170 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Coch_2113 on replicon NC_013162
Organism: Capnocytophaga ochracea DSM 7271



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013162  Coch_2113  Mammalian cell entry related domain protein  100 
 
 
316 aa  633  1e-180  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.202192  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4584  hypothetical protein  40.91 
 
 
321 aa  236  6e-61  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11078  hypothetical protein  35.48 
 
 
316 aa  219  3.9999999999999997e-56  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6192  Mammalian cell entry related domain protein  34.64 
 
 
332 aa  181  1e-44  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.387563 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1867  Mammalian cell entry related domain protein  28.89 
 
 
316 aa  154  2.9999999999999998e-36  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.449047  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG1049  hypothetical protein  28.24 
 
 
292 aa  148  9e-35  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00460957 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3636  Mammalian cell entry related domain protein  32.09 
 
 
321 aa  142  8e-33  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.676726 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4901  Mammalian cell entry related domain protein  29.57 
 
 
328 aa  138  1e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.374077  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0638  hypothetical protein  27.53 
 
 
306 aa  119  4.9999999999999996e-26  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.498696 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0751  ABC transporter permease  27.74 
 
 
308 aa  114  2.0000000000000002e-24  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0221313  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2344  Mammalian cell entry related domain protein  26.56 
 
 
314 aa  108  2e-22  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1899  virulence factor Mce family protein  26.09 
 
 
349 aa  82.4  0.000000000000009  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3307  Mammalian cell entry related domain protein  23.82 
 
 
339 aa  78.6  0.0000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.185146  normal  0.246163 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3705  hypothetical protein  26.9 
 
 
349 aa  77.4  0.0000000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0393  Mammalian cell entry related domain protein  25.77 
 
 
515 aa  76.3  0.0000000000007  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1508  Mammalian cell entry related domain protein  27.42 
 
 
356 aa  74.7  0.000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.577537 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4517  hypothetical protein  22.13 
 
 
359 aa  73.9  0.000000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2541  virulence factor MCE-like protein-related protein  22.75 
 
 
360 aa  70.1  0.00000000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.143277  hitchhiker  0.00000000000784881 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1873  Mammalian cell entry related domain protein  24.68 
 
 
293 aa  70.1  0.00000000005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.010294 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0926  mce-related protein  28.65 
 
 
360 aa  67.8  0.0000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0188  Mammalian cell entry related domain protein  28.66 
 
 
337 aa  67.8  0.0000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.107684  normal  0.968767 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1696  Mammalian cell entry related domain protein  27.18 
 
 
293 aa  67.8  0.0000000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1272  virulence factor MCE-like protein-related protein  22.66 
 
 
347 aa  64.7  0.000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.821992  hitchhiker  0.0000000117847 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1739  Mammalian cell entry related domain protein  26.95 
 
 
292 aa  64.3  0.000000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2733  Mammalian cell entry related domain protein  28.25 
 
 
356 aa  63.5  0.000000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.978964  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2448  hypothetical protein  23.12 
 
 
333 aa  62.8  0.000000008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2254  Mammalian cell entry related domain protein  24.1 
 
 
292 aa  62.4  0.00000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.371924  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5199  virulence factor Mce family protein  26.74 
 
 
453 aa  62  0.00000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.214398  normal  0.135987 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0178  Mammalian cell entry related domain protein  24.91 
 
 
305 aa  62.4  0.00000001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0661  hypothetical protein  27.51 
 
 
292 aa  61.6  0.00000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1526  virulence factor MCE-like protein  26.47 
 
 
438 aa  60.8  0.00000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1549  virulence factor Mce family protein  26.47 
 
 
438 aa  60.8  0.00000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.427862  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2066  Mammalian cell entry related domain protein  23.29 
 
 
388 aa  60.8  0.00000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0710  virulence factor Mce family protein  24.16 
 
 
343 aa  60.1  0.00000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.476442  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3214  hypothetical protein  23.95 
 
 
360 aa  59.7  0.00000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0495  Mammalian cell entry related domain protein  27.68 
 
 
360 aa  59.7  0.00000007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0707  Mammalian cell entry related domain protein  24.22 
 
 
362 aa  59.7  0.00000007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.886561  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1559  virulence factor Mce family protein  25.54 
 
 
459 aa  59.3  0.00000008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0135  virulence factor Mce family protein  25.19 
 
 
343 aa  58.9  0.0000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0575  putative ABC transport system periplasmic substrate-binding protein  26.61 
 
 
288 aa  58.9  0.0000001  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0838  virulence factor Mce family protein  24.45 
 
 
523 aa  58.9  0.0000001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0478  VpsC protein  24.76 
 
 
292 aa  57.8  0.0000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.238955  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2103  virulence factor Mce family protein  24.42 
 
 
453 aa  57.8  0.0000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.265097  normal  0.867723 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1243  hypothetical protein  21.79 
 
 
360 aa  58.2  0.0000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2981  virulence factor Mce family protein  30.89 
 
 
390 aa  57.4  0.0000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4571  Mammalian cell entry related domain protein  24.6 
 
 
468 aa  57.4  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3948  virulence factor Mce family protein  25.82 
 
 
405 aa  57  0.0000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0908494  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3669  virulence factor MCE-like protein  27.3 
 
