58 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene P9515_03221 on replicon NC_008817
Organism: Prochlorococcus marinus str. MIT 9515



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008817  P9515_03221  putative ABC transporter  100 
 
 
281 aa  560  1.0000000000000001e-159  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.0751946  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_03131  putative ABC transporter  86.12 
 
 
281 aa  495  1e-139  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0291  putative ABC transporter  85.05 
 
 
281 aa  491  9.999999999999999e-139  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.324707  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_03121  putative ABC transporter  85.05 
 
 
281 aa  493  9.999999999999999e-139  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.776003  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1655  putative ABC transporter  49.47 
 
 
281 aa  288  9e-77  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_03691  putative ABC transporter  49.82 
 
 
281 aa  286  2.9999999999999996e-76  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_03151  putative ABC transporter  41.84 
 
 
281 aa  242  3.9999999999999997e-63  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_25211  putative ABC transporter  39.86 
 
 
291 aa  237  2e-61  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0235  ABC transporter  37.72 
 
 
286 aa  233  2.0000000000000002e-60  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0208  ABC transporter  37.01 
 
 
286 aa  226  3e-58  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.751363 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0351  putative ABC transport system substrate-binding protein  27.13 
 
 
377 aa  101  2e-20  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3809  Mammalian cell entry related domain protein  26.77 
 
 
404 aa  99.4  7e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.622643  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3037  Mammalian cell entry related domain protein  27.5 
 
 
479 aa  79.7  0.00000000000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.622361 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0513  Mammalian cell entry related domain protein  25.09 
 
 
465 aa  79  0.00000000000008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0530  Mammalian cell entry related domain protein  25.09 
 
 
465 aa  79  0.00000000000008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0794795  hitchhiker  0.00420823 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0998  mammalian cell entry related domain-containing protein  29.63 
 
 
470 aa  68.2  0.0000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0397137  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2165  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  28.1 
 
 
476 aa  60.5  0.00000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2960  signal peptide protein  33.94 
 
 
173 aa  58.5  0.0000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.432073  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2399  hypothetical protein  33.03 
 
 
156 aa  57.4  0.0000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3238  Mammalian cell entry related domain protein  35.78 
 
 
175 aa  57  0.0000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.303674  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2891  Mammalian cell entry related domain protein  34.86 
 
 
175 aa  56.2  0.0000006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.27124 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1898  putative ABC transporter substrate-binding protein  28.97 
 
 
155 aa  55.1  0.000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2674  hypothetical protein  26.17 
 
 
470 aa  54.7  0.000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1195  hypothetical protein  24.64 
 
 
312 aa  53.9  0.000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2747  hypothetical protein  28.04 
 
 
161 aa  52.8  0.000006  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2707  hypothetical protein  27 
 
 
149 aa  50.8  0.00002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2937  hypothetical protein  30.28 
 
 
162 aa  51.2  0.00002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.887715  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3120  hypothetical protein  27.2 
 
 
173 aa  49.7  0.00005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.771354  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0687  hypothetical protein  31.19 
 
 
169 aa  49.7  0.00006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0132  virulence factor Mce family protein  22.63 
 
 
519 aa  49.3  0.00007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.208767  normal  0.215397 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0123  virulence factor MCE-like protein  22.63 
 
 
519 aa  49.3  0.00007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_41114  predicted protein  20.22 
 
 
306 aa  48.9  0.00008  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.830125  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2118  hypothetical protein  32.98 
 
 
151 aa  48.9  0.0001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0393  Mammalian cell entry related domain protein  25.6 
 
 
515 aa  47.8  0.0002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1330  hypothetical protein  27.36 
 
 
168 aa  47.4  0.0003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.519307  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0743  hypothetical protein  26.12 
 
 
308 aa  46.2  0.0005  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4584  hypothetical protein  21.19 
 
 
321 aa  46.6  0.0005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1222  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  26.12 
 
 
308 aa  46.2  0.0005  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0113  virulence factor Mce family protein  22.63 
 
 
519 aa  46.2  0.0006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2411  hypothetical protein  25 
 
 
154 aa  45.8  0.0008  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.108225  normal  0.153742 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3702  hypothetical protein  31.78 
 
 
149 aa  45.8  0.0009  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0795  hypothetical protein  31.48 
 
 
168 aa  45.1  0.001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0952502  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0638  hypothetical protein  27.62 
 
 
306 aa  45.1  0.001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.498696 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0098  hypothetical protein  30.99 
 
 
160 aa  44.7  0.002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.334829  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0178  Mammalian cell entry related domain protein  26.79 
 
 
305 aa  44.7  0.002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1156  Mammalian cell entry related domain protein  33.33 
 
 
163 aa  44.3  0.002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.482142  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5534  hypothetical protein  29.41 
 
 
161 aa  44.7  0.002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.264569  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0097  Mammalian cell entry related domain protein  30.99 
 
 
160 aa  43.5  0.003  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  decreased coverage  0.0000148019  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0893  hypothetical protein  21.45 
 
 
360 aa  43.9  0.003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.932259  normal  0.840241 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0853  Mammalian cell entry related domain protein  21.45 
 
 
360 aa  43.9  0.003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.547444  normal  0.0740756 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0718  Mammalian cell entry related domain protein  26.82 
 
 
161 aa  43.9  0.003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2635  hypothetical protein  19.92 
 
 
328 aa  43.1  0.004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0761  Mammalian cell entry related domain protein  30.3 
 
 
145 aa  43.1  0.005  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2744  hypothetical protein  25.6 
 
 
315 aa  43.1  0.005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0811657 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2885  hypothetical protein  26.26 
 
 
160 aa  43.1  0.005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.827962  normal  0.785076 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3636  Mammalian cell entry related domain protein  22.03 
 
 
321 aa  42.7  0.006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.676726 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0819  Mammalian cell entry related domain protein  21.45 
 
 
360 aa  42.7  0.006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.940856  normal  0.371377 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3400  hypothetical protein  33.8 
 
 
156 aa  42.7  0.007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>