66 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene P9303_25211 on replicon NC_008820
Organism: Prochlorococcus marinus str. MIT 9303



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008820  P9303_25211  putative ABC transporter  100 
 
 
291 aa  588  1e-167  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0208  ABC transporter  55.79 
 
 
286 aa  342  4e-93  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.751363 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0235  ABC transporter  57.19 
 
 
286 aa  340  1e-92  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_03691  putative ABC transporter  46.26 
 
 
281 aa  278  1e-73  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1655  putative ABC transporter  45.91 
 
 
281 aa  274  1.0000000000000001e-72  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_03131  putative ABC transporter  40.57 
 
 
281 aa  246  2e-64  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_03121  putative ABC transporter  40.21 
 
 
281 aa  246  3e-64  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.776003  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0291  putative ABC transporter  40.21 
 
 
281 aa  244  9.999999999999999e-64  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.324707  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_03151  putative ABC transporter  40.93 
 
 
281 aa  239  2.9999999999999997e-62  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_03221  putative ABC transporter  39.86 
 
 
281 aa  237  2e-61  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.0751946  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0351  putative ABC transport system substrate-binding protein  26.39 
 
 
377 aa  112  5e-24  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3809  Mammalian cell entry related domain protein  26.64 
 
 
404 aa  85.5  9e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.622643  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3037  Mammalian cell entry related domain protein  30.77 
 
 
479 aa  79  0.00000000000009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.622361 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0513  Mammalian cell entry related domain protein  23.65 
 
 
465 aa  77  0.0000000000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0530  Mammalian cell entry related domain protein  23.65 
 
 
465 aa  77  0.0000000000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0794795  hitchhiker  0.00420823 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2165  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  30.3 
 
 
476 aa  67  0.0000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0329  hypothetical protein  27.27 
 
 
430 aa  65.1  0.000000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.967579  normal  0.70235 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0998  mammalian cell entry related domain-containing protein  32.45 
 
 
470 aa  64.3  0.000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0397137  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2113  Mammalian cell entry related domain protein  25.39 
 
 
316 aa  55.1  0.000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.202192  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4165  virulence factor Mce family protein  25.36 
 
 
487 aa  53.5  0.000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.450079 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1487  hypothetical protein  25.85 
 
 
321 aa  52.8  0.000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.30011 
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_41114  predicted protein  20.14 
 
 
306 aa  52.8  0.000007  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.830125  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3945  virulence factor Mce family protein  24.75 
 
 
476 aa  52.4  0.000008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2811  ABC transporter periplasmic substrate-binding protein  25.42 
 
 
321 aa  51.6  0.00001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.218461  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4584  hypothetical protein  21.75 
 
 
321 aa  52.4  0.00001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10175  MCE-family protein mce1F  25.4 
 
 
515 aa  51.2  0.00002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2674  hypothetical protein  25.38 
 
 
470 aa  51.6  0.00002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2315  hypothetical protein  24.48 
 
 
433 aa  49.7  0.00005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.629666  normal  0.23577 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4571  Mammalian cell entry related domain protein  21.89 
 
 
468 aa  48.9  0.00009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2514  hypothetical protein  20.63 
 
 
302 aa  48.5  0.0001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0373094  hitchhiker  0.00640469 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1222  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  21.61 
 
 
308 aa  47.8  0.0002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2028  hypothetical protein  24.51 
 
 
307 aa  48.1  0.0002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0743  hypothetical protein  21.61 
 
 
308 aa  47.8  0.0002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2106  virulence factor Mce family protein  35.05 
 
 
486 aa  47.4  0.0003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.583314  normal  0.616965 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0853  Mammalian cell entry related domain protein  26.19 
 
 
360 aa  47.4  0.0003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.547444  normal  0.0740756 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1718  hypothetical protein  25.85 
 
 
321 aa  47.4  0.0003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.130812  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2023  hypothetical protein  22.78 
 
 
307 aa  47  0.0003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0893  hypothetical protein  26.19 
 
 
360 aa  46.6  0.0004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.932259  normal  0.840241 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1135  virulence factor Mce family protein  31.9 
 
 
413 aa  46.6  0.0005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4612  virulence factor MCE-like protein  27.32 
 
 
584 aa  46.6  0.0005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4700  virulence factor Mce family protein  27.32 
 
 
584 aa  46.6  0.0005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4533  virulence factor Mce family protein  34.29 
 
 
504 aa  46.2  0.0006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0456406  normal  0.287629 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5197  virulence factor Mce family protein  23.37 
 
 
564 aa  45.1  0.001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0737049  normal  0.144071 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0271  virulence factor Mce family protein  23.37 
 
 
512 aa  44.7  0.002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.739387 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0280  virulence factor MCE-like protein  23.37 
 
 
512 aa  44.7  0.002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0290  virulence factor Mce family protein  23.37 
 
 
512 aa  44.7  0.002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.530159 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0132  virulence factor Mce family protein  27.97 
 
 
519 aa  44.7  0.002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.208767  normal  0.215397 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0123  virulence factor MCE-like protein  27.97 
 
 
519 aa  44.7  0.002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0819  Mammalian cell entry related domain protein  25.79 
 
 
360 aa  44.7  0.002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.940856  normal  0.371377 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3238  Mammalian cell entry related domain protein  35.4 
 
 
175 aa  44.3  0.002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.303674  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4995  virulence factor Mce family protein  25.77 
 
 
580 aa  44.3  0.003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.771933  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2891  Mammalian cell entry related domain protein  35.4 
 
 
175 aa  44.3  0.003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.27124 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2368  hypothetical protein  23.05 
 
 
316 aa  44.3  0.003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.709282  normal  0.77833 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0039  hypothetical protein  24.13 
 
 
312 aa  43.5  0.004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.292682  normal  0.178021 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1508  Mammalian cell entry related domain protein  24.65 
 
 
356 aa  42.7  0.006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.577537 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2960  signal peptide protein  31.86 
 
 
173 aa  43.1  0.006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.432073  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10606  MCE-family protein mce2F  23.94 
 
 
516 aa  43.1  0.006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.466214 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1552  hypothetical protein  20.9 
 
 
458 aa  42.7  0.007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.394461  normal  0.189115 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4165  virulence factor Mce family protein  25.13 
 
 
484 aa  42.4  0.008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2243  virulence factor Mce family protein  30.93 
 
 
420 aa  42.4  0.008  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0661  hypothetical protein  25.19 
 
 
292 aa  42.4  0.009  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2819  virulence factor Mce family protein  23.62 
 
 
422 aa  42.4  0.009  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.906597  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0156  hypothetical protein  24.48 
 
 
312 aa  42.4  0.009  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.997452 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03760  virulence factor Mce family protein  26.29 
 
 
398 aa  42.4  0.009  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.704534  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4599  virulence factor Mce family protein  22.68 
 
 
499 aa  42.4  0.009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.376755  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1556  virulence factor Mce family protein  25.48 
 
 
400 aa  42.4  0.009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>