120 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dole_0031 on replicon NC_009943
Organism: Desulfococcus oleovorans Hxd3



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009943  Dole_0031  hypothetical protein  100 
 
 
305 aa  618  1e-176  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.929118  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0795  Mammalian cell entry related domain protein  22.49 
 
 
328 aa  76.6  0.0000000000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0393  Mammalian cell entry related domain protein  23.81 
 
 
515 aa  70.9  0.00000000003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5281  Mammalian cell entry related domain protein  23.59 
 
 
340 aa  68.2  0.0000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.192594 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3316  Mammalian cell entry related domain protein  27.88 
 
 
266 aa  65.9  0.0000000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.635964  hitchhiker  0.0000217652 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0188  Mammalian cell entry related domain protein  23.78 
 
 
337 aa  65.9  0.0000000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.107684  normal  0.968767 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1810  Mammalian cell entry related domain protein  25.62 
 
 
341 aa  64.7  0.000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.550546 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0705  virulence factor Mce family protein  25 
 
 
321 aa  64.7  0.000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1854  Mammalian cell entry related domain protein  21.71 
 
 
318 aa  63.5  0.000000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000329704  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1899  virulence factor Mce family protein  20.66 
 
 
349 aa  62.8  0.000000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2984  ABC transporter, permease component  20.92 
 
 
325 aa  62.8  0.000000006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.395413  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0706  virulence factor Mce family protein  22.69 
 
 
520 aa  59.3  0.00000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.900705  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0638  hypothetical protein  24.12 
 
 
306 aa  58.2  0.0000002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.498696 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4341  virulence factor Mce family protein  22.14 
 
 
493 aa  57.4  0.0000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0139  virulence factor Mce family protein  23.08 
 
 
520 aa  57.4  0.0000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1173  virulence factor Mce family protein  26.15 
 
 
432 aa  57.4  0.0000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.376131 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1627  virulence factor Mce family protein  23.65 
 
 
509 aa  57  0.0000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.0870735 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1894  hypothetical protein  22.4 
 
 
324 aa  57  0.0000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000276188  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5201  virulence factor Mce family protein  20.95 
 
 
341 aa  56.6  0.0000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.922675  normal  0.183603 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4616  virulence factor MCE-like protein  22.3 
 
 
344 aa  56.2  0.0000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.978929  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4704  virulence factor Mce family protein  22.3 
 
 
344 aa  56.2  0.0000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.112748  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1873  Mammalian cell entry related domain protein  22.06 
 
 
293 aa  55.8  0.0000009  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.010294 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0960  virulence factor Mce family protein  20.9 
 
 
351 aa  55.5  0.000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1508  Mammalian cell entry related domain protein  20.2 
 
 
356 aa  55.5  0.000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.577537 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4584  hypothetical protein  22.92 
 
 
321 aa  54.7  0.000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4316  hypothetical protein  25.32 
 
 
279 aa  54.3  0.000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.209742  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2597  Mammalian cell entry related domain protein  24.89 
 
 
259 aa  54.3  0.000003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.144498  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2513  virulence factor Mce family protein  24.01 
 
 
564 aa  53.9  0.000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.444181 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0838  virulence factor Mce family protein  23.27 
 
 
523 aa  53.5  0.000004  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0678  Mammalian cell entry related domain protein  22.81 
 
 
529 aa  53.1  0.000006  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.828772 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3679  virulence factor Mce family protein  25.57 
 
 
564 aa  52.8  0.000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.794076  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1133  virulence factor Mce family protein  24.05 
 
 
445 aa  52.8  0.000008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0440  VpsC protein  21.38 
 
 
292 aa  52.4  0.00001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2299  putative ABC transport system substrate-binding protein  33.59 
 
 
148 aa  51.6  0.00001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0104875  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3666  virulence factor MCE-like protein  25.57 
 
 
564 aa  52  0.00001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3739  virulence factor Mce family protein  25.57 
 
 
564 aa  52  0.00001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3705  hypothetical protein  20.66 
 
 
349 aa  52  0.00001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0368  virulence factor Mce family protein  22.87 
 
 
481 aa  51.6  0.00002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0854  Mammalian cell entry related domain protein  29.6 
 
 
148 aa  51.2  0.00002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.102404 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03770  virulence factor Mce family protein  25 
 
 
420 aa  51.6  0.00002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0786  virulence factor MCE-like protein-related protein  27.14 
 
 
150 aa  50.4  0.00003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4145  virulence factor Mce family protein  22.94 
 
 
561 aa  50.8  0.00003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.903302  normal  0.559384 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0687  hypothetical protein  23.35 
 
 
332 aa  50.8  0.00003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0119  virulence factor MCE-like protein  27.36 
 
 
343 aa  50.4  0.00004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.410781  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0128  virulence factor Mce family protein  27.36 
 
 
343 aa  50.4  0.00004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.284372  normal  0.252656 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0109  virulence factor Mce family protein  27.36 
 
 
343 aa  50.4  0.00004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.971857  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0449  ABC-type transport system protein  27.97 
 
 
148 aa  49.7  0.00007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  2.58514e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0661  hypothetical protein  25.56 
 
 
292 aa  49.3  0.00007  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1557  virulence factor Mce family protein  19.32 
 
