210 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rru_A2439 on replicon NC_007643
Organism: Rhodospirillum rubrum ATCC 11170



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007643  Rru_A2439  hypothetical protein  100 
 
 		 271 aa  529  1e-149  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0222447  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3296  hypothetical protein  36.81 
 
 		 164 aa  85.9  6e-16  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.091613  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1110  Mammalian cell entry related domain protein  37.58 
 
 		 196 aa  84.3  0.000000000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0820134  normal  0.240411 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1391  hypothetical protein  38.73 
 
 		 148 aa  84.3  0.000000000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.230903  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0194  ABC transporter substrate-binding protein  41.82 
 
 		 156 aa  78.2  0.0000000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.176856  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2438  hypothetical protein  35.97 
 
 		 151 aa  77  0.0000000000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.284994  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1268  hypothetical protein  42.73 
 
 		 155 aa  77  0.0000000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1827  hypothetical protein  40.91 
 
 		 156 aa  77  0.0000000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.607055 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0761  Mammalian cell entry related domain protein  33.81 
 
 		 145 aa  75.9  0.0000000000007  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3120  hypothetical protein  35.34 
 
 		 173 aa  75.1  0.000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.771354  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2784  ABC-type transport system involved in resistance to organic solvents periplasmic component  34.75 
 
 		 155 aa  74.3  0.000000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.162084  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1898  putative ABC transporter substrate-binding protein  36.84 
 
 		 155 aa  73.2  0.000000000004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1171  hypothetical protein  30.18 
 
 		 168 aa  73.6  0.000000000004  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2960  signal peptide protein  33.09 
 
 		 173 aa  72.8  0.000000000006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.432073  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3257  hypothetical protein  38.83 
 
 		 179 aa  72.8  0.000000000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1451  hypothetical protein  38.18 
 
 		 156 aa  72.8  0.000000000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.813641  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2719  hypothetical protein  35.66 
 
 		 151 aa  72.4  0.000000000007  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.46934  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0534  Mammalian cell entry related domain protein  33.1 
 
 		 150 aa  72.4  0.000000000007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2891  Mammalian cell entry related domain protein  30.88 
 
 		 175 aa  72.4  0.000000000007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.27124 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0171  hypothetical protein  34.72 
 
 		 166 aa  72.4  0.000000000008  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0384  Mammalian cell entry related domain protein  36.84 
 
 		 152 aa  72  0.000000000009  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.214826 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3238  Mammalian cell entry related domain protein  30.88 
 
 		 175 aa  71.6  0.00000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.303674  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0890  Mammalian cell entry related domain protein  34.81 
 
 		 156 aa  72  0.00000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.114761  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0878  hypothetical protein  38.53 
 
 		 156 aa  68.2  0.0000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.600632  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2768  hypothetical protein  36.15 
 
 		 184 aa  68.6  0.0000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.422541  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0339  Mammalian cell entry related domain protein  34.56 
 
 		 152 aa  67.8  0.0000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.620596 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0449  ABC-type transport system protein  33.81 
 
 		 148 aa  67.4  0.0000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  2.58514e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3569  Mammalian cell entry related domain protein  34.72 
 
 		 186 aa  67.8  0.0000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0424468  hitchhiker  0.0000173433 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0160  mce-related protein  34.56 
 
 		 152 aa  67.8  0.0000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1818  hypothetical protein  33.8 
 
 		 148 aa  67.8  0.0000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1967  hypothetical protein  33.33 
 
 		 166 aa  67  0.0000000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.539275  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0739  Mammalian cell entry related domain protein  34.06 
 
 		 152 aa  67.4  0.0000000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.942465  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0098  hypothetical protein  34.58 
 
 		 160 aa  67  0.0000000003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.334829  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0815  mce-related protein  35.51 
 
 		 149 aa  66.6  0.0000000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0786  virulence factor MCE-like protein-related protein  33.81 
 
 		 150 aa  66.2  0.0000000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0389  putative signal peptide protein, toluene tolerance Ttg2C-like  36.92 
 
 		 181 aa  66.2  0.0000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1750  hypothetical protein  34.81 
 
 		 178 aa  66.2  0.0000000005  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.892099  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2299  putative ABC transport system substrate-binding protein  31.62 
 
 		 148 aa  65.9  0.0000000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0104875  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1041  hypothetical protein  35.46 
 
 		 150 aa  66.2  0.0000000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0854  Mammalian cell entry related domain protein  33.8 
 
 		 148 aa  65.9  0.0000000007  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.102404 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3702  hypothetical protein  31.58 
 
 		 149 aa  65.9  0.0000000008  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0239  hypothetical protein  31.65 
 
 		 164 aa  65.1  0.000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.852395 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3400  hypothetical protein  32.71 
 
 		 156 aa  63.9  0.000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0967  hypothetical protein  35.65 
 
 		 161 aa  64.3  0.000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4255  hypothetical protein  35.65 
 
 		 161 aa  63.9  0.000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0999  hypothetical protein  35.65 
 
 		 160 aa  63.9  0.000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0960  hypothetical protein  35.65 
 
 		 161 aa  63.9  0.000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2747  hypothetical protein  29.46 
 
 		 161 aa  63.5  0.000000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0097  Mammalian cell entry related domain protein  32.71 
 
