252 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_1135 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013441  Gbro_1135  virulence factor Mce family protein  100 
 
 		 413 aa  836    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3485  virulence factor Mce family protein  69.42 
 
 		 415 aa  598  1e-170  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2243  virulence factor Mce family protein  49.05 
 
 		 420 aa  406  1.0000000000000001e-112  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03770  virulence factor Mce family protein  34.3 
 
 		 420 aa  235  9e-61  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0708  virulence factor Mce family protein  36.03 
 
 		 424 aa  234  2.0000000000000002e-60  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0372566  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09310  virulence factor Mce family protein  38.3 
 
 		 394 aa  232  8.000000000000001e-60  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.91288 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4341  virulence factor Mce family protein  32.92 
 
 		 493 aa  195  1e-48  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1173  virulence factor Mce family protein  35.61 
 
 		 432 aa  193  4e-48  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.376131 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0123  virulence factor MCE-like protein  33.64 
 
 		 519 aa  177  3e-43  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0132  virulence factor Mce family protein  33.64 
 
 		 519 aa  177  3e-43  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.208767  normal  0.215397 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0113  virulence factor Mce family protein  33.03 
 
 		 519 aa  173  3.9999999999999995e-42  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3977  virulence factor Mce family protein  36.27 
 
 		 479 aa  172  1e-41  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.240888  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4165  virulence factor Mce family protein  35.69 
 
 		 484 aa  171  2e-41  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4145  virulence factor Mce family protein  32.3 
 
 		 561 aa  169  7e-41  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.903302  normal  0.559384 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2513  virulence factor Mce family protein  32.64 
 
 		 564 aa  169  8e-41  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.444181 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0706  virulence factor Mce family protein  33.13 
 
 		 520 aa  167  2.9999999999999998e-40  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.900705  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3679  virulence factor Mce family protein  32.21 
 
 		 564 aa  165  1.0000000000000001e-39  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.794076  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0271  virulence factor Mce family protein  31.85 
 
 		 512 aa  164  2.0000000000000002e-39  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.739387 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0280  virulence factor MCE-like protein  31.85 
 
 		 512 aa  164  2.0000000000000002e-39  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3666  virulence factor MCE-like protein  31.95 
 
 		 564 aa  164  2.0000000000000002e-39  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0290  virulence factor Mce family protein  31.85 
 
 		 512 aa  164  2.0000000000000002e-39  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.530159 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3739  virulence factor Mce family protein  31.95 
 
 		 564 aa  164  2.0000000000000002e-39  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2106  virulence factor Mce family protein  33.33 
 
 		 486 aa  164  3e-39  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.583314  normal  0.616965 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4599  virulence factor Mce family protein  32.58 
 
 		 499 aa  162  1e-38  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.376755  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3945  virulence factor Mce family protein  29.87 
 
 		 476 aa  161  2e-38  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0368  virulence factor Mce family protein  32.23 
 
 		 481 aa  157  3e-37  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0139  virulence factor Mce family protein  32.83 
 
 		 520 aa  156  7e-37  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1529  virulence factor MCE-like protein  30.68 
 
 		 479 aa  152  8.999999999999999e-36  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1552  virulence factor Mce family protein  30.68 
 
 		 479 aa  152  8.999999999999999e-36  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.977582  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1632  virulence factor Mce family protein  33.07 
 
 		 484 aa  151  2e-35  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.175029  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1659  virulence factor MCE-like protein  33.07 
 
 		 484 aa  151  2e-35  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1683  virulence factor Mce family protein  33.07 
 
 		 484 aa  151  2e-35  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0518  virulence factor Mce family protein  33.07 
 
 		 484 aa  151  2e-35  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.608059  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0647  virulence factor Mce family protein  32.81 
 
 		 484 aa  150  4e-35  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4533  virulence factor Mce family protein  33.59 
 
 		 504 aa  149  1.0000000000000001e-34  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0456406  normal  0.287629 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10175  MCE-family protein mce1F  30 
 
 		 515 aa  147  2.0000000000000003e-34  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0927  virulence factor Mce family protein  31.44 
 
 		 495 aa  147  4.0000000000000006e-34  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.903302  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12002  MCE-family protein mce3F  33.16 
 
 		 437 aa  145  1e-33  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000281764  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4394  virulence factor Mce family protein  31.87 
 
 		 483 aa  145  1e-33  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5197  virulence factor Mce family protein  30.1 
 
 		 564 aa  143  6e-33  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0737049  normal  0.144071 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10606  MCE-family protein mce2F  28.42 
 
 		 516 aa  141  1.9999999999999998e-32  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.466214 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4165  virulence factor Mce family protein  29.87 
 
 		 487 aa  141  1.9999999999999998e-32  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.450079 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4612  virulence factor MCE-like protein  31.11 
 
 		 584 aa  139  1e-31  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4700  virulence factor Mce family protein  31.11 
 
 		 584 aa  139  1e-31  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4183  virulence factor Mce family protein  32.31 
 
 		 482 aa  139  1e-31  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.791662  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2819  virulence factor Mce family protein  31.53 
 
 		 422 aa  138  2e-31  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.906597  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4995  virulence factor Mce family protein  31.09 
 
 		 580 aa  137  3.0000000000000003e-31  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.771933  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1561  virulence factor Mce family protein  29.61 
 
 		 565 aa  133  5e-30  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13528  MCE-family protein mce4F  28.68 
 
 		 564 aa  124  4e-27  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000487906 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2162  virulence factor Mce family protein  31.61 
 
