58 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppha_2254 on replicon NC_011060
Organism: Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011060  Ppha_2254  Mammalian cell entry related domain protein  100 
 
 		 292 aa  583  1.0000000000000001e-165  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.371924  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0478  VpsC protein  73.63 
 
 		 292 aa  445  1.0000000000000001e-124  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.238955  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1739  Mammalian cell entry related domain protein  73.29 
 
 		 292 aa  423  1e-117  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0661  hypothetical protein  70.89 
 
 		 292 aa  412  1e-114  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0440  VpsC protein  63.36 
 
 		 292 aa  371  1e-102  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1873  Mammalian cell entry related domain protein  56.31 
 
 		 293 aa  343  2.9999999999999997e-93  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.010294 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1696  Mammalian cell entry related domain protein  54.61 
 
 		 293 aa  332  4e-90  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1243  hypothetical protein  26.16 
 
 		 360 aa  119  7e-26  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2541  virulence factor MCE-like protein-related protein  24.17 
 
 		 360 aa  111  1.0000000000000001e-23  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.143277  hitchhiker  0.00000000000784881 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3214  hypothetical protein  24.26 
 
 		 360 aa  109  6e-23  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0495  Mammalian cell entry related domain protein  27.27 
 
 		 360 aa  105  1e-21  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0926  mce-related protein  25.62 
 
 		 360 aa  102  6e-21  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4517  hypothetical protein  23.92 
 
 		 359 aa  98.2  1e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1867  Mammalian cell entry related domain protein  27.39 
 
 		 316 aa  85.1  0.000000000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.449047  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0795  Mammalian cell entry related domain protein  28.52 
 
 		 328 aa  83.6  0.000000000000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3636  Mammalian cell entry related domain protein  26.13 
 
 		 321 aa  83.2  0.000000000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.676726 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4901  Mammalian cell entry related domain protein  27.39 
 
 		 328 aa  83.2  0.000000000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.374077  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0188  Mammalian cell entry related domain protein  26.78 
 
 		 337 aa  82.4  0.000000000000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.107684  normal  0.968767 
 
 
-
 
NC_002950  PG1049  hypothetical protein  28.08 
 
 		 292 aa  76.6  0.0000000000005  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00460957 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1810  Mammalian cell entry related domain protein  27.88 
 
 		 341 aa  72  0.00000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.550546 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6192  Mammalian cell entry related domain protein  26.01 
 
 		 332 aa  71.2  0.00000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.387563 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4316  hypothetical protein  30.43 
 
 		 279 aa  71.6  0.00000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.209742  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5281  Mammalian cell entry related domain protein  24.44 
 
 		 340 aa  70.9  0.00000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.192594 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4584  hypothetical protein  27.07 
 
 		 321 aa  70.5  0.00000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11078  hypothetical protein  24.12 
 
 		 316 aa  67  0.0000000004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3705  hypothetical protein  28.52 
 
 		 349 aa  67  0.0000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2984  ABC transporter, permease component  26.43 
 
 		 325 aa  67  0.0000000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.395413  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2344  Mammalian cell entry related domain protein  21.12 
 
 		 314 aa  64.7  0.000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0751  ABC transporter permease  27.42 
 
 		 308 aa  63.2  0.000000005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0221313  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3316  Mammalian cell entry related domain protein  29.76 
 
 		 266 aa  61.2  0.00000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.635964  hitchhiker  0.0000217652 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1899  virulence factor Mce family protein  25.71 
 
 		 349 aa  57.8  0.0000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0329  hypothetical protein  25.57 
 
 		 430 aa  57.8  0.0000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.967579  normal  0.70235 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0687  hypothetical protein  25.52 
 
 		 332 aa  57.4  0.0000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0707  Mammalian cell entry related domain protein  23.59 
 
 		 362 aa  57  0.0000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.886561  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0638  hypothetical protein  24.83 
 
 		 306 aa  56.2  0.0000006  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.498696 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1272  virulence factor MCE-like protein-related protein  23.63 
 
 		 347 aa  55.5  0.000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.821992  hitchhiker  0.0000000117847 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0838  virulence factor Mce family protein  24.88 
 
 		 523 aa  53.9  0.000003  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3390  Mammalian cell entry related domain protein  23.38 
 
 		 317 aa  53.9  0.000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0881876 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0393  Mammalian cell entry related domain protein  23.24 
 
 		 515 aa  52.4  0.000008  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0678  Mammalian cell entry related domain protein  20.9 
 
 		 529 aa  52.8  0.000008  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.828772 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1508  Mammalian cell entry related domain protein  24.22 
 
 		 356 aa  50.8  0.00003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.577537 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0031  hypothetical protein  26.02 
 
 		 305 aa  49.7  0.00007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.929118  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3702  hypothetical protein  29.17 
 
 		 149 aa  48.5  0.0001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0449  ABC-type transport system protein  31.9 
 
 		 148 aa  47.4  0.0003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  2.58514e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1007  Mammalian cell entry related domain protein  30.7 
 
 		 152 aa  47  0.0003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.063355  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2113  Mammalian cell entry related domain protein  24.1 
 
 		 316 aa  47  0.0003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.202192  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2299  putative ABC transport system substrate-binding protein  28.46 
 
 		 148 aa  46.2  0.0006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0104875  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3183  Mammalian cell entry related domain protein  28.7 
 
 		 150 aa  45.8  0.0009  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1818  hypothetical protein  29.85 
 
 		 148 aa  45.4  0.001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0403  hypothetical protein  26.87 
 
 		 146 aa  45.4  0.001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.304841  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1898  putative ABC transporter substrate-binding protein  27.78 
 
 		 155 aa  45.1  0.001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1894  hypothetical protein  19.75 
 
 		 324 aa  44.7  0.002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000276188  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2822  virulence factor Mce family protein  31.03 
 
 		 329 aa  43.9  0.003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.883459  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2733  Mammalian cell entry related domain protein  25.22 
 
 		 356 aa  43.5  0.004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.978964  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2084  Mammalian cell entry related domain protein  34 
 
 		 564 aa  42.7  0.008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1999  Mammalian cell entry related domain protein  34 
 
 		 567 aa  42.4  0.008  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1435  hypothetical protein  24.38 
 
 		 313 aa  42.4  0.01  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0152442  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0384  Mammalian cell entry related domain protein  21.48 
 
 		 152 aa  42.4  0.01  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.214826 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>