139 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dbac_0466 on replicon NC_013173
Organism: Desulfomicrobium baculatum DSM 4028



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013173  Dbac_0466  Mammalian cell entry related domain protein  100 
 
 
337 aa  688    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1015  hypothetical protein  36.01 
 
 
321 aa  199  7e-50  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2751  paraquat-inducible ABC-type transporter, periplasmic component  28.05 
 
 
326 aa  102  1e-20  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1320  Mammalian cell entry related domain protein  24.52 
 
 
337 aa  86.7  6e-16  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1496  Mammalian cell entry related domain protein  25.21 
 
 
335 aa  86.3  7e-16  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.024979  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4623  hypothetical protein  29.41 
 
 
334 aa  84  0.000000000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1203  hypothetical protein  29.02 
 
 
310 aa  80.9  0.00000000000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.511791  normal  0.098201 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0743  hypothetical protein  26.75 
 
 
308 aa  79  0.0000000000001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1222  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  26.75 
 
 
308 aa  79  0.0000000000001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1072  hypothetical protein  23.92 
 
 
309 aa  76.3  0.0000000000008  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0178  Mammalian cell entry related domain protein  22.29 
 
 
305 aa  75.5  0.000000000001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2635  hypothetical protein  24.71 
 
 
328 aa  73.2  0.000000000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0100  Mammalian cell entry related domain protein  26.51 
 
 
316 aa  72.4  0.00000000001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0668  hypothetical protein  24.79 
 
 
330 aa  70.5  0.00000000004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2447  hypothetical protein  23.14 
 
 
323 aa  69.7  0.00000000007  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.106785  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3015  hypothetical protein  25.66 
 
 
329 aa  69.7  0.00000000007  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.231252  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2514  hypothetical protein  26.74 
 
 
302 aa  69.7  0.00000000007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0373094  hitchhiker  0.00640469 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1679  hypothetical protein  32.73 
 
 
298 aa  68.9  0.0000000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2028  hypothetical protein  23.91 
 
 
307 aa  67.8  0.0000000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2023  hypothetical protein  23.57 
 
 
307 aa  65.5  0.000000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0376  Mammalian cell entry related domain protein  34.93 
 
 
295 aa  62.4  0.00000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.202968  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0039  hypothetical protein  22.26 
 
 
312 aa  62.4  0.00000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.292682  normal  0.178021 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3138  hypothetical protein  43.75 
 
 
322 aa  61.6  0.00000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.448864  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0156  hypothetical protein  25.65 
 
 
312 aa  61.2  0.00000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.997452 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0249  ABC-type transport system periplasmic component  30.94 
 
 
315 aa  60.5  0.00000004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.79889 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_22660  hypothetical protein  25.15 
 
 
312 aa  59.7  0.00000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00283529 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5087  hypothetical protein  24.46 
 
 
312 aa  59.7  0.00000007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0684473 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2315  hypothetical protein  25.37 
 
 
433 aa  59.3  0.00000009  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.629666  normal  0.23577 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1960  hypothetical protein  23.51 
 
 
327 aa  59.3  0.0000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0139154  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1360  Mammalian cell entry related domain protein  24.58 
 
 
334 aa  58.5  0.0000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2344  hypothetical protein  26.99 
 
 
306 aa  58.2  0.0000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0043368 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0375  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  25 
 
 
309 aa  57.4  0.0000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.747955  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1195  hypothetical protein  26.46 
 
 
312 aa  57.8  0.0000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0119  putative ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  29.08 
 
 
275 aa  57.4  0.0000004  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2744  hypothetical protein  27.78 
 
 
315 aa  56.6  0.0000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0811657 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1820  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein, putative  25.1 
 
 
296 aa  56.2  0.0000007  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0021  ABC-type transport system involved in resistance to organic solvents periplasmic component-like  23.46 
 
 
313 aa  56.6  0.0000007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.577639  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1652  paraquat-inducible protein B  22.54 
 
 
548 aa  56.2  0.0000007  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0099  hypothetical protein  25.68 
 
 
313 aa  56.2  0.0000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.447004  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2368  hypothetical protein  22.52 
 
 
316 aa  56.2  0.0000008  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.709282  normal  0.77833 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1639  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein, putative  25.1 
 
 
296 aa  56.2  0.0000008  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1913  hypothetical protein  24.55 
 
 
312 aa  56.2  0.0000008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_2008  ABC transporter periplasmic substrate-binding protein  24.7 
 
 
296 aa  55.8  0.0000009  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0479  hypothetical protein  23.62 
 
 
313 aa  55.8  0.000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0772873  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0158  hypothetical protein  26.84 
 
 
312 aa  55.5  0.000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0315  signal peptide protein  26.6 
 
 
330 aa  55.1  0.000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1526  hypothetical protein  29.84 
 
 
300 aa  54.3  0.000003  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0265226  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4223  ABC transporter, periplasmic ligand binding protein  24.41 
 
 
320 aa  54.3  0.000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.381021 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2118  hypothetical protein  34.43 
 
