156 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CA2559_11078 on replicon NC_014230
Organism: Croceibacter atlanticus HTCC2559



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014230  CA2559_11078  hypothetical protein  100 
 
 
316 aa  631  1e-180  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4584  hypothetical protein  44.09 
 
 
321 aa  272  7e-72  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1867  Mammalian cell entry related domain protein  38.51 
 
 
316 aa  210  2e-53  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.449047  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2113  Mammalian cell entry related domain protein  35.81 
 
 
316 aa  208  8e-53  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.202192  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6192  Mammalian cell entry related domain protein  35.82 
 
 
332 aa  201  9.999999999999999e-51  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.387563 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3636  Mammalian cell entry related domain protein  29.28 
 
 
321 aa  163  5.0000000000000005e-39  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.676726 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4901  Mammalian cell entry related domain protein  26.79 
 
 
328 aa  145  7.0000000000000006e-34  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.374077  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG1049  hypothetical protein  27.78 
 
 
292 aa  125  1e-27  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00460957 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0751  ABC transporter permease  27.74 
 
 
308 aa  114  2.0000000000000002e-24  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0221313  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0638  hypothetical protein  25.07 
 
 
306 aa  114  2.0000000000000002e-24  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.498696 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2344  Mammalian cell entry related domain protein  25.57 
 
 
314 aa  96.7  4e-19  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1696  Mammalian cell entry related domain protein  26.73 
 
 
293 aa  84.7  0.000000000000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0661  hypothetical protein  27.6 
 
 
292 aa  79.7  0.00000000000006  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1873  Mammalian cell entry related domain protein  25.55 
 
 
293 aa  79  0.0000000000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.010294 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0440  VpsC protein  24.91 
 
 
292 aa  76.3  0.0000000000006  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4517  hypothetical protein  22.66 
 
 
359 aa  75.9  0.0000000000008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1739  Mammalian cell entry related domain protein  26.33 
 
 
292 aa  75.1  0.000000000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2254  Mammalian cell entry related domain protein  25.72 
 
 
292 aa  74.7  0.000000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.371924  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2541  virulence factor MCE-like protein-related protein  25.27 
 
 
360 aa  74.7  0.000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.143277  hitchhiker  0.00000000000784881 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1272  virulence factor MCE-like protein-related protein  25.19 
 
 
347 aa  72.8  0.000000000008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.821992  hitchhiker  0.0000000117847 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0329  hypothetical protein  24.42 
 
 
430 aa  72.8  0.000000000008  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.967579  normal  0.70235 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0838  virulence factor Mce family protein  25.53 
 
 
523 aa  71.6  0.00000000002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0926  mce-related protein  23.63 
 
 
360 aa  69.3  0.00000000008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3705  hypothetical protein  24.37 
 
 
349 aa  67.8  0.0000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0478  VpsC protein  22.76 
 
 
292 aa  67  0.0000000004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.238955  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0393  Mammalian cell entry related domain protein  21.36 
 
 
515 aa  67  0.0000000004  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0113  virulence factor Mce family protein  27.85 
 
 
519 aa  66.2  0.0000000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0123  virulence factor MCE-like protein  27.85 
 
 
519 aa  65.9  0.0000000009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0132  virulence factor Mce family protein  27.85 
 
 
519 aa  65.9  0.0000000009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.208767  normal  0.215397 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1899  virulence factor Mce family protein  22.15 
 
 
349 aa  63.9  0.000000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0678  Mammalian cell entry related domain protein  23.5 
 
 
529 aa  63.2  0.000000005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.828772 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11998  MCE-family protein mce3B  25.56 
 
 
342 aa  62.8  0.000000008  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000000434194  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1243  hypothetical protein  24.51 
 
 
360 aa  62.4  0.000000009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1508  Mammalian cell entry related domain protein  22.04 
 
 
356 aa  62.4  0.000000009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.577537 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1655  putative ABC transporter  24.46 
 
 
281 aa  61.2  0.00000002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0707  Mammalian cell entry related domain protein  21.94 
 
 
362 aa  60.8  0.00000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.886561  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0495  Mammalian cell entry related domain protein  26.95 
 
 
360 aa  60.5  0.00000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1888  Mammalian cell entry related domain protein  24.16 
 
 
529 aa  60.1  0.00000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0706  virulence factor Mce family protein  24.92 
 
 
520 aa  60.1  0.00000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.900705  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2733  Mammalian cell entry related domain protein  22.34 
 
 
356 aa  57.8  0.0000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.978964  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10606  MCE-family protein mce2F  24.54 
 
 
516 aa  57.8  0.0000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.466214 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2448  hypothetical protein  22.22 
 
 
333 aa  57.4  0.0000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0517  virulence factor Mce family protein  24.54 
 
 
355 aa  56.6  0.0000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3669  virulence factor MCE-like protein  23.4 
 
 
367 aa  56.6  0.0000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.493573  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3742  virulence factor Mce family protein  23.4 
 
 
367 aa  56.6  0.0000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.673254 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_03691  putative ABC transporter  25.09 
 
 
281 aa  56.6  0.0000006  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3682  virulence factor Mce family protein  23.4 
 
 
367 aa  56.2  0.0000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.192954  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2066  Mammalian cell entry related domain protein  21.67 
 
 
388 aa  56.2  0.0000006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3214  hypothetical protein  20.79 
 
