.0000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0257  hypothetical protein  23.13 
 
 		 543 aa  68.6  0.0000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1015  hypothetical protein  29.84 
 
 		 321 aa  68.2  0.0000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1570  hypothetical protein  28.31 
 
 		 538 aa  66.2  0.0000000006  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2008  hypothetical protein  27.03 
 
 		 547 aa  65.9  0.0000000009  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1704  hypothetical protein  24.25 
 
 		 554 aa  65.9  0.0000000009  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3139  hypothetical protein  26.3 
 
 		 546 aa  65.5  0.000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.667877  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3288  hypothetical protein  27.57 
 
 		 546 aa  65.1  0.000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02656  putative paraquat-inducible protein B  25.95 
 
 		 555 aa  64.7  0.000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.40052  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0156  hypothetical protein  30 
 
 		 312 aa  63.9  0.000000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.997452 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0040  paraquat-inducible protein  26.78 
 
 		 569 aa  62.8  0.000000007  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  decreased coverage  0.00684202  normal  0.214843 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2391  hypothetical protein  27.65 
 
 		 545 aa  62.8  0.000000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.931506  normal  0.945303 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2562  hypothetical protein  33.33 
 
 		 558 aa  62.4  0.00000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0758211  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>