More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_56588 on replicon NC_011678
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011678  PHATRDRAFT_56588  predicted protein  100 
 
 
545 aa  1126    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_56608  predicted protein  51.32 
 
 
433 aa  352  1e-95  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0109  protochlorophyllide oxidoreductase  43.79 
 
 
323 aa  250  4e-65  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0190  light-dependent protochlorophyllide reductase  42.12 
 
 
321 aa  249  1e-64  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.71364  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0294  protochlorophyllide oxidoreductase  44.48 
 
 
329 aa  242  1e-62  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.920312 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3774  protochlorophyllide oxidoreductase  43.25 
 
 
320 aa  235  2.0000000000000002e-60  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0260841  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3722  protochlorophyllide oxidoreductase  43.25 
 
 
320 aa  235  2.0000000000000002e-60  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009959  Dshi_4160  protochlorophyllide oxidoreductase  39.23 
 
 
328 aa  233  7.000000000000001e-60  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.297736  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1998  protochlorophyllide oxidoreductase  42.36 
 
 
320 aa  232  1e-59  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4969  protochlorophyllide oxidoreductase  43.42 
 
 
325 aa  231  3e-59  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_4180  predicted protein  44.37 
 
 
328 aa  228  2e-58  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0280434  decreased coverage  0.000647505 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2503  protochlorophyllide oxidoreductase  42.53 
 
 
321 aa  227  3e-58  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0476532  hitchhiker  0.00139691 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_05981  protochlorophyllide oxidoreductase  38.82 
 
 
334 aa  203  6e-51  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1623  protochlorophyllide oxidoreductase  38.46 
 
 
318 aa  201  1.9999999999999998e-50  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.783305  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0542  protochlorophyllide oxidoreductase  39.4 
 
 
334 aa  202  1.9999999999999998e-50  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_05681  protochlorophyllide oxidoreductase  39.4 
 
 
334 aa  200  5e-50  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_07921  protochlorophyllide oxidoreductase  39.8 
 
 
334 aa  197  4.0000000000000005e-49  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_06061  protochlorophyllide oxidoreductase  38.41 
 
 
334 aa  196  1e-48  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.901695  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_05961  protochlorophyllide oxidoreductase  37.92 
 
 
337 aa  194  4e-48  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.641306 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1871  protochlorophyllide oxidoreductase  37.92 
 
 
337 aa  193  6e-48  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_05441  protochlorophyllide oxidoreductase  36.1 
 
 
338 aa  193  8e-48  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0740  protochlorophyllide oxidoreductase  35.31 
 
 
316 aa  190  5.999999999999999e-47  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_4520  predicted protein  32.54 
 
 
330 aa  111  3e-23  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.645511  normal  0.871752 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_06971  putative light-dependent protochlorophyllide oxido-reductase  31.17 
 
 
340 aa  92.4  2e-17  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.938537  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0074  putative light-dependent protochlorophyllide oxido-reductase  29.33 
 
 
340 aa  91.3  4e-17  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.120468  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1268  chlorophyll synthase / NADPH-protochlorophyllide oxidoreductase  27.02 
 
 
328 aa  85.5  0.000000000000003  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_13231  putative light-dependent protochlorophyllide oxido-reductase  28.85 
 
 
348 aa  84.3  0.000000000000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.379961 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1216  light-dependent protochlorophyllide oxido-reductase  28.17 
 
 
322 aa  79.7  0.0000000000001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1067  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.22 
 
 
279 aa  79  0.0000000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10309  dehydrogenase/reductase  28.21 
 
 
302 aa  77.8  0.0000000000005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0691061  normal  0.130665 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_5468  predicted protein  29 
 
 
292 aa  75.5  0.000000000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2789  short chain dehydrogenase  25.91 
 
 
304 aa  71.6  0.00000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.625532  normal  0.190884 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0493  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.12 
 
 
250 aa  70.9  0.00000000007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2106  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  23.46 
 
 
298 aa  70.5  0.00000000009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0407655  normal 
 
 
-
 
NC_009375  OSTLU_89854  predicted protein  25.27 
 
 
363 aa  68.9  0.0000000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.264825  hitchhiker  0.0060203 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3573  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.71 
 
 
298 aa  69.3  0.0000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3278  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  27.38 
 
 
306 aa  69.3  0.0000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0605  short chain dehydrogenase  26.22 
 
 
300 aa  68.9  0.0000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.140006  n/a   
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_88990  predicted protein  25.27 
 
 
363 aa  68.9  0.0000000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.0137755 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0618  short chain dehydrogenase  26.22 
 
 
300 aa  68.9  0.0000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.673408  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0596  short chain dehydrogenase  26.01 
 
 
300 aa  67  0.0000000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0763  short chain dehydrogenase  30.09 
 
 
316 aa  67  0.0000000008  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.920637  normal  0.460734 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0860  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.2 
 
 
287 aa  66.2  0.000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.943731  normal  0.246629 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_06901  putative light-dependent protochlorophyllide oxido-reductase  24.04 
 
 
333 aa  66.6  0.000000001  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.710368  n/a   
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_38463  predicted protein  27.59 
 
 
342 aa  65.5  0.000000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.622688  normal  0.36197 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4028  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  27.19 
 
 
292 aa  66.2  0.000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.251041  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2915  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  26.2 
 
