83 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Clim_1739 on replicon NC_010803
Organism: Chlorobium limicola DSM 245



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010803  Clim_1739  Mammalian cell entry related domain protein  100 
 
 		 292 aa  578  1e-164  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0661  hypothetical protein  76.03 
 
 		 292 aa  444  1e-123  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2254  Mammalian cell entry related domain protein  73.29 
 
 		 292 aa  439  9.999999999999999e-123  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.371924  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0478  VpsC protein  69.52 
 
 		 292 aa  424  1e-118  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.238955  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0440  VpsC protein  67.81 
 
 		 292 aa  394  1e-109  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1873  Mammalian cell entry related domain protein  59.39 
 
 		 293 aa  362  3e-99  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.010294 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1696  Mammalian cell entry related domain protein  59.73 
 
 		 293 aa  360  1e-98  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4517  hypothetical protein  28.57 
 
 		 359 aa  113  4.0000000000000004e-24  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3214  hypothetical protein  25.21 
 
 		 360 aa  111  2.0000000000000002e-23  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2541  virulence factor MCE-like protein-related protein  25.56 
 
 		 360 aa  109  7.000000000000001e-23  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.143277  hitchhiker  0.00000000000784881 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0926  mce-related protein  26.39 
 
 		 360 aa  105  6e-22  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0495  Mammalian cell entry related domain protein  25.07 
 
 		 360 aa  97.1  3e-19  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1243  hypothetical protein  27.17 
 
 		 360 aa  96.7  4e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3636  Mammalian cell entry related domain protein  27.21 
 
 		 321 aa  93.2  5e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.676726 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4901  Mammalian cell entry related domain protein  25.32 
 
 		 328 aa  90.5  3e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.374077  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0795  Mammalian cell entry related domain protein  27.12 
 
 		 328 aa  87.4  3e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1867  Mammalian cell entry related domain protein  26.69 
 
 		 316 aa  85.1  0.000000000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.449047  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0188  Mammalian cell entry related domain protein  26.71 
 
 		 337 aa  83.6  0.000000000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.107684  normal  0.968767 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1810  Mammalian cell entry related domain protein  31.05 
 
 		 341 aa  76.6  0.0000000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.550546 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4584  hypothetical protein  28.9 
 
 		 321 aa  76.6  0.0000000000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11078  hypothetical protein  26.42 
 
 		 316 aa  75.5  0.000000000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2344  Mammalian cell entry related domain protein  21.86 
 
 		 314 aa  73.2  0.000000000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2984  ABC transporter, permease component  27.5 
 
 		 325 aa  69.3  0.00000000007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.395413  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6192  Mammalian cell entry related domain protein  28.16 
 
 		 332 aa  67  0.0000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.387563 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1222  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  23.45 
 
 		 308 aa  66.6  0.0000000005  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0743  hypothetical protein  23.45 
 
 		 308 aa  66.6  0.0000000005  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3705  hypothetical protein  23.91 
 
 		 349 aa  66.2  0.0000000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5281  Mammalian cell entry related domain protein  24.65 
 
 		 340 aa  65.5  0.0000000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.192594 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0678  Mammalian cell entry related domain protein  24.1 
 
 		 529 aa  64.7  0.000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.828772 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3316  Mammalian cell entry related domain protein  29.32 
 
 		 266 aa  63.9  0.000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.635964  hitchhiker  0.0000217652 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0638  hypothetical protein  24.56 
 
 		 306 aa  62.8  0.000000006  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.498696 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0329  hypothetical protein  25.86 
 
 		 430 aa  62.8  0.000000007  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.967579  normal  0.70235 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0751  ABC transporter permease  26.14 
 
 		 308 aa  62.4  0.00000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0221313  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1049  hypothetical protein  26.76 
 
 		 292 aa  62  0.00000001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00460957 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4316  hypothetical protein  27.91 
 
 		 279 aa  61.2  0.00000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.209742  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1272  virulence factor MCE-like protein-related protein  22.9 
 
 		 347 aa  59.7  0.00000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.821992  hitchhiker  0.0000000117847 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1899  virulence factor Mce family protein  23.61 
 
 		 349 aa  59.3  0.00000007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3702  hypothetical protein  29.29 
 
 		 149 aa  58.2  0.0000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0403  hypothetical protein  31.65 
 
 		 146 aa  56.6  0.0000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.304841  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0687  hypothetical protein  26.76 
 
 		 332 aa  56.2  0.0000006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2733  Mammalian cell entry related domain protein  30.71 
 
