24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnap_1790 on replicon NC_008781
Organism: Polaromonas naphthalenivorans CJ2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008781  Pnap_1790  hypothetical protein  100 
 
 		 343 aa  679    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0502683 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2658  ABC-type transport system periplasmic component  79.7 
 
 		 346 aa  513  1e-144  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.102884  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1217  Mammalian cell entry related domain protein  63.87 
 
 		 336 aa  416  9.999999999999999e-116  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2591  hypothetical protein  63.87 
 
 		 336 aa  416  9.999999999999999e-116  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.703679  normal  0.200982 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1818  hypothetical protein  64.6 
 
 		 338 aa  404  1e-111  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2918  hypothetical protein  61.69 
 
 		 330 aa  376  1e-103  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.184503  normal  0.278538 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0011  hypothetical protein  62.37 
 
 		 324 aa  372  1e-102  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000604844 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0553  hypothetical protein  59.21 
 
 		 341 aa  366  1e-100  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.252149 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1223  ABC-type transport system periplasmic component  56.54 
 
 		 299 aa  348  7e-95  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0978  ABC-type transport system periplasmic component  41.83 
 
 		 308 aa  236  6e-61  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0163523  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1854  Mammalian cell entry related domain protein  27.62 
 
 		 318 aa  61.2  0.00000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000329704  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1894  hypothetical protein  23.59 
 
 		 324 aa  60.5  0.00000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000276188  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0188  Mammalian cell entry related domain protein  22.03 
 
 		 337 aa  54.7  0.000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.107684  normal  0.968767 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2805  Mammalian cell entry related domain protein  25.54 
 
 		 357 aa  50.1  0.00006  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0795  Mammalian cell entry related domain protein  24.07 
 
 		 328 aa  47.8  0.0003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1508  Mammalian cell entry related domain protein  24.44 
 
 		 356 aa  46.6  0.0006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.577537 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0031  hypothetical protein  22.34 
 
 		 305 aa  46.6  0.0007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.929118  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1810  Mammalian cell entry related domain protein  24.12 
 
 		 341 aa  46.2  0.0008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.550546 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2048  hypothetical protein  26.76 
 
 		 579 aa  45.8  0.001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.715666 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3705  hypothetical protein  23.22 
 
 		 349 aa  45.4  0.001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4935  hypothetical protein  24.62 
 
 		 359 aa  44.7  0.002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.704687  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2315  hypothetical protein  27.4 
 
 		 433 aa  44.7  0.002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.629666  normal  0.23577 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4999  virulence factor Mce family protein  25.95 
 
 		 344 aa  43.5  0.006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.789271 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0960  virulence factor Mce family protein  30.34 
 
 		 351 aa  42.7  0.01  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>