146 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Glov_1854 on replicon NC_010814
Organism: Geobacter lovleyi SZ



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010814  Glov_1854  Mammalian cell entry related domain protein  100 
 
 		 318 aa  634    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000329704  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1894  hypothetical protein  47.53 
 
 		 324 aa  311  9e-84  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000276188  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0978  ABC-type transport system periplasmic component  27.78 
 
 		 308 aa  87.4  3e-16  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0163523  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0031  hypothetical protein  21.71 
 
 		 305 aa  72.8  0.000000000007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.929118  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2658  ABC-type transport system periplasmic component  26 
 
 		 346 aa  70.1  0.00000000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.102884  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1810  Mammalian cell entry related domain protein  24.32 
 
 		 341 aa  67  0.0000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.550546 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1217  Mammalian cell entry related domain protein  24.83 
 
 		 336 aa  66.2  0.0000000007  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0553  hypothetical protein  26.63 
 
 		 341 aa  65.9  0.0000000009  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.252149 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1272  virulence factor MCE-like protein-related protein  24.65 
 
 		 347 aa  65.9  0.000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.821992  hitchhiker  0.0000000117847 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2591  hypothetical protein  23.79 
 
 		 336 aa  65.5  0.000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.703679  normal  0.200982 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1790  hypothetical protein  26.45 
 
 		 343 aa  63.5  0.000000005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0502683 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1818  hypothetical protein  24.39 
 
 		 338 aa  63.2  0.000000006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0678  Mammalian cell entry related domain protein  26.1 
 
 		 529 aa  62.4  0.000000009  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.828772 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0188  Mammalian cell entry related domain protein  24.48 
 
 		 337 aa  62.4  0.000000009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.107684  normal  0.968767 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2918  hypothetical protein  25.86 
 
 		 330 aa  62  0.00000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.184503  normal  0.278538 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2984  ABC transporter, permease component  20.78 
 
 		 325 aa  61.2  0.00000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.395413  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0795  Mammalian cell entry related domain protein  21.79 
 
 		 328 aa  60.1  0.00000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2448  hypothetical protein  27.14 
 
 		 333 aa  58.9  0.0000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4316  hypothetical protein  21.32 
 
 		 279 aa  58.9  0.0000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.209742  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5281  Mammalian cell entry related domain protein  25.5 
 
 		 340 aa  58.9  0.0000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.192594 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1610  hypothetical protein  23.49 
 
 		 313 aa  57.8  0.0000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0011  hypothetical protein  23.91 
 
 		 324 aa  57.8  0.0000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000604844 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2541  virulence factor MCE-like protein-related protein  36.94 
 
 		 360 aa  57.4  0.0000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.143277  hitchhiker  0.00000000000784881 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0290  Mammalian cell entry related domain protein  30.25 
 
 		 188 aa  57.8  0.0000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.151432  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3316  Mammalian cell entry related domain protein  21.62 
 
 		 266 aa  56.6  0.0000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.635964  hitchhiker  0.0000217652 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2514  hypothetical protein  22.99 
 
 		 302 aa  56.6  0.0000006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0373094  hitchhiker  0.00640469 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2048  hypothetical protein  22.99 
 
 		 579 aa  56.6  0.0000006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.715666 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1873  Mammalian cell entry related domain protein  25.53 
 
 		 293 aa  56.6  0.0000006  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.010294 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0283  Mammalian cell entry related domain protein  29.41 
 
 		 188 aa  56.2  0.0000007  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0329  hypothetical protein  23.4 
 
 		 430 aa  56.2  0.0000007  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.967579  normal  0.70235 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4616  virulence factor MCE-like protein  26.98 
 
 		 344 aa  55.5  0.000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.978929  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4704  virulence factor Mce family protein  26.98 
 
 		 344 aa  55.5  0.000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.112748  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1503  Mammalian cell entry related domain protein  22.41 
 
 		 307 aa  55.5  0.000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1508  Mammalian cell entry related domain protein  26.48 
 
 		 356 aa  55.1  0.000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.577537 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0403  hypothetical protein  27.78 
 
 		 146 aa  54.3  0.000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.304841  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1895  ABC transporter substrate binding protein  25.11 
 
 		 455 aa  53.9  0.000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1750  hypothetical protein  28.03 
 
 		 178 aa  54.3  0.000003  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.892099  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0926  mce-related protein  35.85 
 
 		 360 aa  53.9  0.000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0534  Mammalian cell entry related domain protein  29.46 
 
 		 150 aa  53.5  0.000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0626  ABC transporter permease  23.64 
 
 		 308 aa  53.5  0.000004  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.112844  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0577  hypothetical protein  23.64 
 
 		 308 aa  53.5  0.000005  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.749568  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3705  hypothetical protein  24.34 
 
 		 349 aa  53.1  0.000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2344  Mammalian cell entry related domain protein  24.41 
 
 		 314 aa  52.8  0.000008  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1243  hypothetical protein  32.41 
 
 		 360 aa  52.8  0.000008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3307  Mammalian cell entry related domain protein  21.98 
 
 		 339 aa  52.4  0.000009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.185146  normal  0.246163 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0039  hypothetical protein  21.48 
 
 		 312 aa  52  0.00001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.292682  normal  0.178021 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3806  Mammalian cell entry related domain protein  30.25 
 
 		 214 aa  52  0.00001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.0010771  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1978  hypothetical protein  25.3 
 
 		 568 aa  52  0.00001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.308445  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1899  virulence factor Mce family protein  24.44 
 
