152 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHU_2984 on replicon NC_008255
Organism: Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008255  CHU_2984  ABC transporter, permease component  100 
 
 		 325 aa  649    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.395413  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0188  Mammalian cell entry related domain protein  50.78 
 
 		 337 aa  332  5e-90  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.107684  normal  0.968767 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5281  Mammalian cell entry related domain protein  46.23 
 
 		 340 aa  309  4e-83  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.192594 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0795  Mammalian cell entry related domain protein  44.9 
 
 		 328 aa  291  1e-77  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1810  Mammalian cell entry related domain protein  45.48 
 
 		 341 aa  280  2e-74  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.550546 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3316  Mammalian cell entry related domain protein  28.1 
 
 		 266 aa  100  3e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.635964  hitchhiker  0.0000217652 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4316  hypothetical protein  29.41 
 
 		 279 aa  98.2  2e-19  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.209742  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0707  Mammalian cell entry related domain protein  22.66 
 
 		 362 aa  82  0.00000000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.886561  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3214  hypothetical protein  26.37 
 
 		 360 aa  78.6  0.0000000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0678  Mammalian cell entry related domain protein  25 
 
 		 529 aa  75.5  0.000000000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.828772 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2448  hypothetical protein  27.21 
 
 		 333 aa  75.1  0.000000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1508  Mammalian cell entry related domain protein  23.1 
 
 		 356 aa  72.8  0.000000000008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.577537 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2254  Mammalian cell entry related domain protein  26.43 
 
 		 292 aa  66.6  0.0000000005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.371924  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1873  Mammalian cell entry related domain protein  24.29 
 
 		 293 aa  66.2  0.0000000006  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.010294 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1243  hypothetical protein  24.78 
 
 		 360 aa  65.9  0.0000000009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2541  virulence factor MCE-like protein-related protein  22.68 
 
 		 360 aa  63.9  0.000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.143277  hitchhiker  0.00000000000784881 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0687  hypothetical protein  22.45 
 
 		 332 aa  64.3  0.000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3705  hypothetical protein  22.9 
 
 		 349 aa  63.9  0.000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1899  virulence factor Mce family protein  22.08 
 
 		 349 aa  63.9  0.000000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0031  hypothetical protein  20.92 
 
 		 305 aa  62.8  0.000000008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.929118  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0926  mce-related protein  23.71 
 
 		 360 aa  61.6  0.00000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1739  Mammalian cell entry related domain protein  27.5 
 
 		 292 aa  61.6  0.00000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1696  Mammalian cell entry related domain protein  25.09 
 
 		 293 aa  60.5  0.00000004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2918  hypothetical protein  22.34 
 
 		 330 aa  60.5  0.00000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.184503  normal  0.278538 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0501  virulence factor Mce family protein  28.24 
 
 		 278 aa  59.3  0.00000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.298085  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1655  virulence factor MCE-like protein  28.24 
 
 		 342 aa  59.3  0.00000009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1679  virulence factor Mce family protein  28.24 
 
 		 342 aa  59.3  0.00000009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.859349  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1628  virulence factor Mce family protein  28.24 
 
 		 342 aa  59.3  0.00000009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0651  virulence factor Mce family protein  28.24 
 
 		 342 aa  59.3  0.00000009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.228257  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0393  Mammalian cell entry related domain protein  28.96 
 
 		 515 aa  58.5  0.0000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2937  hypothetical protein  36.97 
 
 		 162 aa  58.9  0.0000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.887715  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0329  hypothetical protein  24.82 
 
 		 430 aa  57.8  0.0000003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.967579  normal  0.70235 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0371  hypothetical protein  23.73 
 
 		 305 aa  57.8  0.0000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2733  Mammalian cell entry related domain protein  20.81 
 
 		 356 aa  57.4  0.0000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.978964  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3183  Mammalian cell entry related domain protein  31.78 
 
 		 150 aa  57.8  0.0000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1272  virulence factor MCE-like protein-related protein  21.13 
 
 		 347 aa  57.4  0.0000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.821992  hitchhiker  0.0000000117847 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1156  Mammalian cell entry related domain protein  33.33 
 
 		 163 aa  56.6  0.0000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.482142  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4517  hypothetical protein  22.9 
 
 		 359 aa  56.6  0.0000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0661  hypothetical protein  24.59 
 
 		 292 aa  56.6  0.0000006  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_22660  hypothetical protein  24.84 
 
 		 312 aa  56.2  0.0000007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00283529 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0795  hypothetical protein  35.29 
 
 		 168 aa  56.2  0.0000008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0952502  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1913  hypothetical protein  24.52 
 
 		 312 aa  55.8  0.0000008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1894  hypothetical protein  27.97 
 
 		 324 aa  55.8  0.0000009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000276188  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0478  VpsC protein  25.62 
 
 		 292 aa  55.1  0.000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.238955  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3238  Mammalian cell entry related domain protein  33.86 
 
 		 175 aa  55.8  0.000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.303674  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0140  hypothetical protein  23.78 
 
 		 312 aa  54.3  0.000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.682464 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0534  Mammalian cell entry related domain protein  30.71 
 
 		 150 aa  55.1  0.000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2508  virulence factor Mce family protein  26.36 
 
 		 397 aa  55.1  0.000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.650637 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1503  Mammalian cell entry related domain protein  23.23 
 