 
367 aa  56.6  0.0000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.493573  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3742  virulence factor Mce family protein  27.3 
 
 
367 aa  56.6  0.0000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.673254 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3682  virulence factor Mce family protein  27.3 
 
 
367 aa  56.6  0.0000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.192954  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4165  virulence factor Mce family protein  28.49 
 
 
487 aa  55.8  0.0000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.450079 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0687  hypothetical protein  23.4 
 
 
332 aa  55.8  0.0000009  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1435  hypothetical protein  23.36 
 
 
313 aa  55.8  0.0000009  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0152442  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0440  VpsC protein  24.67 
 
 
292 aa  55.1  0.000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_25211  putative ABC transporter  25.39 
 
 
291 aa  55.1  0.000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1527  virulence factor MCE-like protein  27.5 
 
 
424 aa  55.1  0.000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.292709  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0376  Mammalian cell entry related domain protein  25.64 
 
 
295 aa  54.7  0.000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.202968  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0678  Mammalian cell entry related domain protein  21.64 
 
 
529 aa  55.1  0.000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.828772 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1550  virulence factor Mce family protein  27.5 
 
 
424 aa  55.1  0.000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4186  virulence factor Mce family protein  24.63 
 
 
407 aa  55.1  0.000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0925  virulence factor Mce family protein  32.56 
 
 
427 aa  53.9  0.000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4168  virulence factor Mce family protein  26.18 
 
 
444 aa  53.1  0.000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.375234  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3980  virulence factor Mce family protein  24.14 
 
 
410 aa  53.1  0.000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0739  Mammalian cell entry related domain protein  30.65 
 
 
152 aa  52.8  0.000007  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.942465  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10604  MCE-family protein mce2D  25.73 
 
 
508 aa  52.8  0.000008  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2985  virulence factor Mce family protein  22.88 
 
 
344 aa  52.4  0.000009  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4602  virulence factor Mce family protein  26.01 
 
 
450 aa  52.4  0.000009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.939789  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2109  hypothetical protein  25.96 
 
 
331 aa  52.8  0.000009  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2246  virulence factor Mce family protein  32.26 
 
 
350 aa  52  0.00001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.73861  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2344  hypothetical protein  23.24 
 
 
306 aa  52  0.00001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0043368 
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_41114  predicted protein  22.55 
 
 
306 aa  52.4  0.00001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.830125  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0795  Mammalian cell entry related domain protein  23.57 
 
 
328 aa  51.6  0.00002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1999  Mammalian cell entry related domain protein  20.75 
 
 
567 aa  51.2  0.00002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5200  virulence factor Mce family protein  24.52 
 
 
355 aa  51.6  0.00002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.168356  normal  0.194199 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2084  Mammalian cell entry related domain protein  20.75 
 
 
564 aa  51.2  0.00002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1208  hypothetical protein  23.13 
 
 
308 aa  50.8  0.00003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11999  MCE-family protein mce3C  23.01 
 
 
410 aa  50.4  0.00004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.000000102981  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3306  Mammalian cell entry related domain protein  21.18 
 
 
350 aa  50.4  0.00004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.508137  normal  0.241337 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0705  virulence factor Mce family protein  30.86 
 
 
321 aa  50.4  0.00004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0137  virulence factor Mce family protein  28.12 
 
 
544 aa  50.1  0.00004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4148  virulence factor Mce family protein  27.38 
 
 
367 aa  50.4  0.00004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10606  MCE-family protein mce2F  23.44 
 
 
516 aa  50.4  0.00004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.466214 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13531  MCE-family protein mce4C  37.84 
 
 
357 aa  49.7  0.00007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000185056 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1558  virulence factor Mce family protein  23.79 
 
 
352 aa  49.7  0.00007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2218  hypothetical protein  34.21 
 
 
154 aa  49.3  0.00008  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1268  hypothetical protein  36.67 
 
 
155 aa  49.3  0.00008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1810  Mammalian cell entry related domain protein  25.69 
 
 
341 aa  49.3  0.00009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.550546 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1888  Mammalian cell entry related domain protein  20.63 
 
 
529 aa  49.3  0.00009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR1021  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein, putative  24.55 
 
 
331 aa  48.5  0.0001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0905  hypothetical protein  29.17 
 
 
158 aa  48.9  0.0001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0874  hypothetical protein  29.17 
 
 
158 aa  48.9  0.0001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2658  ABC-type transport system periplasmic component  25.2 
 
 
346 aa  48.9  0.0001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.102884  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0121  virulence factor MCE-like protein  26.57 
 
 
548 aa  48.9  0.0001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.216217  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0130  virulence factor Mce family protein  26.57 
 
 
548 aa  48.9  0.0001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.139367 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10173  MCE-family protein mce1D  23.89 
 
 
530 aa  48.5  0.0001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1502  Mammalian cell entry related domain protein  27.7 
 
 
228 aa  48.9  0.0001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0111  virulence factor Mce family protein  26.57 
 
 
548 aa  48.9  0.0001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0351  putative ABC transport system substrate-binding protein  25.27 
 
 
377 aa  48.1  0.0002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0475  putative ABC transport system periplasmic substrate-binding protein  24.89 
 
 
304 aa  47.8  0.0002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.848355  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3296  hypothetical protein  26.06 
 
 
164 aa  48.1  0.0002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.091613  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>