 		 160 aa  63.5  0.000000003  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  decreased coverage  0.0000148019  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57850  hypothetical protein  37.72 
 
 		 157 aa  63.9  0.000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5026  hypothetical protein  37.72 
 
 		 157 aa  63.9  0.000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1576  hypothetical protein  34.11 
 
 		 172 aa  62.8  0.000000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.667817  normal  0.289363 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0981  hypothetical protein  31.25 
 
 		 158 aa  62.4  0.000000007  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1015  hypothetical protein  34.48 
 
 		 163 aa  62  0.000000009  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0865  hypothetical protein  34.86 
 
 		 155 aa  62  0.00000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2937  hypothetical protein  31.21 
 
 		 162 aa  61.6  0.00000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.887715  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2554  hypothetical protein  37.07 
 
 		 164 aa  62  0.00000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.572152  normal  0.17098 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2411  hypothetical protein  31.21 
 
 		 154 aa  61.6  0.00000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.108225  normal  0.153742 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4139  hypothetical protein  33.91 
 
 		 155 aa  61.2  0.00000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1521  hypothetical protein  34.86 
 
 		 150 aa  61.2  0.00000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.661029  normal  0.423884 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2399  hypothetical protein  33.09 
 
 		 156 aa  60.8  0.00000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4445  mce-related protein  33.04 
 
 		 155 aa  60.5  0.00000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_4018  Mammalian cell entry related domain protein  33.88 
 
 		 174 aa  60.5  0.00000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.129238  normal  0.186584 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4358  hypothetical protein  26.53 
 
 		 183 aa  60.5  0.00000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.52116  normal  0.0531845 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1818  toluene tolerance protein  33.87 
 
 		 178 aa  59.7  0.00000004  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0718  Mammalian cell entry related domain protein  34.33 
 
 		 161 aa  60.1  0.00000004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1007  Mammalian cell entry related domain protein  33.67 
 
 		 152 aa  59.7  0.00000005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.063355  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0750  hypothetical protein  33.83 
 
 		 161 aa  59.3  0.00000006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3648  Mammalian cell entry related domain protein  27.89 
 
 		 190 aa  58.2  0.0000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3572  Mce family protein  28.86 
 
 		 183 aa  58.5  0.0000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0795  hypothetical protein  32.61 
 
 		 168 aa  58.2  0.0000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0952502  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0319  hypothetical protein  34.95 
 
 		 187 aa  58.2  0.0000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0287402  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3608  Mce family protein  28.86 
 
 		 183 aa  58.5  0.0000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.345737 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1330  hypothetical protein  28.36 
 
 		 168 aa  58.2  0.0000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.519307  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3670  Mce family protein  28.86 
 
 		 183 aa  58.5  0.0000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.0296035 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3501  Mce family protein  28.86 
 
 		 183 aa  58.5  0.0000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0513461  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3503  Mce family protein  28.86 
 
 		 183 aa  58.5  0.0000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.869463  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD1105  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein, putative  28.57 
 
 		 151 aa  57.8  0.0000002  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.165504  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03209  toluene tolerance protein  33.58 
 
 		 183 aa  57.8  0.0000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2691  hypothetical protein  33.33 
 
 		 189 aa  57.8  0.0000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0995365  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1156  Mammalian cell entry related domain protein  31.39 
 
 		 163 aa  57.4  0.0000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.482142  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0416  hypothetical protein  33.33 
 
 		 189 aa  57.8  0.0000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.249405  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0395  hypothetical protein  33.33 
 
 		 187 aa  57.8  0.0000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.147868  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2221  hypothetical protein  33.78 
 
 		 153 aa  57.4  0.0000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.693824  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3827  virulence factor Mce family protein  31.5 
 
 		 364 aa  57  0.0000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3002  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  33.65 
 
 		 176 aa  56.6  0.0000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.784047  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0343  hypothetical protein  32.54 
 
 		 187 aa  57  0.0000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.908048  normal  0.599528 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2218  hypothetical protein  34.23 
 
 		 154 aa  56.6  0.0000005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3514  ABC transporter, inner membrane subunit  32.54 
 
 		 184 aa  55.8  0.0000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.531635  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2118  hypothetical protein  36.28 
 
 		 151 aa  55.8  0.0000007  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12870  organic solvent tolerance ABC efflux transporter, substrate binding protein  33.94 
 
 		 156 aa  55.5  0.0000008  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0403  hypothetical protein  31.62 
 
 		 146 aa  55.5  0.0000008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.304841  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3806  Mammalian cell entry related domain protein  28.26 
 
 		 214 aa  55.5  0.0000008  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.0010771  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5534  hypothetical protein  33.08 
 
 		 161 aa  55.5  0.0000008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.264569  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2724  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  33.65 
 
 		 184 aa  55.5  0.000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0334  hypothetical protein  32.54 
 
 		 187 aa  54.7  0.000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3392  hypothetical protein  34.58 
 
 		 160 aa  55.5  0.000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1779  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  33.65 
 
 		 186 aa  55.5  0.000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3675  mce family protein  33.65 
 
 		 189 aa  55.5  0.000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.090883  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3733  mce family protein  33.65 
 
 		 186 aa  55.5  0.000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>