 		 307 aa  54.3  0.000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1854  Mammalian cell entry related domain protein  20.43 
 
 		 318 aa  53.9  0.000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000329704  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0687  hypothetical protein  31.45 
 
 		 169 aa  53.9  0.000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2399  hypothetical protein  31.15 
 
 		 156 aa  54.3  0.000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2891  Mammalian cell entry related domain protein  33.07 
 
 		 175 aa  54.3  0.000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.27124 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1041  hypothetical protein  32.79 
 
 		 150 aa  53.9  0.000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4715  Mammalian cell entry related domain protein  26.06 
 
 		 398 aa  53.5  0.000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.324726  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2048  hypothetical protein  23.71 
 
 		 579 aa  53.1  0.000006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.715666 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2960  signal peptide protein  36.27 
 
 		 173 aa  53.1  0.000007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.432073  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3120  hypothetical protein  35.58 
 
 		 173 aa  53.1  0.000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.771354  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0704  virulence factor Mce family protein  22.22 
 
 		 348 aa  53.1  0.000007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2591  hypothetical protein  23.14 
 
 		 336 aa  53.1  0.000007  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.703679  normal  0.200982 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1625  Mammalian cell entry related domain protein  29.37 
 
 		 559 aa  53.1  0.000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.164573 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13532  MCE-family protein mce4B  22.91 
 
 		 350 aa  52.8  0.000007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000717957 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3514  ABC transporter, inner membrane subunit  34.58 
 
 		 184 aa  52.8  0.000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.531635  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2691  hypothetical protein  33.01 
 
 		 189 aa  52.4  0.00001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0995365  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0416  hypothetical protein  33.01 
 
 		 189 aa  52.4  0.00001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.249405  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1217  Mammalian cell entry related domain protein  23.14 
 
 		 336 aa  52.4  0.00001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1557  virulence factor Mce family protein  21.12 
 
 		 343 aa  52  0.00001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0395  hypothetical protein  33.01 
 
 		 187 aa  52.4  0.00001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.147868  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0343  hypothetical protein  33.01 
 
 		 187 aa  51.6  0.00002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.908048  normal  0.599528 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0334  hypothetical protein  33.01 
 
 		 187 aa  52  0.00002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2344  hypothetical protein  26.96 
 
 		 306 aa  52  0.00002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0043368 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1718  hypothetical protein  23.83 
 
 		 321 aa  51.6  0.00002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.130812  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0786  virulence factor MCE-like protein-related protein  31.53 
 
 		 150 aa  50.8  0.00003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2805  Mammalian cell entry related domain protein  28.83 
 
 		 357 aa  51.2  0.00003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0098  hypothetical protein  34.91 
 
 		 160 aa  50.8  0.00003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.334829  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0838  virulence factor Mce family protein  27.13 
 
 		 523 aa  50.8  0.00003  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5087  hypothetical protein  21.67 
 
 		 312 aa  50.8  0.00003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0684473 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1375  hypothetical protein  23.85 
 
 		 390 aa  50.4  0.00004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6192  Mammalian cell entry related domain protein  23.65 
 
 		 332 aa  50.4  0.00004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.387563 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0560  hypothetical protein  30.39 
 
 		 148 aa  50.4  0.00004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000625618  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5201  virulence factor Mce family protein  22.58 
 
 		 341 aa  50.4  0.00004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.922675  normal  0.183603 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5534  hypothetical protein  33.62 
 
 		 161 aa  50.4  0.00004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.264569  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0440  VpsC protein  23.4 
 
 		 292 aa  50.1  0.00005  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2439  hypothetical protein  31.11 
 
 		 271 aa  50.1  0.00005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0222447  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0161  Mammalian cell entry related domain protein  24.44 
 
 		 334 aa  49.7  0.00006  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.458265 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0039  hypothetical protein  26.8 
 
 		 312 aa  49.7  0.00007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.292682  normal  0.178021 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1454  hypothetical protein  25.59 
 
 		 289 aa  49.7  0.00007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0474733  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_03151  putative ABC transporter  23.47 
 
 		 281 aa  49.7  0.00008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1355  hypothetical protein  23.02 
 
 		 390 aa  48.9  0.0001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0495  Mammalian cell entry related domain protein  23.96 
 
 		 360 aa  48.9  0.0001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3702  hypothetical protein  25.19 
 
 		 149 aa  48.9  0.0001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0097  Mammalian cell entry related domain protein  33.96 
 
 		 160 aa  48.5  0.0001  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  decreased coverage  0.0000148019  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4150  virulence factor Mce family protein  26.36 
 
 		 427 aa  48.9  0.0001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.357993  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3307  Mammalian cell entry related domain protein  22.73 
 
 		 339 aa  48.1  0.0002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.185146  normal  0.246163 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0119  putative ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  25.45 
 
 		 275 aa  48.1  0.0002  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2747  hypothetical protein  32.62 
 
 		 161 aa  48.1  0.0002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0119  virulence factor MCE-like protein  29.23 
 
 		 343 aa  48.1  0.0002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.410781  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0128  virulence factor Mce family protein  29.23 
 
 		 343 aa  48.1  0.0002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.284372  normal  0.252656 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0135  virulence factor Mce family protein  26.92 
 
 		 343 aa  47.8  0.0002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0718  Mammalian cell entry related domain protein  30.08 
 
 		 161 aa  48.5  0.0002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>