28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtpsy_1217 on replicon NC_011992
Organism: Acidovorax ebreus TPSY



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011992  Dtpsy_1217  Mammalian cell entry related domain protein  100 
 
 		 336 aa  661    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2591  hypothetical protein  99.11 
 
 		 336 aa  655    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.703679  normal  0.200982 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1818  hypothetical protein  78.47 
 
 		 338 aa  497  1e-139  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2918  hypothetical protein  66.96 
 
 		 330 aa  422  1e-117  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.184503  normal  0.278538 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2658  ABC-type transport system periplasmic component  64.37 
 
 		 346 aa  420  1e-116  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.102884  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1790  hypothetical protein  67.92 
 
 		 343 aa  412  1e-114  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0502683 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0553  hypothetical protein  67.28 
 
 		 341 aa  407  1.0000000000000001e-112  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.252149 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0011  hypothetical protein  65.17 
 
 		 324 aa  377  1e-103  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000604844 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1223  ABC-type transport system periplasmic component  58.36 
 
 		 299 aa  340  2.9999999999999998e-92  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0978  ABC-type transport system periplasmic component  39.47 
 
 		 308 aa  209  6e-53  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0163523  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0188  Mammalian cell entry related domain protein  22.22 
 
 		 337 aa  67.8  0.0000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.107684  normal  0.968767 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1854  Mammalian cell entry related domain protein  25.52 
 
 		 318 aa  66.2  0.0000000008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000329704  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1894  hypothetical protein  22.32 
 
 		 324 aa  64.3  0.000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000276188  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2984  ABC transporter, permease component  22.3 
 
 		 325 aa  54.3  0.000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.395413  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1810  Mammalian cell entry related domain protein  23.84 
 
 		 341 aa  53.5  0.000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.550546 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1503  Mammalian cell entry related domain protein  24.74 
 
 		 307 aa  50.1  0.00005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5281  Mammalian cell entry related domain protein  25.13 
 
 		 340 aa  50.1  0.00005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.192594 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0960  virulence factor Mce family protein  26.42 
 
 		 351 aa  48.1  0.0002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2514  hypothetical protein  23.37 
 
 		 302 aa  47.4  0.0004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0373094  hitchhiker  0.00640469 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0743  hypothetical protein  22.15 
 
 		 308 aa  47  0.0005  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1222  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  22.15 
 
 		 308 aa  47  0.0005  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0031  hypothetical protein  21.31 
 
 		 305 aa  46.2  0.0008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.929118  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1954  hypothetical protein  23.59 
 
 		 360 aa  44.7  0.002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.104433  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1317  hypothetical protein  24.72 
 
 		 293 aa  45.1  0.002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2048  hypothetical protein  28.48 
 
 		 579 aa  43.9  0.003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.715666 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5555  ABC transporter periplasmic-binding protein  23.81 
 
 		 292 aa  43.9  0.004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.99193  normal  0.689785 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0178  Mammalian cell entry related domain protein  21.17 
 
 		 305 aa  43.9  0.004  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1899  virulence factor Mce family protein  23.44 
 
 		 349 aa  43.9  0.004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>