106 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHU_0751 on replicon NC_008255
Organism: Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008255  CHU_0751  ABC transporter permease  100 
 
 		 308 aa  613  9.999999999999999e-175  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0221313  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4901  Mammalian cell entry related domain protein  38.64 
 
 		 328 aa  201  9.999999999999999e-51  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.374077  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3636  Mammalian cell entry related domain protein  38.64 
 
 		 321 aa  197  1.0000000000000001e-49  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.676726 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1867  Mammalian cell entry related domain protein  33.33 
 
 		 316 aa  171  1e-41  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.449047  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6192  Mammalian cell entry related domain protein  31.89 
 
 		 332 aa  152  8.999999999999999e-36  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.387563 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4584  hypothetical protein  29.81 
 
 		 321 aa  122  9e-27  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1049  hypothetical protein  28.99 
 
 		 292 aa  117  1.9999999999999998e-25  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00460957 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11078  hypothetical protein  28.31 
 
 		 316 aa  117  3e-25  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0638  hypothetical protein  26.32 
 
 		 306 aa  115  1.0000000000000001e-24  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.498696 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2113  Mammalian cell entry related domain protein  28.75 
 
 		 316 aa  111  1.0000000000000001e-23  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.202192  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2344  Mammalian cell entry related domain protein  24.61 
 
 		 314 aa  73.9  0.000000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0838  virulence factor Mce family protein  26.65 
 
 		 523 aa  69.3  0.00000000008  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1899  virulence factor Mce family protein  27.33 
 
 		 349 aa  67.8  0.0000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1873  Mammalian cell entry related domain protein  26.51 
 
 		 293 aa  68.2  0.0000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.010294 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2028  hypothetical protein  26.88 
 
 		 307 aa  67  0.0000000004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1696  Mammalian cell entry related domain protein  28.21 
 
 		 293 aa  66.6  0.0000000005  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0329  hypothetical protein  26.15 
 
 		 430 aa  65.9  0.0000000009  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.967579  normal  0.70235 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2023  hypothetical protein  26.48 
 
 		 307 aa  64.3  0.000000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0393  Mammalian cell entry related domain protein  23.84 
 
 		 515 aa  63.2  0.000000005  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2254  Mammalian cell entry related domain protein  27.42 
 
 		 292 aa  63.2  0.000000005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.371924  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0705  virulence factor Mce family protein  27.24 
 
 		 321 aa  62  0.00000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0743  hypothetical protein  20.27 
 
 		 308 aa  60.5  0.00000004  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1222  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  20.27 
 
 		 308 aa  60.5  0.00000004  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1739  Mammalian cell entry related domain protein  25.24 
 
 		 292 aa  60.1  0.00000005  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1272  virulence factor MCE-like protein-related protein  26.37 
 
 		 347 aa  59.7  0.00000007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.821992  hitchhiker  0.0000000117847 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0440  VpsC protein  26.57 
 
 		 292 aa  58.5  0.0000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3705  hypothetical protein  26.9 
 
 		 349 aa  58.5  0.0000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0707  Mammalian cell entry related domain protein  26.22 
 
 		 362 aa  58.9  0.0000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.886561  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0478  VpsC protein  25.73 
 
 		 292 aa  56.6  0.0000005  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.238955  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1508  Mammalian cell entry related domain protein  24.3 
 
 		 356 aa  55.8  0.0000008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.577537 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1435  hypothetical protein  24.44 
 
 		 313 aa  54.7  0.000002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0152442  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1208  hypothetical protein  28.1 
 
 		 308 aa  53.9  0.000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2514  hypothetical protein  22.4 
 
 		 302 aa  53.5  0.000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0373094  hitchhiker  0.00640469 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2811  ABC transporter periplasmic substrate-binding protein  22.12 
 
 		 321 aa  52  0.00001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.218461  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2448  hypothetical protein  21.71 
 
 		 333 aa  52  0.00001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2315  hypothetical protein  25.61 
 
 		 433 aa  52.4  0.00001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.629666  normal  0.23577 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0207  hypothetical protein  24.58 
 
 		 320 aa  52.4  0.00001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0522  Mammalian cell entry related domain protein  26.22 
 
 		 308 aa  52  0.00001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.629914  normal  0.424693 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1506  virulence factor Mce family protein  26.54 
 
 		 339 aa  52.4  0.00001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0351  putative ABC transport system substrate-binding protein  24 
 
 		 377 aa  51.6  0.00002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2368  hypothetical protein  24.84 
 
 		 316 aa  51.2  0.00002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.709282  normal  0.77833 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0661  hypothetical protein  26.62 
 
 		 292 aa  51.2  0.00002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0924  virulence factor Mce family protein  25.18 
 
 		 438 aa  51.6  0.00002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.841372 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1487  hypothetical protein  21.7 
 
 		 321 aa  51.6  0.00002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.30011 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2103  virulence factor Mce family protein  26.1 
 
 		 453 aa  51.2  0.00002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.265097  normal  0.867723 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0090  mce related protein  24.73 
 
 		 313 aa  51.6  0.00002  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0699486  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3498  hypothetical protein  28.96 
 
 		 378 aa  51.6  0.00002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.252503 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2159  virulence factor Mce family protein  25.97 
 
 		 321 aa  51.2  0.00002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0878447  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0315  signal peptide protein  21.72 
 
 		 330 aa  50.8  0.00003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0170  Mammalian cell entry related domain protein  23.66 
 
