More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcar_0449 on replicon NC_007498
Organism: Pelobacter carbinolicus DSM 2380



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007498  Pcar_0449  ABC-type transport system protein  100 
 
 		 148 aa  294  3e-79  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  2.58514e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1818  hypothetical protein  51.03 
 
 		 148 aa  154  4e-37  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0854  Mammalian cell entry related domain protein  49.66 
 
 		 148 aa  152  2e-36  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.102404 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0815  mce-related protein  51.72 
 
 		 149 aa  151  2.9999999999999998e-36  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2299  putative ABC transport system substrate-binding protein  49.66 
 
 		 148 aa  150  8e-36  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0104875  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0786  virulence factor MCE-like protein-related protein  52.03 
 
 		 150 aa  149  1e-35  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3183  Mammalian cell entry related domain protein  52.03 
 
 		 150 aa  149  2e-35  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1041  hypothetical protein  50.68 
 
 		 150 aa  146  1.0000000000000001e-34  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0560  hypothetical protein  50 
 
 		 148 aa  145  2.0000000000000003e-34  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000625618  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0534  Mammalian cell entry related domain protein  49.65 
 
 		 150 aa  140  5e-33  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0403  hypothetical protein  46.62 
 
 		 146 aa  132  9.999999999999999e-31  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.304841  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0474  hypothetical protein  45.52 
 
 		 164 aa  131  3e-30  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.000014845  unclonable  0.00000680839 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3702  hypothetical protein  42.86 
 
 		 149 aa  128  2.0000000000000002e-29  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1007  Mammalian cell entry related domain protein  40.14 
 
 		 152 aa  127  5.0000000000000004e-29  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.063355  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2784  ABC-type transport system involved in resistance to organic solvents periplasmic component  40 
 
 		 155 aa  114  3.9999999999999997e-25  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.162084  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0339  Mammalian cell entry related domain protein  37.84 
 
 		 152 aa  113  7.999999999999999e-25  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.620596 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0160  mce-related protein  37.84 
 
 		 152 aa  113  7.999999999999999e-25  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1967  hypothetical protein  40 
 
 		 166 aa  113  1.0000000000000001e-24  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.539275  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3120  hypothetical protein  37.16 
 
 		 173 aa  108  2.0000000000000002e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.771354  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0395  hypothetical protein  35.14 
 
 		 187 aa  108  2.0000000000000002e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.147868  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2691  hypothetical protein  35.14 
 
 		 189 aa  108  2.0000000000000002e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0995365  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0416  hypothetical protein  35.14 
 
 		 189 aa  108  2.0000000000000002e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.249405  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2960  signal peptide protein  37.84 
 
 		 173 aa  108  4.0000000000000004e-23  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.432073  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0761  Mammalian cell entry related domain protein  39.72 
 
 		 145 aa  107  6e-23  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3514  ABC transporter, inner membrane subunit  34.46 
 
 		 184 aa  106  9.000000000000001e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.531635  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0343  hypothetical protein  34.46 
 
 		 187 aa  106  1e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.908048  normal  0.599528 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2891  Mammalian cell entry related domain protein  35.81 
 
 		 175 aa  105  2e-22  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.27124 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1750  hypothetical protein  36.73 
 
 		 178 aa  105  2e-22  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.892099  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0389  putative signal peptide protein, toluene tolerance Ttg2C-like  34.46 
 
 		 181 aa  104  3e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3238  Mammalian cell entry related domain protein  35.81 
 
 		 175 aa  105  3e-22  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.303674  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2768  hypothetical protein  34.46 
 
 		 184 aa  104  4e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.422541  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1576  hypothetical protein  44.27 
 
 		 172 aa  103  6e-22  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.667817  normal  0.289363 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0334  hypothetical protein  33.78 
 
 		 187 aa  103  8e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2411  hypothetical protein  35.81 
 
 		 154 aa  103  1e-21  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.108225  normal  0.153742 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2707  hypothetical protein  35.86 
 
 		 149 aa  102  3e-21  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0384  Mammalian cell entry related domain protein  36.3 
 
 		 152 aa  101  3e-21  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.214826 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3569  Mammalian cell entry related domain protein  33.33 
 
 		 186 aa  101  4e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0424468  hitchhiker  0.0000173433 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3296  hypothetical protein  35.81 
 
 		 164 aa  101  4e-21  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.091613  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2747  hypothetical protein  34.46 
 
 		 161 aa  100  7e-21  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1330  hypothetical protein  40.14 
 
 		 168 aa  99.8  1e-20  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.519307  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0098  hypothetical protein  35.14 
 
 		 160 aa  98.6  2e-20  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.334829  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2221  hypothetical protein  34.97 
 
 		 153 aa  99  2e-20  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.693824  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0171  hypothetical protein  41.07 
 
 		 166 aa  99  2e-20  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0890  Mammalian cell entry related domain protein  35.14 
 
 		 156 aa  98.6  3e-20  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.114761  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1818  toluene tolerance protein  36.73 
 
 		 178 aa  97.8  4e-20  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0239  hypothetical protein  32.89 
 
 		 164 aa  97.1  7e-20  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.852395 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03209  toluene tolerance protein  37.84 
 
 		 183 aa  97.1  8e-20  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2218  hypothetical protein  35.57 
 
