126 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gmet_2541 on replicon NC_007517
Organism: Geobacter metallireducens GS-15



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007517  Gmet_2541  virulence factor MCE-like protein-related protein  100 
 
 		 360 aa  717    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.143277  hitchhiker  0.00000000000784881 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0926  mce-related protein  81.67 
 
 		 360 aa  607  1e-173  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1243  hypothetical protein  67.78 
 
 		 360 aa  532  1e-150  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3214  hypothetical protein  61.11 
 
 		 360 aa  466  9.999999999999999e-131  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0495  Mammalian cell entry related domain protein  57.78 
 
 		 360 aa  428  1e-119  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4517  hypothetical protein  28.92 
 
 		 359 aa  160  3e-38  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2254  Mammalian cell entry related domain protein  25.97 
 
 		 292 aa  117  3e-25  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.371924  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3705  hypothetical protein  27.83 
 
 		 349 aa  100  4e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1873  Mammalian cell entry related domain protein  23.37 
 
 		 293 aa  99.4  9e-20  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.010294 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1739  Mammalian cell entry related domain protein  24.17 
 
 		 292 aa  97.4  3e-19  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1899  virulence factor Mce family protein  26.57 
 
 		 349 aa  96.7  5e-19  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1272  virulence factor MCE-like protein-related protein  25.08 
 
 		 347 aa  94.7  2e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.821992  hitchhiker  0.0000000117847 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1696  Mammalian cell entry related domain protein  21.7 
 
 		 293 aa  94.4  3e-18  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0661  hypothetical protein  23.61 
 
 		 292 aa  93.6  5e-18  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0707  Mammalian cell entry related domain protein  28.01 
 
 		 362 aa  90.5  4e-17  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.886561  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0478  VpsC protein  22.22 
 
 		 292 aa  90.5  4e-17  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.238955  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0795  Mammalian cell entry related domain protein  23.18 
 
 		 328 aa  89.7  7e-17  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1508  Mammalian cell entry related domain protein  25.83 
 
 		 356 aa  89  1e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.577537 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0440  VpsC protein  28.92 
 
 		 292 aa  85.1  0.000000000000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2733  Mammalian cell entry related domain protein  24.44 
 
 		 356 aa  82.8  0.000000000000009  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.978964  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4901  Mammalian cell entry related domain protein  24.86 
 
 		 328 aa  77.4  0.0000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.374077  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0678  Mammalian cell entry related domain protein  25.88 
 
 		 529 aa  77  0.0000000000005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.828772 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0687  hypothetical protein  22.61 
 
 		 332 aa  75.5  0.000000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1810  Mammalian cell entry related domain protein  24.93 
 
 		 341 aa  74.3  0.000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.550546 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3636  Mammalian cell entry related domain protein  24.58 
 
 		 321 aa  71.2  0.00000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.676726 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5281  Mammalian cell entry related domain protein  25.51 
 
 		 340 aa  69.7  0.00000000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.192594 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0188  Mammalian cell entry related domain protein  27.31 
 
 		 337 aa  68.6  0.0000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.107684  normal  0.968767 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11078  hypothetical protein  25.27 
 
 		 316 aa  68.6  0.0000000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3307  Mammalian cell entry related domain protein  24.84 
 
 		 339 aa  65.9  0.000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.185146  normal  0.246163 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4584  hypothetical protein  22.99 
 
 		 321 aa  64.7  0.000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1867  Mammalian cell entry related domain protein  41.54 
 
 		 316 aa  64.7  0.000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.449047  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2984  ABC transporter, permease component  22.68 
 
 		 325 aa  63.5  0.000000005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.395413  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2448  hypothetical protein  24.53 
 
 		 333 aa  63.5  0.000000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0449  ABC-type transport system protein  36.11 
 
 		 148 aa  60.1  0.00000006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  2.58514e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2066  Mammalian cell entry related domain protein  24.18 
 
 		 388 aa  59.7  0.00000007  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6192  Mammalian cell entry related domain protein  24.17 
 
 		 332 aa  58.9  0.0000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.387563 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3316  Mammalian cell entry related domain protein  27.73 
 
 		 266 aa  59.3  0.0000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.635964  hitchhiker  0.0000217652 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4316  hypothetical protein  23.27 
 
 		 279 aa  58.2  0.0000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.209742  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1203  hypothetical protein  35 
 
 		 310 aa  57.4  0.0000004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.511791  normal  0.098201 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0530  Mammalian cell entry related domain protein  32.48 
 
 		 465 aa  57  0.0000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0794795  hitchhiker  0.00420823 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2344  Mammalian cell entry related domain protein  22.57 
 
 		 314 aa  57  0.0000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0513  Mammalian cell entry related domain protein  32.48 
 
 		 465 aa  57  0.0000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1049  hypothetical protein  31.62 
 
 		 292 aa  56.2  0.0000009  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00460957 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1558  virulence factor Mce family protein  27.55 
 
 		 352 aa  56.2  0.0000009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5200  virulence factor Mce family protein  27.33 
 
 		 355 aa  55.5  0.000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.168356  normal  0.194199 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0838  virulence factor Mce family protein  22.1 
 
 		 523 aa  53.9  0.000004  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0393  Mammalian cell entry related domain protein  24.07 
 
 		 515 aa  53.5  0.000005  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2118  hypothetical protein  34.82 
 
 		 151 aa  53.5  0.000006  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1007  Mammalian cell entry related domain protein  31.62 
 
