130 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GSU0926 on replicon NC_002939
Organism: Geobacter sulfurreducens PCA



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002939  GSU0926  mce-related protein  100 
 
 		 360 aa  709    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2541  virulence factor MCE-like protein-related protein  81.67 
 
 		 360 aa  607  1e-173  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.143277  hitchhiker  0.00000000000784881 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1243  hypothetical protein  65.83 
 
 		 360 aa  518  1e-146  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3214  hypothetical protein  60.56 
 
 		 360 aa  451  1e-125  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0495  Mammalian cell entry related domain protein  58.33 
 
 		 360 aa  427  1e-118  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4517  hypothetical protein  27.3 
 
 		 359 aa  149  1.0000000000000001e-34  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2254  Mammalian cell entry related domain protein  25.62 
 
 		 292 aa  102  8e-21  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.371924  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1873  Mammalian cell entry related domain protein  25 
 
 		 293 aa  102  1e-20  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.010294 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0661  hypothetical protein  26.42 
 
 		 292 aa  100  4e-20  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1508  Mammalian cell entry related domain protein  28.48 
 
 		 356 aa  98.6  1e-19  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.577537 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3705  hypothetical protein  26.77 
 
 		 349 aa  98.2  2e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1899  virulence factor Mce family protein  27.38 
 
 		 349 aa  97.1  4e-19  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2733  Mammalian cell entry related domain protein  27.94 
 
 		 356 aa  94.7  2e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.978964  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1272  virulence factor MCE-like protein-related protein  26.85 
 
 		 347 aa  93.6  5e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.821992  hitchhiker  0.0000000117847 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1739  Mammalian cell entry related domain protein  23.89 
 
 		 292 aa  90.9  3e-17  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0707  Mammalian cell entry related domain protein  27.94 
 
 		 362 aa  88.2  2e-16  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.886561  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0795  Mammalian cell entry related domain protein  23.44 
 
 		 328 aa  84.3  0.000000000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0440  VpsC protein  33.1 
 
 		 292 aa  84.3  0.000000000000003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1810  Mammalian cell entry related domain protein  26.4 
 
 		 341 aa  84  0.000000000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.550546 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1696  Mammalian cell entry related domain protein  23.05 
 
 		 293 aa  82.4  0.00000000000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0478  VpsC protein  23.88 
 
 		 292 aa  80.1  0.00000000000005  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.238955  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0188  Mammalian cell entry related domain protein  28.51 
 
 		 337 aa  80.1  0.00000000000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.107684  normal  0.968767 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0678  Mammalian cell entry related domain protein  24.93 
 
 		 529 aa  79  0.0000000000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.828772 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0687  hypothetical protein  24.78 
 
 		 332 aa  77.8  0.0000000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4901  Mammalian cell entry related domain protein  26.82 
 
 		 328 aa  77.8  0.0000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.374077  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3307  Mammalian cell entry related domain protein  25.81 
 
 		 339 aa  73.2  0.000000000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.185146  normal  0.246163 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2344  Mammalian cell entry related domain protein  24.29 
 
 		 314 aa  70.1  0.00000000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5281  Mammalian cell entry related domain protein  23.91 
 
 		 340 aa  68.9  0.0000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.192594 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1867  Mammalian cell entry related domain protein  41.54 
 
 		 316 aa  68.2  0.0000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.449047  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2448  hypothetical protein  24.05 
 
 		 333 aa  63.5  0.000000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0449  ABC-type transport system protein  32.41 
 
 		 148 aa  63.5  0.000000006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  2.58514e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0351  putative ABC transport system substrate-binding protein  28.1 
 
 		 377 aa  63.2  0.000000006  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11078  hypothetical protein  23.63 
 
 		 316 aa  62.8  0.000000008  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1203  hypothetical protein  30.96 
 
 		 310 aa  62.8  0.00000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.511791  normal  0.098201 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2984  ABC transporter, permease component  23.71 
 
 		 325 aa  61.6  0.00000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.395413  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6192  Mammalian cell entry related domain protein  25.07 
 
 		 332 aa  62  0.00000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.387563 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3636  Mammalian cell entry related domain protein  23.36 
 
 		 321 aa  60.5  0.00000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.676726 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2066  Mammalian cell entry related domain protein  25.54 
 
 		 388 aa  60.1  0.00000005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4584  hypothetical protein  21.88 
 
 		 321 aa  60.1  0.00000006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0530  Mammalian cell entry related domain protein  35.11 
 
 		 465 aa  58.5  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0794795  hitchhiker  0.00420823 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0513  Mammalian cell entry related domain protein  35.11 
 
 		 465 aa  58.5  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1049  hypothetical protein  44.64 
 
 		 292 aa  57.8  0.0000003  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00460957 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3037  Mammalian cell entry related domain protein  37.7 
 
 		 479 aa  57.8  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.622361 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2891  Mammalian cell entry related domain protein  40.18 
 
 		 175 aa  57  0.0000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.27124 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3390  Mammalian cell entry related domain protein  23.89 
 
 		 317 aa  56.6  0.0000006  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0881876 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3238  Mammalian cell entry related domain protein  39.29 
 
 		 175 aa  55.5  0.000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.303674  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2960  signal peptide protein  38.39 
 
 		 173 aa  54.3  0.000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.432073  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2218  hypothetical protein  34.13 
 
 		 154 aa  54.7  0.000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0393  Mammalian cell entry related domain protein  24.25 
 
