200 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_3316 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_3316  Mammalian cell entry related domain protein  100 
 
 		 266 aa  532  1e-150  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.635964  hitchhiker  0.0000217652 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4316  hypothetical protein  39.73 
 
 		 279 aa  185  8e-46  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.209742  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5281  Mammalian cell entry related domain protein  31.9 
 
 		 340 aa  125  5e-28  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.192594 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0188  Mammalian cell entry related domain protein  31.75 
 
 		 337 aa  115  7.999999999999999e-25  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.107684  normal  0.968767 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0795  Mammalian cell entry related domain protein  30.93 
 
 		 328 aa  112  4.0000000000000004e-24  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1810  Mammalian cell entry related domain protein  34.46 
 
 		 341 aa  113  4.0000000000000004e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.550546 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2984  ABC transporter, permease component  25.86 
 
 		 325 aa  103  3e-21  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.395413  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4517  hypothetical protein  29.85 
 
 		 359 aa  102  8e-21  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0707  Mammalian cell entry related domain protein  28.86 
 
 		 362 aa  100  2e-20  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.886561  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1873  Mammalian cell entry related domain protein  28.49 
 
 		 293 aa  73.2  0.000000000005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.010294 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6192  Mammalian cell entry related domain protein  35.88 
 
 		 332 aa  71.2  0.00000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.387563 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0478  VpsC protein  30.16 
 
 		 292 aa  68.2  0.0000000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.238955  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1696  Mammalian cell entry related domain protein  25.38 
 
 		 293 aa  67.8  0.0000000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1508  Mammalian cell entry related domain protein  26.34 
 
 		 356 aa  67.4  0.0000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.577537 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0678  Mammalian cell entry related domain protein  26.32 
 
 		 529 aa  67.4  0.0000000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.828772 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3705  hypothetical protein  26.55 
 
 		 349 aa  66.2  0.0000000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2448  hypothetical protein  25.68 
 
 		 333 aa  65.5  0.0000000009  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0440  VpsC protein  30.48 
 
 		 292 aa  65.5  0.000000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0031  hypothetical protein  27.88 
 
 		 305 aa  65.1  0.000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.929118  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1739  Mammalian cell entry related domain protein  29.32 
 
 		 292 aa  63.9  0.000000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4901  Mammalian cell entry related domain protein  26.78 
 
 		 328 aa  63.5  0.000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.374077  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0661  hypothetical protein  28.14 
 
 		 292 aa  61.2  0.00000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1894  hypothetical protein  29.28 
 
 		 324 aa  60.8  0.00000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000276188  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2254  Mammalian cell entry related domain protein  29.27 
 
 		 292 aa  60.5  0.00000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.371924  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1272  virulence factor MCE-like protein-related protein  25.45 
 
 		 347 aa  60.1  0.00000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.821992  hitchhiker  0.0000000117847 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2541  virulence factor MCE-like protein-related protein  27.95 
 
 		 360 aa  59.7  0.00000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.143277  hitchhiker  0.00000000000784881 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0687  hypothetical protein  23.58 
 
 		 332 aa  59.7  0.00000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4358  hypothetical protein  33.57 
 
 		 183 aa  59.3  0.00000007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.52116  normal  0.0531845 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0393  Mammalian cell entry related domain protein  26.91 
 
 		 515 aa  58.5  0.0000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2218  hypothetical protein  26.32 
 
 		 154 aa  57.4  0.0000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0283  Mammalian cell entry related domain protein  30.65 
 
 		 188 aa  57.8  0.0000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0290  Mammalian cell entry related domain protein  31.45 
 
 		 188 aa  57.8  0.0000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.151432  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5201  virulence factor Mce family protein  30 
 
 		 341 aa  57.8  0.0000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.922675  normal  0.183603 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2707  hypothetical protein  32.84 
 
 		 149 aa  57.8  0.0000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0495  Mammalian cell entry related domain protein  26.13 
 
 		 360 aa  57  0.0000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1867  Mammalian cell entry related domain protein  29.27 
 
 		 316 aa  57  0.0000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.449047  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0119  putative ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  27.23 
 
 		 275 aa  56.6  0.0000004  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11998  MCE-family protein mce3B  30.94 
 
 		 342 aa  56.6  0.0000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000000434194  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0638  hypothetical protein  23.72 
 
 		 306 aa  55.8  0.0000006  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.498696 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2733  Mammalian cell entry related domain protein  24.51 
 
 		 356 aa  55.8  0.0000007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.978964  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5534  hypothetical protein  32.84 
 
 		 161 aa  55.8  0.0000008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.264569  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3214  hypothetical protein  23.77 
 
 		 360 aa  55.5  0.0000009  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4445  mce-related protein  36.84 
 
 		 155 aa  55.1  0.000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4139  hypothetical protein  35.79 
 
 		 155 aa  54.7  0.000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3806  Mammalian cell entry related domain protein  28.15 
 
 		 214 aa  55.1  0.000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.0010771  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0854  Mammalian cell entry related domain protein  28.57 
 
 		 148 aa  54.7  0.000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.102404 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0815  mce-related protein  29.91 
 
 		 149 aa  54.7  0.000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1899  virulence factor Mce family protein  25 
 
