29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gdia_3390 on replicon NC_011365
Organism: Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011365  Gdia_3390  Mammalian cell entry related domain protein  100 
 
 
317 aa  634    Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.0881876 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1810  Mammalian cell entry related domain protein  26.03 
 
 
341 aa  73.6  0.000000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.550546 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2448  hypothetical protein  24.63 
 
 
333 aa  61.2  0.00000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0926  mce-related protein  23.69 
 
 
360 aa  61.6  0.00000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0795  Mammalian cell entry related domain protein  25.45 
 
 
328 aa  60.5  0.00000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0661  hypothetical protein  23.29 
 
 
292 aa  57  0.0000004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2254  Mammalian cell entry related domain protein  22.48 
 
 
292 aa  56.2  0.0000007  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.371924  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1243  hypothetical protein  22.31 
 
 
360 aa  55.8  0.0000009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1873  Mammalian cell entry related domain protein  23.17 
 
 
293 aa  55.1  0.000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.010294 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2541  virulence factor MCE-like protein-related protein  24.1 
 
 
360 aa  53.9  0.000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.143277  hitchhiker  0.00000000000784881 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1894  hypothetical protein  18.99 
 
 
324 aa  53.5  0.000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000276188  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0478  VpsC protein  20.48 
 
 
292 aa  53.1  0.000006  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.238955  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0188  Mammalian cell entry related domain protein  19.93 
 
 
337 aa  51.6  0.00002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.107684  normal  0.968767 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5281  Mammalian cell entry related domain protein  23.36 
 
 
340 aa  50.1  0.00005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.192594 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0440  VpsC protein  28.02 
 
 
292 aa  50.1  0.00005  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1552  hypothetical protein  22.97 
 
 
458 aa  49.3  0.00008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.394461  normal  0.189115 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1696  Mammalian cell entry related domain protein  23.39 
 
 
293 aa  49.3  0.00009  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2984  ABC transporter, permease component  21.45 
 
 
325 aa  48.9  0.0001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.395413  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4517  hypothetical protein  21.59 
 
 
359 aa  46.6  0.0005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3316  Mammalian cell entry related domain protein  25 
 
 
266 aa  45.8  0.001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.635964  hitchhiker  0.0000217652 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1854  Mammalian cell entry related domain protein  20.88 
 
 
318 aa  44.7  0.002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000329704  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3705  hypothetical protein  28.83 
 
 
349 aa  45.1  0.002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4316  hypothetical protein  25.23 
 
 
279 aa  44.3  0.002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.209742  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0449  ABC-type transport system protein  34.23 
 
 
148 aa  44.7  0.002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  2.58514e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1021  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein, putative  24.2 
 
 
331 aa  44.3  0.003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0495  Mammalian cell entry related domain protein  22.57 
 
 
360 aa  43.5  0.004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0393  Mammalian cell entry related domain protein  24.3 
 
 
515 aa  43.1  0.005  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0329  hypothetical protein  18.02 
 
 
430 aa  43.1  0.006  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.967579  normal  0.70235 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0011  hypothetical protein  23.22 
 
 
324 aa  42.7  0.007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000604844 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>