140 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_3307 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013440  Hoch_3307  Mammalian cell entry related domain protein  100 
 
 
339 aa  669    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.185146  normal  0.246163 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2448  hypothetical protein  25.21 
 
 
333 aa  80.1  0.00000000000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3214  hypothetical protein  21.55 
 
 
360 aa  75.1  0.000000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0926  mce-related protein  25.81 
 
 
360 aa  73.2  0.000000000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4517  hypothetical protein  24.07 
 
 
359 aa  67  0.0000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0393  Mammalian cell entry related domain protein  21.31 
 
 
515 aa  66.2  0.0000000008  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2541  virulence factor MCE-like protein-related protein  24.84 
 
 
360 aa  65.9  0.000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.143277  hitchhiker  0.00000000000784881 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2113  Mammalian cell entry related domain protein  23.66 
 
 
316 aa  64.7  0.000000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.202192  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1243  hypothetical protein  23.03 
 
 
360 aa  63.5  0.000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0161  Mammalian cell entry related domain protein  21.47 
 
 
334 aa  63.5  0.000000005  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.458265 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0678  Mammalian cell entry related domain protein  25.38 
 
 
529 aa  62.8  0.000000007  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.828772 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2066  Mammalian cell entry related domain protein  23.63 
 
 
388 aa  62.4  0.00000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0739  Mammalian cell entry related domain protein  31.75 
 
 
152 aa  61.2  0.00000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.942465  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0339  Mammalian cell entry related domain protein  30.77 
 
 
152 aa  61.2  0.00000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.620596 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0160  mce-related protein  30.77 
 
 
152 aa  61.2  0.00000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1173  virulence factor Mce family protein  24.75 
 
 
432 aa  60.8  0.00000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.376131 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1899  virulence factor Mce family protein  24.46 
 
 
349 aa  59.7  0.00000007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1529  virulence factor MCE-like protein  24.42 
 
 
479 aa  57.8  0.0000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1552  virulence factor Mce family protein  24.42 
 
 
479 aa  57.8  0.0000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.977582  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0838  virulence factor Mce family protein  20.93 
 
 
523 aa  58.5  0.0000002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1508  Mammalian cell entry related domain protein  24.19 
 
 
356 aa  57  0.0000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.577537 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0707  Mammalian cell entry related domain protein  22.52 
 
 
362 aa  56.6  0.0000007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.886561  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0495  Mammalian cell entry related domain protein  20.22 
 
 
360 aa  56.2  0.0000007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2891  Mammalian cell entry related domain protein  31.17 
 
 
175 aa  55.8  0.000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.27124 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3238  Mammalian cell entry related domain protein  31.17 
 
 
175 aa  55.5  0.000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.303674  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2733  Mammalian cell entry related domain protein  23.81 
 
 
356 aa  55.5  0.000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.978964  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0384  Mammalian cell entry related domain protein  29.01 
 
 
152 aa  55.1  0.000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.214826 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1320  Mammalian cell entry related domain protein  25.14 
 
 
337 aa  54.7  0.000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1272  virulence factor MCE-like protein-related protein  23.31 
 
 
347 aa  54.3  0.000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.821992  hitchhiker  0.0000000117847 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0815  mce-related protein  31.71 
 
 
149 aa  53.1  0.000007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1894  hypothetical protein  23.02 
 
 
324 aa  53.1  0.000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000276188  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11998  MCE-family protein mce3B  30.34 
 
 
342 aa  53.1  0.000007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000000434194  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1810  Mammalian cell entry related domain protein  21.39 
 
 
341 aa  52.8  0.000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.550546 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2597  Mammalian cell entry related domain protein  24.68 
 
 
259 aa  52.8  0.000009  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.144498  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2960  signal peptide protein  29.87 
 
 
173 aa  52.4  0.00001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.432073  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12002  MCE-family protein mce3F  28.97 
 
 
437 aa  52.8  0.00001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000281764  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0329  hypothetical protein  24.07 
 
 
430 aa  52  0.00001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.967579  normal  0.70235 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0890  Mammalian cell entry related domain protein  34.38 
 
 
156 aa  52.4  0.00001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.114761  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0479  hypothetical protein  24.76 
 
 
313 aa  51.6  0.00002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0772873  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2344  Mammalian cell entry related domain protein  24.35 
 
 
314 aa  51.6  0.00002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3705  hypothetical protein  21.41 
 
 
349 aa  51.2  0.00002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13533  MCE-family protein mce4A  22.14 
 
 
400 aa  51.6  0.00002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000534897 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2514  hypothetical protein  21.62 
 
 
302 aa  51.6  0.00002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0373094  hitchhiker  0.00640469 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0923  virulence factor Mce family protein  24.09 
 
 
343 aa  50.8  0.00003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.771537 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0239  hypothetical protein  30.08 
 
 
164 aa  50.4  0.00004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.852395 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2823  virulence factor Mce family protein  24.69 
 
 
361 aa  50.8  0.00004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.314486  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3316  Mammalian cell entry related domain protein  23.16 
 
 
266 aa  50.4  0.00004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.635964  hitchhiker  0.0000217652 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1982  Mammalian cell entry related domain protein  23.67 
 
 
456 aa  50.8  0.00004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0362661  normal  0.670067 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2784  ABC-type transport system involved in resistance to organic solvents periplasmic component  27.42 
 