 		 349 aa  54.7  0.000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3648  Mammalian cell entry related domain protein  32.61 
 
 		 190 aa  54.7  0.000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4603  virulence factor Mce family protein  32.14 
 
 		 346 aa  54.7  0.000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2118  hypothetical protein  30.4 
 
 		 151 aa  54.7  0.000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0329  hypothetical protein  29.2 
 
 		 430 aa  54.7  0.000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.967579  normal  0.70235 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3183  Mammalian cell entry related domain protein  26.57 
 
 		 150 aa  53.9  0.000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03656  hypothetical protein  29.63 
 
 		 165 aa  53.5  0.000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4616  virulence factor MCE-like protein  30.4 
 
 		 344 aa  53.1  0.000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.978929  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2597  Mammalian cell entry related domain protein  27.5 
 
 		 259 aa  53.5  0.000004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.144498  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4704  virulence factor Mce family protein  30.4 
 
 		 344 aa  53.1  0.000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.112748  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12870  organic solvent tolerance ABC efflux transporter, substrate binding protein  34.38 
 
 		 156 aa  53.1  0.000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0960  hypothetical protein  34.74 
 
 		 161 aa  52.8  0.000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0865  hypothetical protein  34.74 
 
 		 155 aa  52.8  0.000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1243  hypothetical protein  27.78 
 
 		 360 aa  52.8  0.000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0514  hypothetical protein  31.69 
 
 		 185 aa  52.4  0.000007  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.449918  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1655  virulence factor MCE-like protein  31.16 
 
 		 342 aa  52.4  0.000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1679  virulence factor Mce family protein  31.16 
 
 		 342 aa  52.4  0.000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.859349  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1628  virulence factor Mce family protein  31.16 
 
 		 342 aa  52.4  0.000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0651  virulence factor Mce family protein  31.16 
 
 		 342 aa  52.4  0.000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.228257  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0450  mce family protein  31.69 
 
 		 185 aa  52.4  0.000007  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.132036  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0743  hypothetical protein  30.25 
 
 		 308 aa  52  0.000009  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0501  virulence factor Mce family protein  31.16 
 
 		 278 aa  52  0.000009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.298085  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0923  virulence factor Mce family protein  30.43 
 
 		 343 aa  52  0.000009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.771537 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1222  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  30.25 
 
 		 308 aa  52  0.000009  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03058  predicted ABC-type organic solvent transporter  32.14 
 
 		 183 aa  52  0.00001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0328967  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0514  Mammalian cell entry related domain protein  32.14 
 
 		 183 aa  52  0.00001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0145877  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3386  Mce family protein  32.14 
 
 		 183 aa  52  0.00001  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000578801  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1144  hypothetical protein  30.99 
 
 		 185 aa  52  0.00001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0507  hypothetical protein  32.14 
 
 		 183 aa  52  0.00001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.945849  normal  0.16691 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3489  Mce family protein  32.14 
 
 		 183 aa  52  0.00001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3681  Mce family protein  32.14 
 
 		 183 aa  52  0.00001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0116721  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03009  hypothetical protein  32.14 
 
 		 183 aa  52  0.00001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0277207  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4515  Mce family protein  32.14 
 
 		 183 aa  52  0.00001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0766033  normal  0.489861 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13532  MCE-family protein mce4B  29.84 
 
 		 350 aa  52  0.00001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000717957 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3577  Mce family protein  32.14 
 
 		 183 aa  52  0.00001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.45422  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0926  mce-related protein  25.38 
 
 		 360 aa  50.8  0.00002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0786  virulence factor MCE-like protein-related protein  30 
 
 		 150 aa  51.2  0.00002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0999  hypothetical protein  33.68 
 
 		 160 aa  51.2  0.00002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0474  hypothetical protein  28.89 
 
 		 164 aa  51.2  0.00002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.000014845  unclonable  0.00000680839 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4255  hypothetical protein  34.74 
 
 		 161 aa  50.8  0.00002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1557  virulence factor Mce family protein  26.67 
 
 		 343 aa  51.2  0.00002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1041  hypothetical protein  31.09 
 
 		 150 aa  50.8  0.00002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3670  Mce family protein  33.67 
 
 		 183 aa  50.4  0.00003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.0296035 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3307  Mammalian cell entry related domain protein  23.16 
 
 		 339 aa  50.4  0.00003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.185146  normal  0.246163 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2299  putative ABC transport system substrate-binding protein  26.21 
 
 		 148 aa  50.4  0.00003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0104875  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1171  hypothetical protein  32.03 
 
 		 168 aa  50.4  0.00003  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3608  Mce family protein  33.67 
 
 		 183 aa  50.4  0.00003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.345737 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0560  hypothetical protein  25.53 
 
 		 148 aa  50.4  0.00003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000625618  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3503  Mce family protein  33.67 
 
 		 183 aa  50.4  0.00003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.869463  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4999  virulence factor Mce family protein  28.69 
 
 		 344 aa  50.4  0.00003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.789271 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3572  Mce family protein  33.67 
 
 		 183 aa  50.4  0.00003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3501  Mce family protein  33.67 
 
 		 183 aa  50.4  0.00003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0513461  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2747  hypothetical protein  28.79 
 
 		 161 aa  49.7  0.00004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>