 		 515 aa  54.7  0.000003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0739  Mammalian cell entry related domain protein  38.46 
 
 		 152 aa  53.9  0.000005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.942465  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4316  hypothetical protein  22.17 
 
 		 279 aa  53.1  0.000008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.209742  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0838  virulence factor Mce family protein  22.74 
 
 		 523 aa  53.1  0.000008  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1007  Mammalian cell entry related domain protein  32.41 
 
 		 152 aa  52  0.00002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.063355  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2299  putative ABC transport system substrate-binding protein  35.78 
 
 		 148 aa  51.6  0.00002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0104875  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3569  Mammalian cell entry related domain protein  34.82 
 
 		 186 aa  52  0.00002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0424468  hitchhiker  0.0000173433 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2118  hypothetical protein  37.61 
 
 		 151 aa  51.2  0.00003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3316  Mammalian cell entry related domain protein  25.38 
 
 		 266 aa  50.8  0.00004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.635964  hitchhiker  0.0000217652 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2635  hypothetical protein  47.54 
 
 		 328 aa  50.4  0.00005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0534  Mammalian cell entry related domain protein  35.19 
 
 		 150 aa  50.1  0.00005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0389  putative signal peptide protein, toluene tolerance Ttg2C-like  38.89 
 
 		 181 aa  50.1  0.00006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0403  hypothetical protein  29.63 
 
 		 146 aa  50.1  0.00007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.304841  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4394  virulence factor Mce family protein  26.19 
 
 		 483 aa  49.7  0.00007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2784  ABC-type transport system involved in resistance to organic solvents periplasmic component  31.2 
 
 		 155 aa  49.3  0.0001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.162084  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11999  MCE-family protein mce3C  32.95 
 
 		 410 aa  49.3  0.0001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.000000102981  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2768  hypothetical protein  38.89 
 
 		 184 aa  48.9  0.0001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.422541  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0329  hypothetical protein  22.22 
 
 		 430 aa  48.9  0.0001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.967579  normal  0.70235 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0161  Mammalian cell entry related domain protein  24.01 
 
 		 334 aa  49.3  0.0001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.458265 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0751  ABC transporter permease  35.59 
 
 		 308 aa  48.5  0.0002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0221313  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2113  Mammalian cell entry related domain protein  28.65 
 
 		 316 aa  48.1  0.0002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.202192  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0368  virulence factor Mce family protein  27.02 
 
 		 481 aa  48.1  0.0002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0924  virulence factor Mce family protein  33.63 
 
 		 438 aa  48.5  0.0002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.841372 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1360  Mammalian cell entry related domain protein  33.9 
 
 		 334 aa  48.1  0.0002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1818  hypothetical protein  35.19 
 
 		 148 aa  48.1  0.0002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0905  hypothetical protein  39.13 
 
 		 158 aa  47.8  0.0003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0874  hypothetical protein  39.13 
 
 		 158 aa  47.8  0.0003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2747  hypothetical protein  30.58 
 
 		 161 aa  47.8  0.0003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0475  putative ABC transport system periplasmic substrate-binding protein  29.15 
 
 		 304 aa  47.4  0.0004  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.848355  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3400  hypothetical protein  39.71 
 
 		 156 aa  46.6  0.0006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0865  hypothetical protein  38.46 
 
 		 155 aa  46.6  0.0006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2221  hypothetical protein  37.8 
 
 		 153 aa  47  0.0006  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.693824  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3120  hypothetical protein  33.87 
 
 		 173 aa  45.8  0.001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.771354  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2822  virulence factor Mce family protein  37.84 
 
 		 329 aa  45.4  0.001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.883459  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5200  virulence factor Mce family protein  25.81 
 
 		 355 aa  46.2  0.001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.168356  normal  0.194199 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0384  Mammalian cell entry related domain protein  28.69 
 
 		 152 aa  45.8  0.001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.214826 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1558  virulence factor Mce family protein  25.59 
 
 		 352 aa  45.8  0.001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0319  hypothetical protein  35.71 
 
 		 187 aa  45.8  0.001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0287402  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0097  Mammalian cell entry related domain protein  33.75 
 
 		 160 aa  46.2  0.001  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  decreased coverage  0.0000148019  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0960  hypothetical protein  39.44 
 
 		 161 aa  45.4  0.002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0981  hypothetical protein  30.49 
 
 		 158 aa  45.1  0.002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2691  hypothetical protein  32.54 
 
 		 189 aa  45.1  0.002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0995365  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0334  hypothetical protein  32.54 
 
 		 187 aa  45.1  0.002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0416  hypothetical protein  32.54 
 
 		 189 aa  45.1  0.002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.249405  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2707  hypothetical protein  29.46 
 
 		 149 aa  44.7  0.002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0687  hypothetical protein  32.54 
 
 		 169 aa  45.1  0.002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0878  hypothetical protein  40.85 
 
 		 156 aa  45.1  0.002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.600632  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1015  hypothetical protein  32.41 
 
 		 321 aa  45.4  0.002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0967  hypothetical protein  39.44 
 
 		 161 aa  45.4  0.002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0395  hypothetical protein  32.54 
 
 		 187 aa  45.1  0.002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.147868  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0343  hypothetical protein  31.75 
 
 		 187 aa  45.1  0.002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.908048  normal  0.599528 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12870  organic solvent tolerance ABC efflux transporter, substrate binding protein  38.46 
 
 		 156 aa  44.7  0.002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>