45 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Syncc9605_0208 on replicon NC_007516
Organism: Synechococcus sp. CC9605



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007516  Syncc9605_0208  ABC transporter  100 
 
 		 286 aa  573  1.0000000000000001e-162  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.751363 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0235  ABC transporter  68.88 
 
 		 286 aa  421  1e-117  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_25211  putative ABC transporter  55.79 
 
 		 291 aa  342  2.9999999999999997e-93  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1655  putative ABC transporter  39.15 
 
 		 281 aa  242  5e-63  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_03691  putative ABC transporter  38.79 
 
 		 281 aa  242  6e-63  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_03121  putative ABC transporter  39.15 
 
 		 281 aa  240  2e-62  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.776003  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_03131  putative ABC transporter  38.79 
 
 		 281 aa  237  2e-61  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0291  putative ABC transporter  37.72 
 
 		 281 aa  234  1.0000000000000001e-60  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.324707  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_03221  putative ABC transporter  37.01 
 
 		 281 aa  226  3e-58  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.0751946  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_03151  putative ABC transporter  38.08 
 
 		 281 aa  224  1e-57  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0351  putative ABC transport system substrate-binding protein  23.21 
 
 		 377 aa  97.1  3e-19  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3809  Mammalian cell entry related domain protein  27.1 
 
 		 404 aa  80.9  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.622643  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3037  Mammalian cell entry related domain protein  32.17 
 
 		 479 aa  78.2  0.0000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.622361 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0530  Mammalian cell entry related domain protein  28.29 
 
 		 465 aa  65.9  0.0000000007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0794795  hitchhiker  0.00420823 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0513  Mammalian cell entry related domain protein  28.29 
 
 		 465 aa  65.9  0.0000000007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0998  mammalian cell entry related domain-containing protein  24.15 
 
 		 470 aa  65.9  0.0000000007  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0397137  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0329  hypothetical protein  24.81 
 
 		 430 aa  63.5  0.000000004  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.967579  normal  0.70235 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1867  Mammalian cell entry related domain protein  22.68 
 
 		 316 aa  56.2  0.0000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.449047  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4584  hypothetical protein  24.16 
 
 		 321 aa  56.2  0.0000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2674  hypothetical protein  22.12 
 
 		 470 aa  54.7  0.000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2165  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  30 
 
 		 476 aa  52.8  0.000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0743  hypothetical protein  23.05 
 
 		 308 aa  49.7  0.00005  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1222  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  23.05 
 
 		 308 aa  49.7  0.00005  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0838  virulence factor Mce family protein  23.14 
 
 		 523 aa  47.8  0.0002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0761  Mammalian cell entry related domain protein  35.4 
 
 		 145 aa  45.4  0.001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2411  hypothetical protein  29.41 
 
 		 154 aa  45.4  0.001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.108225  normal  0.153742 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4612  virulence factor MCE-like protein  34.72 
 
 		 584 aa  44.3  0.002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4533  virulence factor Mce family protein  33.72 
 
 		 504 aa  44.3  0.002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0456406  normal  0.287629 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0474  hypothetical protein  31.19 
 
 		 164 aa  44.3  0.002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.000014845  unclonable  0.00000680839 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0626  ABC transporter permease  25.2 
 
 		 308 aa  44.7  0.002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.112844  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4700  virulence factor Mce family protein  34.72 
 
 		 584 aa  44.3  0.002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0577  hypothetical protein  24.8 
 
 		 308 aa  44.3  0.003  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.749568  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1506  virulence factor Mce family protein  28.02 
 
 		 339 aa  44.3  0.003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0708  virulence factor Mce family protein  28 
 
 		 424 aa  43.9  0.003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0372566  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5197  virulence factor Mce family protein  34.72 
 
 		 564 aa  44.3  0.003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0737049  normal  0.144071 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1841  hypothetical protein  27.56 
 
 		 313 aa  43.5  0.004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1561  virulence factor Mce family protein  34.72 
 
 		 565 aa  43.5  0.004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4995  virulence factor Mce family protein  34.72 
 
 		 580 aa  43.1  0.005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.771933  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1330  hypothetical protein  29.2 
 
 		 168 aa  43.1  0.005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.519307  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2106  virulence factor Mce family protein  41.18 
 
 		 486 aa  43.1  0.005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.583314  normal  0.616965 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11078  hypothetical protein  20.68 
 
 		 316 aa  42.7  0.006  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0113  virulence factor Mce family protein  31.09 
 
 		 519 aa  42.7  0.007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0559  hypothetical protein  32.05 
 
 		 154 aa  42.4  0.008  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0739  Mammalian cell entry related domain protein  29.06 
 
 		 152 aa  42.4  0.009  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.942465  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3302  hypothetical protein  34.62 
 
 		 157 aa  42.4  0.01  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.132932 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>