 		 349 aa  51.6  0.00002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2028  hypothetical protein  22.12 
 
 		 307 aa  51.6  0.00002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2023  hypothetical protein  22.54 
 
 		 307 aa  51.6  0.00002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2218  hypothetical protein  28.46 
 
 		 154 aa  51.6  0.00002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3214  hypothetical protein  31.48 
 
 		 360 aa  51.2  0.00002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0838  virulence factor Mce family protein  23.36 
 
 		 523 aa  51.2  0.00002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0707  Mammalian cell entry related domain protein  30 
 
 		 362 aa  51.6  0.00002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.886561  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3498  hypothetical protein  24.34 
 
 		 378 aa  50.8  0.00003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.252503 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0339  Mammalian cell entry related domain protein  24.31 
 
 		 152 aa  50.4  0.00004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.620596 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1203  hypothetical protein  25.4 
 
 		 310 aa  50.4  0.00004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.511791  normal  0.098201 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3569  Mammalian cell entry related domain protein  26.77 
 
 		 186 aa  50.4  0.00004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0424468  hitchhiker  0.0000173433 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0160  mce-related protein  24.31 
 
 		 152 aa  50.4  0.00004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0522  Mammalian cell entry related domain protein  23.28 
 
 		 308 aa  49.3  0.00008  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.629914  normal  0.424693 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1696  Mammalian cell entry related domain protein  25 
 
 		 293 aa  48.5  0.0001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3514  ABC transporter, inner membrane subunit  28.68 
 
 		 184 aa  48.5  0.0001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.531635  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1718  hypothetical protein  22.33 
 
 		 321 aa  48.9  0.0001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.130812  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0450  mce family protein  28.12 
 
 		 185 aa  48.5  0.0001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.132036  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4358  hypothetical protein  28.89 
 
 		 183 aa  48.9  0.0001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.52116  normal  0.0531845 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2066  Mammalian cell entry related domain protein  24.26 
 
 		 388 aa  48.9  0.0001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0514  hypothetical protein  28.12 
 
 		 185 aa  48.5  0.0001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.449918  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0343  hypothetical protein  28.68 
 
 		 187 aa  48.5  0.0001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.908048  normal  0.599528 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03181  ABC transporter substrate-binding protein  25 
 
 		 308 aa  48.9  0.0001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.721062  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0981  hypothetical protein  27.07 
 
 		 158 aa  48.5  0.0002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0334  hypothetical protein  28.68 
 
 		 187 aa  47.8  0.0002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0661  hypothetical protein  19.53 
 
 		 292 aa  48.5  0.0002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2118  hypothetical protein  27.56 
 
 		 151 aa  48.1  0.0002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3636  Mammalian cell entry related domain protein  23.51 
 
 		 321 aa  48.1  0.0002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.676726 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13532  MCE-family protein mce4B  22.22 
 
 		 350 aa  48.1  0.0002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000717957 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1144  hypothetical protein  28.12 
 
 		 185 aa  48.1  0.0002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1954  hypothetical protein  23.75 
 
 		 360 aa  47.8  0.0002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.104433  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2811  ABC transporter periplasmic substrate-binding protein  22.67 
 
 		 321 aa  47.4  0.0003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.218461  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2691  hypothetical protein  28.68 
 
 		 189 aa  47.4  0.0003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0995365  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0751  ABC transporter permease  24.53 
 
 		 308 aa  47.8  0.0003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0221313  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0416  hypothetical protein  28.68 
 
 		 189 aa  47.4  0.0003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.249405  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1739  Mammalian cell entry related domain protein  25.33 
 
 		 292 aa  47.4  0.0003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4999  virulence factor Mce family protein  29.27 
 
 		 344 aa  47.8  0.0003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.789271 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1360  Mammalian cell entry related domain protein  25.24 
 
 		 334 aa  47.4  0.0003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0395  hypothetical protein  28.68 
 
 		 187 aa  47.8  0.0003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.147868  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2315  hypothetical protein  21.91 
 
 		 433 aa  47  0.0004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.629666  normal  0.23577 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5201  virulence factor Mce family protein  24.59 
 
 		 341 aa  47  0.0004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.922675  normal  0.183603 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1487  hypothetical protein  22.67 
 
 		 321 aa  47  0.0004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.30011 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3629  hypothetical protein  30.43 
 
 		 187 aa  47  0.0004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.271767  normal  0.2689 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0988  putative ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  24.14 
 
 		 331 aa  47  0.0004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3670  hypothetical protein  22.59 
 
 		 353 aa  47  0.0004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.0456409 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0393  Mammalian cell entry related domain protein  23.57 
 
 		 515 aa  47.4  0.0004  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5087  hypothetical protein  26.27 
 
 		 312 aa  47  0.0005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0684473 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0389  putative signal peptide protein, toluene tolerance Ttg2C-like  25.98 
 
 		 181 aa  46.2  0.0006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2221  hypothetical protein  25.58 
 
 		 153 aa  46.6  0.0006  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.693824  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0100  Mammalian cell entry related domain protein  22.22 
 
 		 316 aa  46.6  0.0006  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1156  Mammalian cell entry related domain protein  23.61 
 
 		 313 aa  46.2  0.0007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0687  hypothetical protein  24.59 
 
 		 169 aa  46.2  0.0007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4901  Mammalian cell entry related domain protein  24.84 
 
 		 328 aa  46.2  0.0007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.374077  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>