76 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plut_0440 on replicon NC_007512
Organism: Chlorobium luteolum DSM 273



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007512  Plut_0440  VpsC protein  100 
 
 
292 aa  584  1e-166  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1739  Mammalian cell entry related domain protein  67.81 
 
 
292 aa  402  1e-111  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0661  hypothetical protein  67.12 
 
 
292 aa  397  9.999999999999999e-111  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0478  VpsC protein  64.73 
 
 
292 aa  397  1e-109  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.238955  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2254  Mammalian cell entry related domain protein  63.36 
 
 
292 aa  395  1e-109  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.371924  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1873  Mammalian cell entry related domain protein  56.31 
 
 
293 aa  344  1e-93  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.010294 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1696  Mammalian cell entry related domain protein  53.58 
 
 
293 aa  333  3e-90  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0495  Mammalian cell entry related domain protein  26.3 
 
 
360 aa  108  9.000000000000001e-23  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0926  mce-related protein  25.62 
 
 
360 aa  107  3e-22  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2541  virulence factor MCE-like protein-related protein  25.14 
 
 
360 aa  103  4e-21  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.143277  hitchhiker  0.00000000000784881 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4517  hypothetical protein  23.88 
 
 
359 aa  100  3e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3214  hypothetical protein  23.16 
 
 
360 aa  97.8  2e-19  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1243  hypothetical protein  27.17 
 
 
360 aa  97.1  3e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3636  Mammalian cell entry related domain protein  26.62 
 
 
321 aa  92  1e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.676726 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1867  Mammalian cell entry related domain protein  25.31 
 
 
316 aa  87.4  3e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.449047  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4901  Mammalian cell entry related domain protein  26.35 
 
 
328 aa  85.5  9e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.374077  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0795  Mammalian cell entry related domain protein  26.04 
 
 
328 aa  75.1  0.000000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11078  hypothetical protein  24.52 
 
 
316 aa  71.6  0.00000000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2344  Mammalian cell entry related domain protein  24.42 
 
 
314 aa  70.9  0.00000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6192  Mammalian cell entry related domain protein  26.99 
 
 
332 aa  70.5  0.00000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.387563 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0188  Mammalian cell entry related domain protein  24.65 
 
 
337 aa  68.9  0.00000000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.107684  normal  0.968767 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3316  Mammalian cell entry related domain protein  29.76 
 
 
266 aa  67.8  0.0000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.635964  hitchhiker  0.0000217652 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0707  Mammalian cell entry related domain protein  21.79 
 
 
362 aa  67  0.0000000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.886561  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4584  hypothetical protein  25.99 
 
 
321 aa  63.9  0.000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1508  Mammalian cell entry related domain protein  31.11 
 
 
356 aa  62.8  0.000000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.577537 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3705  hypothetical protein  29.55 
 
 
349 aa  62.4  0.000000008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2733  Mammalian cell entry related domain protein  31.11 
 
 
356 aa  62  0.00000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.978964  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1810  Mammalian cell entry related domain protein  27.76 
 
 
341 aa  61.2  0.00000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.550546 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0751  ABC transporter permease  26.38 
 
 
308 aa  60.8  0.00000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0221313  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5281  Mammalian cell entry related domain protein  24.89 
 
 
340 aa  58.9  0.00000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.192594 
 
 
-
 
NC_002950  PG1049  hypothetical protein  23.65 
 
 
292 aa  57  0.0000004  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00460957 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1272  virulence factor MCE-like protein-related protein  24.09 
 
 
347 aa  56.6  0.0000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.821992  hitchhiker  0.0000000117847 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4316  hypothetical protein  23.5 
 
 
279 aa  56.2  0.0000006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.209742  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0687  hypothetical protein  24.24 
 
 
332 aa  56.2  0.0000006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3702  hypothetical protein  32.2 
 
 
149 aa  56.2  0.0000006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0838  virulence factor Mce family protein  22.28 
 
 
523 aa  54.7  0.000002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0031  hypothetical protein  21.65 
 
 
305 aa  53.9  0.000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.929118  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2984  ABC transporter, permease component  23.57 
 