 
151 aa  54.3  0.000003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0177  Mammalian cell entry related domain protein  25.41 
 
 
322 aa  53.5  0.000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1718  hypothetical protein  25.38 
 
 
321 aa  53.5  0.000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.130812  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0140  hypothetical protein  27.92 
 
 
312 aa  53.1  0.000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.682464 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0064  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  23.42 
 
 
309 aa  53.1  0.000006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.702785  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0614  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  23.42 
 
 
309 aa  53.1  0.000006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.399104  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1983  hypothetical protein  36.14 
 
 
343 aa  53.5  0.000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.042136  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0230  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  23.42 
 
 
309 aa  53.1  0.000006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1363  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  23.42 
 
 
309 aa  53.1  0.000006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.498606  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0433  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  23.42 
 
 
309 aa  53.1  0.000006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.233147  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0452  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  23.42 
 
 
309 aa  53.1  0.000006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3199  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  23.42 
 
 
309 aa  53.1  0.000006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2810  hypothetical protein  25.08 
 
 
311 aa  53.1  0.000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.177575 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2948  hypothetical protein  25.08 
 
 
310 aa  53.1  0.000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0363  paraquat-inducible protein B  23.24 
 
 
572 aa  52.4  0.00001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.364646  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2811  ABC transporter periplasmic substrate-binding protein  26.86 
 
 
321 aa  52.4  0.00001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.218461  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1610  hypothetical protein  27.03 
 
 
313 aa  52  0.00001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0534  Mammalian cell entry related domain protein  37.1 
 
 
150 aa  52.8  0.00001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0232  hypothetical protein  24.31 
 
 
310 aa  52.4  0.00001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2284  hypothetical protein  24.92 
 
 
309 aa  52.4  0.00001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2899  hypothetical protein  24.92 
 
 
309 aa  52.4  0.00001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.236087  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0761  Mammalian cell entry related domain protein  33.93 
 
 
145 aa  52  0.00001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0040  Mammalian cell entry related domain protein  24.69 
 
 
327 aa  52.8  0.00001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0170  Mammalian cell entry related domain protein  23.98 
 
 
322 aa  52.4  0.00001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1487  hypothetical protein  26.72 
 
 
321 aa  51.6  0.00002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.30011 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2908  hypothetical protein  24.62 
 
 
309 aa  50.8  0.00003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0626  ABC transporter permease  21.79 
 
 
308 aa  51.2  0.00003  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.112844  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0577  hypothetical protein  21.79 
 
 
308 aa  51.2  0.00003  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.749568  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_04760  MCE domain protein  25 
 
 
312 aa  51.2  0.00003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.321932  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0678  Mammalian cell entry related domain protein  22.63 
 
 
529 aa  50.1  0.00005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.828772 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2679  hypothetical protein  24.08 
 
 
546 aa  50.1  0.00006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.331347  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0070  hypothetical protein  28.12 
 
 
313 aa  49.7  0.00007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_41114  predicted protein  24.38 
 
 
306 aa  49.7  0.00008  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.830125  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6241  ABC transporter, periplasmic ligand binding protein  25.08 
 
 
309 aa  48.9  0.0001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1983  hypothetical protein  29.5 
 
 
301 aa  48.9  0.0001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3376  hypothetical protein  26.88 
 
 
559 aa  49.3  0.0001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.166606  normal  0.0325483 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0184  hypothetical protein  26.25 
 
 
310 aa  48.9  0.0001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.683235  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2549  paraquat-inducible protein B  22.31 
 
 
550 aa  49.3  0.0001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0824615  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0090  mce related protein  31.25 
 
 
313 aa  48.9  0.0001  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0699486  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1990  paraquat-inducible protein B  22.31 
 
 
550 aa  49.3  0.0001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2638  paraquat-inducible protein B  22.31 
 
 
550 aa  49.3  0.0001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2275  Mammalian cell entry related domain protein  31.25 
 
 
305 aa  48.1  0.0002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3037  Mammalian cell entry related domain protein  30.08 
 
 
479 aa  48.1  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.622361 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3499  hypothetical protein  24.26 
 
 
324 aa  47.8  0.0002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1230  Mammalian cell entry related domain protein  21.53 
 
 
322 aa  48.1  0.0002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.16167  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1794  Mammalian cell entry related domain protein  29.17 
 
 
312 aa  47.8  0.0003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0475  putative ABC transport system periplasmic substrate-binding protein  24.6 
 
 
304 aa  47.4  0.0003  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.848355  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0739  Mammalian cell entry related domain protein  28.93 
 
 
152 aa  47.8  0.0003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.942465  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2135  mce-related protein  29.17 
 
 
312 aa  47.8  0.0003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0384  Mammalian cell entry related domain protein  30.97 
 
 
152 aa  47.8  0.0003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.214826 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2416  hypothetical protein  20.96 
 
 
359 aa  47.4  0.0004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.186903  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2048  hypothetical protein  32.65 
 
 
579 aa  47.4  0.0004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.715666 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>