 		 322 aa  50.4  0.00003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0495  Mammalian cell entry related domain protein  32.97 
 
 		 360 aa  50.8  0.00003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2733  Mammalian cell entry related domain protein  23.9 
 
 		 356 aa  50.4  0.00004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.978964  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0795  Mammalian cell entry related domain protein  24.12 
 
 		 328 aa  50.4  0.00004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2066  Mammalian cell entry related domain protein  22.02 
 
 		 388 aa  50.1  0.00005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0178  Mammalian cell entry related domain protein  25.33 
 
 		 305 aa  49.3  0.00009  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4517  hypothetical protein  24.66 
 
 		 359 aa  48.9  0.0001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1841  hypothetical protein  32.17 
 
 		 313 aa  48.9  0.0001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1982  Mammalian cell entry related domain protein  23.11 
 
 		 456 aa  48.9  0.0001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0362661  normal  0.670067 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0926  mce-related protein  35.59 
 
 		 360 aa  48.1  0.0002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2541  virulence factor MCE-like protein-related protein  21.65 
 
 		 360 aa  47.8  0.0002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.143277  hitchhiker  0.00000000000784881 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1526  virulence factor MCE-like protein  24.4 
 
 		 438 aa  48.1  0.0002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1549  virulence factor Mce family protein  24.4 
 
 		 438 aa  48.1  0.0002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.427862  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13531  MCE-family protein mce4C  30.28 
 
 		 357 aa  48.1  0.0002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000185056 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0577  hypothetical protein  26.09 
 
 		 308 aa  48.1  0.0002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.749568  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0100  Mammalian cell entry related domain protein  24.88 
 
 		 316 aa  48.1  0.0002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0140  hypothetical protein  23.58 
 
 		 312 aa  47.4  0.0003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.682464 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0172  Mce family protein  25.35 
 
 		 304 aa  47.8  0.0003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2910  hypothetical protein  25.14 
 
 		 317 aa  47.4  0.0003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2048  hypothetical protein  25.91 
 
 		 579 aa  47.4  0.0003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.715666 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0893  hypothetical protein  28.93 
 
 		 360 aa  47.4  0.0003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.932259  normal  0.840241 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0626  ABC transporter permease  26.09 
 
 		 308 aa  47.4  0.0003  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.112844  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0853  Mammalian cell entry related domain protein  28.93 
 
 		 360 aa  47.4  0.0003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.547444  normal  0.0740756 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03740  virulence factor Mce family protein  26.14 
 
 		 328 aa  47.4  0.0003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0575  putative ABC transport system periplasmic substrate-binding protein  20.54 
 
 		 288 aa  47  0.0004  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0819  Mammalian cell entry related domain protein  28.93 
 
 		 360 aa  47  0.0004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.940856  normal  0.371377 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0678  Mammalian cell entry related domain protein  22.58 
 
 		 529 aa  47  0.0004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.828772 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1195  hypothetical protein  34.17 
 
 		 312 aa  46.6  0.0005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0156  hypothetical protein  24.44 
 
 		 312 aa  46.6  0.0005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.997452 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2299  putative ABC transport system substrate-binding protein  32.81 
 
 		 148 aa  46.6  0.0006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0104875  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4397  virulence factor Mce family protein  29.58 
 
 		 430 aa  46.2  0.0006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2193  Mammalian cell entry related domain protein  23.02 
 
 		 456 aa  46.6  0.0006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.141725  normal  0.182946 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1718  hypothetical protein  21.54 
 
 		 321 aa  45.8  0.0008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.130812  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0405  hypothetical protein  22.91 
 
 		 309 aa  45.8  0.0008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0144565 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0177  Mammalian cell entry related domain protein  22.81 
 
 		 322 aa  45.8  0.0008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0249  ABC-type transport system periplasmic component  23.33 
 
 		 315 aa  45.4  0.001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.79889 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4602  virulence factor Mce family protein  24.61 
 
 		 450 aa  45.1  0.001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.939789  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1810  Mammalian cell entry related domain protein  25.25 
 
 		 341 aa  45.1  0.001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.550546 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_22660  hypothetical protein  22.54 
 
 		 312 aa  44.7  0.002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00283529 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1894  hypothetical protein  23.02 
 
 		 324 aa  45.1  0.002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000276188  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2744  hypothetical protein  23.11 
 
 		 315 aa  44.7  0.002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0811657 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1503  Mammalian cell entry related domain protein  23.3 
 
 		 307 aa  44.3  0.002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0188  Mammalian cell entry related domain protein  23.64 
 
 		 337 aa  44.7  0.002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.107684  normal  0.968767 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0021  ABC-type transport system involved in resistance to organic solvents periplasmic component-like  25.89 
 
 		 313 aa  43.9  0.003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.577639  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1983  hypothetical protein  20.39 
 
 		 301 aa  43.9  0.003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4186  virulence factor Mce family protein  26.03 
 
 		 407 aa  43.9  0.003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1170  virulence factor Mce family protein  23.81 
 
 		 346 aa  43.9  0.003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09340  virulence factor Mce family protein  38.46 
 
 		 329 aa  44.3  0.003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.677284 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3214  hypothetical protein  20.73 
 
 		 360 aa  43.5  0.004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3566  hypothetical protein  21.45 
 
 		 312 aa  43.9  0.004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.46814  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0364  virulence factor Mce family protein  28.95 
 
 		 342 aa  43.5  0.005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>