 
325 aa  53.9  0.000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.395413  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0403  hypothetical protein  30.4 
 
 
146 aa  53.1  0.000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.304841  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1899  virulence factor Mce family protein  27.12 
 
 
349 aa  52.8  0.000007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0678  Mammalian cell entry related domain protein  22.48 
 
 
529 aa  51.6  0.00001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.828772 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0329  hypothetical protein  24.4 
 
 
430 aa  52  0.00001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.967579  normal  0.70235 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0449  ABC-type transport system protein  28.32 
 
 
148 aa  52.4  0.00001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  2.58514e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2118  hypothetical protein  29.1 
 
 
151 aa  51.2  0.00002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1007  Mammalian cell entry related domain protein  35.65 
 
 
152 aa  50.8  0.00003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.063355  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1506  virulence factor Mce family protein  30.48 
 
 
339 aa  50.4  0.00003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3390  Mammalian cell entry related domain protein  25.38 
 
 
317 aa  50.4  0.00003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.0881876 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0638  hypothetical protein  23.53 
 
 
306 aa  50.1  0.00004  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.498696 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0384  Mammalian cell entry related domain protein  25.78 
 
 
152 aa  50.4  0.00004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.214826 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0815  mce-related protein  30.97 
 
 
149 aa  48.9  0.0001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1898  putative ABC transporter substrate-binding protein  33.33 
 
 
155 aa  48.1  0.0002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2707  hypothetical protein  28.22 
 
 
149 aa  48.1  0.0002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2823  virulence factor Mce family protein  28.06 
 
 
361 aa  47.8  0.0002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.314486  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3238  Mammalian cell entry related domain protein  32.46 
 
 
175 aa  47.4  0.0003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.303674  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2113  Mammalian cell entry related domain protein  25.16 
 
 
316 aa  47.4  0.0003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.202192  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3569  Mammalian cell entry related domain protein  31.25 
 
 
186 aa  47  0.0004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0424468  hitchhiker  0.0000173433 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2891  Mammalian cell entry related domain protein  31.58 
 
 
175 aa  46.2  0.0006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.27124 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3307  Mammalian cell entry related domain protein  22.75 
 
 
339 aa  46.2  0.0006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.185146  normal  0.246163 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1894  hypothetical protein  21.29 
 
 
324 aa  45.8  0.0007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000276188  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2768  hypothetical protein  31.25 
 
 
184 aa  45.8  0.0008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.422541  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0334  hypothetical protein  31.25 
 
 
187 aa  44.7  0.002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2960  signal peptide protein  33.04 
 
 
173 aa  44.7  0.002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.432073  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0389  putative signal peptide protein, toluene tolerance Ttg2C-like  30.47 
 
 
181 aa  45.1  0.002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2747  hypothetical protein  29.13 
 
 
161 aa  44.7  0.002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0119  virulence factor MCE-like protein  29.46 
 
 
343 aa  43.9  0.003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.410781  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0109  virulence factor Mce family protein  29.46 
 
 
343 aa  43.9  0.003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.971857  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0128  virulence factor Mce family protein  29.46 
 
 
343 aa  43.9  0.003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.284372  normal  0.252656 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1818  hypothetical protein  32.23 
 
 
148 aa  44.3  0.003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3514  ABC transporter, inner membrane subunit  30.47 
 
 
184 aa  44.3  0.003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.531635  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0343  hypothetical protein  29.69 
 
 
187 aa  44.3  0.003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.908048  normal  0.599528 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0854  Mammalian cell entry related domain protein  30.95 
 
 
148 aa  43.5  0.004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.102404 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0961  virulence factor Mce family protein  29.82 
 
 
345 aa  43.1  0.005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2448  hypothetical protein  27.27 
 
 
333 aa  43.1  0.005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2299  putative ABC transport system substrate-binding protein  30.33 
 
 
148 aa  43.5  0.005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0104875  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2002  hypothetical protein  29.19 
 
 
316 aa  42.7  0.006  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2066  Mammalian cell entry related domain protein  20 
 
 
388 aa  42.4  0.009  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>