53 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Syncc9902_0235 on replicon NC_007513
Organism: Synechococcus sp. CC9902



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007513  Syncc9902_0235  ABC transporter  100 
 
 		 286 aa  574  1.0000000000000001e-163  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0208  ABC transporter  68.88 
 
 		 286 aa  421  1e-117  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.751363 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_25211  putative ABC transporter  57.19 
 
 		 291 aa  340  1e-92  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_03691  putative ABC transporter  43.06 
 
 		 281 aa  257  1e-67  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1655  putative ABC transporter  42.7 
 
 		 281 aa  253  2.0000000000000002e-66  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_03121  putative ABC transporter  38.79 
 
 		 281 aa  242  6e-63  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.776003  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0291  putative ABC transporter  38.08 
 
 		 281 aa  239  4e-62  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.324707  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_03131  putative ABC transporter  38.79 
 
 		 281 aa  238  5.999999999999999e-62  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_03221  putative ABC transporter  37.72 
 
 		 281 aa  233  2.0000000000000002e-60  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.0751946  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_03151  putative ABC transporter  39.86 
 
 		 281 aa  227  2e-58  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0351  putative ABC transport system substrate-binding protein  24.63 
 
 		 377 aa  97.4  2e-19  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0513  Mammalian cell entry related domain protein  27.95 
 
 		 465 aa  91.7  1e-17  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0530  Mammalian cell entry related domain protein  27.95 
 
 		 465 aa  91.7  1e-17  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0794795  hitchhiker  0.00420823 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3809  Mammalian cell entry related domain protein  29.15 
 
 		 404 aa  89.7  4e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.622643  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3037  Mammalian cell entry related domain protein  32.87 
 
 		 479 aa  81.3  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.622361 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2165  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  32.23 
 
 		 476 aa  64.3  0.000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0998  mammalian cell entry related domain-containing protein  38.64 
 
 		 470 aa  61.6  0.00000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0397137  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2635  hypothetical protein  26.26 
 
 		 328 aa  59.3  0.00000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1561  virulence factor Mce family protein  26.67 
 
 		 565 aa  52.8  0.000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5197  virulence factor Mce family protein  36.49 
 
 		 564 aa  52  0.00001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0737049  normal  0.144071 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4165  virulence factor Mce family protein  32.11 
 
 		 487 aa  50.8  0.00002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.450079 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4700  virulence factor Mce family protein  37.84 
 
 		 584 aa  48.5  0.0001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4612  virulence factor MCE-like protein  37.84 
 
 		 584 aa  48.5  0.0001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2674  hypothetical protein  20.99 
 
 		 470 aa  48.1  0.0002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0329  hypothetical protein  23.38 
 
 		 430 aa  47.8  0.0002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.967579  normal  0.70235 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0678  Mammalian cell entry related domain protein  25.21 
 
 		 529 aa  48.1  0.0002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.828772 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4995  virulence factor Mce family protein  29.21 
 
 		 580 aa  47.8  0.0002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.771933  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2106  virulence factor Mce family protein  37.5 
 
 		 486 aa  48.1  0.0002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.583314  normal  0.616965 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0518  virulence factor Mce family protein  26.55 
 
 		 484 aa  47  0.0003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.608059  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1659  virulence factor MCE-like protein  26.55 
 
 		 484 aa  47  0.0003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13528  MCE-family protein mce4F  27.54 
 
 		 564 aa  47  0.0003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000487906 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1632  virulence factor Mce family protein  26.55 
 
 		 484 aa  47  0.0003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.175029  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1683  virulence factor Mce family protein  26.55 
 
 		 484 aa  47  0.0003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1841  hypothetical protein  29.13 
 
 		 313 aa  46.6  0.0004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0924  virulence factor Mce family protein  24.69 
 
 		 438 aa  47  0.0004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.841372 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6192  Mammalian cell entry related domain protein  24.57 
 
 		 332 aa  47  0.0004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.387563 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0647  virulence factor Mce family protein  27.08 
 
 		 484 aa  46.6  0.0005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4599  virulence factor Mce family protein  34.15 
 
 		 499 aa  46.2  0.0006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.376755  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4183  virulence factor Mce family protein  31.37 
 
 		 482 aa  45.4  0.001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.791662  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09320  virulence factor Mce family protein  25.7 
 
 		 359 aa  45.1  0.001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.906316 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0707  Mammalian cell entry related domain protein  24.36 
 
 		 362 aa  44.7  0.002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.886561  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4571  Mammalian cell entry related domain protein  22.67 
 
 		 468 aa  43.9  0.003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1330  hypothetical protein  31.86 
 
 		 168 aa  43.5  0.004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.519307  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0981  hypothetical protein  33.03 
 
 		 158 aa  43.5  0.004  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0708  virulence factor Mce family protein  28.87 
 
 		 424 aa  43.1  0.005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0372566  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0515  virulence factor Mce family protein  41.1 
 
 		 342 aa  43.1  0.005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3077  putative paraquat-inducible protein B  31.08 
 
 		 580 aa  42.7  0.006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.198785  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1861  hypothetical protein  25.54 
 
 		 567 aa  42.7  0.007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3945  virulence factor Mce family protein  31.94 
 
 		 476 aa  42.7  0.007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0739  Mammalian cell entry related domain protein  32.32 
 
 		 152 aa  42.4  0.008  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.942465  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0890  Mammalian cell entry related domain protein  38.36 
 
 		 156 aa  42.7  0.008  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.114761  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4175  Mammalian cell entry related domain protein  24.9 
 
 		 370 aa  42.4  0.009  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0626  ABC transporter permease  26.51 
 
 		 308 aa  42  0.01  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.112844  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>