More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_1330 on replicon NC_010338
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010338  Caul_1330  hypothetical protein  100 
 
 
168 aa  328  2e-89  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.519307  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1576  hypothetical protein  76.35 
 
 
172 aa  235  2e-61  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.667817  normal  0.289363 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3296  hypothetical protein  46.85 
 
 
164 aa  122  2e-27  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.091613  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1451  hypothetical protein  43.17 
 
 
156 aa  106  2e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.813641  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1268  hypothetical protein  46.09 
 
 
155 aa  102  2e-21  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1827  hypothetical protein  42.45 
 
 
156 aa  102  2e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.607055 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0194  ABC transporter substrate-binding protein  41.73 
 
 
156 aa  102  4e-21  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.176856  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0339  Mammalian cell entry related domain protein  37.75 
 
 
152 aa  100  9e-21  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.620596 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0160  mce-related protein  37.75 
 
 
152 aa  100  9e-21  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0449  ABC-type transport system protein  40.14 
 
 
148 aa  99.8  2e-20  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  2.58514e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2554  hypothetical protein  37.5 
 
 
164 aa  96.7  1e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.572152  normal  0.17098 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1750  hypothetical protein  37.16 
 
 
178 aa  94  1e-18  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.892099  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03209  toluene tolerance protein  41.6 
 
 
183 aa  92.8  2e-18  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0171  hypothetical protein  37.41 
 
 
166 aa  92.8  2e-18  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1521  hypothetical protein  38.13 
 
 
150 aa  91.7  5e-18  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.661029  normal  0.423884 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2438  hypothetical protein  39.42 
 
 
151 aa  91.3  6e-18  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.284994  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2719  hypothetical protein  39.04 
 
 
151 aa  90.1  1e-17  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.46934  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1818  toluene tolerance protein  41.28 
 
 
178 aa  89.4  2e-17  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1391  hypothetical protein  35.25 
 
 
148 aa  87.8  6e-17  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.230903  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2891  Mammalian cell entry related domain protein  33.93 
 
 
175 aa  86.7  2e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.27124 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3702  hypothetical protein  32.65 
 
 
149 aa  85.5  4e-16  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2299  putative ABC transport system substrate-binding protein  36.55 
 
 
148 aa  84.3  7e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0104875  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3238  Mammalian cell entry related domain protein  33.33 
 
 
175 aa  84  8e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.303674  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_4018  Mammalian cell entry related domain protein  42.06 
 
 
174 aa  84  8e-16  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.129238  normal  0.186584 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0343  hypothetical protein  33.77 
 
 
187 aa  82  0.000000000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.908048  normal  0.599528 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1967  hypothetical protein  44.33 
 
 
166 aa  81.6  0.000000000000005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.539275  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0384  Mammalian cell entry related domain protein  33.33 
 
 
152 aa  81.3  0.000000000000005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.214826 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0395  hypothetical protein  35.17 
 
 
187 aa  81.3  0.000000000000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.147868  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2691  hypothetical protein  35.17 
 
 
189 aa  81.3  0.000000000000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0995365  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0416  hypothetical protein  35.17 
 
 
189 aa  81.3  0.000000000000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.249405  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0334  hypothetical protein  33.77 
 
 
187 aa  80.5  0.00000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0319  hypothetical protein  38.4 
 
 
187 aa  80.1  0.00000000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0287402  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2937  hypothetical protein  32.5 
 
 
162 aa  79.3  0.00000000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.887715  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2707  hypothetical protein  34.03 
 
 
149 aa  79.3  0.00000000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0098  hypothetical protein  36.13 
 
 
160 aa  79.7  0.00000000000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.334829  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1110  Mammalian cell entry related domain protein  36.61 
 
 
196 aa  79.3  0.00000000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0820134  normal  0.240411 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2411  hypothetical protein  31.21 
 
 
154 aa  79  0.00000000000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.108225  normal  0.153742 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2221  hypothetical protein  37.93 
 
 
153 aa  78.2  0.00000000000005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.693824  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3514  ABC transporter, inner membrane subunit  33.11 
 
 
184 aa  77.8  0.00000000000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.531635  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2118  hypothetical protein  34.25 
 
 
151 aa  77.8  0.00000000000007  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0854  Mammalian cell entry related domain protein  36.88 
 
 
148 aa  77.4  0.00000000000008  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.102404 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2784  ABC-type transport system involved in resistance to organic solvents periplasmic component  32.68 
 
 
155 aa  77.4  0.00000000000009  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.162084  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1818  hypothetical protein  38.3 
 
 
148 aa  76.6  0.0000000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3257  hypothetical protein  37.74 
 
 
179 aa  76.6  0.0000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002978  WD1105  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein, putative  32.88 
 
 
151 aa  76.3  0.0000000000002  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.165504  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0097  Mammalian cell entry related domain protein  36.84 
 
 
160 aa  76.3  0.0000000000002  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  decreased coverage  0.0000148019  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3392  hypothetical protein  36.67 
 
 
160 aa  75.5  0.0000000000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2960  signal peptide protein  34.48 
 
 
173 aa  75.9  0.0000000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.432073  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2399  hypothetical protein  34.51 
 
