43 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tery_2165 on replicon NC_008312
Organism: Trichodesmium erythraeum IMS101



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008312  Tery_2165  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  100 
 
 
476 aa  943    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0530  Mammalian cell entry related domain protein  35.24 
 
 
465 aa  265  1e-69  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0794795  hitchhiker  0.00420823 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0513  Mammalian cell entry related domain protein  35.24 
 
 
465 aa  265  1e-69  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2674  hypothetical protein  37.64 
 
 
470 aa  257  3e-67  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0998  mammalian cell entry related domain-containing protein  35.79 
 
 
470 aa  241  2e-62  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0397137  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4571  Mammalian cell entry related domain protein  33.33 
 
 
468 aa  223  4.9999999999999996e-57  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3037  Mammalian cell entry related domain protein  41.71 
 
 
479 aa  169  1e-40  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.622361 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3809  Mammalian cell entry related domain protein  29.18 
 
 
404 aa  146  8.000000000000001e-34  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.622643  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0351  putative ABC transport system substrate-binding protein  35.98 
 
 
377 aa  142  9.999999999999999e-33  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_41114  predicted protein  27.08 
 
 
306 aa  94.4  5e-18  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.830125  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_03151  putative ABC transporter  26.58 
 
 
281 aa  85.1  0.000000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1655  putative ABC transporter  33.99 
 
 
281 aa  79.3  0.0000000000001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_03691  putative ABC transporter  32.69 
 
 
281 aa  77.8  0.0000000000004  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_25211  putative ABC transporter  30.3 
 
 
291 aa  76.3  0.000000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0235  ABC transporter  34.01 
 
 
286 aa  75.9  0.000000000001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_03221  putative ABC transporter  29.25 
 
 
281 aa  70.9  0.00000000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.0751946  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_03121  putative ABC transporter  26.13 
 
 
281 aa  69.7  0.0000000001  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.776003  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0291  putative ABC transporter  30.2 
 
 
281 aa  65.9  0.000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.324707  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_03131  putative ABC transporter  27.89 
 
 
281 aa  65.1  0.000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0208  ABC transporter  30.14 
 
 
286 aa  61.6  0.00000003  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.751363 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4394  virulence factor Mce family protein  30 
 
 
483 aa  53.9  0.000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2315  hypothetical protein  23.89 
 
 
433 aa  52.4  0.00002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.629666  normal  0.23577 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2048  hypothetical protein  23.39 
 
 
579 aa  50.4  0.00006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.715666 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3977  virulence factor Mce family protein  29.52 
 
 
479 aa  48.9  0.0002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.240888  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0139  virulence factor Mce family protein  31 
 
 
520 aa  49.3  0.0002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1718  hypothetical protein  21.51 
 
 
321 aa  48.1  0.0004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.130812  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1627  virulence factor Mce family protein  27.27 
 
 
509 aa  47  0.0007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.0870735 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0363  virulence factor Mce family protein  29.79 
 
 
454 aa  45.8  0.001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1581  hypothetical protein  25.53 
 
 
164 aa  46.6  0.001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.0000000000000509629  normal  0.19941 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2368  hypothetical protein  27.62 
 
 
316 aa  46.6  0.001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.709282  normal  0.77833 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0178  Mammalian cell entry related domain protein  22.44 
 
 
305 aa  45.8  0.002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0466  Mammalian cell entry related domain protein  31.25 
 
 
337 aa  45.8  0.002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1487  hypothetical protein  21.35 
 
 
321 aa  45.1  0.003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.30011 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09330  virulence factor Mce family protein  20.68 
 
 
332 aa  44.7  0.003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.892194 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2811  ABC transporter periplasmic substrate-binding protein  21.35 
 
 
321 aa  44.7  0.003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.218461  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0393  Mammalian cell entry related domain protein  22.41 
 
 
515 aa  45.1  0.003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1226  CUB protein  19.46 
 
 
1621 aa  45.1  0.003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.287366  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0333  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Pas/Pac sensor  25.54 
 
 
720 aa  45.1  0.003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1502  Mammalian cell entry related domain protein  37.5 
 
 
228 aa  44.3  0.005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2984  virulence factor Mce family protein  23.98 
 
 
329 aa  44.3  0.005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.474914  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0534  Mammalian cell entry related domain protein  37.31 
 
 
150 aa  43.9  0.007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3636  Mammalian cell entry related domain protein  25.97 
 
 
321 aa  43.9  0.007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.676726 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1181  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  27.39 
 
 
621 aa  43.5  0.008  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00022904  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>