 
326 aa  65.5  0.000000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3909  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.49 
 
 
306 aa  64.3  0.000000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.235938  normal  0.0957503 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0521  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.52 
 
 
253 aa  64.3  0.000000006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.413243 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0634  putative light-dependent protochlorophyllide oxido-reductase  25.1 
 
 
333 aa  64.3  0.000000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.257073  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_15491  short-chain dehydrogenase/reductase  27.78 
 
 
309 aa  64.3  0.000000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.821697  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0032  short chain dehydrogenase  32.9 
 
 
300 aa  63.5  0.000000008  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.249754  normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_06611  putative light-dependent protochlorophyllide oxido-reductase  23.51 
 
 
333 aa  63.5  0.000000009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.588691  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0326  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.38 
 
 
325 aa  63.2  0.00000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.167691 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0542  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.57 
 
 
253 aa  62.4  0.00000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0795693 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2564  short-chain dehydrogenase/reductase  34.69 
 
 
302 aa  62.8  0.00000002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.554832  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1065  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.21 
 
 
312 aa  62.8  0.00000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.334573  normal  0.72801 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0852  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.94 
 
 
307 aa  62  0.00000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0401995  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0856  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  26.85 
 
 
252 aa  62  0.00000003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_35460  predicted protein  28.83 
 
 
301 aa  61.2  0.00000005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3875  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.46 
 
 
336 aa  60.8  0.00000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.893798  normal  0.0397379 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0143  short chain dehydrogenase  34.16 
 
 
303 aa  61.2  0.00000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_43164  predicted protein  26.09 
 
 
298 aa  60.8  0.00000005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_15641  short-chain dehydrogenase/reductase  26.92 
 
 
309 aa  60.8  0.00000005  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6760  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.51 
 
 
309 aa  60.8  0.00000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3678  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  27.11 
 
 
292 aa  60.8  0.00000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0772847  normal  0.304058 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3626  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.9 
 
 
306 aa  60.5  0.00000007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.474498  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1554  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.53 
 
 
253 aa  60.5  0.00000007  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.135569  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0488  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  31.17 
 
 
253 aa  60.5  0.00000008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.596302  normal  0.0751805 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3902  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.26 
 
 
246 aa  60.5  0.00000008  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.809389  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3370  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.37 
 
 
248 aa  60.5  0.00000009  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3438  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  31.25 
 
 
252 aa  60.1  0.00000009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_11105  short-chain dehydrogenase/reductase family protein, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G03280)  34.13 
 
 
332 aa  60.1  0.0000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09140  short-chain dehydrogenase of unknown substrate specificity  25.7 
 
 
272 aa  59.7  0.0000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.334901 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2783  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  27.78 
 
 
327 aa  59.7  0.0000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1453  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.43 
 
 
323 aa  59.7  0.0000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0851  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.33 
 
 
304 aa  59.7  0.0000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0651953  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_07001  putative light-dependent protochlorophyllide oxido-reductase  27.18 
 
 
333 aa  60.1  0.0000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.825166  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1150  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.45 
 
 
281 aa  59.7  0.0000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1583  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  25.99 
 
 
349 aa  59.3  0.0000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.216927  normal  0.0361789 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5347  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.06 
 
 
301 aa  59.3  0.0000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.981527  normal  0.0865499 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1861  oxidoreductase, short chain dehydrogenase/reductase family  30.56 
 
 
270 aa  59.3  0.0000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0952097  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3427  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.06 
 
 
301 aa  59.3  0.0000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.779859  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4941  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.06 
 
 
301 aa  59.3  0.0000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.89804  unclonable  0.0000194239 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4786  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.21 
 
 
288 aa  59.3  0.0000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_66867  predicted protein  29.03 
 
 
463 aa  59.3  0.0000002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.445197 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4226  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.03 
 
 
255 aa  58.5  0.0000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3541  short chain dehydrogenase  31.72 
 
 
270 aa  58.9  0.0000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.100637  normal  0.0669938 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1529  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  26.13 
 
 
328 aa  58.5  0.0000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.392114 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_17930  dehydrogenase of unknown specificity, short-chain alcohol dehydrogenase like protein  27.91 
 
 
268 aa  58.5  0.0000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.165231  normal  0.481868 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7589  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.85 
 
 
258 aa  58.2  0.0000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_07421  putative light-dependent protochlorophyllide oxido-reductase  26.1 
 
 
335 aa  58.2  0.0000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.784304  normal  0.258775 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1459  short-chain dehydrogenase/reductase  27.78 
 
 
309 aa  58.2  0.0000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.392397  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1053  oxidoreductase  29.44 
 
 
319 aa  58.2  0.0000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.176111  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0894  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  27.78 
 
 
266 aa  58.2  0.0000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_05410  dehydrogenase of unknown specificity, short-chain alcohol dehydrogenase like protein  26.46 
 
 
320 aa  57.8  0.0000004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_36252  predicted protein  26.69 
 
 
320 aa  57.8  0.0000005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.140786  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1813  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  26.11 
 
 
301 aa  57.8  0.0000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000491998  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7167  short chain dehydrogenase  30.23 
 
 
249 aa  57.4  0.0000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1920  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  23.94 
 
 
290 aa  57.4  0.0000006  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.108282  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>