97 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_1867 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013061  Phep_1867  Mammalian cell entry related domain protein  100 
 
 
316 aa  622  1e-177  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.449047  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6192  Mammalian cell entry related domain protein  37.97 
 
 
332 aa  222  6e-57  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.387563 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11078  hypothetical protein  38.51 
 
 
316 aa  203  2e-51  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4584  hypothetical protein  32.28 
 
 
321 aa  178  1e-43  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0751  ABC transporter permease  32.8 
 
 
308 aa  168  1e-40  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0221313  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3636  Mammalian cell entry related domain protein  31.27 
 
 
321 aa  158  1e-37  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.676726 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4901  Mammalian cell entry related domain protein  31.86 
 
 
328 aa  157  2e-37  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.374077  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG1049  hypothetical protein  28.39 
 
 
292 aa  141  1.9999999999999998e-32  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00460957 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2113  Mammalian cell entry related domain protein  28.89 
 
 
316 aa  135  7.000000000000001e-31  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.202192  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0638  hypothetical protein  28.39 
 
 
306 aa  119  7.999999999999999e-26  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.498696 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1696  Mammalian cell entry related domain protein  26.65 
 
 
293 aa  89  1e-16  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2254  Mammalian cell entry related domain protein  27.39 
 
 
292 aa  85.1  0.000000000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.371924  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0440  VpsC protein  25.33 
 
 
292 aa  84.7  0.000000000000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0661  hypothetical protein  28.19 
 
 
292 aa  82.8  0.000000000000006  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3705  hypothetical protein  25.08 
 
 
349 aa  80.1  0.00000000000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0478  VpsC protein  26.96 
 
 
292 aa  79.7  0.00000000000006  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.238955  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2344  Mammalian cell entry related domain protein  23.05 
 
 
314 aa  78.6  0.0000000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1739  Mammalian cell entry related domain protein  27.03 
 
 
292 aa  78.2  0.0000000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1873  Mammalian cell entry related domain protein  26.32 
 
 
293 aa  77  0.0000000000004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.010294 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0838  virulence factor Mce family protein  22.6 
 
 
523 aa  69.7  0.00000000006  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0329  hypothetical protein  23.53 
 
 
430 aa  68.6  0.0000000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.967579  normal  0.70235 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0495  Mammalian cell entry related domain protein  43.08 
 
 
360 aa  68.9  0.0000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0926  mce-related protein  41.54 
 
 
360 aa  68.2  0.0000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1899  virulence factor Mce family protein  24.5 
 
 
349 aa  67  0.0000000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0393  Mammalian cell entry related domain protein  24.1 
 
 
515 aa  66.6  0.0000000006  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2541  virulence factor MCE-like protein-related protein  41.54 
 
 
360 aa  64.7  0.000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.143277  hitchhiker  0.00000000000784881 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0707  Mammalian cell entry related domain protein  23.84 
 
 
362 aa  63.9  0.000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.886561  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1508  Mammalian cell entry related domain protein  23.2 
 
 
356 aa  64.3  0.000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.577537 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4517  hypothetical protein  22.83 
 
 
359 aa  63.2  0.000000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3214  hypothetical protein  27.66 
 
 
360 aa  63.2  0.000000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1272  virulence factor MCE-like protein-related protein  22.66 
 
 
347 aa  62  0.00000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.821992  hitchhiker  0.0000000117847 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1243  hypothetical protein  40 
 
 
360 aa  62  0.00000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0687  hypothetical protein  22.42 
 
 
332 aa  60.8  0.00000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2733  Mammalian cell entry related domain protein  22.47 
 
 
356 aa  60.5  0.00000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.978964  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3316  Mammalian cell entry related domain protein  29.27 
 
 
266 aa  57.4  0.0000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.635964  hitchhiker  0.0000217652 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3828  virulence factor Mce family protein  20.78 
 
 
352 aa  57  0.0000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0208  ABC transporter  22.68 
 
 
286 aa  56.2  0.0000006  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.751363 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1222  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  21.52 
 
 
308 aa  54.7  0.000002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0743  hypothetical protein  21.52 
 
 
308 aa  54.7  0.000002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2299  putative ABC transport system substrate-binding protein  31.5 
 
 
148 aa  53.5  0.000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0104875  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2448  hypothetical protein  21.15 
 
 
333 aa  53.1  0.000007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1895  ABC transporter substrate binding protein  26.92 
 
 
455 aa  52.4  0.000009  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1894  hypothetical protein  27.32 
 
 
324 aa  52  0.00001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000276188  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0678  Mammalian cell entry related domain protein  22.19 
 
 
529 aa  51.6  0.00002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.828772 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1978  hypothetical protein  24.27 
 
 
568 aa  51.2  0.00002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.308445  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0522  Mammalian cell entry related domain protein  26.26 
 
 
308 aa  51.2  0.00002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.629914  normal  0.424693 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1888  Mammalian cell entry related domain protein  21.04 
 
 
529 aa  50.4  0.00004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0795  Mammalian cell entry related domain protein  23.71 
 
 
328 aa  49.7  0.00006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0351  putative ABC transport system substrate-binding protein  22.48 
 
