142 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppro_3214 on replicon NC_008609
Organism: Pelobacter propionicus DSM 2379



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008609  Ppro_3214  hypothetical protein  100 
 
 
360 aa  725    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1243  hypothetical protein  61.39 
 
 
360 aa  469  1.0000000000000001e-131  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2541  virulence factor MCE-like protein-related protein  61.11 
 
 
360 aa  466  9.999999999999999e-131  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.143277  hitchhiker  0.00000000000784881 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0926  mce-related protein  60.56 
 
 
360 aa  451  1e-125  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0495  Mammalian cell entry related domain protein  62.5 
 
 
360 aa  445  1.0000000000000001e-124  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4517  hypothetical protein  27.3 
 
 
359 aa  147  2.0000000000000003e-34  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3705  hypothetical protein  27.22 
 
 
349 aa  109  8.000000000000001e-23  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2254  Mammalian cell entry related domain protein  24.26 
 
 
292 aa  109  8.000000000000001e-23  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.371924  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1272  virulence factor MCE-like protein-related protein  26.67 
 
 
347 aa  108  1e-22  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.821992  hitchhiker  0.0000000117847 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1508  Mammalian cell entry related domain protein  28.45 
 
 
356 aa  104  3e-21  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.577537 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0661  hypothetical protein  24.18 
 
 
292 aa  103  5e-21  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1739  Mammalian cell entry related domain protein  25.21 
 
 
292 aa  102  7e-21  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1899  virulence factor Mce family protein  27.55 
 
 
349 aa  99.8  7e-20  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1873  Mammalian cell entry related domain protein  25.54 
 
 
293 aa  99.4  9e-20  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.010294 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0478  VpsC protein  23.43 
 
 
292 aa  97.8  3e-19  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.238955  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1696  Mammalian cell entry related domain protein  23.55 
 
 
293 aa  95.9  1e-18  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2733  Mammalian cell entry related domain protein  27.41 
 
 
356 aa  93.6  5e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.978964  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0795  Mammalian cell entry related domain protein  25.16 
 
 
328 aa  91.7  2e-17  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0678  Mammalian cell entry related domain protein  24.32 
 
 
529 aa  89.7  6e-17  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.828772 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0707  Mammalian cell entry related domain protein  27.24 
 
 
362 aa  89.4  1e-16  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.886561  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0440  VpsC protein  23.16 
 
 
292 aa  84.3  0.000000000000003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1810  Mammalian cell entry related domain protein  26.32 
 
 
341 aa  82.4  0.00000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.550546 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0687  hypothetical protein  23.56 
 
 
332 aa  79.7  0.00000000000007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2984  ABC transporter, permease component  26.37 
 
 
325 aa  77.8  0.0000000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.395413  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0188  Mammalian cell entry related domain protein  25.61 
 
 
337 aa  76.6  0.0000000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.107684  normal  0.968767 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5281  Mammalian cell entry related domain protein  24.92 
 
 
340 aa  76.6  0.0000000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.192594 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3307  Mammalian cell entry related domain protein  21.55 
 
 
339 aa  75.1  0.000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.185146  normal  0.246163 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4901  Mammalian cell entry related domain protein  23.25 
 
 
328 aa  68.9  0.0000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.374077  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1867  Mammalian cell entry related domain protein  27.66 
 
 
316 aa  63.2  0.000000007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.449047  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2448  hypothetical protein  22.67 
 
 
333 aa  62.4  0.00000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1203  hypothetical protein  27.73 
 
 
310 aa  60.8  0.00000004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.511791  normal  0.098201 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4316  hypothetical protein  22.17 
 
 
279 aa  60.1  0.00000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.209742  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2344  Mammalian cell entry related domain protein  22.63 
 
 
314 aa  60.1  0.00000006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0530  Mammalian cell entry related domain protein  36.36 
 
 
465 aa  60.1  0.00000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0794795  hitchhiker  0.00420823 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0513  Mammalian cell entry related domain protein  36.36 
 
 
465 aa  60.1  0.00000006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0393  Mammalian cell entry related domain protein  25 
 
 
515 aa  60.1  0.00000007  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0838  virulence factor Mce family protein  23.41 
 
 
523 aa  59.3  0.00000009  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4584  hypothetical protein  23.29 
 
 
321 aa  58.9  0.0000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1049  hypothetical protein  35.82 
 
 
292 aa  57.8  0.0000003  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00460957 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11078  hypothetical protein  20.8 
 
 
316 aa  57  0.0000005  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3316  Mammalian cell entry related domain protein  23.77 
 
 
266 aa  55.8  0.000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.635964  hitchhiker  0.0000217652 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6192  Mammalian cell entry related domain protein  23.29 
 
 
332 aa  55.8  0.000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.387563 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0384  Mammalian cell entry related domain protein  31.78 
 
 
152 aa  53.1  0.000007  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.214826 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0739  Mammalian cell entry related domain protein  43.84 
 
 
152 aa  52  0.00001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.942465  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3569  Mammalian cell entry related domain protein  33.93 
 
 
186 aa  52.4  0.00001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0424468  hitchhiker  0.0000173433 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2066  Mammalian cell entry related domain protein  22.54 
 
 
388 aa  51.2  0.00003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4603  virulence factor Mce family protein  25.55 
 
 
346 aa  50.8  0.00003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11999  MCE-family protein mce3C  23.93 
 