 
155 aa  50.1  0.00006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.162084  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0188  Mammalian cell entry related domain protein  21.41 
 
 
337 aa  49.7  0.00007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.107684  normal  0.968767 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0119  putative ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  22.22 
 
 
275 aa  49.3  0.00008  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2118  hypothetical protein  27.01 
 
 
151 aa  49.7  0.00008  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1967  hypothetical protein  29.92 
 
 
166 aa  48.9  0.0001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.539275  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0718  Mammalian cell entry related domain protein  31.91 
 
 
161 aa  48.9  0.0001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2885  hypothetical protein  28.57 
 
 
160 aa  49.3  0.0001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.827962  normal  0.785076 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4316  hypothetical protein  24.73 
 
 
279 aa  49.3  0.0001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.209742  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2768  hypothetical protein  26.56 
 
 
184 aa  48.9  0.0001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.422541  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3569  Mammalian cell entry related domain protein  26.19 
 
 
186 aa  48.9  0.0001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0424468  hitchhiker  0.0000173433 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0786  virulence factor MCE-like protein-related protein  27.91 
 
 
150 aa  48.1  0.0002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1007  Mammalian cell entry related domain protein  24.19 
 
 
152 aa  48.5  0.0002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.063355  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1873  Mammalian cell entry related domain protein  23.1 
 
 
293 aa  48.1  0.0002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.010294 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1625  Mammalian cell entry related domain protein  26.86 
 
 
559 aa  48.5  0.0002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.164573 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0981  hypothetical protein  31.78 
 
 
158 aa  47.8  0.0003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2984  ABC transporter, permease component  22.73 
 
 
325 aa  47.8  0.0003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.395413  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4901  Mammalian cell entry related domain protein  23.53 
 
 
328 aa  47.8  0.0003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.374077  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1170  virulence factor Mce family protein  24.66 
 
 
346 aa  47.8  0.0003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1750  hypothetical protein  29.93 
 
 
178 aa  47.4  0.0003  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.892099  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0440  VpsC protein  25.42 
 
 
292 aa  47.4  0.0004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2819  virulence factor Mce family protein  28.46 
 
 
422 aa  47  0.0004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.906597  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0750  hypothetical protein  31.21 
 
 
161 aa  47.4  0.0004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4358  hypothetical protein  26.24 
 
 
183 aa  47  0.0004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.52116  normal  0.0531845 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0031  hypothetical protein  21.97 
 
 
305 aa  47.4  0.0004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.929118  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2193  Mammalian cell entry related domain protein  23.37 
 
 
456 aa  47  0.0004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.141725  normal  0.182946 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6192  Mammalian cell entry related domain protein  22.91 
 
 
332 aa  46.6  0.0006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.387563 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2221  hypothetical protein  28.68 
 
 
153 aa  46.6  0.0006  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.693824  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1268  hypothetical protein  33.01 
 
 
155 aa  46.6  0.0006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1718  hypothetical protein  26.39 
 
 
321 aa  46.6  0.0006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.130812  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0905  hypothetical protein  27.2 
 
 
158 aa  46.6  0.0007  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0874  hypothetical protein  27.2 
 
 
158 aa  46.6  0.0007  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0449  ABC-type transport system protein  26 
 
 
148 aa  46.2  0.0007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  2.58514e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0368  virulence factor Mce family protein  29.59 
 
 
481 aa  46.2  0.0007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0450  mce family protein  26.83 
 
 
185 aa  46.2  0.0008  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.132036  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0514  hypothetical protein  26.83 
 
 
185 aa  46.2  0.0008  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.449918  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0687  hypothetical protein  20.91 
 
 
332 aa  46.2  0.0008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3806  Mammalian cell entry related domain protein  25.2 
 
 
214 aa  46.2  0.0009  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.0010771  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0389  putative signal peptide protein, toluene tolerance Ttg2C-like  25 
 
 
181 aa  45.8  0.001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0661  hypothetical protein  22.32 
 
 
292 aa  45.8  0.001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0708  virulence factor Mce family protein  24.29 
 
 
424 aa  45.8  0.001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0372566  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3306  Mammalian cell entry related domain protein  21.43 
 
 
350 aa  45.4  0.001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.508137  normal  0.241337 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3648  Mammalian cell entry related domain protein  26.02 
 
 
190 aa  46.2  0.001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4584  hypothetical protein  20.06 
 
 
321 aa  45.8  0.001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1041  hypothetical protein  27.5 
 
 
150 aa  45.8  0.001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0283  Mammalian cell entry related domain protein  26.02 
 
 
188 aa  45.4  0.001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13532  MCE-family protein mce4B  23.94 
 
 
350 aa  45.4  0.001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000717957 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1169  virulence factor Mce family protein  22.79 
 
 
356 aa  45.4  0.001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1144  hypothetical protein  26.02 
 
 
185 aa  45.8  0.001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1739  Mammalian cell entry related domain protein  27.61 
 
 
292 aa  45.8  0.001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1854  Mammalian cell entry related domain protein  25 
 
 
318 aa  45.4  0.001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000329704  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1895  ABC transporter substrate binding protein  22.56 
 
 
455 aa  45.1  0.002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1696  Mammalian cell entry related domain protein  22.03 
 
 
293 aa  44.7  0.002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>