25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bpro_2658 on replicon NC_007948
Organism: Polaromonas sp. JS666



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007948  Bpro_2658  ABC-type transport system periplasmic component  100 
 
 		 346 aa  688    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.102884  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1790  hypothetical protein  78.87 
 
 		 343 aa  502  1e-141  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0502683 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2591  hypothetical protein  64 
 
 		 336 aa  423  1e-117  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.703679  normal  0.200982 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1217  Mammalian cell entry related domain protein  64 
 
 		 336 aa  424  1e-117  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1818  hypothetical protein  62.36 
 
 		 338 aa  408  1e-113  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2918  hypothetical protein  57.49 
 
 		 330 aa  373  1e-102  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.184503  normal  0.278538 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0011  hypothetical protein  62.02 
 
 		 324 aa  371  1e-101  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000604844 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0553  hypothetical protein  58.88 
 
 		 341 aa  366  1e-100  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.252149 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1223  ABC-type transport system periplasmic component  58.5 
 
 		 299 aa  360  3e-98  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0978  ABC-type transport system periplasmic component  41.97 
 
 		 308 aa  238  2e-61  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0163523  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1854  Mammalian cell entry related domain protein  26.47 
 
 		 318 aa  67  0.0000000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000329704  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1894  hypothetical protein  22.18 
 
 		 324 aa  58.9  0.0000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000276188  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0188  Mammalian cell entry related domain protein  21.14 
 
 		 337 aa  51.2  0.00003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.107684  normal  0.968767 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2193  Mammalian cell entry related domain protein  21.78 
 
 		 456 aa  49.3  0.0001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.141725  normal  0.182946 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2805  Mammalian cell entry related domain protein  23.25 
 
 		 357 aa  47.8  0.0003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1810  Mammalian cell entry related domain protein  24.1 
 
 		 341 aa  44.7  0.002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.550546 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1954  hypothetical protein  22.87 
 
 		 360 aa  44.7  0.002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.104433  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1982  Mammalian cell entry related domain protein  20.92 
 
 		 456 aa  44.3  0.003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0362661  normal  0.670067 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0031  hypothetical protein  21.31 
 
 		 305 aa  44.3  0.003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.929118  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1552  hypothetical protein  21.9 
 
 		 458 aa  44.7  0.003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.394461  normal  0.189115 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3980  virulence factor Mce family protein  26.64 
 
 		 410 aa  44.3  0.003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2048  hypothetical protein  29.7 
 
 		 579 aa  43.5  0.005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.715666 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1638  hypothetical protein  23.58 
 
 		 317 aa  43.5  0.006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0522  Mammalian cell entry related domain protein  20.96 
 
 		 308 aa  43.1  0.007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.629914  normal  0.424693 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2109  hypothetical protein  23.7 
 
 		 331 aa  43.1  0.007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>