 
360 aa  55.5  0.000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0139  virulence factor Mce family protein  24.32 
 
 
520 aa  55.8  0.000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3979  virulence factor Mce family protein  23.51 
 
 
425 aa  55.8  0.000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0795  Mammalian cell entry related domain protein  22.96 
 
 
328 aa  55.5  0.000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0710  virulence factor Mce family protein  23.7 
 
 
343 aa  53.9  0.000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.476442  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0707  virulence factor Mce family protein  25 
 
 
472 aa  53.5  0.000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.953173  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3021  ABC-type transport system involved in resistance to organic solvents periplasmic component-like protein  25.7 
 
 
340 aa  52.8  0.000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0923  virulence factor Mce family protein  25.27 
 
 
343 aa  52.8  0.000009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.771537 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0208  ABC transporter  21.92 
 
 
286 aa  51.6  0.00002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.751363 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1242  Mammalian cell entry related domain protein  22.47 
 
 
707 aa  51.6  0.00002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12000  MCE-family protein mce3D  22.55 
 
 
423 aa  51.6  0.00002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000000734416  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1208  hypothetical protein  21.8 
 
 
308 aa  50.8  0.00003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1506  virulence factor Mce family protein  23.21 
 
 
339 aa  50.8  0.00003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4148  virulence factor Mce family protein  26.42 
 
 
367 aa  50.8  0.00003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1978  hypothetical protein  32.48 
 
 
568 aa  51.2  0.00003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.308445  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3316  Mammalian cell entry related domain protein  26.36 
 
 
266 aa  50.1  0.00004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.635964  hitchhiker  0.0000217652 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0705  virulence factor Mce family protein  24.87 
 
 
321 aa  50.1  0.00005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4162  virulence factor Mce family protein  34.72 
 
 
361 aa  50.1  0.00005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3827  virulence factor Mce family protein  24.62 
 
 
364 aa  49.7  0.00006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_25211  putative ABC transporter  21.81 
 
 
291 aa  49.7  0.00007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2510  virulence factor Mce family protein  21.85 
 
 
367 aa  49.3  0.00008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.609279 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0188  Mammalian cell entry related domain protein  22.32 
 
 
337 aa  49.3  0.0001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.107684  normal  0.968767 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2822  virulence factor Mce family protein  28.28 
 
 
329 aa  48.9  0.0001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.883459  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5200  virulence factor Mce family protein  29.13 
 
 
355 aa  49.3  0.0001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.168356  normal  0.194199 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0516  virulence factor Mce family protein  22.57 
 
 
345 aa  47.8  0.0002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2744  hypothetical protein  21.64 
 
 
315 aa  48.1  0.0002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0811657 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0743  hypothetical protein  19.93 
 
 
308 aa  48.1  0.0002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1222  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  19.93 
 
 
308 aa  48.1  0.0002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3947  virulence factor Mce family protein  22.66 
 
 
419 aa  47.4  0.0003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2299  putative ABC transport system substrate-binding protein  31.78 
 
 
148 aa  47.4  0.0003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0104875  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2315  hypothetical protein  23.88 
 
 
433 aa  47.8  0.0003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.629666  normal  0.23577 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2438  hypothetical protein  28.57 
 
 
151 aa  47  0.0004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.284994  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5199  virulence factor Mce family protein  22.41 
 
 
453 aa  47  0.0004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.214398  normal  0.135987 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2106  virulence factor Mce family protein  23.87 
 
 
486 aa  47  0.0004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.583314  normal  0.616965 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0706  virulence factor Mce family protein  25.28 
 
 
379 aa  46.6  0.0005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0100  Mammalian cell entry related domain protein  24.87 
 
 
316 aa  46.6  0.0005  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2983  virulence factor Mce family protein  31.33 
 
 
394 aa  47  0.0005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.844857  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_03131  putative ABC transporter  18.71 
 
 
281 aa  46.6  0.0005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4963  Mammalian cell entry related domain protein  27 
 
 
359 aa  47  0.0005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1655  virulence factor MCE-like protein  22.92 
 
 
342 aa  46.6  0.0006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1679  virulence factor Mce family protein  22.92 
 
 
342 aa  46.6  0.0006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.859349  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1628  virulence factor Mce family protein  22.92 
 
 
342 aa  46.6  0.0006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0651  virulence factor Mce family protein  22.92 
 
 
342 aa  46.6  0.0006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.228257  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1529  virulence factor MCE-like protein  25 
 
 
479 aa  46.2  0.0007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1552  virulence factor Mce family protein  25 
 
 
479 aa  46.2  0.0007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.977582  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1894  hypothetical protein  22.64 
 
 
324 aa  46.2  0.0007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000276188  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10171  MCE-family protein mce1B  22.9 
 
 
346 aa  46.2  0.0007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1504  virulence factor Mce family protein  23.77 
 
 
395 aa  46.2  0.0008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_03221  putative ABC transporter  22.37 
 
 
281 aa  46.2  0.0008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.0751946  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4603  virulence factor Mce family protein  22.56 
 
 
346 aa  45.8  0.0009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09340  virulence factor Mce family protein  25.54 
 
 
329 aa  45.8  0.001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.677284 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_03121  putative ABC transporter  19.13 
 
 
281 aa  45.4  0.001  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.776003  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>