 		 348 aa  123  5e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6630  ABC-type transport system involved in resistance to organic solvents periplasmic component  28.17 
 
 		 471 aa  92.4  1e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.000794553  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2981  virulence factor Mce family protein  27.9 
 
 		 390 aa  89  2e-16  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0005  virulence factor Mce family protein  28.52 
 
 		 416 aa  83.6  0.000000000000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.409112 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3023  ABC-type transport system involved in resistance to organic solvents periplasmic component-like protein  28.1 
 
 		 338 aa  80.5  0.00000000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0964  hypothetical protein  25.99 
 
 		 416 aa  77.8  0.0000000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3022  ABC-type transport system involved in resistance to organic solvents periplasmic component-like protein  29.78 
 
 		 355 aa  77.4  0.0000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0518  virulence factor Mce family protein  28.28 
 
 		 337 aa  72  0.00000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1504  virulence factor Mce family protein  26.35 
 
 		 395 aa  72  0.00000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1171  virulence factor Mce family protein  26.05 
 
 		 369 aa  71.2  0.00000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.919732 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3828  virulence factor Mce family protein  26.94 
 
 		 352 aa  70.9  0.00000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3827  virulence factor Mce family protein  24.38 
 
 		 364 aa  70.5  0.00000000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1527  virulence factor MCE-like protein  26.01 
 
 		 424 aa  69.3  0.0000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.292709  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1550  virulence factor Mce family protein  26.01 
 
 		 424 aa  69.3  0.0000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2118  hypothetical protein  31.97 
 
 		 151 aa  69.3  0.0000000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0706  virulence factor Mce family protein  24.54 
 
 		 379 aa  67.8  0.0000000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2983  virulence factor Mce family protein  22.91 
 
 		 394 aa  67  0.0000000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.844857  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1240  Mammalian cell entry related domain protein  27.41 
 
 		 320 aa  67  0.0000000007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0513  virulence factor Mce family protein  25.2 
 
 		 430 aa  66.2  0.000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3823  virulence factor Mce family protein  23.57 
 
 		 432 aa  65.1  0.000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0678  Mammalian cell entry related domain protein  26.15 
 
 		 529 aa  63.9  0.000000004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.828772 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4614  virulence factor MCE-like protein  22.36 
 
 		 453 aa  63.5  0.000000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4702  virulence factor Mce family protein  22.36 
 
 		 453 aa  63.5  0.000000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3018  ABC-type transport system involved in resistance to organic solvents periplasmic component-like protein  25.98 
 
 		 460 aa  62.4  0.00000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.710207  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4167  virulence factor Mce family protein  24.91 
 
 		 448 aa  62.8  0.00000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.185217  normal  0.581101 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5199  virulence factor Mce family protein  24.79 
 
 		 453 aa  62.4  0.00000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.214398  normal  0.135987 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3021  ABC-type transport system involved in resistance to organic solvents periplasmic component-like protein  22.9 
 
 		 340 aa  62  0.00000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1559  virulence factor Mce family protein  24.8 
 
 		 459 aa  61.6  0.00000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4997  virulence factor Mce family protein  21.95 
 
 		 463 aa  61.6  0.00000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.430498 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0366  virulence factor Mce family protein  28.23 
 
 		 439 aa  62.4  0.00000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.814005 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2157  virulence factor Mce family protein  25.59 
 
 		 359 aa  62  0.00000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00120827  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13530  MCE-family protein mce4D  22.65 
 
 		 451 aa  60.8  0.00000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000446617 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0517  virulence factor Mce family protein  23.97 
 
 		 355 aa  60.8  0.00000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2960  signal peptide protein  31.06 
 
 		 173 aa  60.5  0.00000006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.432073  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1041  hypothetical protein  30.66 
 
 		 150 aa  60.1  0.00000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3020  ABC-type transport system involved in resistance to organic solvents periplasmic component-like protein  23.2 
 
 		 363 aa  59.7  0.00000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09330  virulence factor Mce family protein  23.84 
 
 		 332 aa  58.9  0.0000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.892194 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1130  virulence factor Mce family protein  26.15 
 
 		 443 aa  58.9  0.0000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2784  ABC-type transport system involved in resistance to organic solvents periplasmic component  29.71 
 
 		 155 aa  58.5  0.0000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.162084  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0840  hypothetical protein  24.92 
 
 		 317 aa  58.9  0.0000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0137  virulence factor Mce family protein  22.92 
 
 		 544 aa  58.5  0.0000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1133  virulence factor Mce family protein  21.89 
 
 		 445 aa  58.2  0.0000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4166  Fis family transcriptional regulator  25 
 
 		 380 aa  57.8  0.0000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.802783 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10173  MCE-family protein mce1D  21.88 
 
 		 530 aa  58.2  0.0000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11997  MCE-family protein mce3A  26.34 
 
 		 425 aa  58.2  0.0000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00865104  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0925  virulence factor Mce family protein  26.72 
 
 		 427 aa  58.2  0.0000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1818  hypothetical protein  30.66 
 
 		 148 aa  58.2  0.0000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09340  virulence factor Mce family protein  22.69 
 
 		 329 aa  57.4  0.0000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.677284 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4343  virulence factor Mce family protein  24.17 
 
 		 434 aa  57  0.0000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1625  Mammalian cell entry related domain protein  26.91 
 
 		 559 aa  57  0.0000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.164573 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0384  Mammalian cell entry related domain protein  26.9 
 
 		 152 aa  56.6  0.0000007  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.214826 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>