31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbd_0978 on replicon NC_007404
Organism: Thiobacillus denitrificans ATCC 25259



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007404  Tbd_0978  ABC-type transport system periplasmic component  100 
 
 		 308 aa  610  9.999999999999999e-175  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0163523  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1790  hypothetical protein  43.16 
 
 		 343 aa  233  2.0000000000000002e-60  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0502683 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2658  ABC-type transport system periplasmic component  43.16 
 
 		 346 aa  234  2.0000000000000002e-60  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.102884  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0011  hypothetical protein  41.2 
 
 		 324 aa  222  6e-57  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000604844 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1818  hypothetical protein  40.97 
 
 		 338 aa  214  9.999999999999999e-55  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2591  hypothetical protein  39.93 
 
 		 336 aa  209  5e-53  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.703679  normal  0.200982 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1217  Mammalian cell entry related domain protein  39.93 
 
 		 336 aa  208  9e-53  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1223  ABC-type transport system periplasmic component  37.41 
 
 		 299 aa  203  2e-51  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2918  hypothetical protein  35.79 
 
 		 330 aa  192  4e-48  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.184503  normal  0.278538 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0553  hypothetical protein  37.46 
 
 		 341 aa  182  4.0000000000000006e-45  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.252149 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1854  Mammalian cell entry related domain protein  26.32 
 
 		 318 aa  83.2  0.000000000000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000329704  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1894  hypothetical protein  24.44 
 
 		 324 aa  70.1  0.00000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000276188  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0577  hypothetical protein  25.53 
 
 		 308 aa  51.6  0.00002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.749568  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0140  hypothetical protein  25.3 
 
 		 312 aa  50.8  0.00003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.682464 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1317  hypothetical protein  25.54 
 
 		 293 aa  50.4  0.00004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0988  putative ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  24.76 
 
 		 331 aa  50.4  0.00004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0626  ABC transporter permease  25.53 
 
 		 308 aa  50.4  0.00004  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.112844  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1841  hypothetical protein  21.45 
 
 		 313 aa  48.5  0.0001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4483  Mammalian cell entry related domain protein  26.29 
 
 		 297 aa  47.8  0.0002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1021  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein, putative  24.76 
 
 		 331 aa  46.6  0.0006  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0158  hypothetical protein  26.17 
 
 		 312 aa  46.2  0.0007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0156  hypothetical protein  24.9 
 
 		 312 aa  45.4  0.001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.997452 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1954  hypothetical protein  25.09 
 
 		 360 aa  45.1  0.001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.104433  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1552  hypothetical protein  24.21 
 
 		 458 aa  45.4  0.001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.394461  normal  0.189115 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1629  hypothetical protein  27.59 
 
 		 291 aa  45.4  0.001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.232196 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6192  Mammalian cell entry related domain protein  23.34 
 
 		 332 aa  45.1  0.002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.387563 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0678  Mammalian cell entry related domain protein  24.38 
 
 		 529 aa  45.1  0.002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.828772 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2048  hypothetical protein  25.56 
 
 		 579 aa  44.3  0.003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.715666 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2109  hypothetical protein  26.29 
 
 		 331 aa  43.9  0.004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1610  hypothetical protein  24.42 
 
 		 313 aa  43.5  0.004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1272  virulence factor MCE-like protein-related protein  23.45 
 
 		 347 aa  42.4  0.009  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.821992  hitchhiker  0.0000000117847 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>