 		 356 aa  55.8  0.0000008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.978964  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1007  Mammalian cell entry related domain protein  35.4 
 
 		 152 aa  54.3  0.000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.063355  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3566  hypothetical protein  26.14 
 
 		 312 aa  54.3  0.000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.46814  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2113  Mammalian cell entry related domain protein  25.58 
 
 		 316 aa  52  0.00001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.202192  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1508  Mammalian cell entry related domain protein  31.01 
 
 		 356 aa  52  0.00001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.577537 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0707  Mammalian cell entry related domain protein  21.99 
 
 		 362 aa  50.4  0.00004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.886561  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3307  Mammalian cell entry related domain protein  24.15 
 
 		 339 aa  49.7  0.00006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.185146  normal  0.246163 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1818  hypothetical protein  32.23 
 
 		 148 aa  49.7  0.00006  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0854  Mammalian cell entry related domain protein  30.23 
 
 		 148 aa  49.3  0.00007  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.102404 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1913  hypothetical protein  24.83 
 
 		 312 aa  47.8  0.0002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0449  ABC-type transport system protein  31.86 
 
 		 148 aa  48.1  0.0002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  2.58514e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3183  Mammalian cell entry related domain protein  27.78 
 
 		 150 aa  47.8  0.0002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1894  hypothetical protein  21.19 
 
 		 324 aa  47.8  0.0002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000276188  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1861  hypothetical protein  44.68 
 
 		 567 aa  48.1  0.0002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1156  Mammalian cell entry related domain protein  23.83 
 
 		 313 aa  47  0.0004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2299  putative ABC transport system substrate-binding protein  33.08 
 
 		 148 aa  47  0.0004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0104875  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0838  virulence factor Mce family protein  29.66 
 
 		 523 aa  46.6  0.0005  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1967  hypothetical protein  29.79 
 
 		 166 aa  46.2  0.0006  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.539275  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0815  mce-related protein  28.32 
 
 		 149 aa  46.2  0.0006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_22660  hypothetical protein  22.59 
 
 		 312 aa  46.2  0.0007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00283529 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3390  Mammalian cell entry related domain protein  23.95 
 
 		 317 aa  45.4  0.001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0881876 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0560  hypothetical protein  25.16 
 
 		 148 aa  45.1  0.001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000625618  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0031  hypothetical protein  25.23 
 
 		 305 aa  45.4  0.001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.929118  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1999  Mammalian cell entry related domain protein  40.43 
 
 		 567 aa  44.3  0.002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2448  hypothetical protein  25.63 
 
 		 333 aa  44.7  0.002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2084  Mammalian cell entry related domain protein  40.43 
 
 		 564 aa  44.7  0.002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0393  Mammalian cell entry related domain protein  22.91 
 
 		 515 aa  44.3  0.003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3569  Mammalian cell entry related domain protein  28.91 
 
 		 186 aa  44.3  0.003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0424468  hitchhiker  0.0000173433 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0343  hypothetical protein  28.12 
 
 		 187 aa  43.9  0.003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.908048  normal  0.599528 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3514  ABC transporter, inner membrane subunit  28.91 
 
 		 184 aa  43.9  0.003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.531635  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0389  putative signal peptide protein, toluene tolerance Ttg2C-like  28.91 
 
 		 181 aa  43.9  0.003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2106  virulence factor Mce family protein  29.91 
 
 		 486 aa  43.9  0.003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.583314  normal  0.616965 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1898  putative ABC transporter substrate-binding protein  30.23 
 
 		 155 aa  43.9  0.004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1506  virulence factor Mce family protein  29.52 
 
 		 339 aa  43.9  0.004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2768  hypothetical protein  28.91 
 
 		 184 aa  43.1  0.006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.422541  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0577  hypothetical protein  24.24 
 
 		 308 aa  42.7  0.007  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.749568  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0384  Mammalian cell entry related domain protein  25.66 
 
 		 152 aa  42.7  0.007  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.214826 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2368  hypothetical protein  23.51 
 
 		 316 aa  42.7  0.007  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.709282  normal  0.77833 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1435  hypothetical protein  23.84 
 
 		 313 aa  42.4  0.008  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0152442  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0626  ABC transporter permease  24.24 
 
 		 308 aa  42.4  0.009  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.112844  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1173  virulence factor Mce family protein  26.4 
 
 		 432 aa  42.4  0.009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.376131 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1041  hypothetical protein  31.19 
 
 		 150 aa  42.4  0.01  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0534  Mammalian cell entry related domain protein  31.82 
 
 		 150 aa  42.4  0.01  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>