22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_2918 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010002  Daci_2918  hypothetical protein  100 
 
 		 330 aa  649    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.184503  normal  0.278538 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1818  hypothetical protein  68.93 
 
 		 338 aa  432  1e-120  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1217  Mammalian cell entry related domain protein  66.96 
 
 		 336 aa  418  1e-116  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2591  hypothetical protein  66.37 
 
 		 336 aa  413  1e-114  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.703679  normal  0.200982 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1790  hypothetical protein  62.07 
 
 		 343 aa  378  1e-103  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0502683 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2658  ABC-type transport system periplasmic component  58.82 
 
 		 346 aa  374  1e-102  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.102884  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0553  hypothetical protein  61.47 
 
 		 341 aa  369  1e-101  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.252149 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0011  hypothetical protein  61.67 
 
 		 324 aa  356  3.9999999999999996e-97  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000604844 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1223  ABC-type transport system periplasmic component  54.1 
 
 		 299 aa  320  3e-86  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0978  ABC-type transport system periplasmic component  35.79 
 
 		 308 aa  193  3e-48  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0163523  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0188  Mammalian cell entry related domain protein  21.81 
 
 		 337 aa  67  0.0000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.107684  normal  0.968767 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2984  ABC transporter, permease component  21.29 
 
 		 325 aa  62  0.00000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.395413  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1854  Mammalian cell entry related domain protein  25.5 
 
 		 318 aa  62  0.00000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000329704  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1894  hypothetical protein  22.68 
 
 		 324 aa  59.7  0.00000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000276188  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1810  Mammalian cell entry related domain protein  23.56 
 
 		 341 aa  52.8  0.000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.550546 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2109  hypothetical protein  24.41 
 
 		 331 aa  51.6  0.00002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2843  hypothetical protein  26.38 
 
 		 319 aa  50.8  0.00003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1021  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein, putative  26.1 
 
 		 331 aa  49.3  0.00009  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0988  putative ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  23.67 
 
 		 331 aa  49.3  0.0001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5281  Mammalian cell entry related domain protein  21.11 
 
 		 340 aa  46.6  0.0005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.192594 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2048  hypothetical protein  25.35 
 
 		 579 aa  45.8  0.001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.715666 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1503  Mammalian cell entry related domain protein  25.5 
 
 		 307 aa  45.1  0.002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>