 
410 aa  50.8  0.00004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.000000102981  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0343  hypothetical protein  33.93 
 
 
187 aa  50.1  0.00006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.908048  normal  0.599528 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0449  ABC-type transport system protein  33.94 
 
 
148 aa  49.7  0.00008  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  2.58514e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2221  hypothetical protein  29.91 
 
 
153 aa  49.7  0.00009  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.693824  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2784  ABC-type transport system involved in resistance to organic solvents periplasmic component  36 
 
 
155 aa  49.3  0.0001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.162084  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3514  ABC transporter, inner membrane subunit  33.93 
 
 
184 aa  49.3  0.0001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.531635  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0334  hypothetical protein  33.93 
 
 
187 aa  49.3  0.0001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2118  hypothetical protein  33.61 
 
 
151 aa  49.3  0.0001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0743  hypothetical protein  24.75 
 
 
308 aa  49.3  0.0001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1222  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  24.75 
 
 
308 aa  49.3  0.0001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0161  Mammalian cell entry related domain protein  25.81 
 
 
334 aa  49.3  0.0001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.458265 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3120  hypothetical protein  33.33 
 
 
173 aa  48.5  0.0002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.771354  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2691  hypothetical protein  34.51 
 
 
189 aa  48.1  0.0002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0995365  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0416  hypothetical protein  34.51 
 
 
189 aa  48.1  0.0002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.249405  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2822  virulence factor Mce family protein  29.46 
 
 
329 aa  48.5  0.0002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.883459  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0100  Mammalian cell entry related domain protein  23.78 
 
 
316 aa  48.1  0.0002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0395  hypothetical protein  34.51 
 
 
187 aa  48.1  0.0002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.147868  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2768  hypothetical protein  33.04 
 
 
184 aa  48.5  0.0002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.422541  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0329  hypothetical protein  26.42 
 
 
430 aa  48.5  0.0002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.967579  normal  0.70235 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1156  Mammalian cell entry related domain protein  32.28 
 
 
163 aa  47.8  0.0003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.482142  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0534  Mammalian cell entry related domain protein  32.14 
 
 
150 aa  47.4  0.0004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0389  putative signal peptide protein, toluene tolerance Ttg2C-like  33.04 
 
 
181 aa  47.4  0.0004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0761  Mammalian cell entry related domain protein  34.18 
 
 
145 aa  47  0.0004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0119  putative ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  25.2 
 
 
275 aa  47.4  0.0004  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2549  paraquat-inducible protein B  27.43 
 
 
550 aa  47.4  0.0004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0824615  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1990  paraquat-inducible protein B  27.43 
 
 
550 aa  47.4  0.0004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2638  paraquat-inducible protein B  27.43 
 
 
550 aa  47.4  0.0004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0097  Mammalian cell entry related domain protein  36.25 
 
 
160 aa  47.4  0.0004  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  decreased coverage  0.0000148019  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0403  hypothetical protein  28.57 
 
 
146 aa  47  0.0005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.304841  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1894  hypothetical protein  24.8 
 
 
324 aa  47  0.0005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000276188  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2960  signal peptide protein  33.04 
 
 
173 aa  47  0.0006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.432073  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2707  hypothetical protein  30.91 
 
 
149 aa  47  0.0006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0710  virulence factor Mce family protein  22.22 
 
 
343 aa  46.6  0.0007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.476442  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2597  Mammalian cell entry related domain protein  22.69 
 
 
259 aa  46.6  0.0008  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.144498  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1463  paraquat-inducible protein B  25.93 
 
 
545 aa  46.2  0.0008  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0560595  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2411  hypothetical protein  33.88 
 
 
154 aa  46.2  0.0008  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.108225  normal  0.153742 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4853  paraquat-inducible protein B  25.21 
 
 
547 aa  46.2  0.0008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00098113 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4445  mce-related protein  37.21 
 
 
155 aa  45.8  0.001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4139  hypothetical protein  36.05 
 
 
155 aa  45.4  0.001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3636  Mammalian cell entry related domain protein  34.92 
 
 
321 aa  45.8  0.001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.676726 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0351  putative ABC transport system substrate-binding protein  24.19 
 
 
377 aa  45.4  0.001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1007  Mammalian cell entry related domain protein  30.36 
 
 
152 aa  45.4  0.001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.063355  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12870  organic solvent tolerance ABC efflux transporter, substrate binding protein  37.66 
 
 
156 aa  45.8  0.001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1818  hypothetical protein  31.86 
 
 
148 aa  46.2  0.001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1558  virulence factor Mce family protein  26.72 
 
 
352 aa  45.8  0.001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13532  MCE-family protein mce4B  27.17 
 
 
350 aa  45.8  0.001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000717957 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0865  hypothetical protein  35.06 
 
 
155 aa  44.7  0.002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1317  hypothetical protein  28.57 
 
 
293 aa  45.1  0.002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5200  virulence factor Mce family protein  25.41 
 
 
355 aa  44.7  0.002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.168356  normal  0.194199 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0098  hypothetical protein  34.15 
 
 
160 aa  45.4  0.002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.334829  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2635  hypothetical protein  24.35 
 
 
328 aa  45.4  0.002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1139  paraquat-inducible protein B  23.77 
 
 
546 aa  45.4  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0102675  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1105  paraquat-inducible protein B  23.77 
 
 
546 aa  44.7  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.486337  normal  0.0294366 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>