 
156 aa  75.5  0.0000000000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1015  hypothetical protein  38.05 
 
 
163 aa  75.5  0.0000000000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0534  Mammalian cell entry related domain protein  39.42 
 
 
150 aa  74.7  0.0000000000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3002  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  33.79 
 
 
176 aa  74.7  0.0000000000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.784047  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5534  hypothetical protein  32.7 
 
 
161 aa  74.7  0.0000000000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.264569  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2724  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  33.79 
 
 
184 aa  73.2  0.000000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0718  Mammalian cell entry related domain protein  37.17 
 
 
161 aa  73.6  0.000000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3120  hypothetical protein  32.41 
 
 
173 aa  73.6  0.000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.771354  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3702  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  33.79 
 
 
188 aa  73.2  0.000000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3733  mce family protein  33.79 
 
 
186 aa  73.2  0.000000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1007  Mammalian cell entry related domain protein  42.86 
 
 
152 aa  73.9  0.000000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.063355  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2774  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  33.79 
 
 
186 aa  73.2  0.000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0739  Mammalian cell entry related domain protein  32.88 
 
 
152 aa  73.6  0.000000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.942465  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3230  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  33.79 
 
 
186 aa  73.2  0.000000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.42671  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3675  mce family protein  33.79 
 
 
189 aa  73.2  0.000000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.090883  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1779  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  33.79 
 
 
186 aa  73.2  0.000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1898  putative ABC transporter substrate-binding protein  33.79 
 
 
155 aa  72.8  0.000000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0389  putative signal peptide protein, toluene tolerance Ttg2C-like  30.72 
 
 
181 aa  72.8  0.000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0750  hypothetical protein  37.17 
 
 
161 aa  72.8  0.000000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03656  hypothetical protein  35.67 
 
 
165 aa  72.8  0.000000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0474  hypothetical protein  35.44 
 
 
164 aa  72.4  0.000000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.000014845  unclonable  0.00000680839 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2747  hypothetical protein  29.81 
 
 
161 aa  71.2  0.000000000007  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3569  Mammalian cell entry related domain protein  33.1 
 
 
186 aa  70.9  0.000000000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0424468  hitchhiker  0.0000173433 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2768  hypothetical protein  31.72 
 
 
184 aa  70.1  0.00000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.422541  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0795  hypothetical protein  31.72 
 
 
168 aa  70.5  0.00000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0952502  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3183  Mammalian cell entry related domain protein  32.67 
 
 
150 aa  70.5  0.00000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0905  hypothetical protein  29.14 
 
 
158 aa  69.3  0.00000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0874  hypothetical protein  29.14 
 
 
158 aa  69.3  0.00000000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1156  Mammalian cell entry related domain protein  32.5 
 
 
163 aa  69.3  0.00000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.482142  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002411  uncharacterized ABC transporter, periplasmic component YrbD  35.57 
 
 
162 aa  69.7  0.00000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1041  hypothetical protein  31.72 
 
 
150 aa  69.3  0.00000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0560  hypothetical protein  34.51 
 
 
148 aa  69.7  0.00000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000625618  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0890  Mammalian cell entry related domain protein  35.07 
 
 
156 aa  68.9  0.00000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.114761  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0999  hypothetical protein  37.3 
 
 
160 aa  68.9  0.00000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0761  Mammalian cell entry related domain protein  38.58 
 
 
145 aa  68.6  0.00000000004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0527  mce-related protein  30.66 
 
 
145 aa  68.2  0.00000000005  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0290  Mammalian cell entry related domain protein  30.56 
 
 
188 aa  67.8  0.00000000006  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.151432  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0878  hypothetical protein  33.56 
 
 
156 aa  67.8  0.00000000006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.600632  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0786  virulence factor MCE-like protein-related protein  33.33 
 
 
150 aa  67.8  0.00000000007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3648  Mammalian cell entry related domain protein  30.06 
 
 
190 aa  67.4  0.00000000009  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0815  mce-related protein  30.56 
 
 
149 aa  67.4  0.0000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0960  hypothetical protein  36.51 
 
 
161 aa  67  0.0000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0687  hypothetical protein  30.36 
 
 
169 aa  67  0.0000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3806  Mammalian cell entry related domain protein  29.45 
 
 
214 aa  66.6  0.0000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.0010771  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0559  hypothetical protein  37.29 
 
 
154 aa  67  0.0000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0021  Mammalian cell entry related domain protein  32.65 
 
 
155 aa  67  0.0000000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.579673  normal  0.0449568 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0865  hypothetical protein  35.71 
 
 
155 aa  66.2  0.0000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0239  hypothetical protein  31.03 
 
 
164 aa  66.6  0.0000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.852395 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4358  hypothetical protein  30.43 
 
 
183 aa  66.2  0.0000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.52116  normal  0.0531845 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12870  organic solvent tolerance ABC efflux transporter, substrate binding protein  34.25 
 
 
156 aa  65.9  0.0000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0967  hypothetical protein  36.51 
 
 
161 aa  66.2  0.0000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4255  hypothetical protein  36.51 
 
 
161 aa  65.5  0.0000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>