129 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Glov_0495 on replicon NC_010814
Organism: Geobacter lovleyi SZ



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010814  Glov_0495  Mammalian cell entry related domain protein  100 
 
 
360 aa  726    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3214  hypothetical protein  62.5 
 
 
360 aa  462  1e-129  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1243  hypothetical protein  58.33 
 
 
360 aa  451  1e-125  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2541  virulence factor MCE-like protein-related protein  57.78 
 
 
360 aa  442  1e-123  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.143277  hitchhiker  0.00000000000784881 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0926  mce-related protein  58.33 
 
 
360 aa  439  9.999999999999999e-123  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4517  hypothetical protein  28.69 
 
 
359 aa  138  1e-31  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1873  Mammalian cell entry related domain protein  27.22 
 
 
293 aa  120  3e-26  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.010294 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2254  Mammalian cell entry related domain protein  26.72 
 
 
292 aa  111  2.0000000000000002e-23  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.371924  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3705  hypothetical protein  24.4 
 
 
349 aa  102  1e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1899  virulence factor Mce family protein  27.36 
 
 
349 aa  101  2e-20  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0661  hypothetical protein  25 
 
 
292 aa  99.8  6e-20  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1739  Mammalian cell entry related domain protein  24.52 
 
 
292 aa  99  1e-19  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0440  VpsC protein  26.03 
 
 
292 aa  96.3  6e-19  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1272  virulence factor MCE-like protein-related protein  25.57 
 
 
347 aa  95.9  1e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.821992  hitchhiker  0.0000000117847 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1508  Mammalian cell entry related domain protein  26.61 
 
 
356 aa  95.5  1e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.577537 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2733  Mammalian cell entry related domain protein  27.35 
 
 
356 aa  91.3  2e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.978964  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0795  Mammalian cell entry related domain protein  23.91 
 
 
328 aa  87  4e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1696  Mammalian cell entry related domain protein  23.43 
 
 
293 aa  84.7  0.000000000000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0478  VpsC protein  25 
 
 
292 aa  81.6  0.00000000000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.238955  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0188  Mammalian cell entry related domain protein  24.91 
 
 
337 aa  80.5  0.00000000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.107684  normal  0.968767 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0707  Mammalian cell entry related domain protein  25 
 
 
362 aa  78.6  0.0000000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.886561  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0678  Mammalian cell entry related domain protein  24.87 
 
 
529 aa  72.8  0.000000000008  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.828772 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3636  Mammalian cell entry related domain protein  23.93 
 
 
321 aa  70.9  0.00000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.676726 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4316  hypothetical protein  26.07 
 
 
279 aa  70.1  0.00000000006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.209742  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1810  Mammalian cell entry related domain protein  23.51 
 
 
341 aa  70.1  0.00000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.550546 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5281  Mammalian cell entry related domain protein  23.53 
 
 
340 aa  70.1  0.00000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.192594 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1867  Mammalian cell entry related domain protein  43.08 
 
 
316 aa  68.9  0.0000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.449047  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0687  hypothetical protein  24.64 
 
 
332 aa  67  0.0000000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2448  hypothetical protein  25.93 
 
 
333 aa  66.6  0.0000000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2066  Mammalian cell entry related domain protein  24.93 
 
 
388 aa  66.6  0.0000000007  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2344  Mammalian cell entry related domain protein  23.55 
 
 
314 aa  65.5  0.000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0838  virulence factor Mce family protein  25.91 
 
 
523 aa  65.1  0.000000002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3307  Mammalian cell entry related domain protein  20.22 
 
 
339 aa  63.9  0.000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.185146  normal  0.246163 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3316  Mammalian cell entry related domain protein  26.13 
 
 
266 aa  63.5  0.000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.635964  hitchhiker  0.0000217652 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11078  hypothetical protein  26.95 
 
 
316 aa  60.1  0.00000005  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4584  hypothetical protein  22.66 
 
 
321 aa  59.7  0.00000008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0393  Mammalian cell entry related domain protein  23.28 
 
 
515 aa  59.7  0.00000008  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2984  ABC transporter, permease component  23.96 
 
 
325 aa  57.8  0.0000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.395413  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4901  Mammalian cell entry related domain protein  25.41 
 
 
328 aa  57.4  0.0000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.374077  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1203  hypothetical protein  32.76 
 
 
310 aa  55.5  0.000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.511791  normal  0.098201 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0343  hypothetical protein  34.86 
 
 
187 aa  55.5  0.000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.908048  normal  0.599528 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0449  ABC-type transport system protein  32.79 
 
 
148 aa  54.3  0.000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  2.58514e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2822  virulence factor Mce family protein  32.46 
 
 
329 aa  54.3  0.000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.883459  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1818  hypothetical protein  34.78 
 
 
148 aa  54.7  0.000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0334  hypothetical protein  34.86 
 
 
187 aa  54.3  0.000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2691  hypothetical protein  34.86 
 
 
189 aa  53.5  0.000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0995365  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0416  hypothetical protein  34.86 
 
 
189 aa  53.5  0.000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.249405  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0395  hypothetical protein  34.86 
 
 
187 aa  53.5  0.000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.147868  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3514  ABC transporter, inner membrane subunit  33.94 
 