 
377 aa  49.7  0.00007  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1982  Mammalian cell entry related domain protein  23.97 
 
 
456 aa  49.3  0.00009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0362661  normal  0.670067 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1529  virulence factor MCE-like protein  21.34 
 
 
479 aa  48.9  0.0001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1552  virulence factor Mce family protein  21.34 
 
 
479 aa  48.9  0.0001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.977582  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2193  Mammalian cell entry related domain protein  22.84 
 
 
456 aa  48.9  0.0001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.141725  normal  0.182946 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0352  tryptophanyl-tRNA synthetase  26.24 
 
 
325 aa  47.8  0.0002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1552  hypothetical protein  22.53 
 
 
458 aa  47.8  0.0002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.394461  normal  0.189115 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1506  virulence factor Mce family protein  22.31 
 
 
339 aa  47.4  0.0003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2439  hypothetical protein  32.56 
 
 
271 aa  47.4  0.0004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0222447  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0188  Mammalian cell entry related domain protein  24.28 
 
 
337 aa  46.2  0.0007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.107684  normal  0.968767 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0239  hypothetical protein  27.59 
 
 
164 aa  45.8  0.001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.852395 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03181  ABC transporter substrate-binding protein  24.46 
 
 
308 aa  45.8  0.001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.721062  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2768  hypothetical protein  30.85 
 
 
184 aa  45.1  0.001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.422541  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13532  MCE-family protein mce4B  22.4 
 
 
350 aa  45.4  0.001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000717957 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2066  Mammalian cell entry related domain protein  20.25 
 
 
388 aa  45.8  0.001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5198  virulence factor Mce family protein  22.29 
 
 
386 aa  45.4  0.001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.18609  normal  0.284434 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4996  virulence factor Mce family protein  25.84 
 
 
395 aa  44.3  0.002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.401829 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0112  virulence factor Mce family protein  21.74 
 
 
382 aa  44.7  0.002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3022  ABC-type transport system involved in resistance to organic solvents periplasmic component-like protein  23.11 
 
 
355 aa  44.7  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4165  virulence factor Mce family protein  21.29 
 
 
487 aa  44.7  0.002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.450079 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4148  virulence factor Mce family protein  22.97 
 
 
367 aa  45.1  0.002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10606  MCE-family protein mce2F  21.51 
 
 
516 aa  44.7  0.002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.466214 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0518  virulence factor Mce family protein  33.77 
 
 
337 aa  45.1  0.002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0706  virulence factor Mce family protein  25.45 
 
 
520 aa  45.1  0.002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.900705  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5281  Mammalian cell entry related domain protein  23.05 
 
 
340 aa  44.3  0.003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.192594 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0122  virulence factor MCE-like protein  21.74 
 
 
382 aa  44.3  0.003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.749721  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2084  Mammalian cell entry related domain protein  18.88 
 
 
564 aa  44.3  0.003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0123  virulence factor MCE-like protein  25.3 
 
 
519 aa  43.9  0.003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0131  virulence factor Mce family protein  21.74 
 
 
382 aa  44.3  0.003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.307486  normal  0.199018 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0132  virulence factor Mce family protein  25.3 
 
 
519 aa  43.9  0.003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.208767  normal  0.215397 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1169  virulence factor Mce family protein  22.06 
 
 
356 aa  43.9  0.003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1156  Mammalian cell entry related domain protein  32.29 
 
 
163 aa  43.9  0.004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.482142  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3827  virulence factor Mce family protein  20.39 
 
 
364 aa  43.9  0.004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0113  virulence factor Mce family protein  24.7 
 
 
519 aa  43.9  0.004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11998  MCE-family protein mce3B  19.87 
 
 
342 aa  43.9  0.004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000000434194  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0988  putative ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  20.89 
 
 
331 aa  43.9  0.004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0384  Mammalian cell entry related domain protein  31.82 
 
 
152 aa  43.5  0.005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.214826 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2597  Mammalian cell entry related domain protein  22.95 
 
 
259 aa  43.5  0.005  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.144498  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0960  virulence factor Mce family protein  22.47 
 
 
351 aa  43.5  0.005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0854  Mammalian cell entry related domain protein  28.91 
 
 
148 aa  43.5  0.005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.102404 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1999  Mammalian cell entry related domain protein  21.59 
 
 
567 aa  43.5  0.005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2910  hypothetical protein  20.2 
 
 
317 aa  43.1  0.005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1502  Mammalian cell entry related domain protein  24.32 
 
 
228 aa  43.1  0.006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2510  virulence factor Mce family protein  22.49 
 
 
367 aa  43.1  0.006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.609279 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4169  virulence factor Mce family protein  20.68 
 
 
342 aa  42.7  0.007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.757225  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1560  virulence factor Mce family protein  23.39 
 
 
386 aa  42.7  0.008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3569  Mammalian cell entry related domain protein  28.72 
 
 
186 aa  42.7  0.009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0424468  hitchhiker  0.0000173433 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4115  hypothetical protein  22.98 
 
 
307 aa  42.4  0.009  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0544388  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3400  hypothetical protein  25.77 
 
 
156 aa  42.4  0.01  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>