 		 152 aa  52.8  0.000009  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.063355  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11999  MCE-family protein mce3C  32.95 
 
 		 410 aa  52.8  0.00001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.000000102981  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2960  signal peptide protein  35.71 
 
 		 173 aa  52  0.00002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.432073  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2299  putative ABC transport system substrate-binding protein  33.03 
 
 		 148 aa  51.2  0.00002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0104875  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0161  Mammalian cell entry related domain protein  27.1 
 
 		 334 aa  50.4  0.00005  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.458265 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0638  hypothetical protein  20.69 
 
 		 306 aa  50.4  0.00005  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.498696 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0534  Mammalian cell entry related domain protein  32.41 
 
 		 150 aa  50.4  0.00005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2218  hypothetical protein  30.95 
 
 		 154 aa  49.7  0.00007  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1041  hypothetical protein  30.56 
 
 		 150 aa  49.7  0.00008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0475  putative ABC transport system periplasmic substrate-binding protein  26.47 
 
 		 304 aa  49.3  0.00009  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.848355  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3238  Mammalian cell entry related domain protein  35.71 
 
 		 175 aa  49.7  0.00009  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.303674  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0739  Mammalian cell entry related domain protein  29.46 
 
 		 152 aa  49.7  0.00009  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.942465  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0998  mammalian cell entry related domain-containing protein  33.66 
 
 		 470 aa  48.9  0.0001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0397137  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0924  virulence factor Mce family protein  32.32 
 
 		 438 aa  49.3  0.0001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.841372 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0329  hypothetical protein  24.41 
 
 		 430 aa  48.9  0.0001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.967579  normal  0.70235 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3569  Mammalian cell entry related domain protein  32.14 
 
 		 186 aa  48.9  0.0001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0424468  hitchhiker  0.0000173433 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2891  Mammalian cell entry related domain protein  35.71 
 
 		 175 aa  49.3  0.0001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.27124 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0865  hypothetical protein  37.18 
 
 		 155 aa  48.5  0.0002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0403  hypothetical protein  28.7 
 
 		 146 aa  48.9  0.0002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.304841  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3037  Mammalian cell entry related domain protein  34.26 
 
 		 479 aa  48.5  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.622361 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12870  organic solvent tolerance ABC efflux transporter, substrate binding protein  38.46 
 
 		 156 aa  48.1  0.0002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2113  Mammalian cell entry related domain protein  22.75 
 
 		 316 aa  48.5  0.0002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.202192  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0389  putative signal peptide protein, toluene tolerance Ttg2C-like  36.11 
 
 		 181 aa  47.4  0.0003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0751  ABC transporter permease  21.65 
 
 		 308 aa  47.8  0.0003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0221313  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0999  hypothetical protein  28.91 
 
 		 160 aa  47.8  0.0003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0351  putative ABC transport system substrate-binding protein  23.72 
 
 		 377 aa  47.4  0.0004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2221  hypothetical protein  35.29 
 
 		 153 aa  47.4  0.0004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.693824  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1894  hypothetical protein  32.79 
 
 		 324 aa  47.4  0.0004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000276188  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1435  hypothetical protein  21.94 
 
 		 313 aa  47  0.0004  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0152442  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3390  Mammalian cell entry related domain protein  24.64 
 
 		 317 aa  47  0.0005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0881876 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0905  hypothetical protein  32.61 
 
 		 158 aa  47  0.0006  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0874  hypothetical protein  32.61 
 
 		 158 aa  47  0.0006  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3183  Mammalian cell entry related domain protein  28.7 
 
 		 150 aa  47  0.0006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0474  hypothetical protein  30 
 
 		 164 aa  46.6  0.0007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.000014845  unclonable  0.00000680839 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0967  hypothetical protein  36.62 
 
 		 161 aa  46.6  0.0007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0960  hypothetical protein  36.62 
 
 		 161 aa  46.2  0.0008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2707  hypothetical protein  28.57 
 
 		 149 aa  46.2  0.0008  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0837  hypothetical protein  22.47 
 
 		 319 aa  46.2  0.0008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.866105  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0339  Mammalian cell entry related domain protein  31.19 
 
 		 152 aa  46.2  0.0009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.620596 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0160  mce-related protein  31.19 
 
 		 152 aa  46.2  0.0009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0815  mce-related protein  29.63 
 
 		 149 aa  45.4  0.001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4445  mce-related protein  35.9 
 
 		 155 aa  45.8  0.001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4139  hypothetical protein  34.62 
 
 		 155 aa  45.4  0.001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0795  hypothetical protein  30.95 
 
 		 168 aa  45.8  0.001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0952502  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1526  virulence factor MCE-like protein  27.78 
 
 		 438 aa  45.8  0.001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1549  virulence factor Mce family protein  27.78 
 
 		 438 aa  45.8  0.001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.427862  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1818  hypothetical protein  33.33 
 
 		 148 aa  45.8  0.001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4998  virulence factor Mce family protein  29.27 
 
 		 352 aa  45.8  0.001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.408593 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13531  MCE-family protein mce4C  26.57 
 
 		 357 aa  45.8  0.001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000185056 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0384  Mammalian cell entry related domain protein  24.79 
 
 		 152 aa  45.8  0.001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.214826 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4168  virulence factor Mce family protein  32.38 
 
 		 444 aa  45.1  0.002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.375234  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2635  hypothetical protein  34.88 
 
 		 328 aa  45.1  0.002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>