 
184 aa  53.1  0.000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.531635  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0403  hypothetical protein  28.81 
 
 
146 aa  52.8  0.000008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.304841  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1041  hypothetical protein  30.63 
 
 
150 aa  52.8  0.00001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0530  Mammalian cell entry related domain protein  33.33 
 
 
465 aa  52  0.00002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0794795  hitchhiker  0.00420823 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6192  Mammalian cell entry related domain protein  24.86 
 
 
332 aa  51.6  0.00002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.387563 
 
 
-
 
NC_002950  PG1049  hypothetical protein  26.24 
 
 
292 aa  51.6  0.00002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00460957 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2960  signal peptide protein  34.86 
 
 
173 aa  51.6  0.00002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.432073  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0560  hypothetical protein  29.57 
 
 
148 aa  52  0.00002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000625618  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0384  Mammalian cell entry related domain protein  28.45 
 
 
152 aa  51.6  0.00002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.214826 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0319  hypothetical protein  39.29 
 
 
187 aa  51.6  0.00002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0287402  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3569  Mammalian cell entry related domain protein  32.11 
 
 
186 aa  52  0.00002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0424468  hitchhiker  0.0000173433 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0513  Mammalian cell entry related domain protein  33.33 
 
 
465 aa  52  0.00002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0751  ABC transporter permease  32.97 
 
 
308 aa  50.8  0.00003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0221313  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2221  hypothetical protein  32.48 
 
 
153 aa  50.8  0.00003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.693824  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2747  hypothetical protein  32.26 
 
 
161 aa  50.4  0.00004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0534  Mammalian cell entry related domain protein  32.73 
 
 
150 aa  50.4  0.00004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0815  mce-related protein  27.68 
 
 
149 aa  50.4  0.00005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2118  hypothetical protein  35.34 
 
 
151 aa  50.4  0.00005  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0493  Mammalian cell entry related domain protein  24.53 
 
 
320 aa  50.1  0.00006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.254167  normal  0.0924288 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0389  putative signal peptide protein, toluene tolerance Ttg2C-like  32.11 
 
 
181 aa  49.7  0.00007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1007  Mammalian cell entry related domain protein  31.58 
 
 
152 aa  50.1  0.00007  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.063355  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3183  Mammalian cell entry related domain protein  33.04 
 
 
150 aa  49.7  0.00007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2299  putative ABC transport system substrate-binding protein  28.7 
 
 
148 aa  49.3  0.0001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0104875  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0161  Mammalian cell entry related domain protein  26.3 
 
 
334 aa  49.3  0.0001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.458265 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3002  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  36.9 
 
 
176 aa  48.1  0.0002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.784047  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2937  hypothetical protein  32.31 
 
 
162 aa  48.1  0.0002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.887715  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2218  hypothetical protein  29.6 
 
 
154 aa  48.1  0.0002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3238  Mammalian cell entry related domain protein  32.11 
 
 
175 aa  48.5  0.0002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.303674  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2891  Mammalian cell entry related domain protein  32.11 
 
 
175 aa  47.8  0.0003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.27124 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0239  hypothetical protein  32.77 
 
 
164 aa  47.8  0.0003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.852395 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0687  hypothetical protein  33.6 
 
 
169 aa  47.8  0.0003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0739  Mammalian cell entry related domain protein  36.71 
 
 
152 aa  47.4  0.0004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.942465  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2724  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  36.9 
 
 
184 aa  47  0.0005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3702  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  36.9 
 
 
188 aa  47  0.0005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3230  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  36.9 
 
 
186 aa  47  0.0005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.42671  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1779  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  36.9 
 
 
186 aa  47  0.0005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3675  mce family protein  36.9 
 
 
189 aa  47  0.0005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.090883  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3733  mce family protein  36.9 
 
 
186 aa  47  0.0005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2774  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  36.9 
 
 
186 aa  47  0.0005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0097  Mammalian cell entry related domain protein  37.04 
 
 
160 aa  46.6  0.0006  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  decreased coverage  0.0000148019  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1750  hypothetical protein  31.19 
 
 
178 aa  47  0.0006  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.892099  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0854  Mammalian cell entry related domain protein  28.7 
 
 
148 aa  47  0.0006  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.102404 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4223  ABC transporter, periplasmic ligand binding protein  24.82 
 
 
320 aa  46.6  0.0007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.381021 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2768  hypothetical protein  31.19 
 
 
184 aa  46.6  0.0008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.422541  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1898  putative ABC transporter substrate-binding protein  35.45 
 
 
155 aa  45.8  0.001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0795  hypothetical protein  32 
 
 
168 aa  46.2  0.001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0952502  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2707  hypothetical protein  30.91 
 
 
149 aa  45.8  0.001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3400  hypothetical protein  36.36 
 
 
156 aa  45.1  0.002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3702  hypothetical protein  29.31 
 
 
149 aa  45.1  0.002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0474  hypothetical protein  29.75 
 
 
164 aa  45.4  0.002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.000014845  unclonable  0.00000680839 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0718  Mammalian cell entry related domain protein  34.23 
 
 
161 aa  45.1  0.002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2344  hypothetical protein  40 
 
 
306 aa  44.7  0.002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0043368 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>