 		 154 aa  95.5  2e-19  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3002  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  35.14 
 
 		 176 aa  94.7  4e-19  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.784047  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3400  hypothetical protein  37.16 
 
 		 156 aa  94  7e-19  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0097  Mammalian cell entry related domain protein  34.46 
 
 		 160 aa  93.6  8e-19  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  decreased coverage  0.0000148019  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0878  hypothetical protein  37.58 
 
 		 156 aa  93.6  8e-19  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.600632  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0739  Mammalian cell entry related domain protein  34.03 
 
 		 152 aa  92.8  1e-18  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.942465  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_4018  Mammalian cell entry related domain protein  41.59 
 
 		 174 aa  92  2e-18  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.129238  normal  0.186584 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1898  putative ABC transporter substrate-binding protein  33.78 
 
 		 155 aa  92  2e-18  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0319  hypothetical protein  34.11 
 
 		 187 aa  92.4  2e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0287402  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0795  hypothetical protein  33.11 
 
 		 168 aa  92.4  2e-18  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0952502  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1156  Mammalian cell entry related domain protein  31.08 
 
 		 163 aa  92  2e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.482142  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2937  hypothetical protein  31.76 
 
 		 162 aa  90.9  5e-18  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.887715  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3733  mce family protein  33.78 
 
 		 186 aa  90.1  9e-18  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2724  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  33.78 
 
 		 184 aa  90.1  9e-18  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3702  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  33.78 
 
 		 188 aa  90.1  9e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3675  mce family protein  33.78 
 
 		 189 aa  90.1  9e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.090883  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2774  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  33.78 
 
 		 186 aa  90.1  9e-18  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1779  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  33.78 
 
 		 186 aa  90.1  9e-18  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3230  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  33.78 
 
 		 186 aa  90.1  9e-18  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.42671  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2118  hypothetical protein  33.56 
 
 		 151 aa  89.7  1e-17  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0905  hypothetical protein  34.84 
 
 		 158 aa  89  2e-17  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0874  hypothetical protein  34.84 
 
 		 158 aa  89  2e-17  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3392  hypothetical protein  37.5 
 
 		 160 aa  89  2e-17  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3257  hypothetical protein  35.14 
 
 		 179 aa  88.2  3e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2399  hypothetical protein  31.33 
 
 		 156 aa  87.8  4e-17  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0687  hypothetical protein  30.41 
 
 		 169 aa  86.7  1e-16  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0021  Mammalian cell entry related domain protein  40.3 
 
 		 155 aa  86.3  1e-16  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.579673  normal  0.0449568 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5534  hypothetical protein  30.41 
 
 		 161 aa  86.3  1e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.264569  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0718  Mammalian cell entry related domain protein  29.73 
 
 		 161 aa  84.3  5e-16  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0750  hypothetical protein  29.73 
 
 		 161 aa  83.6  8e-16  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3099  putative ABC transport system substrate-binding protein  35.14 
 
 		 160 aa  83.6  9e-16  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.369391  normal  0.460198 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12870  organic solvent tolerance ABC efflux transporter, substrate binding protein  36.91 
 
 		 156 aa  82.8  0.000000000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4358  hypothetical protein  31.82 
 
 		 183 aa  83.2  0.000000000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.52116  normal  0.0531845 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4255  hypothetical protein  40 
 
 		 161 aa  82  0.000000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3806  Mammalian cell entry related domain protein  31.82 
 
 		 214 aa  82.8  0.000000000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.0010771  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2438  hypothetical protein  37.23 
 
 		 151 aa  81.6  0.000000000000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.284994  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3079  mce-related protein  36.3 
 
 		 156 aa  81.6  0.000000000000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.185697 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1110  Mammalian cell entry related domain protein  35.19 
 
 		 196 aa  81.3  0.000000000000004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0820134  normal  0.240411 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1521  hypothetical protein  32.64 
 
 		 150 aa  81.3  0.000000000000005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.661029  normal  0.423884 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0999  hypothetical protein  39.09 
 
 		 160 aa  80.9  0.000000000000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0450  mce family protein  29.87 
 
 		 185 aa  80.9  0.000000000000006  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.132036  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0514  hypothetical protein  29.87 
 
 		 185 aa  80.9  0.000000000000006  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.449918  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1268  hypothetical protein  35.85 
 
 		 155 aa  80.5  0.000000000000007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1144  hypothetical protein  29.87 
 
 		 185 aa  80.5  0.000000000000008  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5026  hypothetical protein  39.09 
 
 		 157 aa  80.5  0.000000000000008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57850  hypothetical protein  39.09 
 
 		 157 aa  80.5  0.000000000000008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1391  hypothetical protein  31.29 
 
 		 148 aa  80.1  0.000000000000009  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.230903  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1171  hypothetical protein  33.33 
 
 		 168 aa  80.1  0.000000000000009  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0960  hypothetical protein  38.18 
 
 		 161 aa  79  0.00000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4445  mce-related protein  37.27 
 
 		 155 aa  78.6  0.00000000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4139  hypothetical protein  38.18 
 
 		 155 aa  79.3  0.00000000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0865  hypothetical protein  37.27 
 
 		 155 aa  78.6  0.00000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0981  hypothetical protein  31.72 
 
 		 158 aa  79  0.00000000000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>