 
343 aa  49.3  0.00007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2254  Mammalian cell entry related domain protein  26.02 
 
 
292 aa  49.7  0.00007  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.371924  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0815  mce-related protein  25.9 
 
 
149 aa  49.3  0.00008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10606  MCE-family protein mce2F  23.27 
 
 
516 aa  49.3  0.00008  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.466214 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1203  hypothetical protein  22.03 
 
 
310 aa  49.3  0.00009  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.511791  normal  0.098201 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09330  virulence factor Mce family protein  23.53 
 
 
332 aa  48.5  0.0001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.892194 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1015  hypothetical protein  29.36 
 
 
321 aa  48.9  0.0001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3702  hypothetical protein  27.14 
 
 
149 aa  48.1  0.0002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2823  virulence factor Mce family protein  20.99 
 
 
361 aa  47.8  0.0002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.314486  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1242  Mammalian cell entry related domain protein  30.7 
 
 
707 aa  48.5  0.0002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3037  Mammalian cell entry related domain protein  26.23 
 
 
479 aa  47.8  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.622361 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0474  hypothetical protein  29.79 
 
 
164 aa  47.8  0.0003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.000014845  unclonable  0.00000680839 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0706  virulence factor Mce family protein  20.85 
 
 
379 aa  47.4  0.0003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2985  virulence factor Mce family protein  21.4 
 
 
344 aa  47.8  0.0003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5200  virulence factor Mce family protein  22 
 
 
355 aa  47.4  0.0003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.168356  normal  0.194199 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0710  virulence factor Mce family protein  22.94 
 
 
343 aa  47.4  0.0003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.476442  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3307  Mammalian cell entry related domain protein  21.97 
 
 
339 aa  47.4  0.0003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.185146  normal  0.246163 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11998  MCE-family protein mce3B  26.03 
 
 
342 aa  47.4  0.0003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000000434194  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2158  virulence factor Mce family protein  22.9 
 
 
342 aa  47.8  0.0003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0278327  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03740  virulence factor Mce family protein  25.97 
 
 
328 aa  47.4  0.0003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2023  hypothetical protein  25.45 
 
 
307 aa  47  0.0004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0403  hypothetical protein  24.26 
 
 
146 aa  47  0.0004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.304841  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2448  hypothetical protein  22.27 
 
 
333 aa  47  0.0004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3683  virulence factor Mce family protein  21.7 
 
 
341 aa  47  0.0004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.264066  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0009  virulence factor Mce family protein  22.39 
 
 
351 aa  47  0.0004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.629178  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3183  Mammalian cell entry related domain protein  27.21 
 
 
150 aa  47  0.0004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0560  hypothetical protein  25.87 
 
 
148 aa  46.6  0.0005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000625618  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3945  virulence factor Mce family protein  25 
 
 
476 aa  46.6  0.0005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4999  virulence factor Mce family protein  21.53 
 
 
344 aa  46.6  0.0005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.789271 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09310  virulence factor Mce family protein  20.81 
 
 
394 aa  47  0.0005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.91288 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2028  hypothetical protein  25 
 
 
307 aa  46.2  0.0006  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3670  virulence factor MCE-like protein  19.76 
 
 
341 aa  46.2  0.0006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3743  virulence factor Mce family protein  19.76 
 
 
341 aa  46.2  0.0006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.91638 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1954  hypothetical protein  22.03 
 
 
360 aa  46.2  0.0007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.104433  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4344  virulence factor Mce family protein  32.98 
 
 
349 aa  45.8  0.0008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2218  hypothetical protein  24.52 
 
 
154 aa  45.8  0.0009  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1696  Mammalian cell entry related domain protein  23.28 
 
 
293 aa  45.8  0.0009  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0276  virulence factor MCE-like protein  18.07 
 
 
341 aa  45.1  0.001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1529  virulence factor MCE-like protein  21.3 
 
 
479 aa  45.8  0.001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4612  virulence factor MCE-like protein  23.71 
 
 
584 aa  45.1  0.001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0286  virulence factor Mce family protein  18.07 
 
 
341 aa  45.1  0.001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.650731  normal  0.237761 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1552  virulence factor Mce family protein  21.3 
 
 
479 aa  45.8  0.001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.977582  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4700  virulence factor Mce family protein  23.71 
 
 
584 aa  45.1  0.001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0267  virulence factor Mce family protein  18.07 
 
 
341 aa  45.1  0.001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.664089  normal  0.681989 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4995  virulence factor Mce family protein  28.57 
 
 
580 aa  45.4  0.001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.771933  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4165  virulence factor Mce family protein  23.62 
 
 
484 aa  45.4  0.001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1041  hypothetical protein  28.07 
 
 
150 aa  45.4  0.001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3670  hypothetical protein  25.3 
 
 
353 aa  45.4  0.001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.0456409 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1739  Mammalian cell entry related domain protein  25.23 
 
 
292 aa  45.4  0.001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0981  hypothetical protein  25.68 
 
 
158 aa  44.7  0.002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12002  MCE-family protein mce3F  27.54 
 
 
437 aa  44.7  0.002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000281764  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2891  Mammalian cell entry related domain protein  28.77 
 
 
175 aa  44.7  0.002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.27124 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>